Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

F2SHV9

Protein Details
Accession F2SHV9    Localization Confidence High Confidence Score 27
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
3-31DSSSSSRTPSPRPSRKRKHVPDEPPLEIDHydrophilic
34-58APEPASKKALRKEKKAKLKSSSSEAHydrophilic
282-311EGANGAGTKKPKKRRMKKVWVNRLQGRNLRHydrophilic
316-337EDSTTRYKKRFGKEKTETKEEAHydrophilic
349-371QGNVNLKQKSKKPIKSYGQYSTEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
14-20RPSRKRK
38-52ASKKALRKEKKAKLK
289-300TKKPKKRRMKKV
Subcellular Location(s) nucl 25
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR034225  Nop13/Rnp24_RRM1  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12396  RRM1_Nop13p_fungi  
Amino Acid Sequences MSDSSSSSRTPSPRPSRKRKHVPDEPPLEIDLNAPEPASKKALRKEKKAKLKSSSSEATVSAVSEGTEKGNETKKPETNDGNKKQRTGFGVWIGNLPFTATREMLRTFLTSKSGILDSQITRVHIPDSGMKRKGVKQNKGFAYVDFTSQEIVGRAIQLSEELVGGRRVLIKDATNFDGRVVKEANGDDLKTAGGNPPSTKIFVGNLSFDTTKEHLEEHFSPCGSISNIHVATFEDSGKCKGYAWVEFESTQSSQAAVRGFVKIPDPDDEIEEEEEDDEDGAEGANGAGTKKPKKRRMKKVWVNRLQGRNLRMEFAEDSTTRYKKRFGKEKTETKEEAGSNKKPASEATQGNVNLKQKSKKPIKSYGQYSTETVQKLSGAIVEAKGTKVTFD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.72
2 0.8
3 0.85
4 0.91
5 0.95
6 0.95
7 0.94
8 0.94
9 0.93
10 0.93
11 0.89
12 0.82
13 0.73
14 0.64
15 0.54
16 0.43
17 0.34
18 0.26
19 0.21
20 0.17
21 0.14
22 0.14
23 0.15
24 0.18
25 0.22
26 0.25
27 0.29
28 0.38
29 0.49
30 0.57
31 0.66
32 0.74
33 0.79
34 0.85
35 0.87
36 0.87
37 0.86
38 0.87
39 0.81
40 0.78
41 0.72
42 0.64
43 0.56
44 0.47
45 0.4
46 0.3
47 0.25
48 0.17
49 0.13
50 0.1
51 0.09
52 0.09
53 0.09
54 0.09
55 0.1
56 0.15
57 0.21
58 0.24
59 0.29
60 0.36
61 0.4
62 0.44
63 0.5
64 0.54
65 0.57
66 0.65
67 0.7
68 0.73
69 0.71
70 0.69
71 0.65
72 0.61
73 0.56
74 0.5
75 0.45
76 0.41
77 0.41
78 0.38
79 0.38
80 0.34
81 0.28
82 0.24
83 0.2
84 0.13
85 0.11
86 0.13
87 0.11
88 0.12
89 0.15
90 0.16
91 0.16
92 0.17
93 0.17
94 0.16
95 0.17
96 0.19
97 0.17
98 0.16
99 0.17
100 0.17
101 0.15
102 0.14
103 0.17
104 0.15
105 0.19
106 0.2
107 0.18
108 0.18
109 0.19
110 0.18
111 0.15
112 0.16
113 0.19
114 0.24
115 0.31
116 0.33
117 0.34
118 0.38
119 0.43
120 0.52
121 0.54
122 0.57
123 0.57
124 0.64
125 0.65
126 0.67
127 0.6
128 0.51
129 0.48
130 0.39
131 0.32
132 0.24
133 0.21
134 0.15
135 0.14
136 0.15
137 0.08
138 0.08
139 0.07
140 0.07
141 0.07
142 0.06
143 0.06
144 0.06
145 0.05
146 0.05
147 0.05
148 0.04
149 0.05
150 0.05
151 0.05
152 0.06
153 0.08
154 0.08
155 0.09
156 0.11
157 0.11
158 0.14
159 0.17
160 0.19
161 0.18
162 0.18
163 0.17
164 0.2
165 0.19
166 0.18
167 0.17
168 0.15
169 0.16
170 0.16
171 0.18
172 0.14
173 0.14
174 0.12
175 0.11
176 0.1
177 0.08
178 0.08
179 0.07
180 0.08
181 0.09
182 0.09
183 0.11
184 0.12
185 0.13
186 0.13
187 0.11
188 0.11
189 0.12
190 0.13
191 0.12
192 0.12
193 0.13
194 0.13
195 0.13
196 0.15
197 0.13
198 0.13
199 0.13
200 0.13
201 0.1
202 0.16
203 0.18
204 0.18
205 0.19
206 0.18
207 0.18
208 0.17
209 0.18
210 0.14
211 0.12
212 0.1
213 0.14
214 0.14
215 0.14
216 0.15
217 0.14
218 0.15
219 0.15
220 0.15
221 0.1
222 0.11
223 0.12
224 0.13
225 0.13
226 0.11
227 0.13
228 0.16
229 0.18
230 0.21
231 0.21
232 0.22
233 0.22
234 0.22
235 0.22
236 0.19
237 0.17
238 0.13
239 0.11
240 0.1
241 0.12
242 0.12
243 0.11
244 0.11
245 0.13
246 0.13
247 0.13
248 0.16
249 0.15
250 0.16
251 0.17
252 0.18
253 0.17
254 0.18
255 0.18
256 0.17
257 0.16
258 0.15
259 0.12
260 0.1
261 0.1
262 0.08
263 0.07
264 0.05
265 0.04
266 0.04
267 0.04
268 0.03
269 0.03
270 0.03
271 0.04
272 0.04
273 0.04
274 0.08
275 0.13
276 0.22
277 0.31
278 0.41
279 0.51
280 0.62
281 0.73
282 0.81
283 0.87
284 0.91
285 0.93
286 0.94
287 0.95
288 0.93
289 0.92
290 0.89
291 0.85
292 0.81
293 0.76
294 0.68
295 0.65
296 0.56
297 0.49
298 0.41
299 0.36
300 0.3
301 0.27
302 0.28
303 0.2
304 0.23
305 0.28
306 0.32
307 0.32
308 0.32
309 0.38
310 0.42
311 0.52
312 0.58
313 0.6
314 0.67
315 0.74
316 0.83
317 0.82
318 0.83
319 0.75
320 0.67
321 0.66
322 0.56
323 0.54
324 0.52
325 0.49
326 0.47
327 0.47
328 0.45
329 0.39
330 0.39
331 0.37
332 0.37
333 0.36
334 0.32
335 0.37
336 0.38
337 0.4
338 0.44
339 0.42
340 0.39
341 0.42
342 0.47
343 0.47
344 0.56
345 0.63
346 0.67
347 0.71
348 0.76
349 0.8
350 0.82
351 0.83
352 0.82
353 0.77
354 0.71
355 0.65
356 0.58
357 0.54
358 0.45
359 0.38
360 0.29
361 0.24
362 0.22
363 0.19
364 0.17
365 0.13
366 0.14
367 0.14
368 0.16
369 0.17
370 0.17
371 0.19