Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A080WWP4

Protein Details
Accession A0A080WWP4    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
175-196RGNSRKPSERDRWRAENEKKKDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
171-195IRKARGNSRKPSERDRWRAENEKKK
Subcellular Location(s) nucl 11.5, cyto_nucl 11, cyto 9.5, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd00590  RRM_SF  
Amino Acid Sequences MADLNGKLVLGRPVKVNPGVPRADLQPPLGRRDLDLDSPEPREESNEQQQQQQQQQPAAGTYPPKFVFERWTRDDASKHWYGYAAEGRRLFVGGLPRMRNQPTVDYEIRKVFYGFNIEAISKVIISNRDKLPLSGSQYYYLFVDLESAEEADKALKTLDGVSAIYGNRLHIRKARGNSRKPSERDRWRAENEKKKDEEKTAAQDQDHLLDAPIEAEGITQSLV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.31
2 0.34
3 0.38
4 0.36
5 0.4
6 0.41
7 0.39
8 0.38
9 0.37
10 0.39
11 0.35
12 0.33
13 0.34
14 0.34
15 0.38
16 0.39
17 0.35
18 0.3
19 0.33
20 0.33
21 0.29
22 0.3
23 0.28
24 0.28
25 0.3
26 0.3
27 0.26
28 0.23
29 0.23
30 0.23
31 0.27
32 0.34
33 0.39
34 0.4
35 0.45
36 0.49
37 0.51
38 0.55
39 0.54
40 0.47
41 0.41
42 0.41
43 0.36
44 0.33
45 0.27
46 0.22
47 0.2
48 0.18
49 0.22
50 0.21
51 0.23
52 0.23
53 0.23
54 0.3
55 0.33
56 0.39
57 0.38
58 0.41
59 0.4
60 0.42
61 0.44
62 0.36
63 0.36
64 0.32
65 0.27
66 0.24
67 0.23
68 0.2
69 0.22
70 0.27
71 0.22
72 0.23
73 0.23
74 0.23
75 0.22
76 0.22
77 0.18
78 0.13
79 0.16
80 0.16
81 0.2
82 0.22
83 0.23
84 0.26
85 0.28
86 0.28
87 0.24
88 0.25
89 0.23
90 0.28
91 0.29
92 0.27
93 0.28
94 0.28
95 0.27
96 0.23
97 0.21
98 0.15
99 0.13
100 0.16
101 0.13
102 0.12
103 0.12
104 0.12
105 0.12
106 0.12
107 0.11
108 0.07
109 0.07
110 0.07
111 0.11
112 0.13
113 0.18
114 0.19
115 0.22
116 0.22
117 0.22
118 0.24
119 0.23
120 0.27
121 0.25
122 0.25
123 0.24
124 0.24
125 0.24
126 0.21
127 0.18
128 0.12
129 0.08
130 0.09
131 0.06
132 0.07
133 0.06
134 0.06
135 0.06
136 0.06
137 0.06
138 0.06
139 0.06
140 0.05
141 0.05
142 0.05
143 0.06
144 0.07
145 0.07
146 0.07
147 0.07
148 0.07
149 0.1
150 0.09
151 0.11
152 0.1
153 0.11
154 0.16
155 0.17
156 0.2
157 0.23
158 0.3
159 0.35
160 0.43
161 0.52
162 0.56
163 0.64
164 0.71
165 0.76
166 0.79
167 0.76
168 0.78
169 0.78
170 0.79
171 0.8
172 0.78
173 0.77
174 0.75
175 0.81
176 0.82
177 0.82
178 0.8
179 0.79
180 0.76
181 0.72
182 0.7
183 0.66
184 0.63
185 0.59
186 0.59
187 0.57
188 0.57
189 0.52
190 0.49
191 0.44
192 0.39
193 0.34
194 0.26
195 0.19
196 0.15
197 0.14
198 0.11
199 0.1
200 0.07
201 0.06
202 0.05
203 0.05