FuNGI

F2SPM7

Protein Details

Accession

F2SPM7

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

14.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1-27	MTSSQVEKKRKRASDRHDRPSKKPAIH	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
8-24	KKRKRASDRHDRPSKKP
449-480	KGGKAEAASRRIARLKIPVEFPKMSRGRAPRR

Subcellular Location(s)

nucl 17, cyto_nucl 12.5, cyto 6, mito 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR009668 RNA_pol-assoc_fac_A49-like
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0005730 C:nucleolus GO:0003677 F:DNA binding GO:0006351 P:DNA-templated transcription
Pfam	View protein in Pfam PF06870 RNA_pol_I_A49

Amino Acid Sequences

MTSSQVEKKRKRASDRHDRPSKKPAIHTNPEPAKVQYLKNTAGHVPIIASSPGLTVPETLPLSTYIKPRQQRMKHTENANLAMTEALLHTSGHPKLNFTGREGENQLDNLLNHYVAVYDLKDNTVQLLEARKMMIRGCPRESIEEVEEESEEEGTKTVLSQKAALAAAFGTKLARKAVAAITENALTSNASASSTQAAESALLSSMPQDDMTNAAAERSAQAEIQASKPLPQPNLSATQPADVYSIESLVPSGLLTLHKIPVQDWQAAIAASEGITTSSRFVANRVEAAVQSGDKTVVQLLRFILILIEFSRSLKRSPGGGRGLDSRKLPPREDLRRILSTAVDSETNTTPTITDSFLDSIRRKFVPQGSFLSRNDITLLHTTICAMSLHIPPASGKTGGSNVSELATDPADLRDDLRLENDTILKYFRELGCKVDKPRESEFAKWSIKGGKAEAASRRIARLKIPVEFPKMSRGRAPRR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.87
2	0.89
3	0.9
4	0.91
5	0.88
6	0.84
7	0.84
8	0.83
9	0.79
10	0.77
11	0.77
12	0.76
13	0.79
14	0.78
15	0.78
16	0.76
17	0.72
18	0.66
19	0.56
20	0.54
21	0.49
22	0.47
23	0.45
24	0.44
25	0.45
26	0.45
27	0.47
28	0.41
29	0.39
30	0.35
31	0.27
32	0.22
33	0.18
34	0.18
35	0.14
36	0.12
37	0.1
38	0.1
39	0.1
40	0.1
41	0.09
42	0.09
43	0.09
44	0.15
45	0.16
46	0.15
47	0.15
48	0.17
49	0.2
50	0.23
51	0.29
52	0.31
53	0.38
54	0.44
55	0.52
56	0.6
57	0.65
58	0.72
59	0.74
60	0.76
61	0.75
62	0.75
63	0.74
64	0.69
65	0.64
66	0.54
67	0.45
68	0.36
69	0.28
70	0.22
71	0.15
72	0.1
73	0.07
74	0.06
75	0.06
76	0.08
77	0.13
78	0.16
79	0.21
80	0.21
81	0.22
82	0.26
83	0.33
84	0.33
85	0.31
86	0.37
87	0.33
88	0.38
89	0.38
90	0.36
91	0.3
92	0.29
93	0.26
94	0.2
95	0.19
96	0.16
97	0.14
98	0.12
99	0.11
100	0.1
101	0.09
102	0.08
103	0.09
104	0.08
105	0.09
106	0.09
107	0.1
108	0.11
109	0.11
110	0.11
111	0.1
112	0.09
113	0.1
114	0.14
115	0.14
116	0.14
117	0.15
118	0.15
119	0.16
120	0.17
121	0.21
122	0.24
123	0.29
124	0.31
125	0.35
126	0.35
127	0.38
128	0.39
129	0.36
130	0.3
131	0.26
132	0.23
133	0.19
134	0.18
135	0.14
136	0.13
137	0.09
138	0.08
139	0.07
140	0.06
141	0.05
142	0.05
143	0.05
144	0.1
145	0.12
146	0.13
147	0.14
148	0.14
149	0.17
150	0.18
151	0.17
152	0.12
153	0.1
154	0.1
155	0.08
156	0.08
157	0.06
158	0.06
159	0.08
160	0.08
161	0.09
162	0.08
163	0.1
164	0.12
165	0.15
166	0.16
167	0.16
168	0.16
169	0.16
170	0.16
171	0.14
172	0.12
173	0.08
174	0.07
175	0.06
176	0.05
177	0.05
178	0.05
179	0.06
180	0.07
181	0.07
182	0.07
183	0.07
184	0.07
185	0.06
186	0.06
187	0.06
188	0.05
189	0.05
190	0.05
191	0.05
192	0.05
193	0.05
194	0.05
195	0.05
196	0.05
197	0.06
198	0.07
199	0.07
200	0.06
201	0.06
202	0.06
203	0.06
204	0.06
205	0.06
206	0.06
207	0.05
208	0.06
209	0.08
210	0.09
211	0.1
212	0.12
213	0.11
214	0.13
215	0.17
216	0.19
217	0.19
218	0.19
219	0.19
220	0.19
221	0.24
222	0.22
223	0.2
224	0.18
225	0.18
226	0.16
227	0.15
228	0.13
229	0.09
230	0.09
231	0.07
232	0.07
233	0.06
234	0.06
235	0.05
236	0.04
237	0.04
238	0.03
239	0.03
240	0.04
241	0.04
242	0.05
243	0.06
244	0.08
245	0.09
246	0.09
247	0.1
248	0.15
249	0.17
250	0.17
251	0.16
252	0.15
253	0.15
254	0.15
255	0.14
256	0.09
257	0.06
258	0.05
259	0.05
260	0.04
261	0.04
262	0.04
263	0.05
264	0.05
265	0.06
266	0.08
267	0.08
268	0.09
269	0.12
270	0.13
271	0.13
272	0.14
273	0.13
274	0.12
275	0.14
276	0.13
277	0.09
278	0.09
279	0.09
280	0.08
281	0.07
282	0.07
283	0.08
284	0.1
285	0.1
286	0.11
287	0.11
288	0.11
289	0.11
290	0.11
291	0.09
292	0.06
293	0.07
294	0.06
295	0.07
296	0.07
297	0.08
298	0.11
299	0.12
300	0.13
301	0.16
302	0.16
303	0.2
304	0.24
305	0.31
306	0.32
307	0.32
308	0.33
309	0.38
310	0.4
311	0.38
312	0.36
313	0.34
314	0.38
315	0.41
316	0.4
317	0.4
318	0.46
319	0.52
320	0.58
321	0.58
322	0.56
323	0.55
324	0.54
325	0.48
326	0.39
327	0.3
328	0.25
329	0.2
330	0.14
331	0.12
332	0.14
333	0.15
334	0.15
335	0.14
336	0.13
337	0.11
338	0.12
339	0.14
340	0.11
341	0.1
342	0.11
343	0.12
344	0.14
345	0.19
346	0.2
347	0.21
348	0.25
349	0.26
350	0.25
351	0.3
352	0.36
353	0.35
354	0.36
355	0.41
356	0.44
357	0.48
358	0.48
359	0.49
360	0.41
361	0.37
362	0.34
363	0.27
364	0.23
365	0.2
366	0.21
367	0.15
368	0.15
369	0.15
370	0.14
371	0.14
372	0.11
373	0.09
374	0.11
375	0.13
376	0.15
377	0.15
378	0.15
379	0.14
380	0.18
381	0.19
382	0.16
383	0.14
384	0.14
385	0.17
386	0.19
387	0.2
388	0.17
389	0.15
390	0.15
391	0.15
392	0.14
393	0.12
394	0.11
395	0.1
396	0.1
397	0.1
398	0.11
399	0.11
400	0.12
401	0.13
402	0.14
403	0.15
404	0.16
405	0.18
406	0.17
407	0.2
408	0.22
409	0.19
410	0.19
411	0.2
412	0.18
413	0.17
414	0.22
415	0.22
416	0.26
417	0.26
418	0.31
419	0.38
420	0.45
421	0.49
422	0.53
423	0.55
424	0.54
425	0.59
426	0.61
427	0.57
428	0.56
429	0.55
430	0.55
431	0.54
432	0.49
433	0.47
434	0.45
435	0.46
436	0.43
437	0.4
438	0.36
439	0.35
440	0.41
441	0.44
442	0.41
443	0.42
444	0.41
445	0.45
446	0.45
447	0.44
448	0.42
449	0.45
450	0.46
451	0.46
452	0.52
453	0.53
454	0.55
455	0.57
456	0.54
457	0.55
458	0.54
459	0.51
460	0.52

F2SPM7

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer