Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

F2SSB5

Protein Details
Accession F2SSB5    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
28-49TTKYSYPKRPSAKERAKSKSKTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
35-47KRPSAKERAKSKS
151-167GGGGKPAKGKKKGKGKK
Subcellular Location(s) mito 10, cyto_nucl 9.5, cyto 8.5, nucl 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039914  SRP9-like  
IPR039432  SRP9_dom  
Gene Ontology GO:0048500  C:signal recognition particle  
GO:0006614  P:SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane  
Pfam View protein in Pfam  
PF05486  SRP9-21  
Amino Acid Sequences MVYLATSQDYLKQSSLLLEAYPDTTRITTKYSYPKRPSAKERAKSKSKTAASAPTETPEPTAVPATLTLKTFNPATGICLKYQTNKAAEVGRLIAGLGKLASGSPIEDFVPAPVPVKAAAGEAEDVDMVDATPSSAVDEINRSNTPVAGGGGGGKPAKGKKKGKGKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.2
3 0.15
4 0.12
5 0.11
6 0.11
7 0.13
8 0.13
9 0.12
10 0.12
11 0.12
12 0.14
13 0.14
14 0.17
15 0.17
16 0.23
17 0.33
18 0.41
19 0.51
20 0.56
21 0.63
22 0.68
23 0.75
24 0.77
25 0.77
26 0.79
27 0.77
28 0.8
29 0.8
30 0.81
31 0.77
32 0.75
33 0.74
34 0.66
35 0.61
36 0.55
37 0.54
38 0.48
39 0.48
40 0.42
41 0.33
42 0.32
43 0.28
44 0.26
45 0.17
46 0.14
47 0.11
48 0.12
49 0.1
50 0.09
51 0.1
52 0.11
53 0.11
54 0.12
55 0.12
56 0.11
57 0.13
58 0.13
59 0.11
60 0.11
61 0.09
62 0.12
63 0.15
64 0.16
65 0.15
66 0.17
67 0.18
68 0.2
69 0.23
70 0.23
71 0.19
72 0.19
73 0.2
74 0.2
75 0.19
76 0.17
77 0.14
78 0.11
79 0.1
80 0.09
81 0.08
82 0.06
83 0.06
84 0.05
85 0.04
86 0.04
87 0.04
88 0.04
89 0.03
90 0.04
91 0.04
92 0.05
93 0.06
94 0.06
95 0.07
96 0.07
97 0.09
98 0.09
99 0.1
100 0.09
101 0.09
102 0.09
103 0.1
104 0.09
105 0.07
106 0.08
107 0.08
108 0.08
109 0.07
110 0.07
111 0.07
112 0.06
113 0.05
114 0.05
115 0.04
116 0.04
117 0.03
118 0.03
119 0.04
120 0.04
121 0.05
122 0.05
123 0.05
124 0.07
125 0.11
126 0.12
127 0.17
128 0.18
129 0.18
130 0.18
131 0.19
132 0.18
133 0.16
134 0.14
135 0.1
136 0.1
137 0.1
138 0.1
139 0.13
140 0.12
141 0.12
142 0.16
143 0.23
144 0.32
145 0.4
146 0.47
147 0.54