Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q5A1M4

Protein Details
Accession Q5A1M4    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
457-485LMKKYFPREVKEKLRERDKERYNELRKNABasic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR004331  SPX_dom  
IPR001841  Znf_RING  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
IPR017907  Znf_RING_CS  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0061630  F:ubiquitin protein ligase activity  
GO:0007155  P:cell adhesion  
GO:1900189  P:positive regulation of cell adhesion involved in single-species biofilm formation  
GO:0010811  P:positive regulation of cell-substrate adhesion  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
GO:0044011  P:single-species biofilm formation on inanimate substrate  
KEGG cal:CAALFM_C500980WA  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF03105  SPX  
PF13920  zf-C3HC4_3  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51382  SPX  
PS00518  ZF_RING_1  
PS50089  ZF_RING_2  
CDD cd23137  RING-HC_TRY3-like  
Amino Acid Sequences MKFAKTLERTLEEDEIPQEWVEAAIQYKALKKCINKVVNELEFLGLQKNTLKILLNDKVVEVNEQETNPSNPIIAEYILSKTSTDAHNIKPMLKITLDYSSEDYTKDHIVELGKELKQKIEALLNDSDTEYEEDKIIELKEDDGGDLQIVTSREGSLSPPASRMASPPTSPTLKVVDSLNTNIDEALLSPDDHHKKHEIFIMLNSDSKFFEMLNDELNSLDTLTQQEESKIIEEVKKIAKYVNELKLKQSELYKWRELFKVYLDSEVYFKYNETALPSQQKSSEQIKSNLDLFVTNLNKSGIMTRFKKKQSLETFNQFMEMNYHLLKILQFQTINNEALRKILKKFDKQTSLGIQKTFPKLISNDHIFMSGSSLAQSICYIIQESIIKVIPQLDDYSCPICMNIAYKPIRLSCGHLFCVRCLVKMKQDDKTSCPLCRKENAILYADSSNLDLESMELMKKYFPREVKEKLRERDKERYNELRKNANSGEKCIVM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.32
2 0.27
3 0.24
4 0.2
5 0.16
6 0.12
7 0.12
8 0.1
9 0.1
10 0.1
11 0.1
12 0.12
13 0.14
14 0.21
15 0.24
16 0.29
17 0.33
18 0.37
19 0.45
20 0.54
21 0.59
22 0.55
23 0.59
24 0.63
25 0.6
26 0.57
27 0.49
28 0.39
29 0.33
30 0.31
31 0.26
32 0.17
33 0.15
34 0.16
35 0.16
36 0.16
37 0.17
38 0.19
39 0.18
40 0.27
41 0.31
42 0.32
43 0.31
44 0.31
45 0.31
46 0.3
47 0.28
48 0.21
49 0.19
50 0.18
51 0.18
52 0.19
53 0.19
54 0.21
55 0.21
56 0.2
57 0.17
58 0.14
59 0.15
60 0.15
61 0.12
62 0.11
63 0.11
64 0.12
65 0.13
66 0.13
67 0.12
68 0.11
69 0.14
70 0.15
71 0.2
72 0.22
73 0.24
74 0.31
75 0.32
76 0.34
77 0.34
78 0.34
79 0.3
80 0.27
81 0.25
82 0.2
83 0.25
84 0.25
85 0.23
86 0.24
87 0.24
88 0.24
89 0.24
90 0.22
91 0.18
92 0.18
93 0.17
94 0.14
95 0.14
96 0.15
97 0.16
98 0.19
99 0.23
100 0.23
101 0.26
102 0.27
103 0.26
104 0.26
105 0.26
106 0.24
107 0.24
108 0.23
109 0.24
110 0.25
111 0.25
112 0.23
113 0.22
114 0.2
115 0.15
116 0.16
117 0.13
118 0.11
119 0.11
120 0.1
121 0.1
122 0.12
123 0.11
124 0.1
125 0.09
126 0.09
127 0.11
128 0.11
129 0.11
130 0.09
131 0.09
132 0.08
133 0.07
134 0.07
135 0.08
136 0.08
137 0.09
138 0.08
139 0.08
140 0.09
141 0.09
142 0.11
143 0.12
144 0.15
145 0.14
146 0.15
147 0.16
148 0.17
149 0.17
150 0.18
151 0.19
152 0.19
153 0.19
154 0.2
155 0.24
156 0.24
157 0.24
158 0.25
159 0.22
160 0.2
161 0.21
162 0.19
163 0.18
164 0.17
165 0.18
166 0.18
167 0.15
168 0.15
169 0.13
170 0.12
171 0.09
172 0.08
173 0.08
174 0.07
175 0.07
176 0.08
177 0.15
178 0.19
179 0.2
180 0.22
181 0.24
182 0.25
183 0.27
184 0.31
185 0.25
186 0.22
187 0.24
188 0.26
189 0.23
190 0.24
191 0.22
192 0.19
193 0.16
194 0.16
195 0.14
196 0.09
197 0.09
198 0.1
199 0.1
200 0.12
201 0.12
202 0.12
203 0.11
204 0.12
205 0.11
206 0.08
207 0.08
208 0.05
209 0.06
210 0.06
211 0.07
212 0.07
213 0.07
214 0.08
215 0.08
216 0.09
217 0.09
218 0.09
219 0.1
220 0.1
221 0.13
222 0.17
223 0.17
224 0.16
225 0.17
226 0.17
227 0.2
228 0.27
229 0.32
230 0.34
231 0.34
232 0.37
233 0.38
234 0.38
235 0.35
236 0.3
237 0.27
238 0.27
239 0.32
240 0.34
241 0.33
242 0.35
243 0.35
244 0.33
245 0.29
246 0.25
247 0.25
248 0.21
249 0.21
250 0.19
251 0.18
252 0.18
253 0.17
254 0.16
255 0.09
256 0.09
257 0.08
258 0.08
259 0.08
260 0.12
261 0.13
262 0.15
263 0.22
264 0.22
265 0.22
266 0.23
267 0.24
268 0.25
269 0.29
270 0.32
271 0.29
272 0.33
273 0.34
274 0.34
275 0.34
276 0.3
277 0.25
278 0.18
279 0.15
280 0.17
281 0.16
282 0.15
283 0.14
284 0.14
285 0.14
286 0.14
287 0.18
288 0.15
289 0.21
290 0.26
291 0.31
292 0.39
293 0.42
294 0.48
295 0.46
296 0.51
297 0.54
298 0.58
299 0.59
300 0.58
301 0.58
302 0.51
303 0.51
304 0.41
305 0.31
306 0.24
307 0.19
308 0.14
309 0.12
310 0.12
311 0.1
312 0.11
313 0.11
314 0.12
315 0.13
316 0.15
317 0.15
318 0.15
319 0.2
320 0.23
321 0.24
322 0.21
323 0.2
324 0.17
325 0.19
326 0.22
327 0.2
328 0.19
329 0.26
330 0.33
331 0.4
332 0.47
333 0.53
334 0.57
335 0.57
336 0.6
337 0.6
338 0.6
339 0.55
340 0.48
341 0.42
342 0.41
343 0.43
344 0.39
345 0.31
346 0.27
347 0.26
348 0.3
349 0.35
350 0.34
351 0.31
352 0.3
353 0.3
354 0.26
355 0.25
356 0.22
357 0.15
358 0.11
359 0.1
360 0.1
361 0.09
362 0.09
363 0.09
364 0.07
365 0.06
366 0.07
367 0.08
368 0.07
369 0.1
370 0.11
371 0.11
372 0.13
373 0.14
374 0.13
375 0.13
376 0.15
377 0.13
378 0.13
379 0.15
380 0.13
381 0.15
382 0.18
383 0.19
384 0.17
385 0.16
386 0.15
387 0.13
388 0.13
389 0.13
390 0.13
391 0.2
392 0.22
393 0.24
394 0.27
395 0.28
396 0.31
397 0.3
398 0.34
399 0.33
400 0.36
401 0.38
402 0.4
403 0.4
404 0.36
405 0.45
406 0.39
407 0.34
408 0.34
409 0.35
410 0.38
411 0.47
412 0.52
413 0.5
414 0.58
415 0.59
416 0.58
417 0.64
418 0.6
419 0.57
420 0.6
421 0.58
422 0.55
423 0.57
424 0.58
425 0.56
426 0.59
427 0.57
428 0.52
429 0.46
430 0.43
431 0.38
432 0.33
433 0.26
434 0.19
435 0.15
436 0.11
437 0.1
438 0.07
439 0.07
440 0.08
441 0.09
442 0.1
443 0.1
444 0.1
445 0.14
446 0.18
447 0.22
448 0.27
449 0.32
450 0.38
451 0.46
452 0.55
453 0.63
454 0.7
455 0.75
456 0.77
457 0.82
458 0.83
459 0.83
460 0.84
461 0.82
462 0.81
463 0.81
464 0.82
465 0.81
466 0.81
467 0.8
468 0.79
469 0.72
470 0.7
471 0.67
472 0.66
473 0.6
474 0.57