Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

F2SHM1

Protein Details
Accession F2SHM1    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-21MQKQPPTQPRHHPPQHITPLHHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 14.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045072  MKRN-like  
IPR041367  Znf-CCCH_4  
IPR000571  Znf_CCCH  
IPR036855  Znf_CCCH_sf  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0061630  F:ubiquitin protein ligase activity  
GO:0000209  P:protein polyubiquitination  
Pfam View protein in Pfam  
PF00642  zf-CCCH  
PF18044  zf-CCCH_4  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50103  ZF_C3H1  
Amino Acid Sequences MQKQPPTQPRHHPPQHITPLHPPLQQQIDSRKLNNTASATARMAGGDPRNRAPLPVPGGHGPFPQNENGGMRPPFDMARSPPNPPASKNTKHVPCKFFRQGTCQAGPACPFLHSTDNTIDSAPCKYFTKGNCKFGAKCALAHILPDGRRVNRPSMGLGGNLNLGGRVHPPPYHAQDSALANSLLSQQQINGQNPRFSYPYPSQDDLHLLPPHAQQQVQQQQQLQQQQQQQFGQQYDGSIPHIDAGLVSDTGSKYGSPPEEIRLPMSPIGRTALDAPLPASFDSQGISHMARYGPVAASMPSKFGLDFAHSPSLSHRPNATPDVLRSLHDTAFGTDKKPLGLGSSPPVVSAEDTSGFRVMHSQRVPRQRILSASVPRPTVLDDWEDNFTMEEDYLPTNLHDDVLTPQERMRRLSRTDHELSSSSKDPSGLGIGIGIGIGGSGKVGSPLASSPSRFGALFAKQRQRKEEEAQAALAQNGHVGSPLRESVIGPRSSASAIRPIGSLPGSGDISPFVASPRQSSMSMISEQLSSTSLHPSSARAPTSNPRLDRNISSPVSTSRIDEEQSDLVFSMEEEESNKRTSAIWGANKETPPPTEGEKNANAKASTAGQDKKDGNGKSYLKMESLYGNRS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.83
2 0.85
3 0.79
4 0.74
5 0.73
6 0.72
7 0.68
8 0.63
9 0.54
10 0.5
11 0.52
12 0.51
13 0.48
14 0.48
15 0.52
16 0.54
17 0.55
18 0.54
19 0.52
20 0.5
21 0.5
22 0.44
23 0.4
24 0.39
25 0.4
26 0.35
27 0.31
28 0.29
29 0.23
30 0.21
31 0.22
32 0.26
33 0.28
34 0.31
35 0.34
36 0.39
37 0.39
38 0.4
39 0.37
40 0.37
41 0.38
42 0.37
43 0.38
44 0.36
45 0.4
46 0.4
47 0.4
48 0.35
49 0.32
50 0.31
51 0.29
52 0.26
53 0.25
54 0.26
55 0.25
56 0.29
57 0.27
58 0.25
59 0.24
60 0.24
61 0.23
62 0.22
63 0.24
64 0.22
65 0.31
66 0.33
67 0.36
68 0.4
69 0.47
70 0.48
71 0.47
72 0.52
73 0.51
74 0.55
75 0.57
76 0.6
77 0.61
78 0.69
79 0.75
80 0.73
81 0.7
82 0.74
83 0.77
84 0.75
85 0.69
86 0.67
87 0.68
88 0.67
89 0.63
90 0.57
91 0.5
92 0.45
93 0.43
94 0.37
95 0.28
96 0.21
97 0.21
98 0.19
99 0.23
100 0.22
101 0.23
102 0.24
103 0.26
104 0.26
105 0.25
106 0.23
107 0.18
108 0.21
109 0.18
110 0.17
111 0.17
112 0.18
113 0.23
114 0.29
115 0.39
116 0.44
117 0.5
118 0.54
119 0.57
120 0.57
121 0.57
122 0.6
123 0.5
124 0.42
125 0.38
126 0.36
127 0.31
128 0.3
129 0.27
130 0.24
131 0.23
132 0.28
133 0.29
134 0.27
135 0.33
136 0.36
137 0.38
138 0.36
139 0.37
140 0.33
141 0.33
142 0.31
143 0.27
144 0.24
145 0.19
146 0.16
147 0.15
148 0.13
149 0.08
150 0.07
151 0.07
152 0.09
153 0.1
154 0.12
155 0.13
156 0.16
157 0.22
158 0.28
159 0.32
160 0.29
161 0.29
162 0.31
163 0.33
164 0.31
165 0.27
166 0.2
167 0.16
168 0.16
169 0.17
170 0.13
171 0.11
172 0.1
173 0.08
174 0.15
175 0.21
176 0.24
177 0.29
178 0.3
179 0.33
180 0.33
181 0.36
182 0.32
183 0.26
184 0.3
185 0.28
186 0.34
187 0.37
188 0.39
189 0.37
190 0.36
191 0.39
192 0.33
193 0.34
194 0.27
195 0.21
196 0.21
197 0.22
198 0.25
199 0.23
200 0.22
201 0.18
202 0.27
203 0.36
204 0.37
205 0.38
206 0.35
207 0.39
208 0.45
209 0.49
210 0.42
211 0.39
212 0.42
213 0.44
214 0.46
215 0.41
216 0.39
217 0.35
218 0.33
219 0.29
220 0.23
221 0.19
222 0.16
223 0.16
224 0.14
225 0.11
226 0.1
227 0.09
228 0.08
229 0.08
230 0.06
231 0.06
232 0.06
233 0.05
234 0.06
235 0.07
236 0.07
237 0.07
238 0.08
239 0.07
240 0.06
241 0.1
242 0.11
243 0.12
244 0.13
245 0.16
246 0.19
247 0.19
248 0.2
249 0.18
250 0.19
251 0.19
252 0.19
253 0.17
254 0.14
255 0.15
256 0.13
257 0.13
258 0.13
259 0.11
260 0.1
261 0.1
262 0.1
263 0.09
264 0.1
265 0.09
266 0.08
267 0.07
268 0.07
269 0.07
270 0.07
271 0.07
272 0.07
273 0.08
274 0.07
275 0.08
276 0.08
277 0.08
278 0.08
279 0.08
280 0.07
281 0.07
282 0.07
283 0.07
284 0.09
285 0.09
286 0.1
287 0.09
288 0.09
289 0.08
290 0.09
291 0.09
292 0.09
293 0.11
294 0.12
295 0.16
296 0.15
297 0.16
298 0.17
299 0.24
300 0.22
301 0.22
302 0.2
303 0.18
304 0.21
305 0.24
306 0.24
307 0.18
308 0.18
309 0.22
310 0.21
311 0.2
312 0.2
313 0.2
314 0.17
315 0.17
316 0.17
317 0.12
318 0.16
319 0.16
320 0.14
321 0.14
322 0.15
323 0.13
324 0.13
325 0.12
326 0.1
327 0.11
328 0.11
329 0.12
330 0.14
331 0.14
332 0.13
333 0.14
334 0.12
335 0.11
336 0.1
337 0.09
338 0.08
339 0.09
340 0.09
341 0.1
342 0.1
343 0.09
344 0.14
345 0.14
346 0.19
347 0.22
348 0.27
349 0.33
350 0.42
351 0.46
352 0.44
353 0.46
354 0.41
355 0.4
356 0.39
357 0.4
358 0.35
359 0.36
360 0.35
361 0.33
362 0.31
363 0.29
364 0.26
365 0.2
366 0.16
367 0.15
368 0.13
369 0.15
370 0.16
371 0.16
372 0.14
373 0.14
374 0.13
375 0.1
376 0.09
377 0.07
378 0.06
379 0.07
380 0.07
381 0.07
382 0.07
383 0.07
384 0.08
385 0.08
386 0.06
387 0.07
388 0.08
389 0.13
390 0.14
391 0.13
392 0.15
393 0.19
394 0.21
395 0.24
396 0.27
397 0.27
398 0.3
399 0.39
400 0.41
401 0.45
402 0.47
403 0.44
404 0.42
405 0.38
406 0.37
407 0.33
408 0.31
409 0.24
410 0.21
411 0.2
412 0.18
413 0.17
414 0.16
415 0.11
416 0.09
417 0.08
418 0.07
419 0.06
420 0.06
421 0.05
422 0.02
423 0.02
424 0.02
425 0.02
426 0.02
427 0.02
428 0.02
429 0.03
430 0.03
431 0.04
432 0.05
433 0.06
434 0.1
435 0.12
436 0.13
437 0.14
438 0.16
439 0.17
440 0.16
441 0.17
442 0.17
443 0.22
444 0.3
445 0.36
446 0.44
447 0.48
448 0.52
449 0.57
450 0.58
451 0.58
452 0.56
453 0.57
454 0.53
455 0.5
456 0.46
457 0.42
458 0.37
459 0.31
460 0.25
461 0.16
462 0.11
463 0.09
464 0.08
465 0.07
466 0.08
467 0.08
468 0.1
469 0.11
470 0.11
471 0.11
472 0.12
473 0.17
474 0.24
475 0.24
476 0.22
477 0.22
478 0.22
479 0.23
480 0.24
481 0.19
482 0.19
483 0.19
484 0.19
485 0.19
486 0.18
487 0.2
488 0.19
489 0.18
490 0.11
491 0.13
492 0.13
493 0.13
494 0.13
495 0.11
496 0.11
497 0.11
498 0.11
499 0.09
500 0.11
501 0.12
502 0.14
503 0.18
504 0.2
505 0.2
506 0.22
507 0.24
508 0.24
509 0.25
510 0.24
511 0.2
512 0.18
513 0.17
514 0.16
515 0.14
516 0.11
517 0.11
518 0.15
519 0.14
520 0.16
521 0.16
522 0.18
523 0.23
524 0.28
525 0.29
526 0.25
527 0.29
528 0.36
529 0.46
530 0.51
531 0.48
532 0.47
533 0.51
534 0.54
535 0.54
536 0.5
537 0.49
538 0.43
539 0.42
540 0.39
541 0.36
542 0.36
543 0.32
544 0.29
545 0.24
546 0.25
547 0.25
548 0.24
549 0.24
550 0.23
551 0.23
552 0.21
553 0.17
554 0.15
555 0.14
556 0.12
557 0.12
558 0.09
559 0.1
560 0.11
561 0.15
562 0.18
563 0.2
564 0.2
565 0.17
566 0.18
567 0.2
568 0.26
569 0.31
570 0.36
571 0.39
572 0.44
573 0.49
574 0.49
575 0.51
576 0.46
577 0.39
578 0.33
579 0.31
580 0.32
581 0.34
582 0.36
583 0.4
584 0.44
585 0.48
586 0.5
587 0.52
588 0.46
589 0.39
590 0.39
591 0.35
592 0.33
593 0.34
594 0.36
595 0.34
596 0.41
597 0.41
598 0.45
599 0.49
600 0.45
601 0.41
602 0.45
603 0.46
604 0.44
605 0.48
606 0.44
607 0.37
608 0.36
609 0.34
610 0.33