Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

F2SUG1

Protein Details
Accession F2SUG1    Localization Confidence High Confidence Score 22.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
8-66IDSIASPEKKRKDKGESKKRKRQEQASETVVVDDGEKKKKKKKDKHPKKGEKQAVGDGGBasic
399-425EAVEAQPSKKKKEKKEKKSKKEKSSKPBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
15-29EKKRKDKGESKKRKR
43-78EKKKKKKKDKHPKKGEKQAVGDGGKGRDKLASRKPL
406-425SKKKKEKKEKKSKKEKSSKP
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036898  RNA_pol_Rpb7-like_N_sf  
IPR041178  RPA43_OB  
IPR045113  Rpb7-like  
Gene Ontology GO:0000428  C:DNA-directed RNA polymerase complex  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
Pfam View protein in Pfam  
PF17875  RPA43_OB  
Amino Acid Sequences MSMDEMEIDSIASPEKKRKDKGESKKRKRQEQASETVVVDDGEKKKKKKKDKHPKKGEKQAVGDGGKGRDKLASRKPLSKASSNDKDTHSLSSTADQLPSFHRVTTTLYLPLSPIAISPTHAVSSLLAEHISPLLLTYYPPVRGVVLAYSNPSISATKPTPTPTSTHTPNPEPLTLAKTAGEYGVLHTYLTLTFLVFRPERGQTLEGWINVQSEDFLGAIVFNLFSIGIERRRLPADWKWIAPGQQSDRPSTTSASPTSSSKDEEDEDDDEPDSDKENFKPLASNSEASQFEDAASAETGYFQTRSGKRVRGTIRFRVRDVDVIPGSERDKGFLSLEGTMLSKEDEDKLVAEERSKASGAGRAKSGDNYHDPTSRELQEAPAVDIDLDADEDEDVTMAEAVEAQPSKKKKEKKEKKSKKEKSSKP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.34
3 0.43
4 0.5
5 0.59
6 0.67
7 0.74
8 0.82
9 0.85
10 0.87
11 0.9
12 0.93
13 0.94
14 0.93
15 0.93
16 0.92
17 0.92
18 0.89
19 0.86
20 0.81
21 0.75
22 0.64
23 0.54
24 0.44
25 0.33
26 0.25
27 0.23
28 0.24
29 0.31
30 0.38
31 0.45
32 0.53
33 0.63
34 0.73
35 0.77
36 0.83
37 0.85
38 0.89
39 0.93
40 0.95
41 0.97
42 0.96
43 0.97
44 0.95
45 0.92
46 0.85
47 0.8
48 0.77
49 0.66
50 0.59
51 0.51
52 0.46
53 0.41
54 0.37
55 0.3
56 0.27
57 0.29
58 0.35
59 0.4
60 0.47
61 0.48
62 0.55
63 0.59
64 0.63
65 0.65
66 0.64
67 0.61
68 0.6
69 0.65
70 0.61
71 0.62
72 0.56
73 0.55
74 0.49
75 0.46
76 0.38
77 0.3
78 0.27
79 0.25
80 0.26
81 0.22
82 0.22
83 0.19
84 0.18
85 0.19
86 0.23
87 0.21
88 0.18
89 0.17
90 0.17
91 0.21
92 0.23
93 0.22
94 0.2
95 0.2
96 0.2
97 0.19
98 0.18
99 0.14
100 0.11
101 0.09
102 0.08
103 0.08
104 0.09
105 0.1
106 0.11
107 0.11
108 0.11
109 0.11
110 0.09
111 0.1
112 0.1
113 0.09
114 0.08
115 0.07
116 0.07
117 0.07
118 0.07
119 0.05
120 0.04
121 0.05
122 0.05
123 0.05
124 0.07
125 0.1
126 0.11
127 0.11
128 0.12
129 0.11
130 0.11
131 0.12
132 0.11
133 0.11
134 0.11
135 0.12
136 0.12
137 0.11
138 0.11
139 0.12
140 0.11
141 0.09
142 0.14
143 0.14
144 0.15
145 0.17
146 0.2
147 0.22
148 0.23
149 0.24
150 0.23
151 0.29
152 0.31
153 0.35
154 0.36
155 0.36
156 0.39
157 0.4
158 0.36
159 0.3
160 0.28
161 0.25
162 0.21
163 0.19
164 0.15
165 0.12
166 0.12
167 0.1
168 0.1
169 0.06
170 0.07
171 0.08
172 0.08
173 0.07
174 0.07
175 0.07
176 0.07
177 0.08
178 0.06
179 0.05
180 0.06
181 0.06
182 0.11
183 0.1
184 0.11
185 0.13
186 0.14
187 0.15
188 0.16
189 0.17
190 0.13
191 0.18
192 0.19
193 0.16
194 0.16
195 0.15
196 0.13
197 0.12
198 0.12
199 0.07
200 0.05
201 0.05
202 0.04
203 0.04
204 0.03
205 0.03
206 0.03
207 0.03
208 0.03
209 0.02
210 0.03
211 0.03
212 0.03
213 0.04
214 0.06
215 0.08
216 0.1
217 0.11
218 0.13
219 0.15
220 0.16
221 0.19
222 0.22
223 0.3
224 0.31
225 0.3
226 0.31
227 0.31
228 0.32
229 0.29
230 0.29
231 0.24
232 0.27
233 0.28
234 0.28
235 0.28
236 0.28
237 0.27
238 0.24
239 0.22
240 0.2
241 0.19
242 0.19
243 0.2
244 0.19
245 0.21
246 0.21
247 0.2
248 0.18
249 0.19
250 0.17
251 0.17
252 0.19
253 0.18
254 0.17
255 0.16
256 0.16
257 0.14
258 0.14
259 0.12
260 0.11
261 0.1
262 0.12
263 0.11
264 0.16
265 0.17
266 0.16
267 0.2
268 0.19
269 0.24
270 0.25
271 0.25
272 0.21
273 0.26
274 0.27
275 0.24
276 0.24
277 0.17
278 0.15
279 0.15
280 0.14
281 0.09
282 0.09
283 0.07
284 0.07
285 0.07
286 0.07
287 0.08
288 0.08
289 0.08
290 0.16
291 0.18
292 0.22
293 0.28
294 0.33
295 0.34
296 0.42
297 0.49
298 0.51
299 0.56
300 0.62
301 0.67
302 0.64
303 0.63
304 0.59
305 0.54
306 0.49
307 0.42
308 0.4
309 0.3
310 0.28
311 0.27
312 0.25
313 0.25
314 0.24
315 0.23
316 0.17
317 0.18
318 0.19
319 0.19
320 0.19
321 0.19
322 0.16
323 0.16
324 0.15
325 0.14
326 0.12
327 0.11
328 0.09
329 0.08
330 0.09
331 0.1
332 0.1
333 0.11
334 0.11
335 0.13
336 0.17
337 0.18
338 0.18
339 0.21
340 0.21
341 0.23
342 0.23
343 0.21
344 0.18
345 0.24
346 0.27
347 0.25
348 0.26
349 0.26
350 0.27
351 0.3
352 0.32
353 0.32
354 0.33
355 0.35
356 0.37
357 0.39
358 0.39
359 0.4
360 0.43
361 0.4
362 0.36
363 0.32
364 0.3
365 0.3
366 0.3
367 0.27
368 0.22
369 0.2
370 0.17
371 0.16
372 0.14
373 0.09
374 0.08
375 0.06
376 0.06
377 0.05
378 0.06
379 0.06
380 0.05
381 0.05
382 0.05
383 0.05
384 0.05
385 0.05
386 0.05
387 0.06
388 0.11
389 0.12
390 0.13
391 0.2
392 0.25
393 0.34
394 0.42
395 0.52
396 0.58
397 0.69
398 0.79
399 0.83
400 0.9
401 0.93
402 0.95
403 0.97
404 0.97
405 0.97