FuNGI

F2SWX0

Protein Details

Accession

F2SWX0

Localization Confidence

High

Confidence Score

18.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
161-186	AIEKAKAMVKKKEKKKNAPHPLNFSA	Hydrophilic
386-406	LLEKWKEEERRKNRRENGLPS	Basic
564-605	KTDRSEFKSKLARKKETKEKLGKSSTNKEKARKKNFMMTLGK	Hydrophilic
615-638	VETRATLRAHHERNKRGGKRGNQG	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
153-178	KGSKKRAKAIEKAKAMVKKKEKKKNA
351-357	KRRDRGK
571-636	KSKLARKKETKEKLGKSSTNKEKARKKNFMMTLGKAKAKGKRSLVETRATLRAHHERNKRGGKRGN

Subcellular Location(s)

mito 8, golg 5, nucl 4.5, extr 3, cyto_nucl 3, E.R. 2, vacu 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR027312 Sda1 IPR007949 SDA1_C
Gene Ontology	GO:0005730 C:nucleolus GO:0015031 P:protein transport GO:0042273 P:ribosomal large subunit biogenesis GO:0000055 P:ribosomal large subunit export from nucleus
Pfam	View protein in Pfam PF05285 SDA1

Amino Acid Sequences

MSRLPRNILTLIYSLLQTLFPILVSTPSKTLRAFLFQKIVSDLRSANAKTTNHKLNRTIQTVLFNLVVADRSSSKALWSVKITRELWKRQIWTESKAVEIMKEAALADNEKVIIGGVRFFLGGDKEREELEDESSDDDVIDVGKVKHQATINKGSKKRAKAIEKAKAMVKKKEKKKNAPHPLNFSALHLLHDPQGFAENLFQKHLQNTKAKLNLEQRLLVLQLVSRLVGLHKLTIIQLYSYFLKYLTPKQPSVTSFLASLAQSCHSLVPPDTLEPLIQKIANEFVSEGSAAEVASAGLNAIREICVRQPLAMNDTLLQDLVMYRKSKDKGVMMAAKGLLSLYREVGAEKLKRRDRGKDAAMGLKIGERKSQRYGEEEIGEIEGLELLEKWKEEERRKNRRENGLPSDGESDEDEENENDWAAWNMEEDDSDDSGGWIDVQSDVDIVFSDSEDDEPTAKKAKTDEDATKAGDDKKTEESEAKKISRLATTRILTPADLAKLAELRAAASVNALLPENKRKRLLQQAAANRHADDPLTAAEIEGLAALSAGKQTREEKIAHVNETKTDRSEFKSKLARKKETKEKLGKSSTNKEKARKKNFMMTLGKAKAKGKRSLVETRATLRAHHERNKRGGKRGNQG

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.16
2	0.15
3	0.14
4	0.1
5	0.1
6	0.09
7	0.08
8	0.08
9	0.08
10	0.13
11	0.16
12	0.18
13	0.21
14	0.24
15	0.27
16	0.27
17	0.3
18	0.27
19	0.34
20	0.36
21	0.37
22	0.42
23	0.39
24	0.41
25	0.42
26	0.4
27	0.33
28	0.32
29	0.27
30	0.22
31	0.28
32	0.27
33	0.27
34	0.32
35	0.33
36	0.36
37	0.44
38	0.51
39	0.51
40	0.57
41	0.59
42	0.62
43	0.68
44	0.66
45	0.62
46	0.54
47	0.53
48	0.48
49	0.44
50	0.34
51	0.26
52	0.21
53	0.18
54	0.16
55	0.11
56	0.12
57	0.11
58	0.13
59	0.15
60	0.15
61	0.15
62	0.2
63	0.23
64	0.25
65	0.29
66	0.34
67	0.37
68	0.45
69	0.46
70	0.49
71	0.55
72	0.58
73	0.6
74	0.61
75	0.6
76	0.56
77	0.64
78	0.59
79	0.56
80	0.55
81	0.48
82	0.42
83	0.41
84	0.37
85	0.28
86	0.26
87	0.22
88	0.15
89	0.15
90	0.14
91	0.12
92	0.13
93	0.14
94	0.12
95	0.11
96	0.11
97	0.1
98	0.09
99	0.08
100	0.08
101	0.07
102	0.08
103	0.07
104	0.08
105	0.08
106	0.08
107	0.09
108	0.11
109	0.14
110	0.16
111	0.18
112	0.18
113	0.19
114	0.2
115	0.21
116	0.19
117	0.19
118	0.17
119	0.15
120	0.16
121	0.16
122	0.15
123	0.12
124	0.1
125	0.07
126	0.06
127	0.06
128	0.07
129	0.07
130	0.1
131	0.14
132	0.14
133	0.19
134	0.22
135	0.27
136	0.32
137	0.42
138	0.47
139	0.53
140	0.57
141	0.61
142	0.65
143	0.66
144	0.68
145	0.67
146	0.67
147	0.67
148	0.74
149	0.74
150	0.71
151	0.68
152	0.65
153	0.63
154	0.61
155	0.61
156	0.61
157	0.61
158	0.67
159	0.75
160	0.8
161	0.83
162	0.89
163	0.9
164	0.91
165	0.92
166	0.88
167	0.86
168	0.79
169	0.73
170	0.62
171	0.52
172	0.46
173	0.35
174	0.3
175	0.23
176	0.2
177	0.18
178	0.18
179	0.17
180	0.12
181	0.14
182	0.12
183	0.11
184	0.15
185	0.17
186	0.17
187	0.19
188	0.2
189	0.19
190	0.23
191	0.28
192	0.29
193	0.31
194	0.34
195	0.39
196	0.43
197	0.43
198	0.46
199	0.49
200	0.49
201	0.45
202	0.42
203	0.35
204	0.31
205	0.3
206	0.23
207	0.15
208	0.1
209	0.09
210	0.08
211	0.07
212	0.06
213	0.06
214	0.06
215	0.09
216	0.09
217	0.08
218	0.08
219	0.09
220	0.09
221	0.1
222	0.1
223	0.07
224	0.07
225	0.09
226	0.11
227	0.1
228	0.1
229	0.09
230	0.11
231	0.13
232	0.21
233	0.26
234	0.29
235	0.3
236	0.32
237	0.36
238	0.35
239	0.38
240	0.32
241	0.25
242	0.21
243	0.21
244	0.2
245	0.16
246	0.15
247	0.1
248	0.1
249	0.09
250	0.09
251	0.09
252	0.08
253	0.09
254	0.09
255	0.1
256	0.1
257	0.1
258	0.11
259	0.1
260	0.1
261	0.1
262	0.11
263	0.1
264	0.09
265	0.09
266	0.08
267	0.1
268	0.1
269	0.1
270	0.09
271	0.08
272	0.08
273	0.08
274	0.08
275	0.05
276	0.05
277	0.05
278	0.04
279	0.04
280	0.03
281	0.03
282	0.03
283	0.03
284	0.03
285	0.03
286	0.03
287	0.03
288	0.04
289	0.04
290	0.05
291	0.06
292	0.09
293	0.09
294	0.1
295	0.12
296	0.13
297	0.15
298	0.15
299	0.14
300	0.12
301	0.13
302	0.12
303	0.1
304	0.09
305	0.06
306	0.05
307	0.06
308	0.08
309	0.08
310	0.09
311	0.15
312	0.16
313	0.18
314	0.21
315	0.22
316	0.22
317	0.27
318	0.31
319	0.25
320	0.26
321	0.24
322	0.21
323	0.18
324	0.15
325	0.1
326	0.07
327	0.07
328	0.05
329	0.06
330	0.06
331	0.06
332	0.08
333	0.12
334	0.16
335	0.21
336	0.29
337	0.33
338	0.4
339	0.44
340	0.5
341	0.52
342	0.55
343	0.54
344	0.51
345	0.49
346	0.46
347	0.43
348	0.35
349	0.29
350	0.23
351	0.23
352	0.17
353	0.2
354	0.17
355	0.2
356	0.25
357	0.3
358	0.28
359	0.3
360	0.33
361	0.31
362	0.3
363	0.27
364	0.22
365	0.18
366	0.16
367	0.12
368	0.08
369	0.05
370	0.04
371	0.04
372	0.03
373	0.04
374	0.04
375	0.05
376	0.06
377	0.11
378	0.19
379	0.27
380	0.38
381	0.48
382	0.59
383	0.66
384	0.74
385	0.78
386	0.81
387	0.81
388	0.79
389	0.76
390	0.71
391	0.64
392	0.56
393	0.51
394	0.41
395	0.34
396	0.25
397	0.2
398	0.13
399	0.13
400	0.12
401	0.09
402	0.1
403	0.09
404	0.09
405	0.06
406	0.06
407	0.06
408	0.06
409	0.06
410	0.05
411	0.06
412	0.06
413	0.07
414	0.08
415	0.09
416	0.09
417	0.09
418	0.08
419	0.07
420	0.08
421	0.07
422	0.06
423	0.04
424	0.04
425	0.05
426	0.05
427	0.05
428	0.05
429	0.05
430	0.05
431	0.05
432	0.05
433	0.05
434	0.04
435	0.05
436	0.06
437	0.06
438	0.07
439	0.07
440	0.08
441	0.09
442	0.11
443	0.16
444	0.16
445	0.17
446	0.19
447	0.23
448	0.27
449	0.32
450	0.36
451	0.35
452	0.37
453	0.37
454	0.36
455	0.34
456	0.33
457	0.29
458	0.25
459	0.23
460	0.26
461	0.27
462	0.27
463	0.3
464	0.3
465	0.35
466	0.41
467	0.4
468	0.37
469	0.38
470	0.39
471	0.4
472	0.38
473	0.35
474	0.36
475	0.36
476	0.36
477	0.36
478	0.35
479	0.28
480	0.27
481	0.25
482	0.18
483	0.17
484	0.14
485	0.13
486	0.13
487	0.13
488	0.13
489	0.1
490	0.09
491	0.09
492	0.1
493	0.08
494	0.08
495	0.08
496	0.07
497	0.08
498	0.08
499	0.09
500	0.12
501	0.23
502	0.29
503	0.34
504	0.38
505	0.4
506	0.47
507	0.56
508	0.61
509	0.59
510	0.62
511	0.67
512	0.7
513	0.72
514	0.66
515	0.56
516	0.48
517	0.4
518	0.31
519	0.21
520	0.15
521	0.12
522	0.13
523	0.11
524	0.1
525	0.1
526	0.09
527	0.09
528	0.07
529	0.06
530	0.03
531	0.03
532	0.03
533	0.04
534	0.06
535	0.08
536	0.08
537	0.12
538	0.15
539	0.2
540	0.24
541	0.25
542	0.26
543	0.35
544	0.39
545	0.41
546	0.44
547	0.4
548	0.42
549	0.46
550	0.44
551	0.37
552	0.36
553	0.35
554	0.36
555	0.43
556	0.4
557	0.43
558	0.51
559	0.57
560	0.63
561	0.7
562	0.74
563	0.75
564	0.83
565	0.86
566	0.86
567	0.88
568	0.88
569	0.86
570	0.86
571	0.86
572	0.83
573	0.8
574	0.81
575	0.81
576	0.8
577	0.8
578	0.79
579	0.8
580	0.84
581	0.86
582	0.85
583	0.82
584	0.82
585	0.81
586	0.81
587	0.77
588	0.72
589	0.72
590	0.68
591	0.65
592	0.59
593	0.58
594	0.56
595	0.57
596	0.59
597	0.56
598	0.57
599	0.61
600	0.67
601	0.66
602	0.65
603	0.62
604	0.58
605	0.58
606	0.51
607	0.46
608	0.44
609	0.5
610	0.51
611	0.57
612	0.61
613	0.63
614	0.73
615	0.82
616	0.81
617	0.81
618	0.82

F2SWX0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer