Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

F2SSZ1

Protein Details
Accession F2SSZ1    Localization Confidence Medium Confidence Score 10
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
25-44VSYRTAKYEHLKQRGRLRKEHydrophilic
66-91IQSEPESRDKQQKKRQSSPRIPLVLSHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 13, cyto_nucl 10.333, mito 7.5, cyto_mito 7.166, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007224  TIF_Rrn11  
Gene Ontology GO:0001164  F:RNA polymerase I core promoter sequence-specific DNA binding  
GO:0001181  F:RNA polymerase I general transcription initiation factor activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF04090  RNA_pol_I_TF  
Amino Acid Sequences MSANAYSEQAASYFALPLPLWQQPVSYRTAKYEHLKQRGRLRKEHDDDNEDSDQEGSDGYETDSAIQSEPESRDKQQKKRQSSPRIPLVLSPGEAHQYRISGLPTYRELPGGKFPHKADLDDHDFLDSDDEADSNQDGENSLTTKRKSAKSLNNRQRIEAELSRLNPPIYLAGGNPAKKNTLRLHHLSVVTAILHRCLMEGDYLRAGRALGLILRDNFGGHPVDVRNSGRWATGAEILLQTGSNASKPADASNRNHATDGDRAWFTREGFQRAKEYYERLIIQYQYRKAAPNALSPLHFYPAMFGLWISVSQEESRLAREAGEPTRSPGASVVDSNDYADPDTRMEEYTERDEKSLDDKKATIDACFKELKDAQQIARQMDDLLVSPPFSDSHELLRLRGMVSQWIGDLYLSSVLPNGDESGLAGMKDDDEGEDSFQDDGGGSGNAHLDAKILRIEIDAAKEKRLAEFEKAKSFFNKAQARFERNQSSVVTL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.11
2 0.13
3 0.13
4 0.15
5 0.17
6 0.19
7 0.21
8 0.2
9 0.22
10 0.24
11 0.27
12 0.31
13 0.32
14 0.3
15 0.33
16 0.36
17 0.41
18 0.44
19 0.52
20 0.56
21 0.62
22 0.67
23 0.7
24 0.77
25 0.8
26 0.8
27 0.78
28 0.77
29 0.77
30 0.76
31 0.78
32 0.74
33 0.71
34 0.66
35 0.64
36 0.57
37 0.47
38 0.41
39 0.32
40 0.24
41 0.18
42 0.15
43 0.09
44 0.07
45 0.07
46 0.07
47 0.08
48 0.08
49 0.1
50 0.11
51 0.12
52 0.11
53 0.11
54 0.11
55 0.15
56 0.18
57 0.23
58 0.26
59 0.29
60 0.4
61 0.48
62 0.58
63 0.63
64 0.7
65 0.74
66 0.81
67 0.87
68 0.88
69 0.89
70 0.88
71 0.88
72 0.82
73 0.73
74 0.64
75 0.6
76 0.51
77 0.41
78 0.33
79 0.24
80 0.24
81 0.24
82 0.24
83 0.19
84 0.17
85 0.17
86 0.18
87 0.18
88 0.17
89 0.18
90 0.19
91 0.21
92 0.23
93 0.23
94 0.24
95 0.23
96 0.22
97 0.3
98 0.33
99 0.33
100 0.36
101 0.36
102 0.42
103 0.42
104 0.41
105 0.35
106 0.36
107 0.4
108 0.36
109 0.35
110 0.27
111 0.26
112 0.24
113 0.23
114 0.15
115 0.09
116 0.07
117 0.07
118 0.06
119 0.07
120 0.07
121 0.06
122 0.06
123 0.06
124 0.06
125 0.07
126 0.08
127 0.08
128 0.12
129 0.16
130 0.17
131 0.22
132 0.28
133 0.32
134 0.38
135 0.46
136 0.54
137 0.6
138 0.71
139 0.75
140 0.79
141 0.75
142 0.7
143 0.63
144 0.56
145 0.52
146 0.43
147 0.37
148 0.31
149 0.32
150 0.33
151 0.32
152 0.28
153 0.21
154 0.19
155 0.15
156 0.12
157 0.11
158 0.08
159 0.13
160 0.17
161 0.19
162 0.2
163 0.2
164 0.22
165 0.22
166 0.28
167 0.28
168 0.3
169 0.34
170 0.37
171 0.41
172 0.43
173 0.43
174 0.37
175 0.32
176 0.26
177 0.2
178 0.17
179 0.13
180 0.08
181 0.08
182 0.08
183 0.07
184 0.07
185 0.07
186 0.08
187 0.09
188 0.09
189 0.12
190 0.12
191 0.12
192 0.11
193 0.11
194 0.08
195 0.08
196 0.07
197 0.05
198 0.06
199 0.08
200 0.08
201 0.09
202 0.09
203 0.09
204 0.08
205 0.09
206 0.09
207 0.07
208 0.09
209 0.09
210 0.1
211 0.12
212 0.14
213 0.13
214 0.14
215 0.15
216 0.13
217 0.12
218 0.12
219 0.11
220 0.12
221 0.11
222 0.1
223 0.1
224 0.09
225 0.09
226 0.08
227 0.07
228 0.05
229 0.05
230 0.04
231 0.05
232 0.05
233 0.06
234 0.07
235 0.09
236 0.14
237 0.18
238 0.21
239 0.29
240 0.33
241 0.33
242 0.33
243 0.31
244 0.28
245 0.27
246 0.25
247 0.19
248 0.15
249 0.15
250 0.17
251 0.18
252 0.16
253 0.21
254 0.22
255 0.26
256 0.27
257 0.29
258 0.31
259 0.3
260 0.33
261 0.27
262 0.27
263 0.23
264 0.25
265 0.23
266 0.21
267 0.23
268 0.21
269 0.24
270 0.27
271 0.27
272 0.27
273 0.27
274 0.27
275 0.25
276 0.31
277 0.28
278 0.27
279 0.29
280 0.27
281 0.26
282 0.27
283 0.27
284 0.22
285 0.2
286 0.14
287 0.12
288 0.12
289 0.11
290 0.09
291 0.08
292 0.06
293 0.06
294 0.07
295 0.06
296 0.05
297 0.06
298 0.06
299 0.08
300 0.08
301 0.09
302 0.1
303 0.11
304 0.11
305 0.11
306 0.13
307 0.16
308 0.18
309 0.21
310 0.2
311 0.21
312 0.24
313 0.23
314 0.22
315 0.19
316 0.19
317 0.16
318 0.16
319 0.16
320 0.14
321 0.15
322 0.16
323 0.14
324 0.12
325 0.12
326 0.12
327 0.11
328 0.09
329 0.11
330 0.1
331 0.11
332 0.12
333 0.13
334 0.15
335 0.21
336 0.25
337 0.24
338 0.23
339 0.23
340 0.23
341 0.3
342 0.34
343 0.29
344 0.27
345 0.27
346 0.28
347 0.34
348 0.33
349 0.27
350 0.26
351 0.25
352 0.27
353 0.28
354 0.27
355 0.27
356 0.29
357 0.3
358 0.31
359 0.33
360 0.32
361 0.35
362 0.38
363 0.33
364 0.32
365 0.29
366 0.22
367 0.19
368 0.17
369 0.13
370 0.11
371 0.1
372 0.09
373 0.09
374 0.09
375 0.09
376 0.1
377 0.13
378 0.13
379 0.17
380 0.24
381 0.25
382 0.24
383 0.26
384 0.25
385 0.22
386 0.23
387 0.19
388 0.16
389 0.17
390 0.17
391 0.14
392 0.14
393 0.13
394 0.11
395 0.1
396 0.07
397 0.08
398 0.08
399 0.07
400 0.08
401 0.08
402 0.09
403 0.09
404 0.09
405 0.07
406 0.07
407 0.08
408 0.09
409 0.1
410 0.09
411 0.09
412 0.08
413 0.08
414 0.09
415 0.09
416 0.07
417 0.09
418 0.1
419 0.1
420 0.11
421 0.11
422 0.11
423 0.11
424 0.1
425 0.08
426 0.07
427 0.07
428 0.07
429 0.06
430 0.07
431 0.08
432 0.09
433 0.09
434 0.09
435 0.09
436 0.09
437 0.11
438 0.12
439 0.11
440 0.11
441 0.11
442 0.14
443 0.15
444 0.21
445 0.28
446 0.28
447 0.3
448 0.33
449 0.33
450 0.33
451 0.37
452 0.34
453 0.34
454 0.42
455 0.45
456 0.53
457 0.54
458 0.53
459 0.52
460 0.54
461 0.51
462 0.51
463 0.55
464 0.49
465 0.58
466 0.63
467 0.68
468 0.67
469 0.71
470 0.69
471 0.62
472 0.62