Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q59LX5

Protein Details
Accession Q59LX5    Localization Confidence Low Confidence Score 9.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
31-51CRHGEKCSKKHLKPISSRTILHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 15, cyto_nucl 11, mito 5, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR003954  RRM_dom_euk  
IPR009145  U2AF_small  
IPR000571  Znf_CCCH  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0089701  C:U2AF complex  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0030628  F:pre-mRNA 3'-splice site binding  
GO:0007155  P:cell adhesion  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
GO:1900189  P:positive regulation of cell adhesion involved in single-species biofilm formation  
GO:0010811  P:positive regulation of cell-substrate adhesion  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
GO:0044011  P:single-species biofilm formation on inanimate substrate  
KEGG cal:CAALFM_C105090WA  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00642  zf-CCCH  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
PS50103  ZF_C3H1  
Amino Acid Sequences MNRSSYSSQSDNRYSRNPAVLCSFYSKIGACRHGEKCSKKHLKPISSRTILLANLYQNPTLNDDDYGHANGIGSETSQIIDNESVIKNSDTVGTVSQIDDSPHSNSGEVTKDETVETQEVETENSENIAETGDVKIDHNEDQKQIEDVKESDKVESSEEVQQDDKLHKEDTLEKESEDNIKQDENIEDAKLEDTEKDKLPEFTISQSQKDFDQFFQDIFVHISKLGQIRDIAVCENENNHLAGNVYVMFESAEDAYNANLQLNQEWYNGKPVYSDLSPVNDFNDACCEEYRDYHDCQRGAMCNYMHVRLPSSDIEESLYESQAKSYMLKQLEELKKELPGDIRSSSSTNDDETNGNENGISSTMAVLEQLS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.58
2 0.57
3 0.6
4 0.53
5 0.47
6 0.48
7 0.45
8 0.42
9 0.41
10 0.37
11 0.29
12 0.31
13 0.29
14 0.29
15 0.33
16 0.36
17 0.33
18 0.4
19 0.43
20 0.49
21 0.57
22 0.6
23 0.6
24 0.66
25 0.73
26 0.69
27 0.74
28 0.75
29 0.77
30 0.78
31 0.81
32 0.8
33 0.74
34 0.71
35 0.63
36 0.57
37 0.47
38 0.39
39 0.33
40 0.25
41 0.27
42 0.28
43 0.26
44 0.24
45 0.24
46 0.26
47 0.24
48 0.22
49 0.18
50 0.18
51 0.19
52 0.2
53 0.2
54 0.17
55 0.14
56 0.13
57 0.12
58 0.11
59 0.09
60 0.07
61 0.06
62 0.06
63 0.07
64 0.08
65 0.08
66 0.09
67 0.09
68 0.1
69 0.13
70 0.13
71 0.13
72 0.13
73 0.13
74 0.12
75 0.12
76 0.13
77 0.1
78 0.11
79 0.11
80 0.11
81 0.12
82 0.11
83 0.12
84 0.11
85 0.11
86 0.11
87 0.13
88 0.14
89 0.15
90 0.16
91 0.15
92 0.14
93 0.16
94 0.18
95 0.17
96 0.18
97 0.16
98 0.16
99 0.16
100 0.16
101 0.16
102 0.13
103 0.13
104 0.1
105 0.11
106 0.1
107 0.11
108 0.11
109 0.09
110 0.08
111 0.08
112 0.08
113 0.07
114 0.06
115 0.06
116 0.05
117 0.05
118 0.06
119 0.06
120 0.07
121 0.07
122 0.08
123 0.09
124 0.12
125 0.15
126 0.17
127 0.18
128 0.19
129 0.19
130 0.19
131 0.19
132 0.17
133 0.15
134 0.14
135 0.15
136 0.18
137 0.17
138 0.16
139 0.17
140 0.17
141 0.16
142 0.16
143 0.16
144 0.16
145 0.16
146 0.17
147 0.16
148 0.16
149 0.16
150 0.17
151 0.16
152 0.13
153 0.13
154 0.13
155 0.14
156 0.2
157 0.23
158 0.27
159 0.25
160 0.24
161 0.24
162 0.25
163 0.27
164 0.21
165 0.17
166 0.13
167 0.13
168 0.13
169 0.13
170 0.12
171 0.1
172 0.1
173 0.09
174 0.08
175 0.08
176 0.08
177 0.08
178 0.07
179 0.07
180 0.08
181 0.1
182 0.12
183 0.13
184 0.13
185 0.14
186 0.15
187 0.16
188 0.15
189 0.15
190 0.21
191 0.21
192 0.22
193 0.22
194 0.22
195 0.2
196 0.23
197 0.22
198 0.15
199 0.18
200 0.17
201 0.16
202 0.17
203 0.17
204 0.14
205 0.14
206 0.14
207 0.09
208 0.09
209 0.09
210 0.09
211 0.12
212 0.12
213 0.12
214 0.11
215 0.13
216 0.14
217 0.14
218 0.13
219 0.1
220 0.11
221 0.1
222 0.11
223 0.1
224 0.1
225 0.1
226 0.09
227 0.08
228 0.08
229 0.08
230 0.08
231 0.07
232 0.06
233 0.06
234 0.06
235 0.06
236 0.05
237 0.06
238 0.06
239 0.06
240 0.06
241 0.06
242 0.06
243 0.08
244 0.08
245 0.07
246 0.08
247 0.08
248 0.09
249 0.11
250 0.13
251 0.13
252 0.14
253 0.15
254 0.21
255 0.21
256 0.2
257 0.18
258 0.17
259 0.19
260 0.18
261 0.2
262 0.15
263 0.19
264 0.2
265 0.2
266 0.2
267 0.19
268 0.18
269 0.16
270 0.2
271 0.16
272 0.17
273 0.17
274 0.19
275 0.18
276 0.2
277 0.25
278 0.24
279 0.27
280 0.33
281 0.38
282 0.35
283 0.35
284 0.37
285 0.36
286 0.35
287 0.37
288 0.3
289 0.3
290 0.32
291 0.33
292 0.31
293 0.27
294 0.27
295 0.22
296 0.26
297 0.21
298 0.24
299 0.23
300 0.2
301 0.22
302 0.19
303 0.22
304 0.2
305 0.19
306 0.15
307 0.15
308 0.15
309 0.15
310 0.16
311 0.14
312 0.15
313 0.21
314 0.23
315 0.23
316 0.26
317 0.34
318 0.4
319 0.42
320 0.42
321 0.36
322 0.37
323 0.38
324 0.38
325 0.33
326 0.29
327 0.3
328 0.3
329 0.31
330 0.3
331 0.31
332 0.29
333 0.28
334 0.26
335 0.25
336 0.24
337 0.23
338 0.22
339 0.24
340 0.27
341 0.23
342 0.21
343 0.19
344 0.18
345 0.17
346 0.16
347 0.13
348 0.08
349 0.08
350 0.09
351 0.09