Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

F2SNT7

Protein Details
Accession F2SNT7    Localization Confidence High Confidence Score 17.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
55-76AASLRFQPTKRPQLPSQRLKAKHydrophilic
128-154GYYGGEKRQRGGRKKRKKNYESEVILQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
134-145KRQRGGRKKRKK
401-425KKKSDSEGRGVAPPGGPRGKIVGGG
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto_nucl 14.5, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000467  G_patch_dom  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR040052  RBM17  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0045292  P:mRNA cis splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF01585  G-patch  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50174  G_PATCH  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MSSEKMTTPKPGMSLYANLLDTHESASISRAPVVFKQATDASQDDPAMKKQQISAASLRFQPTKRPQLPSQRLKAKSGISKPPVIISSASPATPDQGTTSGAVTAGRPTGKSTLADWTATADDDDVNGYYGGEKRQRGGRKKRKKNYESEVILQNWDDIYDPTRPNSYEAYKHSDEKIQEVREWKDRLYAHRLAQQYNSDSDSDEERSRLQMNRQFAPPPSFAPPPNLNAPPEESPEPERTFSEAVPQPAVEIPDDSTGEEAYARRLRLSANINQPEPSPQPSQPSQLSQPSPTDEAPASTAPTSQNSNTATISRPPVRYALPAAPGDLPATEAELEATLANEQEDVNKEGDEDAPRSLRPGQKGFAERLLTKYGWTKGSGLGANESGIVNPLQVKVQKQKKKSDSEGRGVAPPGGPRGKIVGGGRKQEEQGKFGPMSDVVILHGMVDGLDLDAELESGELMQEIGDECGEKYGRVERVYIDRNSKDRIPVFIKFTNQLSALRAVNALEGRIFNGNTITARFFDSESFEEGRYD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.33
2 0.3
3 0.32
4 0.3
5 0.27
6 0.27
7 0.25
8 0.22
9 0.2
10 0.17
11 0.13
12 0.12
13 0.15
14 0.17
15 0.16
16 0.19
17 0.18
18 0.2
19 0.22
20 0.29
21 0.29
22 0.25
23 0.29
24 0.29
25 0.29
26 0.3
27 0.29
28 0.24
29 0.25
30 0.26
31 0.23
32 0.24
33 0.27
34 0.29
35 0.29
36 0.29
37 0.29
38 0.34
39 0.34
40 0.37
41 0.39
42 0.37
43 0.39
44 0.41
45 0.42
46 0.42
47 0.4
48 0.45
49 0.48
50 0.54
51 0.58
52 0.61
53 0.66
54 0.71
55 0.81
56 0.81
57 0.81
58 0.8
59 0.76
60 0.73
61 0.7
62 0.66
63 0.64
64 0.62
65 0.62
66 0.57
67 0.58
68 0.55
69 0.53
70 0.47
71 0.4
72 0.33
73 0.24
74 0.26
75 0.22
76 0.21
77 0.19
78 0.18
79 0.18
80 0.17
81 0.16
82 0.12
83 0.12
84 0.14
85 0.13
86 0.14
87 0.12
88 0.12
89 0.11
90 0.1
91 0.1
92 0.12
93 0.12
94 0.12
95 0.14
96 0.16
97 0.18
98 0.19
99 0.19
100 0.23
101 0.24
102 0.24
103 0.21
104 0.21
105 0.19
106 0.18
107 0.17
108 0.1
109 0.08
110 0.08
111 0.09
112 0.07
113 0.07
114 0.07
115 0.07
116 0.08
117 0.1
118 0.14
119 0.19
120 0.2
121 0.22
122 0.3
123 0.4
124 0.48
125 0.58
126 0.65
127 0.7
128 0.81
129 0.88
130 0.91
131 0.91
132 0.9
133 0.87
134 0.86
135 0.8
136 0.74
137 0.7
138 0.59
139 0.52
140 0.42
141 0.34
142 0.23
143 0.18
144 0.14
145 0.08
146 0.09
147 0.14
148 0.15
149 0.16
150 0.19
151 0.19
152 0.21
153 0.24
154 0.26
155 0.26
156 0.3
157 0.36
158 0.36
159 0.38
160 0.37
161 0.38
162 0.34
163 0.34
164 0.37
165 0.31
166 0.32
167 0.34
168 0.36
169 0.39
170 0.4
171 0.34
172 0.34
173 0.34
174 0.37
175 0.39
176 0.41
177 0.36
178 0.41
179 0.43
180 0.38
181 0.38
182 0.37
183 0.31
184 0.28
185 0.26
186 0.2
187 0.18
188 0.18
189 0.17
190 0.17
191 0.16
192 0.15
193 0.14
194 0.15
195 0.18
196 0.19
197 0.23
198 0.25
199 0.28
200 0.31
201 0.32
202 0.33
203 0.32
204 0.35
205 0.29
206 0.27
207 0.27
208 0.26
209 0.25
210 0.28
211 0.28
212 0.26
213 0.3
214 0.29
215 0.26
216 0.24
217 0.27
218 0.23
219 0.24
220 0.22
221 0.19
222 0.2
223 0.25
224 0.25
225 0.23
226 0.22
227 0.21
228 0.21
229 0.19
230 0.23
231 0.2
232 0.2
233 0.19
234 0.18
235 0.17
236 0.16
237 0.17
238 0.1
239 0.08
240 0.08
241 0.09
242 0.09
243 0.08
244 0.08
245 0.07
246 0.07
247 0.07
248 0.06
249 0.09
250 0.12
251 0.12
252 0.12
253 0.12
254 0.13
255 0.17
256 0.21
257 0.24
258 0.3
259 0.33
260 0.33
261 0.33
262 0.33
263 0.32
264 0.29
265 0.26
266 0.21
267 0.19
268 0.23
269 0.24
270 0.28
271 0.26
272 0.27
273 0.26
274 0.29
275 0.29
276 0.26
277 0.26
278 0.24
279 0.25
280 0.22
281 0.21
282 0.15
283 0.14
284 0.14
285 0.13
286 0.12
287 0.1
288 0.11
289 0.1
290 0.12
291 0.13
292 0.12
293 0.16
294 0.16
295 0.17
296 0.17
297 0.17
298 0.17
299 0.18
300 0.23
301 0.23
302 0.23
303 0.22
304 0.24
305 0.24
306 0.24
307 0.25
308 0.22
309 0.21
310 0.21
311 0.21
312 0.19
313 0.18
314 0.17
315 0.13
316 0.11
317 0.07
318 0.08
319 0.06
320 0.06
321 0.06
322 0.05
323 0.06
324 0.05
325 0.05
326 0.04
327 0.04
328 0.04
329 0.05
330 0.05
331 0.06
332 0.09
333 0.11
334 0.11
335 0.11
336 0.11
337 0.11
338 0.14
339 0.14
340 0.13
341 0.13
342 0.14
343 0.14
344 0.16
345 0.21
346 0.22
347 0.25
348 0.28
349 0.28
350 0.33
351 0.36
352 0.37
353 0.37
354 0.36
355 0.32
356 0.31
357 0.33
358 0.27
359 0.25
360 0.28
361 0.26
362 0.24
363 0.25
364 0.23
365 0.21
366 0.25
367 0.25
368 0.21
369 0.19
370 0.17
371 0.16
372 0.16
373 0.14
374 0.09
375 0.09
376 0.08
377 0.07
378 0.07
379 0.08
380 0.1
381 0.12
382 0.17
383 0.26
384 0.36
385 0.43
386 0.49
387 0.59
388 0.65
389 0.72
390 0.77
391 0.78
392 0.76
393 0.76
394 0.75
395 0.66
396 0.61
397 0.53
398 0.44
399 0.35
400 0.29
401 0.28
402 0.24
403 0.22
404 0.2
405 0.22
406 0.22
407 0.24
408 0.27
409 0.3
410 0.33
411 0.39
412 0.41
413 0.4
414 0.42
415 0.45
416 0.44
417 0.38
418 0.35
419 0.34
420 0.32
421 0.3
422 0.29
423 0.21
424 0.21
425 0.17
426 0.15
427 0.1
428 0.11
429 0.1
430 0.08
431 0.08
432 0.06
433 0.05
434 0.05
435 0.05
436 0.04
437 0.04
438 0.03
439 0.04
440 0.04
441 0.04
442 0.03
443 0.03
444 0.03
445 0.03
446 0.03
447 0.03
448 0.03
449 0.03
450 0.04
451 0.04
452 0.05
453 0.05
454 0.06
455 0.06
456 0.11
457 0.11
458 0.11
459 0.13
460 0.19
461 0.24
462 0.25
463 0.26
464 0.25
465 0.34
466 0.4
467 0.44
468 0.46
469 0.47
470 0.49
471 0.53
472 0.53
473 0.52
474 0.48
475 0.5
476 0.48
477 0.47
478 0.5
479 0.49
480 0.5
481 0.46
482 0.46
483 0.42
484 0.38
485 0.34
486 0.31
487 0.3
488 0.27
489 0.24
490 0.23
491 0.19
492 0.21
493 0.2
494 0.18
495 0.15
496 0.14
497 0.16
498 0.19
499 0.18
500 0.15
501 0.16
502 0.17
503 0.17
504 0.19
505 0.19
506 0.16
507 0.19
508 0.2
509 0.19
510 0.19
511 0.23
512 0.23
513 0.26
514 0.27