Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

F2SHY4

Protein Details
Accession F2SHY4    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-23MITRNKGCCRRRRIPISTDKMSSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
157-186RRKLRIKLERSIARRQARLELEKGNTKKRK
Subcellular Location(s) nucl 13, mito 7, cyto 3, plas 2, cyto_pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR025654  PEX2/10  
IPR006845  Pex_N  
IPR001841  Znf_RING  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
IPR017907  Znf_RING_CS  
Gene Ontology GO:0005778  C:peroxisomal membrane  
GO:0016740  F:transferase activity  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0016562  P:protein import into peroxisome matrix, receptor recycling  
GO:0016567  P:protein ubiquitination  
Pfam View protein in Pfam  
PF04757  Pex2_Pex12  
PF13923  zf-C3HC4_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00518  ZF_RING_1  
PS50089  ZF_RING_2  
CDD cd16527  RING-HC_PEX10  
Amino Acid Sequences MITRNKGCCRRRRIPISTDKMSSDSLFDSSMADAALSKTPKPSYFFPWATSPDIIRAHEKDNYITSTLSTQAQSIIRTLRGQQYAHAHSDAIKHAIEVLYLSLTTLLGNRTLGEEYCDVVQLEDDTLQLPSLGRRAGYIVSSILVPSILQRLLPSFRRKLRIKLERSIARRQARLELEKGNTKKRKEAGFSLRVQRYILEHLNSITSLSPFFAVNLAAFYFSGAYYHLSKRVWGLRYVFTKRIGDSEERIGYEVLGVLLVLQIAVQAIVHAKEVIESIQLEEAGQVSATDSAAKGAGTPGLKSISMPDGMTLLAPEEARYDMSVEKDALAMSWIPAGPQRKCTLCLDPFKDPSVSTCGHVFCWTCIRDWVQEKPECPLCRQEAIASKILPLRG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.85
2 0.87
3 0.86
4 0.82
5 0.76
6 0.67
7 0.6
8 0.53
9 0.44
10 0.35
11 0.27
12 0.22
13 0.19
14 0.17
15 0.15
16 0.13
17 0.13
18 0.1
19 0.09
20 0.08
21 0.09
22 0.15
23 0.15
24 0.16
25 0.2
26 0.24
27 0.28
28 0.32
29 0.34
30 0.36
31 0.44
32 0.45
33 0.44
34 0.46
35 0.46
36 0.46
37 0.44
38 0.37
39 0.34
40 0.35
41 0.34
42 0.33
43 0.32
44 0.32
45 0.35
46 0.35
47 0.32
48 0.32
49 0.33
50 0.28
51 0.26
52 0.23
53 0.2
54 0.2
55 0.2
56 0.16
57 0.14
58 0.17
59 0.18
60 0.18
61 0.19
62 0.19
63 0.19
64 0.2
65 0.24
66 0.27
67 0.3
68 0.29
69 0.31
70 0.36
71 0.38
72 0.4
73 0.37
74 0.29
75 0.27
76 0.3
77 0.28
78 0.22
79 0.18
80 0.15
81 0.16
82 0.15
83 0.13
84 0.1
85 0.09
86 0.07
87 0.07
88 0.07
89 0.05
90 0.05
91 0.05
92 0.06
93 0.07
94 0.07
95 0.07
96 0.08
97 0.09
98 0.1
99 0.1
100 0.11
101 0.11
102 0.11
103 0.11
104 0.12
105 0.1
106 0.09
107 0.1
108 0.07
109 0.07
110 0.07
111 0.06
112 0.06
113 0.06
114 0.06
115 0.06
116 0.06
117 0.06
118 0.08
119 0.08
120 0.08
121 0.08
122 0.1
123 0.1
124 0.1
125 0.1
126 0.08
127 0.08
128 0.08
129 0.08
130 0.06
131 0.06
132 0.05
133 0.05
134 0.07
135 0.06
136 0.06
137 0.07
138 0.09
139 0.14
140 0.2
141 0.25
142 0.3
143 0.35
144 0.44
145 0.47
146 0.53
147 0.59
148 0.63
149 0.63
150 0.63
151 0.67
152 0.65
153 0.67
154 0.68
155 0.66
156 0.6
157 0.57
158 0.51
159 0.49
160 0.47
161 0.45
162 0.39
163 0.35
164 0.33
165 0.38
166 0.39
167 0.42
168 0.44
169 0.42
170 0.44
171 0.45
172 0.48
173 0.44
174 0.5
175 0.49
176 0.5
177 0.53
178 0.56
179 0.52
180 0.47
181 0.43
182 0.35
183 0.28
184 0.25
185 0.23
186 0.16
187 0.15
188 0.14
189 0.15
190 0.14
191 0.13
192 0.09
193 0.07
194 0.06
195 0.06
196 0.06
197 0.06
198 0.06
199 0.06
200 0.06
201 0.05
202 0.06
203 0.05
204 0.05
205 0.05
206 0.05
207 0.05
208 0.04
209 0.05
210 0.05
211 0.07
212 0.09
213 0.1
214 0.14
215 0.13
216 0.14
217 0.18
218 0.24
219 0.23
220 0.24
221 0.26
222 0.29
223 0.36
224 0.4
225 0.39
226 0.37
227 0.37
228 0.34
229 0.33
230 0.3
231 0.26
232 0.24
233 0.26
234 0.25
235 0.23
236 0.24
237 0.21
238 0.18
239 0.15
240 0.13
241 0.07
242 0.05
243 0.04
244 0.03
245 0.03
246 0.03
247 0.03
248 0.02
249 0.02
250 0.02
251 0.02
252 0.02
253 0.03
254 0.04
255 0.04
256 0.05
257 0.05
258 0.05
259 0.06
260 0.06
261 0.06
262 0.07
263 0.07
264 0.07
265 0.08
266 0.08
267 0.08
268 0.07
269 0.07
270 0.06
271 0.06
272 0.05
273 0.05
274 0.05
275 0.05
276 0.06
277 0.05
278 0.06
279 0.06
280 0.06
281 0.06
282 0.06
283 0.09
284 0.1
285 0.1
286 0.11
287 0.13
288 0.13
289 0.13
290 0.15
291 0.14
292 0.15
293 0.14
294 0.13
295 0.12
296 0.12
297 0.11
298 0.09
299 0.07
300 0.07
301 0.07
302 0.07
303 0.08
304 0.09
305 0.09
306 0.1
307 0.1
308 0.11
309 0.13
310 0.15
311 0.14
312 0.14
313 0.13
314 0.13
315 0.11
316 0.11
317 0.09
318 0.07
319 0.09
320 0.09
321 0.09
322 0.14
323 0.21
324 0.22
325 0.27
326 0.32
327 0.32
328 0.36
329 0.4
330 0.45
331 0.45
332 0.53
333 0.53
334 0.56
335 0.57
336 0.56
337 0.53
338 0.44
339 0.4
340 0.36
341 0.31
342 0.26
343 0.27
344 0.25
345 0.25
346 0.29
347 0.27
348 0.24
349 0.3
350 0.29
351 0.26
352 0.3
353 0.32
354 0.36
355 0.4
356 0.46
357 0.47
358 0.51
359 0.51
360 0.53
361 0.59
362 0.53
363 0.51
364 0.51
365 0.47
366 0.46
367 0.46
368 0.46
369 0.46
370 0.49
371 0.51
372 0.42
373 0.41