Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q2HDX4

Protein Details
Accession Q2HDX4    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
364-383LPPPNKAPNQPLKPRPKGLSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
159-160RK
377-380PRPK
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 9.5, mito 7, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010684  RNA_pol_II_trans_fac_SIII_A  
Gene Ontology GO:0070449  C:elongin complex  
GO:0006368  P:transcription elongation by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF06881  Elongin_A  
Amino Acid Sequences MAQQRTLVETPLGPRLVVEVPLGARSLAEMSLKVAIDNVKMIQSLGDIPPCYLDPILQAVKSAEQLHIIEINSYDIYDETEKHWKRIIKKDFPILANRHDYVPQNRKSWHKIYNKYKQLDNEQLAAATEKLMQGFAVHTQEKQSRASTIISAEKGGKLRKTKAKSGFNTPRSDNSFISNTRAQLRREAFRFNRPTPSGQLPVRPNQIKKPPPAMVDDHRRMACGNSIPEPPPMIRTPRQRSAPNATGSAQNRKEGESRLLQIKNGGRPNTGPAKNVLSFSDDEGPNDSLPNDADLFGDADDDDLFGDLEQEKKASSAPSPQKSRPTPQPAPTQSSKRRRIVEDIDTEQPTKRPRGFETTTTSALPPPNKAPNQPLKPRPKGLSAAPGINQAPRKMPPGSALKAAAPSAAPPRRSFSAHTGFSQPPRGHPPPES
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.23
3 0.23
4 0.22
5 0.19
6 0.15
7 0.15
8 0.17
9 0.17
10 0.13
11 0.11
12 0.11
13 0.11
14 0.1
15 0.1
16 0.1
17 0.11
18 0.15
19 0.15
20 0.14
21 0.15
22 0.15
23 0.15
24 0.17
25 0.16
26 0.14
27 0.14
28 0.14
29 0.12
30 0.12
31 0.14
32 0.15
33 0.18
34 0.17
35 0.17
36 0.19
37 0.19
38 0.19
39 0.16
40 0.14
41 0.11
42 0.17
43 0.2
44 0.18
45 0.18
46 0.18
47 0.19
48 0.22
49 0.21
50 0.16
51 0.16
52 0.17
53 0.17
54 0.19
55 0.18
56 0.16
57 0.15
58 0.16
59 0.13
60 0.12
61 0.11
62 0.08
63 0.11
64 0.11
65 0.12
66 0.14
67 0.25
68 0.26
69 0.28
70 0.34
71 0.36
72 0.43
73 0.53
74 0.59
75 0.59
76 0.64
77 0.71
78 0.72
79 0.7
80 0.7
81 0.64
82 0.59
83 0.55
84 0.5
85 0.42
86 0.39
87 0.41
88 0.42
89 0.48
90 0.47
91 0.47
92 0.5
93 0.56
94 0.6
95 0.61
96 0.61
97 0.62
98 0.66
99 0.72
100 0.78
101 0.8
102 0.76
103 0.73
104 0.69
105 0.67
106 0.66
107 0.58
108 0.49
109 0.4
110 0.37
111 0.33
112 0.28
113 0.2
114 0.11
115 0.1
116 0.08
117 0.08
118 0.07
119 0.07
120 0.06
121 0.07
122 0.09
123 0.13
124 0.13
125 0.13
126 0.18
127 0.21
128 0.23
129 0.25
130 0.23
131 0.2
132 0.22
133 0.23
134 0.19
135 0.19
136 0.21
137 0.19
138 0.19
139 0.19
140 0.19
141 0.21
142 0.23
143 0.25
144 0.26
145 0.34
146 0.41
147 0.46
148 0.52
149 0.58
150 0.65
151 0.63
152 0.69
153 0.72
154 0.68
155 0.68
156 0.61
157 0.58
158 0.53
159 0.53
160 0.43
161 0.36
162 0.34
163 0.3
164 0.33
165 0.29
166 0.25
167 0.28
168 0.32
169 0.29
170 0.33
171 0.35
172 0.36
173 0.36
174 0.43
175 0.4
176 0.45
177 0.51
178 0.46
179 0.5
180 0.47
181 0.47
182 0.43
183 0.44
184 0.4
185 0.34
186 0.39
187 0.34
188 0.37
189 0.42
190 0.41
191 0.39
192 0.4
193 0.48
194 0.47
195 0.48
196 0.5
197 0.45
198 0.43
199 0.45
200 0.42
201 0.39
202 0.43
203 0.41
204 0.39
205 0.35
206 0.34
207 0.31
208 0.27
209 0.24
210 0.17
211 0.16
212 0.15
213 0.17
214 0.18
215 0.19
216 0.19
217 0.16
218 0.17
219 0.17
220 0.2
221 0.24
222 0.32
223 0.39
224 0.44
225 0.5
226 0.49
227 0.53
228 0.56
229 0.56
230 0.49
231 0.43
232 0.38
233 0.38
234 0.38
235 0.41
236 0.34
237 0.31
238 0.29
239 0.29
240 0.31
241 0.27
242 0.29
243 0.23
244 0.25
245 0.29
246 0.29
247 0.27
248 0.3
249 0.32
250 0.35
251 0.36
252 0.35
253 0.28
254 0.28
255 0.34
256 0.38
257 0.35
258 0.3
259 0.27
260 0.31
261 0.31
262 0.31
263 0.27
264 0.2
265 0.19
266 0.21
267 0.25
268 0.2
269 0.19
270 0.21
271 0.21
272 0.18
273 0.18
274 0.16
275 0.1
276 0.1
277 0.11
278 0.09
279 0.08
280 0.08
281 0.08
282 0.09
283 0.08
284 0.08
285 0.06
286 0.06
287 0.05
288 0.05
289 0.04
290 0.04
291 0.04
292 0.04
293 0.05
294 0.05
295 0.07
296 0.07
297 0.08
298 0.08
299 0.08
300 0.1
301 0.1
302 0.11
303 0.2
304 0.29
305 0.38
306 0.45
307 0.49
308 0.57
309 0.6
310 0.66
311 0.66
312 0.67
313 0.66
314 0.66
315 0.72
316 0.68
317 0.7
318 0.69
319 0.69
320 0.69
321 0.72
322 0.75
323 0.72
324 0.73
325 0.69
326 0.71
327 0.68
328 0.66
329 0.63
330 0.58
331 0.56
332 0.52
333 0.49
334 0.42
335 0.39
336 0.36
337 0.36
338 0.36
339 0.35
340 0.37
341 0.45
342 0.48
343 0.5
344 0.54
345 0.52
346 0.5
347 0.47
348 0.43
349 0.37
350 0.38
351 0.34
352 0.3
353 0.31
354 0.38
355 0.4
356 0.43
357 0.49
358 0.55
359 0.62
360 0.68
361 0.72
362 0.73
363 0.78
364 0.81
365 0.76
366 0.72
367 0.67
368 0.62
369 0.61
370 0.54
371 0.51
372 0.44
373 0.45
374 0.4
375 0.4
376 0.39
377 0.31
378 0.32
379 0.31
380 0.34
381 0.31
382 0.31
383 0.33
384 0.38
385 0.4
386 0.4
387 0.39
388 0.36
389 0.37
390 0.35
391 0.29
392 0.21
393 0.2
394 0.26
395 0.3
396 0.31
397 0.31
398 0.37
399 0.4
400 0.43
401 0.45
402 0.44
403 0.47
404 0.48
405 0.49
406 0.49
407 0.51
408 0.52
409 0.56
410 0.48
411 0.45
412 0.51
413 0.53