Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

F2SJQ3

Protein Details
Accession F2SJQ3    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
114-137AVDEKMDKRRKARREARERQEMEEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
121-130KRRKARREAR
Subcellular Location(s) nucl 14, cyto 6.5, cyto_mito 5.5, mito 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003107  HAT  
IPR010491  PRP1_N  
IPR045075  Syf1-like  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR019734  TPR_repeat  
Gene Ontology GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF06424  PRP1_N  
PF14559  TPR_19  
PF13181  TPR_8  
Amino Acid Sequences MSGRKDFLSQPAPENYVAGLGRGATGFTTRSDLGPAREGPTPEQIQEALAKRAALLGTAPPTAYGASTRGEKGGKADKEEDDDDRYQDPENETGLFAYGQYDRDDDEADQVYQAVDEKMDKRRKARREARERQEMEEYERKNPKIQQQFADLKRSLASVSDEDWANIPEVGDLTGKNRRARQNMRQRFYAVPDSVIANARDSTEFSTTINDDGTESYAPRGENADGTITNFADIGAARDKVLQVRLDQAAEGSNGDVASGSATSIDPKGYLTSLTKSEMKAGEVEIGDIKRVRTLLESVTKTNPKHPPGWIAIARLEEIAGRIGAARNYIARGCELCPKSEDVWLENIRLNDNHNAKIIAANAIKNNDRSTRLWIEAMKLESDPRAKKNVLRQAILHVPQSVTIWKEAVNLEENPEDARLLLAKATEIIPLSVELWLALARLETPENAQKVLNAARKAVPTSRDIWIAAARLQEQMGTANKVNVMKRAVQSLARDSAMPKREEWIVEAEKCEEEDAILTCNAIIRETLGWGLDEDDDRKDIWMEDAKGSIARGKYETARAIYAYALRIFVNKKSVWLAAADLERNHGTKESLWQLLEKAVEACPRSEELWMQLAKEKWQAGEIDNTRRVLGRAFHQNPNNEDIWLAAVKLEADTNQIEQARELLSTARREAGTDRVWIKSVAYERQLGNRDHALDLVNQGLQLYPKADKLWMLKGQIYESDGQIQQAREAYGTGTRACPKSVPLWLLASRLEEKAGVVVKARSVLDRARLAVPKNAELWTESVRVERRANNMSQAKSLMSKALQEVPNSGLLWSESIWHLEPRTHRKPRSLEAIKKVDNDPILFVTVARIFWGERRLEKAMTWFEKAIVANSDLGDVWAWYYKFLLQHGTDEKREDVLTKCIATEPKHGEIWQTVSKDPANAHKTTEEILKITLNRLE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.39
2 0.31
3 0.28
4 0.25
5 0.2
6 0.15
7 0.12
8 0.12
9 0.12
10 0.12
11 0.08
12 0.09
13 0.1
14 0.11
15 0.15
16 0.15
17 0.16
18 0.2
19 0.23
20 0.25
21 0.3
22 0.3
23 0.29
24 0.32
25 0.34
26 0.32
27 0.38
28 0.37
29 0.32
30 0.32
31 0.29
32 0.27
33 0.31
34 0.31
35 0.27
36 0.25
37 0.25
38 0.22
39 0.25
40 0.23
41 0.17
42 0.14
43 0.15
44 0.17
45 0.18
46 0.18
47 0.15
48 0.16
49 0.15
50 0.15
51 0.12
52 0.11
53 0.13
54 0.16
55 0.17
56 0.2
57 0.21
58 0.21
59 0.26
60 0.34
61 0.34
62 0.37
63 0.4
64 0.39
65 0.44
66 0.46
67 0.43
68 0.4
69 0.38
70 0.35
71 0.32
72 0.31
73 0.27
74 0.27
75 0.27
76 0.23
77 0.23
78 0.21
79 0.2
80 0.19
81 0.18
82 0.14
83 0.11
84 0.12
85 0.12
86 0.12
87 0.13
88 0.13
89 0.13
90 0.15
91 0.17
92 0.14
93 0.17
94 0.18
95 0.17
96 0.16
97 0.15
98 0.14
99 0.12
100 0.13
101 0.09
102 0.08
103 0.12
104 0.16
105 0.26
106 0.35
107 0.4
108 0.48
109 0.57
110 0.65
111 0.72
112 0.78
113 0.8
114 0.82
115 0.88
116 0.89
117 0.9
118 0.83
119 0.77
120 0.74
121 0.65
122 0.62
123 0.59
124 0.52
125 0.5
126 0.55
127 0.52
128 0.5
129 0.54
130 0.55
131 0.58
132 0.62
133 0.57
134 0.58
135 0.66
136 0.64
137 0.67
138 0.58
139 0.48
140 0.42
141 0.39
142 0.3
143 0.22
144 0.22
145 0.15
146 0.16
147 0.18
148 0.18
149 0.18
150 0.18
151 0.17
152 0.15
153 0.13
154 0.11
155 0.08
156 0.09
157 0.09
158 0.09
159 0.09
160 0.12
161 0.19
162 0.24
163 0.29
164 0.36
165 0.43
166 0.52
167 0.61
168 0.68
169 0.72
170 0.78
171 0.78
172 0.74
173 0.7
174 0.63
175 0.59
176 0.56
177 0.46
178 0.36
179 0.32
180 0.3
181 0.28
182 0.28
183 0.22
184 0.16
185 0.16
186 0.16
187 0.15
188 0.15
189 0.17
190 0.15
191 0.15
192 0.14
193 0.17
194 0.16
195 0.16
196 0.15
197 0.12
198 0.11
199 0.11
200 0.13
201 0.1
202 0.1
203 0.1
204 0.12
205 0.12
206 0.12
207 0.14
208 0.13
209 0.13
210 0.13
211 0.15
212 0.13
213 0.14
214 0.15
215 0.13
216 0.12
217 0.11
218 0.1
219 0.08
220 0.08
221 0.09
222 0.1
223 0.1
224 0.11
225 0.12
226 0.13
227 0.15
228 0.18
229 0.17
230 0.15
231 0.19
232 0.21
233 0.2
234 0.19
235 0.17
236 0.15
237 0.14
238 0.13
239 0.08
240 0.07
241 0.07
242 0.07
243 0.06
244 0.05
245 0.05
246 0.05
247 0.04
248 0.04
249 0.05
250 0.06
251 0.07
252 0.07
253 0.07
254 0.07
255 0.08
256 0.08
257 0.1
258 0.11
259 0.13
260 0.15
261 0.18
262 0.2
263 0.19
264 0.23
265 0.22
266 0.21
267 0.19
268 0.18
269 0.18
270 0.15
271 0.16
272 0.14
273 0.13
274 0.14
275 0.14
276 0.14
277 0.12
278 0.12
279 0.12
280 0.11
281 0.13
282 0.17
283 0.23
284 0.26
285 0.27
286 0.33
287 0.38
288 0.37
289 0.43
290 0.46
291 0.42
292 0.43
293 0.42
294 0.41
295 0.39
296 0.45
297 0.39
298 0.34
299 0.32
300 0.29
301 0.27
302 0.22
303 0.18
304 0.11
305 0.1
306 0.08
307 0.06
308 0.05
309 0.05
310 0.07
311 0.07
312 0.07
313 0.07
314 0.08
315 0.09
316 0.1
317 0.1
318 0.1
319 0.11
320 0.12
321 0.2
322 0.2
323 0.2
324 0.21
325 0.24
326 0.24
327 0.26
328 0.25
329 0.18
330 0.24
331 0.24
332 0.24
333 0.23
334 0.22
335 0.2
336 0.2
337 0.21
338 0.21
339 0.23
340 0.23
341 0.21
342 0.21
343 0.2
344 0.2
345 0.19
346 0.16
347 0.15
348 0.15
349 0.16
350 0.19
351 0.2
352 0.2
353 0.22
354 0.2
355 0.22
356 0.22
357 0.27
358 0.28
359 0.28
360 0.28
361 0.27
362 0.26
363 0.25
364 0.25
365 0.19
366 0.16
367 0.15
368 0.15
369 0.2
370 0.21
371 0.21
372 0.25
373 0.26
374 0.29
375 0.38
376 0.44
377 0.43
378 0.41
379 0.39
380 0.38
381 0.43
382 0.41
383 0.33
384 0.25
385 0.21
386 0.2
387 0.2
388 0.16
389 0.11
390 0.1
391 0.09
392 0.08
393 0.1
394 0.1
395 0.11
396 0.12
397 0.12
398 0.13
399 0.13
400 0.13
401 0.11
402 0.11
403 0.09
404 0.07
405 0.07
406 0.05
407 0.05
408 0.05
409 0.05
410 0.04
411 0.05
412 0.06
413 0.06
414 0.06
415 0.06
416 0.06
417 0.06
418 0.06
419 0.06
420 0.05
421 0.04
422 0.04
423 0.04
424 0.04
425 0.04
426 0.03
427 0.03
428 0.04
429 0.05
430 0.05
431 0.07
432 0.11
433 0.11
434 0.12
435 0.12
436 0.11
437 0.13
438 0.19
439 0.22
440 0.19
441 0.19
442 0.21
443 0.22
444 0.23
445 0.23
446 0.19
447 0.17
448 0.19
449 0.19
450 0.18
451 0.17
452 0.17
453 0.16
454 0.14
455 0.14
456 0.12
457 0.11
458 0.1
459 0.1
460 0.09
461 0.08
462 0.09
463 0.09
464 0.1
465 0.1
466 0.1
467 0.12
468 0.15
469 0.15
470 0.16
471 0.17
472 0.18
473 0.18
474 0.2
475 0.19
476 0.19
477 0.2
478 0.2
479 0.2
480 0.17
481 0.17
482 0.16
483 0.21
484 0.23
485 0.23
486 0.2
487 0.2
488 0.21
489 0.21
490 0.21
491 0.2
492 0.19
493 0.19
494 0.2
495 0.19
496 0.17
497 0.17
498 0.16
499 0.1
500 0.06
501 0.06
502 0.06
503 0.06
504 0.06
505 0.06
506 0.06
507 0.07
508 0.07
509 0.06
510 0.06
511 0.05
512 0.06
513 0.06
514 0.07
515 0.05
516 0.06
517 0.05
518 0.06
519 0.06
520 0.07
521 0.07
522 0.08
523 0.08
524 0.08
525 0.08
526 0.08
527 0.08
528 0.09
529 0.12
530 0.13
531 0.13
532 0.14
533 0.14
534 0.14
535 0.14
536 0.15
537 0.11
538 0.11
539 0.11
540 0.12
541 0.14
542 0.17
543 0.19
544 0.17
545 0.17
546 0.16
547 0.16
548 0.15
549 0.14
550 0.12
551 0.11
552 0.1
553 0.1
554 0.12
555 0.13
556 0.14
557 0.18
558 0.16
559 0.17
560 0.18
561 0.19
562 0.17
563 0.16
564 0.15
565 0.13
566 0.14
567 0.14
568 0.12
569 0.14
570 0.14
571 0.14
572 0.14
573 0.11
574 0.11
575 0.1
576 0.15
577 0.17
578 0.18
579 0.18
580 0.18
581 0.18
582 0.19
583 0.19
584 0.14
585 0.11
586 0.11
587 0.14
588 0.14
589 0.13
590 0.13
591 0.14
592 0.14
593 0.14
594 0.13
595 0.13
596 0.18
597 0.17
598 0.17
599 0.19
600 0.2
601 0.21
602 0.24
603 0.22
604 0.17
605 0.18
606 0.19
607 0.16
608 0.24
609 0.26
610 0.29
611 0.32
612 0.32
613 0.3
614 0.3
615 0.29
616 0.23
617 0.21
618 0.19
619 0.27
620 0.32
621 0.38
622 0.42
623 0.46
624 0.46
625 0.48
626 0.43
627 0.32
628 0.27
629 0.21
630 0.18
631 0.14
632 0.11
633 0.07
634 0.06
635 0.06
636 0.07
637 0.07
638 0.05
639 0.07
640 0.08
641 0.09
642 0.12
643 0.13
644 0.13
645 0.13
646 0.14
647 0.12
648 0.11
649 0.11
650 0.11
651 0.13
652 0.16
653 0.17
654 0.18
655 0.18
656 0.19
657 0.2
658 0.23
659 0.22
660 0.25
661 0.26
662 0.24
663 0.25
664 0.24
665 0.23
666 0.21
667 0.23
668 0.22
669 0.22
670 0.25
671 0.25
672 0.32
673 0.37
674 0.33
675 0.33
676 0.32
677 0.31
678 0.28
679 0.27
680 0.22
681 0.17
682 0.17
683 0.15
684 0.12
685 0.1
686 0.1
687 0.09
688 0.09
689 0.09
690 0.1
691 0.1
692 0.11
693 0.12
694 0.13
695 0.16
696 0.19
697 0.26
698 0.28
699 0.29
700 0.3
701 0.31
702 0.31
703 0.29
704 0.27
705 0.21
706 0.18
707 0.2
708 0.17
709 0.17
710 0.2
711 0.18
712 0.18
713 0.18
714 0.18
715 0.14
716 0.14
717 0.13
718 0.13
719 0.14
720 0.14
721 0.16
722 0.21
723 0.22
724 0.23
725 0.22
726 0.22
727 0.25
728 0.29
729 0.27
730 0.24
731 0.28
732 0.28
733 0.29
734 0.27
735 0.26
736 0.23
737 0.22
738 0.2
739 0.16
740 0.14
741 0.16
742 0.17
743 0.14
744 0.14
745 0.15
746 0.15
747 0.18
748 0.19
749 0.16
750 0.17
751 0.2
752 0.24
753 0.25
754 0.27
755 0.29
756 0.33
757 0.34
758 0.36
759 0.36
760 0.32
761 0.32
762 0.3
763 0.26
764 0.23
765 0.24
766 0.22
767 0.21
768 0.19
769 0.22
770 0.24
771 0.28
772 0.32
773 0.33
774 0.36
775 0.4
776 0.41
777 0.45
778 0.49
779 0.46
780 0.44
781 0.41
782 0.36
783 0.33
784 0.32
785 0.26
786 0.2
787 0.2
788 0.21
789 0.28
790 0.29
791 0.27
792 0.29
793 0.27
794 0.29
795 0.27
796 0.24
797 0.16
798 0.14
799 0.14
800 0.12
801 0.12
802 0.1
803 0.12
804 0.14
805 0.16
806 0.16
807 0.2
808 0.29
809 0.36
810 0.46
811 0.54
812 0.57
813 0.64
814 0.7
815 0.72
816 0.75
817 0.75
818 0.74
819 0.74
820 0.78
821 0.73
822 0.7
823 0.65
824 0.59
825 0.52
826 0.44
827 0.37
828 0.29
829 0.26
830 0.22
831 0.2
832 0.19
833 0.17
834 0.16
835 0.14
836 0.13
837 0.12
838 0.16
839 0.22
840 0.23
841 0.24
842 0.3
843 0.33
844 0.34
845 0.35
846 0.39
847 0.42
848 0.42
849 0.42
850 0.37
851 0.34
852 0.37
853 0.36
854 0.31
855 0.25
856 0.22
857 0.2
858 0.19
859 0.19
860 0.15
861 0.15
862 0.12
863 0.09
864 0.09
865 0.13
866 0.12
867 0.12
868 0.13
869 0.15
870 0.18
871 0.19
872 0.25
873 0.21
874 0.28
875 0.36
876 0.41
877 0.41
878 0.43
879 0.42
880 0.38
881 0.37
882 0.34
883 0.29
884 0.29
885 0.3
886 0.27
887 0.27
888 0.29
889 0.34
890 0.34
891 0.4
892 0.4
893 0.4
894 0.43
895 0.42
896 0.41
897 0.39
898 0.42
899 0.39
900 0.36
901 0.32
902 0.34
903 0.35
904 0.35
905 0.34
906 0.37
907 0.36
908 0.34
909 0.37
910 0.35
911 0.35
912 0.35
913 0.38
914 0.3
915 0.26
916 0.27
917 0.28
918 0.28