Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

F2SMA1

Protein Details
Accession F2SMA1    Localization Confidence High Confidence Score 17.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
18-48DSPPETDEERKKRLRKEARRKLRVTWKPDSSBasic
376-400DSYDYNKRAKIKKHPKAGLVPCRYWHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
27-40RKKRLRKEARRKLR
383-390RAKIKKHP
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 12.5, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000571  Znf_CCCH  
IPR036855  Znf_CCCH_sf  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF18345  zf_CCCH_4  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50103  ZF_C3H1  
Amino Acid Sequences MANLNKPRERSPSKQEEDSPPETDEERKKRLRKEARRKLRVTWKPDSSLTEVRLFTHDPEEEIGYDDSMMRDVGDVAGEGRTLKLHHGLDDLDDEDEGWNEESLAPYAVPSAIDFSDLLEEDRERNFIKTGGSKAADSPEKTAQDQREATTLSVFYTSPSDIPNTPKEPPPPDNDDEPYSPLVPFGEPDHFVKARSQRYFDSRSPPVQVAPQATPGAQPTNAAPIEISSLLKILQQNQQPQPVQQQQQQPTVPPNVPDLQQTLAQFTNNAQSPQLQQTSQSGQAPGAQGLDFQKLLAVMNAQKQMQQATAFPQVTTPPTPNLAAILSQLSNPASQLQQQQPQPQQQQNQSQNKDSQAYNQALYEDGDNKRSYEGDDSYDYNKRAKIKKHPKAGLVPCRYWKEGKCIKGDECTFRHDPLD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.73
2 0.74
3 0.74
4 0.74
5 0.71
6 0.63
7 0.53
8 0.49
9 0.44
10 0.45
11 0.45
12 0.45
13 0.5
14 0.56
15 0.62
16 0.69
17 0.78
18 0.82
19 0.83
20 0.86
21 0.88
22 0.9
23 0.93
24 0.88
25 0.87
26 0.87
27 0.85
28 0.82
29 0.8
30 0.76
31 0.7
32 0.7
33 0.65
34 0.61
35 0.58
36 0.53
37 0.49
38 0.42
39 0.39
40 0.39
41 0.35
42 0.3
43 0.29
44 0.26
45 0.21
46 0.23
47 0.23
48 0.2
49 0.21
50 0.19
51 0.14
52 0.14
53 0.13
54 0.11
55 0.1
56 0.1
57 0.07
58 0.06
59 0.07
60 0.06
61 0.06
62 0.06
63 0.06
64 0.06
65 0.06
66 0.06
67 0.06
68 0.07
69 0.08
70 0.1
71 0.15
72 0.16
73 0.17
74 0.18
75 0.18
76 0.19
77 0.2
78 0.19
79 0.13
80 0.12
81 0.11
82 0.09
83 0.09
84 0.09
85 0.08
86 0.07
87 0.07
88 0.07
89 0.08
90 0.08
91 0.09
92 0.07
93 0.07
94 0.07
95 0.07
96 0.07
97 0.06
98 0.08
99 0.07
100 0.08
101 0.08
102 0.08
103 0.09
104 0.1
105 0.1
106 0.09
107 0.1
108 0.11
109 0.12
110 0.13
111 0.13
112 0.14
113 0.14
114 0.14
115 0.17
116 0.19
117 0.21
118 0.24
119 0.25
120 0.24
121 0.24
122 0.28
123 0.29
124 0.26
125 0.27
126 0.27
127 0.28
128 0.29
129 0.34
130 0.3
131 0.33
132 0.33
133 0.3
134 0.28
135 0.27
136 0.25
137 0.21
138 0.19
139 0.13
140 0.13
141 0.11
142 0.09
143 0.1
144 0.1
145 0.09
146 0.1
147 0.12
148 0.12
149 0.16
150 0.21
151 0.23
152 0.24
153 0.28
154 0.32
155 0.35
156 0.37
157 0.39
158 0.41
159 0.4
160 0.42
161 0.4
162 0.39
163 0.34
164 0.32
165 0.28
166 0.21
167 0.18
168 0.15
169 0.13
170 0.09
171 0.09
172 0.09
173 0.1
174 0.11
175 0.12
176 0.16
177 0.16
178 0.17
179 0.21
180 0.26
181 0.32
182 0.32
183 0.34
184 0.32
185 0.38
186 0.44
187 0.42
188 0.42
189 0.37
190 0.37
191 0.37
192 0.35
193 0.3
194 0.25
195 0.25
196 0.21
197 0.18
198 0.18
199 0.16
200 0.15
201 0.15
202 0.14
203 0.13
204 0.1
205 0.1
206 0.08
207 0.12
208 0.12
209 0.11
210 0.1
211 0.09
212 0.11
213 0.11
214 0.11
215 0.06
216 0.06
217 0.06
218 0.09
219 0.09
220 0.11
221 0.16
222 0.2
223 0.27
224 0.3
225 0.36
226 0.35
227 0.35
228 0.4
229 0.41
230 0.41
231 0.4
232 0.45
233 0.43
234 0.49
235 0.48
236 0.42
237 0.39
238 0.39
239 0.34
240 0.27
241 0.26
242 0.22
243 0.22
244 0.21
245 0.19
246 0.16
247 0.18
248 0.17
249 0.17
250 0.15
251 0.15
252 0.14
253 0.13
254 0.17
255 0.16
256 0.16
257 0.14
258 0.14
259 0.17
260 0.22
261 0.24
262 0.18
263 0.18
264 0.21
265 0.24
266 0.26
267 0.24
268 0.2
269 0.18
270 0.2
271 0.2
272 0.17
273 0.14
274 0.11
275 0.11
276 0.12
277 0.14
278 0.11
279 0.1
280 0.1
281 0.09
282 0.1
283 0.09
284 0.09
285 0.1
286 0.15
287 0.18
288 0.18
289 0.19
290 0.2
291 0.21
292 0.21
293 0.19
294 0.16
295 0.17
296 0.25
297 0.23
298 0.22
299 0.22
300 0.22
301 0.24
302 0.26
303 0.23
304 0.18
305 0.2
306 0.2
307 0.19
308 0.19
309 0.16
310 0.14
311 0.12
312 0.13
313 0.11
314 0.1
315 0.12
316 0.11
317 0.11
318 0.11
319 0.12
320 0.1
321 0.14
322 0.22
323 0.26
324 0.33
325 0.37
326 0.45
327 0.5
328 0.58
329 0.62
330 0.62
331 0.64
332 0.65
333 0.71
334 0.73
335 0.76
336 0.72
337 0.69
338 0.66
339 0.63
340 0.58
341 0.49
342 0.45
343 0.43
344 0.41
345 0.37
346 0.33
347 0.29
348 0.26
349 0.26
350 0.22
351 0.21
352 0.2
353 0.23
354 0.23
355 0.23
356 0.24
357 0.23
358 0.23
359 0.23
360 0.23
361 0.23
362 0.25
363 0.28
364 0.31
365 0.37
366 0.36
367 0.34
368 0.36
369 0.4
370 0.45
371 0.51
372 0.58
373 0.63
374 0.71
375 0.78
376 0.82
377 0.81
378 0.84
379 0.85
380 0.84
381 0.81
382 0.78
383 0.75
384 0.74
385 0.7
386 0.67
387 0.6
388 0.6
389 0.6
390 0.61
391 0.6
392 0.61
393 0.6
394 0.63
395 0.65
396 0.63
397 0.57
398 0.58
399 0.53