Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

F2SHP0

Protein Details
Accession F2SHP0    Localization Confidence Low Confidence Score 5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
304-327LDIKGLFRKKQQLKPYQQRPFAGDHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) plas 20, E.R. 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007568  RTA1  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
Pfam View protein in Pfam  
PF04479  RTA1  
Amino Acid Sequences MSSKKDTLRELYHYLPSKPAAIIFAILYIASSFLHEYQYKATRPQNFTMPFVLGTTFSSVGFVTRSLSALKIGDPRTLWRISTMFTLGAGPTYAGADYFVCGRIFSYVRSAAPISPLRTVRTFIFFDFLAEIGVWVGSGINDSKDPNSARTKLGVNLVRAAVIIQLALFACFVAVVLLFQIRATSRGFWRASHQQSGGTPGWVKVIYTLYASSLLIAARSGYHIAESFLPIDHPLRATEVPFLCLEALVMFINAAMFNVIHPGVLLPSNPHVYLLANGMEAEDDSPEGTLEDTRPLKMKILDPLDIKGLFRKKQQLKPYQQRPFAGDDEMMSESIIMLGSRQRQEFH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.49
2 0.46
3 0.42
4 0.38
5 0.33
6 0.29
7 0.23
8 0.19
9 0.19
10 0.14
11 0.13
12 0.11
13 0.1
14 0.09
15 0.07
16 0.07
17 0.06
18 0.07
19 0.07
20 0.08
21 0.13
22 0.14
23 0.15
24 0.22
25 0.29
26 0.3
27 0.36
28 0.42
29 0.47
30 0.51
31 0.54
32 0.56
33 0.52
34 0.53
35 0.48
36 0.43
37 0.34
38 0.29
39 0.26
40 0.17
41 0.15
42 0.15
43 0.13
44 0.12
45 0.12
46 0.11
47 0.11
48 0.11
49 0.1
50 0.09
51 0.09
52 0.1
53 0.1
54 0.11
55 0.12
56 0.12
57 0.15
58 0.19
59 0.2
60 0.22
61 0.22
62 0.25
63 0.28
64 0.29
65 0.27
66 0.23
67 0.23
68 0.21
69 0.23
70 0.21
71 0.16
72 0.15
73 0.16
74 0.12
75 0.11
76 0.1
77 0.07
78 0.06
79 0.06
80 0.06
81 0.05
82 0.05
83 0.05
84 0.05
85 0.06
86 0.08
87 0.08
88 0.08
89 0.08
90 0.11
91 0.11
92 0.12
93 0.15
94 0.16
95 0.16
96 0.18
97 0.19
98 0.16
99 0.21
100 0.24
101 0.21
102 0.24
103 0.25
104 0.26
105 0.26
106 0.28
107 0.24
108 0.25
109 0.24
110 0.19
111 0.2
112 0.17
113 0.16
114 0.15
115 0.13
116 0.09
117 0.07
118 0.07
119 0.05
120 0.05
121 0.04
122 0.03
123 0.03
124 0.02
125 0.03
126 0.04
127 0.04
128 0.05
129 0.06
130 0.07
131 0.11
132 0.12
133 0.16
134 0.21
135 0.23
136 0.23
137 0.25
138 0.26
139 0.24
140 0.3
141 0.29
142 0.24
143 0.24
144 0.23
145 0.21
146 0.19
147 0.17
148 0.1
149 0.06
150 0.05
151 0.03
152 0.04
153 0.03
154 0.04
155 0.03
156 0.03
157 0.03
158 0.03
159 0.03
160 0.02
161 0.02
162 0.02
163 0.02
164 0.03
165 0.03
166 0.03
167 0.03
168 0.04
169 0.05
170 0.06
171 0.08
172 0.1
173 0.16
174 0.17
175 0.18
176 0.23
177 0.3
178 0.33
179 0.35
180 0.34
181 0.29
182 0.29
183 0.34
184 0.29
185 0.21
186 0.18
187 0.15
188 0.16
189 0.14
190 0.14
191 0.1
192 0.1
193 0.1
194 0.1
195 0.1
196 0.09
197 0.1
198 0.1
199 0.08
200 0.07
201 0.07
202 0.06
203 0.06
204 0.05
205 0.04
206 0.05
207 0.06
208 0.05
209 0.06
210 0.06
211 0.07
212 0.08
213 0.09
214 0.09
215 0.08
216 0.08
217 0.09
218 0.1
219 0.09
220 0.09
221 0.09
222 0.12
223 0.12
224 0.13
225 0.18
226 0.17
227 0.18
228 0.17
229 0.18
230 0.14
231 0.13
232 0.12
233 0.06
234 0.07
235 0.05
236 0.05
237 0.04
238 0.04
239 0.05
240 0.04
241 0.04
242 0.04
243 0.04
244 0.04
245 0.06
246 0.06
247 0.05
248 0.06
249 0.06
250 0.07
251 0.07
252 0.08
253 0.08
254 0.11
255 0.14
256 0.14
257 0.14
258 0.13
259 0.13
260 0.14
261 0.15
262 0.12
263 0.1
264 0.1
265 0.09
266 0.09
267 0.08
268 0.08
269 0.06
270 0.05
271 0.05
272 0.05
273 0.05
274 0.05
275 0.06
276 0.07
277 0.08
278 0.15
279 0.16
280 0.17
281 0.21
282 0.22
283 0.25
284 0.28
285 0.31
286 0.32
287 0.36
288 0.39
289 0.38
290 0.38
291 0.39
292 0.36
293 0.33
294 0.32
295 0.35
296 0.34
297 0.39
298 0.48
299 0.53
300 0.61
301 0.71
302 0.74
303 0.78
304 0.85
305 0.89
306 0.88
307 0.86
308 0.81
309 0.74
310 0.69
311 0.6
312 0.52
313 0.42
314 0.32
315 0.28
316 0.26
317 0.22
318 0.16
319 0.14
320 0.1
321 0.1
322 0.1
323 0.06
324 0.06
325 0.11
326 0.18
327 0.23