Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

F2SGD4

Protein Details
Accession F2SGD4    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
313-340WAMKRRQQIRRASSSHKKGKPQAENDGDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
322-324RRA
327-330SHKK
Subcellular Location(s) cyto 11.5, cyto_nucl 11.5, nucl 10.5, pero 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006886  RNA_pol_III_Rpc5  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006351  P:DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF04801  RPC5  
Amino Acid Sequences MPPDAQEDDDPITASYDIFITDSQIRRLLLQYPDRPADQPYNDSIGQKPLEFRLKPKTGLVELDIPIDTQVNYDEVKGLRYGNALAKSRITQENGSHGMAGGFNVNGGGIGKFKTEGTGADDVNVYMDMDDEDRKAGVKMTTQVLGGRIKKPVDGDPVYMLGAFRDNELHLAPLEAVVQLRPQLHHIDAYDEVSVKSKAMAKAKKDMDEDSTSRNAAMEARAIDMKVKSADTEGARAVGNNELLLKLFQDEKWEKYRWIDENDQESWDKYDQYMFNEGLEEPVQLQSAITADDYLDSMSAPRVDPTRPEMTGWAMKRRQQIRRASSSHKKGKPQAENDGDDDGDITMA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.12
3 0.09
4 0.09
5 0.09
6 0.09
7 0.11
8 0.17
9 0.2
10 0.22
11 0.25
12 0.25
13 0.26
14 0.28
15 0.3
16 0.32
17 0.38
18 0.42
19 0.45
20 0.48
21 0.48
22 0.47
23 0.46
24 0.46
25 0.4
26 0.38
27 0.35
28 0.37
29 0.37
30 0.37
31 0.34
32 0.32
33 0.3
34 0.28
35 0.27
36 0.28
37 0.35
38 0.35
39 0.38
40 0.42
41 0.45
42 0.46
43 0.47
44 0.46
45 0.4
46 0.41
47 0.39
48 0.34
49 0.3
50 0.3
51 0.27
52 0.21
53 0.19
54 0.17
55 0.14
56 0.08
57 0.09
58 0.08
59 0.09
60 0.09
61 0.12
62 0.11
63 0.13
64 0.13
65 0.13
66 0.12
67 0.13
68 0.15
69 0.17
70 0.23
71 0.24
72 0.25
73 0.26
74 0.26
75 0.3
76 0.32
77 0.29
78 0.27
79 0.26
80 0.32
81 0.33
82 0.32
83 0.27
84 0.23
85 0.2
86 0.17
87 0.15
88 0.09
89 0.05
90 0.05
91 0.05
92 0.04
93 0.04
94 0.05
95 0.05
96 0.05
97 0.05
98 0.06
99 0.07
100 0.07
101 0.08
102 0.08
103 0.08
104 0.12
105 0.15
106 0.14
107 0.15
108 0.15
109 0.14
110 0.14
111 0.13
112 0.08
113 0.05
114 0.05
115 0.04
116 0.05
117 0.06
118 0.06
119 0.06
120 0.06
121 0.07
122 0.07
123 0.09
124 0.08
125 0.1
126 0.12
127 0.14
128 0.15
129 0.15
130 0.15
131 0.16
132 0.2
133 0.21
134 0.2
135 0.22
136 0.21
137 0.22
138 0.23
139 0.23
140 0.25
141 0.24
142 0.23
143 0.21
144 0.21
145 0.2
146 0.18
147 0.15
148 0.08
149 0.08
150 0.07
151 0.06
152 0.06
153 0.06
154 0.07
155 0.07
156 0.08
157 0.06
158 0.06
159 0.06
160 0.05
161 0.05
162 0.05
163 0.05
164 0.04
165 0.05
166 0.06
167 0.07
168 0.07
169 0.09
170 0.11
171 0.11
172 0.12
173 0.12
174 0.13
175 0.13
176 0.13
177 0.12
178 0.1
179 0.1
180 0.11
181 0.1
182 0.08
183 0.09
184 0.12
185 0.16
186 0.24
187 0.28
188 0.29
189 0.38
190 0.41
191 0.44
192 0.42
193 0.39
194 0.36
195 0.36
196 0.35
197 0.3
198 0.29
199 0.24
200 0.22
201 0.21
202 0.16
203 0.12
204 0.11
205 0.1
206 0.09
207 0.1
208 0.1
209 0.1
210 0.12
211 0.11
212 0.12
213 0.11
214 0.11
215 0.1
216 0.1
217 0.15
218 0.13
219 0.15
220 0.14
221 0.14
222 0.14
223 0.14
224 0.14
225 0.11
226 0.1
227 0.09
228 0.09
229 0.08
230 0.08
231 0.08
232 0.07
233 0.07
234 0.09
235 0.09
236 0.17
237 0.19
238 0.23
239 0.29
240 0.31
241 0.32
242 0.34
243 0.41
244 0.37
245 0.41
246 0.44
247 0.43
248 0.47
249 0.46
250 0.45
251 0.39
252 0.34
253 0.31
254 0.26
255 0.21
256 0.16
257 0.21
258 0.2
259 0.23
260 0.26
261 0.23
262 0.22
263 0.23
264 0.22
265 0.18
266 0.17
267 0.14
268 0.1
269 0.11
270 0.11
271 0.09
272 0.09
273 0.07
274 0.07
275 0.07
276 0.07
277 0.06
278 0.06
279 0.06
280 0.07
281 0.06
282 0.06
283 0.05
284 0.06
285 0.08
286 0.09
287 0.09
288 0.11
289 0.14
290 0.15
291 0.18
292 0.24
293 0.28
294 0.28
295 0.29
296 0.28
297 0.32
298 0.39
299 0.39
300 0.43
301 0.42
302 0.47
303 0.55
304 0.62
305 0.65
306 0.66
307 0.72
308 0.72
309 0.77
310 0.77
311 0.78
312 0.8
313 0.81
314 0.83
315 0.8
316 0.81
317 0.8
318 0.84
319 0.84
320 0.81
321 0.81
322 0.78
323 0.75
324 0.68
325 0.62
326 0.51
327 0.41
328 0.34