Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

F2SIY4

Protein Details
Accession F2SIY4    Localization Confidence High Confidence Score 24
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
129-149REEERERKKQAEKTKRVKTADBasic
451-473ELRNVEREKKKKIGRRDGSSGRIBasic
505-538KDGAKPAFRMKGKKKGGKPKTRSSRRASAYKARKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
108-111RKRK
135-141RKKQAEK
403-444MLPRKLRVTRAKRIGAGSEGVREGASRQRQKGGKARKDEKLF
452-468LRNVEREKKKKIGRRDG
505-538KDGAKPAFRMKGKKKGGKPKTRSSRRASAYKARK
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MGNKAKTQTAEGALAVATQVPTASTATGGFPLAATKVDPGLAALFAQSAGPVKEPELKSVSRREENEADNEDEDEDEDIEEDEEDEDDEDEEEDDDVEMEDMEEKASRKRKRGADNDDLEAAYLDRLSREEERERKKQAEKTKRVKTADEAEGDEEEADEEEDKIPMHESLMKSDQADPMDKASRTLFLSNVSTEAIKSKSAKKTLLKHLSSLLPKPSSSSTTTLSTTHKIESLRFRSTAFSSTALPRRAAYAKKELMDSTTKGTNAYVVYSTALAAKKALKLNGTMVLDRHIRVDSVSKPAPVDHTRCVFVGNLGFVDEETQPAEQDGEVKKKKKAAAAADVEEGLWRTFNDHCGGEGVVESVRVVRDRLTRVGKGFAYVQFKDENCVEAALLCDGKKFPPMLPRKLRVTRAKRIGAGSEGVREGASRQRQKGGKARKDEKLFGQAVAAELRNVEREKKKKIGRRDGSSGRIGPGNDANAVPLGDRSGSGNAGTTMVFEGYRAKDGAKPAFRMKGKKKGGKPKTRSSRRASAYKARK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.16
3 0.12
4 0.09
5 0.06
6 0.06
7 0.06
8 0.07
9 0.08
10 0.08
11 0.08
12 0.09
13 0.1
14 0.11
15 0.11
16 0.1
17 0.09
18 0.1
19 0.1
20 0.1
21 0.09
22 0.1
23 0.1
24 0.1
25 0.1
26 0.1
27 0.1
28 0.1
29 0.09
30 0.08
31 0.07
32 0.07
33 0.07
34 0.07
35 0.08
36 0.09
37 0.1
38 0.11
39 0.13
40 0.22
41 0.23
42 0.27
43 0.3
44 0.32
45 0.36
46 0.44
47 0.5
48 0.49
49 0.51
50 0.53
51 0.55
52 0.55
53 0.57
54 0.52
55 0.46
56 0.39
57 0.37
58 0.3
59 0.24
60 0.21
61 0.15
62 0.11
63 0.08
64 0.08
65 0.08
66 0.07
67 0.07
68 0.07
69 0.06
70 0.06
71 0.06
72 0.07
73 0.07
74 0.07
75 0.07
76 0.07
77 0.07
78 0.07
79 0.07
80 0.07
81 0.06
82 0.06
83 0.06
84 0.06
85 0.05
86 0.05
87 0.06
88 0.06
89 0.06
90 0.08
91 0.09
92 0.17
93 0.26
94 0.32
95 0.39
96 0.47
97 0.56
98 0.64
99 0.73
100 0.75
101 0.76
102 0.75
103 0.7
104 0.64
105 0.55
106 0.44
107 0.34
108 0.25
109 0.15
110 0.1
111 0.07
112 0.06
113 0.07
114 0.1
115 0.13
116 0.18
117 0.27
118 0.36
119 0.44
120 0.51
121 0.56
122 0.6
123 0.65
124 0.67
125 0.7
126 0.72
127 0.75
128 0.77
129 0.82
130 0.83
131 0.78
132 0.73
133 0.68
134 0.65
135 0.59
136 0.52
137 0.43
138 0.36
139 0.33
140 0.3
141 0.24
142 0.16
143 0.1
144 0.08
145 0.06
146 0.05
147 0.06
148 0.06
149 0.06
150 0.06
151 0.07
152 0.07
153 0.07
154 0.08
155 0.12
156 0.12
157 0.16
158 0.19
159 0.2
160 0.2
161 0.22
162 0.24
163 0.21
164 0.23
165 0.19
166 0.2
167 0.24
168 0.22
169 0.22
170 0.2
171 0.21
172 0.2
173 0.21
174 0.17
175 0.15
176 0.17
177 0.15
178 0.16
179 0.13
180 0.12
181 0.11
182 0.13
183 0.11
184 0.12
185 0.15
186 0.21
187 0.27
188 0.31
189 0.37
190 0.42
191 0.49
192 0.58
193 0.65
194 0.58
195 0.53
196 0.53
197 0.52
198 0.48
199 0.43
200 0.37
201 0.28
202 0.27
203 0.28
204 0.26
205 0.23
206 0.23
207 0.23
208 0.2
209 0.22
210 0.23
211 0.23
212 0.24
213 0.23
214 0.22
215 0.2
216 0.2
217 0.18
218 0.21
219 0.27
220 0.3
221 0.3
222 0.3
223 0.3
224 0.29
225 0.3
226 0.29
227 0.22
228 0.18
229 0.17
230 0.21
231 0.26
232 0.25
233 0.24
234 0.22
235 0.23
236 0.26
237 0.27
238 0.26
239 0.28
240 0.3
241 0.3
242 0.31
243 0.28
244 0.27
245 0.27
246 0.24
247 0.18
248 0.17
249 0.16
250 0.15
251 0.15
252 0.14
253 0.11
254 0.11
255 0.09
256 0.07
257 0.07
258 0.07
259 0.07
260 0.09
261 0.09
262 0.08
263 0.09
264 0.1
265 0.14
266 0.16
267 0.17
268 0.14
269 0.15
270 0.17
271 0.21
272 0.2
273 0.17
274 0.15
275 0.17
276 0.17
277 0.17
278 0.16
279 0.11
280 0.1
281 0.1
282 0.14
283 0.13
284 0.18
285 0.19
286 0.18
287 0.18
288 0.18
289 0.23
290 0.24
291 0.26
292 0.24
293 0.25
294 0.25
295 0.25
296 0.26
297 0.2
298 0.17
299 0.14
300 0.11
301 0.08
302 0.08
303 0.08
304 0.06
305 0.08
306 0.07
307 0.07
308 0.07
309 0.07
310 0.07
311 0.07
312 0.07
313 0.05
314 0.1
315 0.13
316 0.21
317 0.27
318 0.3
319 0.33
320 0.38
321 0.41
322 0.4
323 0.44
324 0.4
325 0.44
326 0.45
327 0.45
328 0.4
329 0.37
330 0.33
331 0.27
332 0.21
333 0.12
334 0.08
335 0.06
336 0.07
337 0.08
338 0.1
339 0.12
340 0.12
341 0.12
342 0.13
343 0.13
344 0.11
345 0.11
346 0.09
347 0.07
348 0.06
349 0.06
350 0.06
351 0.06
352 0.07
353 0.07
354 0.1
355 0.15
356 0.19
357 0.26
358 0.3
359 0.32
360 0.34
361 0.38
362 0.34
363 0.3
364 0.3
365 0.29
366 0.3
367 0.27
368 0.27
369 0.27
370 0.27
371 0.28
372 0.26
373 0.22
374 0.16
375 0.16
376 0.14
377 0.1
378 0.11
379 0.09
380 0.1
381 0.08
382 0.09
383 0.1
384 0.11
385 0.14
386 0.14
387 0.15
388 0.24
389 0.32
390 0.41
391 0.5
392 0.55
393 0.61
394 0.67
395 0.73
396 0.74
397 0.75
398 0.75
399 0.75
400 0.74
401 0.68
402 0.64
403 0.57
404 0.49
405 0.43
406 0.34
407 0.27
408 0.23
409 0.19
410 0.17
411 0.14
412 0.14
413 0.19
414 0.27
415 0.31
416 0.34
417 0.42
418 0.45
419 0.53
420 0.61
421 0.64
422 0.63
423 0.67
424 0.72
425 0.73
426 0.76
427 0.73
428 0.68
429 0.66
430 0.59
431 0.48
432 0.42
433 0.33
434 0.28
435 0.26
436 0.21
437 0.12
438 0.12
439 0.12
440 0.16
441 0.17
442 0.23
443 0.3
444 0.37
445 0.45
446 0.54
447 0.63
448 0.67
449 0.76
450 0.8
451 0.8
452 0.81
453 0.83
454 0.82
455 0.78
456 0.76
457 0.67
458 0.58
459 0.51
460 0.43
461 0.37
462 0.32
463 0.28
464 0.23
465 0.21
466 0.19
467 0.17
468 0.17
469 0.14
470 0.1
471 0.1
472 0.09
473 0.09
474 0.11
475 0.12
476 0.12
477 0.12
478 0.13
479 0.13
480 0.13
481 0.13
482 0.11
483 0.1
484 0.1
485 0.1
486 0.09
487 0.14
488 0.15
489 0.18
490 0.18
491 0.18
492 0.21
493 0.28
494 0.38
495 0.38
496 0.41
497 0.45
498 0.54
499 0.58
500 0.65
501 0.68
502 0.69
503 0.73
504 0.78
505 0.82
506 0.84
507 0.89
508 0.89
509 0.89
510 0.9
511 0.91
512 0.92
513 0.91
514 0.88
515 0.88
516 0.84
517 0.85
518 0.82