Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

F2SJJ8

Protein Details
Accession F2SJJ8    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
61-80NMVGKRPPPKVKKEVYDDPMHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
441-456EKKTPGWHRIGRLKRG
Subcellular Location(s) nucl 15, mito_nucl 11.333, cyto_mito 6.666, cyto 6.5, mito 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006172  DNA-dir_DNA_pol_B  
IPR006133  DNA-dir_DNA_pol_B_exonuc  
IPR006134  DNA-dir_DNA_pol_B_multi_dom  
IPR043502  DNA/RNA_pol_sf  
IPR023211  DNA_pol_palm_dom_sf  
IPR012337  RNaseH-like_sf  
IPR036397  RNaseH_sf  
Gene Ontology GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0003887  F:DNA-directed DNA polymerase activity  
GO:0000166  F:nucleotide binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00136  DNA_pol_B  
PF03104  DNA_pol_B_exo1  
CDD cd05776  DNA_polB_alpha_exo  
Amino Acid Sequences MSEQPLPSSPVASAVERKTAGASRSKQVIIKKEEDDDDGDDDMLDVAEAVADHSANTPSVNMVGKRPPPKVKKEVYDDPMASSPARATTEMINPSSWNDVTNKLNVLNSSVTDMQRFGKLTCQEAVEEDGSLKFFWLDYTEINGSLCLFGKVKNKTNNSYVSAFVKVDNILRKLYFLPREYKYVRGQSTSEEVDMEDVYGEVDNIMSRSKVEMHKIKPCTRKYAFELPDIPKEAEYLKLMYPYTKPALPMELKGETFSHVFGTNTALFEQFVLWKNIMGPCWLKIEDADFTAVNGASWCKLECEVTNPAEISLVPDSEEIETPPLTLMSLSFRTQLNVKENKQEIIVASARVYENLSLSDTTPPENLPCKTFTVMRPSNLSYPLGFEAEAKKQRGTVMLEKTEQFLLSKFLALFEKIDPDVIMGHQLQEVDFNVLLSRLKEKKTPGWHRIGRLKRGEWPKNFSKGSGFFSDRQLLAGRLLCDVANDMGKSLMMKCQSWTLTEMCQLYLGEGDQRREVDTEAALKTWATSKEGLMNFLSHCEADTYFIAALVLKLQMLPLTKVLTNLAGNSWSRTLSGTRAERNEYILLHEFYRGKYICPDKYGHKNQIKVEENEGEEEGVDKKKKEKYKGGLVFEPEKGLYDKHVLVMDFNSLYPSIIQEFNICFTTVDRHASVSILALS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.33
3 0.32
4 0.32
5 0.31
6 0.33
7 0.33
8 0.36
9 0.38
10 0.39
11 0.44
12 0.47
13 0.48
14 0.5
15 0.56
16 0.54
17 0.56
18 0.53
19 0.52
20 0.51
21 0.5
22 0.46
23 0.39
24 0.34
25 0.28
26 0.25
27 0.19
28 0.17
29 0.14
30 0.11
31 0.08
32 0.05
33 0.04
34 0.04
35 0.04
36 0.04
37 0.05
38 0.05
39 0.05
40 0.07
41 0.09
42 0.09
43 0.09
44 0.09
45 0.09
46 0.12
47 0.16
48 0.16
49 0.2
50 0.28
51 0.35
52 0.42
53 0.5
54 0.57
55 0.62
56 0.7
57 0.75
58 0.76
59 0.77
60 0.78
61 0.8
62 0.75
63 0.74
64 0.65
65 0.59
66 0.52
67 0.45
68 0.36
69 0.27
70 0.23
71 0.18
72 0.2
73 0.17
74 0.16
75 0.19
76 0.25
77 0.29
78 0.29
79 0.26
80 0.25
81 0.26
82 0.28
83 0.24
84 0.2
85 0.18
86 0.21
87 0.23
88 0.26
89 0.26
90 0.23
91 0.25
92 0.23
93 0.24
94 0.21
95 0.18
96 0.2
97 0.22
98 0.21
99 0.2
100 0.21
101 0.2
102 0.22
103 0.23
104 0.19
105 0.23
106 0.24
107 0.26
108 0.27
109 0.27
110 0.23
111 0.24
112 0.27
113 0.19
114 0.17
115 0.15
116 0.13
117 0.13
118 0.12
119 0.11
120 0.07
121 0.07
122 0.07
123 0.08
124 0.09
125 0.09
126 0.15
127 0.15
128 0.16
129 0.16
130 0.15
131 0.14
132 0.13
133 0.13
134 0.1
135 0.09
136 0.14
137 0.21
138 0.28
139 0.36
140 0.44
141 0.49
142 0.52
143 0.57
144 0.58
145 0.55
146 0.5
147 0.45
148 0.38
149 0.35
150 0.31
151 0.25
152 0.22
153 0.18
154 0.2
155 0.23
156 0.22
157 0.22
158 0.21
159 0.22
160 0.23
161 0.29
162 0.31
163 0.29
164 0.34
165 0.34
166 0.42
167 0.42
168 0.45
169 0.45
170 0.47
171 0.46
172 0.42
173 0.41
174 0.37
175 0.39
176 0.35
177 0.28
178 0.21
179 0.18
180 0.16
181 0.15
182 0.12
183 0.07
184 0.05
185 0.05
186 0.05
187 0.05
188 0.04
189 0.04
190 0.04
191 0.04
192 0.05
193 0.05
194 0.05
195 0.07
196 0.12
197 0.15
198 0.22
199 0.3
200 0.34
201 0.43
202 0.5
203 0.57
204 0.61
205 0.62
206 0.64
207 0.59
208 0.6
209 0.58
210 0.62
211 0.56
212 0.52
213 0.56
214 0.49
215 0.51
216 0.48
217 0.41
218 0.31
219 0.29
220 0.25
221 0.2
222 0.17
223 0.14
224 0.12
225 0.14
226 0.14
227 0.15
228 0.16
229 0.18
230 0.19
231 0.18
232 0.18
233 0.17
234 0.22
235 0.22
236 0.22
237 0.22
238 0.22
239 0.21
240 0.21
241 0.2
242 0.16
243 0.15
244 0.14
245 0.11
246 0.1
247 0.1
248 0.09
249 0.13
250 0.12
251 0.12
252 0.12
253 0.11
254 0.1
255 0.1
256 0.1
257 0.1
258 0.11
259 0.12
260 0.12
261 0.12
262 0.13
263 0.15
264 0.15
265 0.14
266 0.12
267 0.12
268 0.15
269 0.15
270 0.14
271 0.12
272 0.14
273 0.13
274 0.12
275 0.12
276 0.09
277 0.08
278 0.09
279 0.09
280 0.07
281 0.06
282 0.06
283 0.05
284 0.06
285 0.06
286 0.06
287 0.07
288 0.08
289 0.08
290 0.12
291 0.15
292 0.16
293 0.17
294 0.16
295 0.15
296 0.14
297 0.14
298 0.12
299 0.08
300 0.07
301 0.07
302 0.07
303 0.08
304 0.08
305 0.08
306 0.06
307 0.07
308 0.07
309 0.07
310 0.07
311 0.06
312 0.05
313 0.05
314 0.05
315 0.06
316 0.09
317 0.09
318 0.11
319 0.11
320 0.12
321 0.14
322 0.17
323 0.22
324 0.27
325 0.28
326 0.33
327 0.34
328 0.34
329 0.32
330 0.29
331 0.21
332 0.19
333 0.18
334 0.11
335 0.1
336 0.11
337 0.11
338 0.11
339 0.11
340 0.07
341 0.07
342 0.07
343 0.08
344 0.07
345 0.08
346 0.1
347 0.1
348 0.1
349 0.1
350 0.1
351 0.11
352 0.15
353 0.15
354 0.15
355 0.16
356 0.17
357 0.18
358 0.21
359 0.21
360 0.27
361 0.29
362 0.29
363 0.3
364 0.3
365 0.31
366 0.3
367 0.28
368 0.18
369 0.18
370 0.17
371 0.14
372 0.12
373 0.11
374 0.13
375 0.19
376 0.24
377 0.23
378 0.22
379 0.22
380 0.23
381 0.26
382 0.27
383 0.28
384 0.29
385 0.3
386 0.32
387 0.31
388 0.32
389 0.28
390 0.24
391 0.17
392 0.12
393 0.12
394 0.1
395 0.11
396 0.1
397 0.11
398 0.11
399 0.11
400 0.12
401 0.1
402 0.12
403 0.11
404 0.11
405 0.09
406 0.09
407 0.09
408 0.08
409 0.1
410 0.07
411 0.08
412 0.08
413 0.08
414 0.08
415 0.09
416 0.09
417 0.08
418 0.08
419 0.08
420 0.07
421 0.08
422 0.08
423 0.08
424 0.14
425 0.16
426 0.18
427 0.22
428 0.26
429 0.33
430 0.43
431 0.52
432 0.53
433 0.59
434 0.62
435 0.66
436 0.72
437 0.72
438 0.69
439 0.66
440 0.6
441 0.59
442 0.65
443 0.66
444 0.62
445 0.62
446 0.6
447 0.62
448 0.61
449 0.53
450 0.48
451 0.43
452 0.42
453 0.4
454 0.37
455 0.31
456 0.34
457 0.36
458 0.31
459 0.29
460 0.26
461 0.2
462 0.19
463 0.2
464 0.16
465 0.14
466 0.14
467 0.13
468 0.11
469 0.12
470 0.11
471 0.1
472 0.09
473 0.09
474 0.08
475 0.09
476 0.09
477 0.09
478 0.12
479 0.12
480 0.13
481 0.13
482 0.18
483 0.19
484 0.2
485 0.22
486 0.2
487 0.19
488 0.23
489 0.23
490 0.18
491 0.18
492 0.17
493 0.14
494 0.13
495 0.11
496 0.13
497 0.15
498 0.17
499 0.17
500 0.18
501 0.19
502 0.19
503 0.2
504 0.16
505 0.15
506 0.17
507 0.16
508 0.16
509 0.15
510 0.14
511 0.13
512 0.16
513 0.16
514 0.15
515 0.15
516 0.16
517 0.24
518 0.25
519 0.26
520 0.22
521 0.23
522 0.2
523 0.21
524 0.21
525 0.13
526 0.13
527 0.12
528 0.11
529 0.12
530 0.12
531 0.12
532 0.11
533 0.11
534 0.11
535 0.09
536 0.09
537 0.08
538 0.07
539 0.06
540 0.06
541 0.06
542 0.08
543 0.09
544 0.11
545 0.12
546 0.14
547 0.15
548 0.16
549 0.17
550 0.18
551 0.17
552 0.16
553 0.15
554 0.16
555 0.16
556 0.18
557 0.18
558 0.15
559 0.15
560 0.16
561 0.17
562 0.17
563 0.25
564 0.28
565 0.34
566 0.37
567 0.42
568 0.41
569 0.43
570 0.42
571 0.34
572 0.33
573 0.32
574 0.29
575 0.25
576 0.29
577 0.27
578 0.25
579 0.33
580 0.28
581 0.24
582 0.31
583 0.38
584 0.38
585 0.4
586 0.43
587 0.43
588 0.54
589 0.62
590 0.64
591 0.63
592 0.65
593 0.67
594 0.73
595 0.72
596 0.64
597 0.61
598 0.56
599 0.5
600 0.46
601 0.41
602 0.31
603 0.24
604 0.22
605 0.19
606 0.2
607 0.22
608 0.21
609 0.28
610 0.36
611 0.45
612 0.53
613 0.61
614 0.63
615 0.71
616 0.78
617 0.78
618 0.76
619 0.73
620 0.69
621 0.6
622 0.53
623 0.42
624 0.35
625 0.3
626 0.25
627 0.22
628 0.22
629 0.22
630 0.22
631 0.25
632 0.23
633 0.23
634 0.23
635 0.24
636 0.19
637 0.18
638 0.17
639 0.14
640 0.15
641 0.13
642 0.14
643 0.14
644 0.14
645 0.15
646 0.17
647 0.18
648 0.2
649 0.21
650 0.2
651 0.17
652 0.17
653 0.23
654 0.22
655 0.26
656 0.24
657 0.24
658 0.24
659 0.25
660 0.24