Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A8PTN4

Protein Details
Accession A8PTN4    Localization Confidence Low Confidence Score 9.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
624-649EEQLNPERLKPQKKRTRPVDVPCKYTHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto_nucl 13, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR022712  Beta_Casp  
IPR027075  CPSF2  
IPR025069  Cpsf2_C  
IPR035639  CPSF2_MBL  
IPR001279  Metallo-B-lactamas  
IPR036866  RibonucZ/Hydroxyglut_hydro  
IPR011108  RMMBL  
Gene Ontology GO:0005847  C:mRNA cleavage and polyadenylation specificity factor complex  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006379  P:mRNA cleavage  
GO:0006378  P:mRNA polyadenylation  
KEGG mgl:MGL_0452  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF10996  Beta-Casp  
PF13299  CPSF100_C  
PF16661  Lactamase_B_6  
PF07521  RMMBL  
CDD cd16293  CPSF2-like_MBL-fold  
Amino Acid Sequences MLNFTPLSGPYAPASDIRGDNAGGGGGGSSERSKALSYLLEIDQCRILLDCGAPEDLTFVDDTQLKQEGSHVWRGTLPDILERIGPTIDVVLLTHAEMSHLGLYAYAYANYGLQCPVYATLPVQTMGRLQMLEIVRSWRAEVDANLTSSKSEANSGLKRYIPTEAQVDDAFDAIRPLRYLEPTPLDGKCAGLVLTAYNAGHSLGGTVWKLRSPTVGTIVMALDWNHHRERHLDGTALLSVGAAAPLAHAIGRPDVLITDIERGLFTNARRKDRDAALLSQIHRTLTSGHSVLIPVDSAARLLEILVLLDQHWAFSYQHQRFPLCLVSHTGQEVVERARTFMEWMSREWAIQLLDAPEASSRRKTTSSSSSSSAATAKSPLDFSGLRFYSSVEALHQALTPSQVKVVLATPPALSHGLSRQLLPEFLCDPDALLILTSRGTPSSLVRNLWDRWNAKQADRDAWRQGHVGVPVSVGGQLSYELRRRVPLAGDELRTYVERQKAREAAADAPRARIQQPQREADDVDDDDASSSDSSSDDEFDGQPSRLPSTRTIAPERAQMQLNAAAPEPVGMSFDIFLRGQVSRDAVHYRMFPHIERKRKVDGYGESIDTSRWLARRRRLEAEQEEQLNPERLKPQKKRTRPVDVPCKYTSDTLNAAVRCHVLYVDLQGLNDGRALTTLVPQLQPRRLIMVNGDEATTLAVRAKLSRTHDLYTPDLGQTVSVGGLSNSYSVRLGDALMGSLRWHPMQDYNIVHLHVSPDFASDSDTPTLVPVNDAATVHTAQAPSTLYIGDLRLPALKAYLARQHRIRADFAGEGVLVCGDRDERNVTVTKQGTGRIVVEGSLSTNLARVRQSIYQLVAQVHR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.21
3 0.21
4 0.22
5 0.22
6 0.2
7 0.19
8 0.18
9 0.15
10 0.1
11 0.09
12 0.07
13 0.05
14 0.05
15 0.07
16 0.07
17 0.08
18 0.09
19 0.1
20 0.11
21 0.11
22 0.14
23 0.15
24 0.16
25 0.2
26 0.22
27 0.26
28 0.26
29 0.27
30 0.26
31 0.24
32 0.22
33 0.18
34 0.16
35 0.13
36 0.14
37 0.13
38 0.13
39 0.15
40 0.14
41 0.13
42 0.14
43 0.12
44 0.11
45 0.11
46 0.09
47 0.11
48 0.13
49 0.14
50 0.16
51 0.2
52 0.19
53 0.18
54 0.21
55 0.26
56 0.28
57 0.36
58 0.33
59 0.31
60 0.33
61 0.35
62 0.34
63 0.3
64 0.26
65 0.22
66 0.23
67 0.22
68 0.22
69 0.2
70 0.2
71 0.16
72 0.15
73 0.11
74 0.1
75 0.09
76 0.08
77 0.08
78 0.07
79 0.08
80 0.08
81 0.08
82 0.07
83 0.07
84 0.08
85 0.09
86 0.08
87 0.08
88 0.08
89 0.07
90 0.08
91 0.09
92 0.1
93 0.08
94 0.08
95 0.08
96 0.1
97 0.1
98 0.11
99 0.1
100 0.09
101 0.09
102 0.1
103 0.11
104 0.11
105 0.11
106 0.1
107 0.13
108 0.14
109 0.15
110 0.14
111 0.13
112 0.13
113 0.15
114 0.15
115 0.12
116 0.11
117 0.17
118 0.17
119 0.18
120 0.18
121 0.19
122 0.19
123 0.2
124 0.2
125 0.15
126 0.15
127 0.16
128 0.16
129 0.18
130 0.19
131 0.21
132 0.21
133 0.2
134 0.18
135 0.17
136 0.17
137 0.12
138 0.12
139 0.14
140 0.21
141 0.25
142 0.29
143 0.32
144 0.33
145 0.33
146 0.33
147 0.34
148 0.28
149 0.25
150 0.26
151 0.23
152 0.23
153 0.22
154 0.21
155 0.17
156 0.16
157 0.13
158 0.09
159 0.1
160 0.08
161 0.09
162 0.09
163 0.11
164 0.13
165 0.16
166 0.18
167 0.22
168 0.26
169 0.27
170 0.31
171 0.29
172 0.28
173 0.25
174 0.24
175 0.19
176 0.15
177 0.12
178 0.09
179 0.09
180 0.07
181 0.07
182 0.08
183 0.07
184 0.07
185 0.07
186 0.07
187 0.07
188 0.06
189 0.06
190 0.05
191 0.08
192 0.08
193 0.1
194 0.1
195 0.12
196 0.13
197 0.13
198 0.16
199 0.17
200 0.19
201 0.22
202 0.23
203 0.21
204 0.21
205 0.21
206 0.18
207 0.15
208 0.13
209 0.11
210 0.12
211 0.16
212 0.17
213 0.18
214 0.19
215 0.2
216 0.26
217 0.29
218 0.28
219 0.25
220 0.24
221 0.25
222 0.24
223 0.22
224 0.16
225 0.09
226 0.07
227 0.06
228 0.06
229 0.03
230 0.03
231 0.03
232 0.03
233 0.03
234 0.03
235 0.04
236 0.05
237 0.06
238 0.06
239 0.06
240 0.06
241 0.06
242 0.07
243 0.07
244 0.07
245 0.09
246 0.09
247 0.09
248 0.09
249 0.1
250 0.11
251 0.13
252 0.15
253 0.21
254 0.27
255 0.33
256 0.36
257 0.39
258 0.43
259 0.44
260 0.5
261 0.45
262 0.42
263 0.41
264 0.43
265 0.4
266 0.37
267 0.34
268 0.26
269 0.22
270 0.2
271 0.16
272 0.13
273 0.16
274 0.13
275 0.13
276 0.13
277 0.13
278 0.13
279 0.11
280 0.09
281 0.06
282 0.06
283 0.05
284 0.05
285 0.05
286 0.05
287 0.04
288 0.04
289 0.04
290 0.04
291 0.04
292 0.04
293 0.04
294 0.04
295 0.06
296 0.06
297 0.05
298 0.06
299 0.08
300 0.08
301 0.13
302 0.23
303 0.25
304 0.29
305 0.32
306 0.32
307 0.31
308 0.33
309 0.33
310 0.24
311 0.21
312 0.22
313 0.21
314 0.21
315 0.21
316 0.19
317 0.13
318 0.13
319 0.13
320 0.1
321 0.12
322 0.11
323 0.11
324 0.11
325 0.11
326 0.12
327 0.12
328 0.16
329 0.14
330 0.16
331 0.18
332 0.18
333 0.18
334 0.17
335 0.17
336 0.11
337 0.1
338 0.1
339 0.08
340 0.08
341 0.08
342 0.08
343 0.08
344 0.09
345 0.1
346 0.13
347 0.13
348 0.16
349 0.18
350 0.19
351 0.23
352 0.31
353 0.34
354 0.34
355 0.35
356 0.34
357 0.33
358 0.32
359 0.27
360 0.19
361 0.14
362 0.13
363 0.11
364 0.1
365 0.1
366 0.09
367 0.11
368 0.11
369 0.12
370 0.18
371 0.18
372 0.18
373 0.17
374 0.18
375 0.16
376 0.16
377 0.15
378 0.08
379 0.09
380 0.09
381 0.09
382 0.09
383 0.08
384 0.08
385 0.1
386 0.1
387 0.09
388 0.09
389 0.09
390 0.08
391 0.09
392 0.1
393 0.09
394 0.09
395 0.09
396 0.09
397 0.08
398 0.1
399 0.1
400 0.09
401 0.08
402 0.09
403 0.13
404 0.13
405 0.13
406 0.13
407 0.13
408 0.14
409 0.13
410 0.13
411 0.1
412 0.1
413 0.1
414 0.08
415 0.08
416 0.07
417 0.07
418 0.05
419 0.04
420 0.04
421 0.04
422 0.04
423 0.04
424 0.04
425 0.04
426 0.05
427 0.05
428 0.07
429 0.13
430 0.15
431 0.15
432 0.16
433 0.2
434 0.21
435 0.24
436 0.29
437 0.25
438 0.25
439 0.32
440 0.33
441 0.31
442 0.34
443 0.33
444 0.34
445 0.36
446 0.37
447 0.34
448 0.34
449 0.33
450 0.28
451 0.27
452 0.22
453 0.19
454 0.17
455 0.12
456 0.11
457 0.1
458 0.1
459 0.09
460 0.07
461 0.06
462 0.04
463 0.05
464 0.06
465 0.08
466 0.11
467 0.12
468 0.13
469 0.14
470 0.15
471 0.16
472 0.17
473 0.16
474 0.2
475 0.22
476 0.23
477 0.22
478 0.21
479 0.21
480 0.2
481 0.19
482 0.17
483 0.2
484 0.21
485 0.23
486 0.28
487 0.3
488 0.3
489 0.32
490 0.29
491 0.29
492 0.31
493 0.35
494 0.3
495 0.29
496 0.3
497 0.28
498 0.27
499 0.28
500 0.29
501 0.32
502 0.37
503 0.39
504 0.4
505 0.4
506 0.4
507 0.34
508 0.31
509 0.23
510 0.18
511 0.14
512 0.11
513 0.1
514 0.1
515 0.09
516 0.06
517 0.05
518 0.05
519 0.05
520 0.06
521 0.06
522 0.07
523 0.07
524 0.08
525 0.08
526 0.1
527 0.12
528 0.11
529 0.12
530 0.12
531 0.15
532 0.15
533 0.17
534 0.18
535 0.21
536 0.25
537 0.28
538 0.32
539 0.33
540 0.32
541 0.36
542 0.36
543 0.34
544 0.3
545 0.26
546 0.23
547 0.23
548 0.23
549 0.18
550 0.16
551 0.13
552 0.12
553 0.12
554 0.1
555 0.06
556 0.06
557 0.05
558 0.05
559 0.06
560 0.06
561 0.08
562 0.07
563 0.08
564 0.09
565 0.09
566 0.09
567 0.1
568 0.12
569 0.1
570 0.13
571 0.16
572 0.15
573 0.17
574 0.17
575 0.18
576 0.21
577 0.23
578 0.22
579 0.3
580 0.36
581 0.44
582 0.47
583 0.5
584 0.53
585 0.54
586 0.55
587 0.51
588 0.47
589 0.44
590 0.44
591 0.39
592 0.32
593 0.29
594 0.27
595 0.21
596 0.18
597 0.14
598 0.15
599 0.21
600 0.28
601 0.36
602 0.45
603 0.5
604 0.56
605 0.58
606 0.64
607 0.63
608 0.61
609 0.58
610 0.52
611 0.47
612 0.41
613 0.39
614 0.35
615 0.28
616 0.25
617 0.27
618 0.31
619 0.41
620 0.49
621 0.58
622 0.63
623 0.73
624 0.8
625 0.83
626 0.86
627 0.85
628 0.86
629 0.86
630 0.8
631 0.76
632 0.68
633 0.63
634 0.54
635 0.47
636 0.39
637 0.32
638 0.29
639 0.27
640 0.31
641 0.27
642 0.26
643 0.24
644 0.24
645 0.19
646 0.17
647 0.13
648 0.09
649 0.09
650 0.11
651 0.14
652 0.14
653 0.14
654 0.14
655 0.15
656 0.14
657 0.14
658 0.12
659 0.07
660 0.07
661 0.08
662 0.08
663 0.1
664 0.12
665 0.13
666 0.15
667 0.19
668 0.25
669 0.29
670 0.31
671 0.29
672 0.31
673 0.3
674 0.29
675 0.29
676 0.28
677 0.26
678 0.24
679 0.24
680 0.19
681 0.18
682 0.17
683 0.14
684 0.09
685 0.07
686 0.08
687 0.09
688 0.11
689 0.14
690 0.19
691 0.25
692 0.32
693 0.35
694 0.36
695 0.4
696 0.42
697 0.42
698 0.4
699 0.36
700 0.28
701 0.25
702 0.22
703 0.18
704 0.14
705 0.11
706 0.08
707 0.06
708 0.06
709 0.05
710 0.06
711 0.06
712 0.08
713 0.07
714 0.08
715 0.09
716 0.09
717 0.1
718 0.09
719 0.09
720 0.09
721 0.09
722 0.09
723 0.09
724 0.09
725 0.09
726 0.11
727 0.12
728 0.11
729 0.12
730 0.13
731 0.17
732 0.2
733 0.26
734 0.26
735 0.28
736 0.3
737 0.3
738 0.28
739 0.24
740 0.24
741 0.18
742 0.17
743 0.13
744 0.12
745 0.12
746 0.12
747 0.15
748 0.13
749 0.17
750 0.17
751 0.16
752 0.15
753 0.15
754 0.17
755 0.13
756 0.13
757 0.1
758 0.11
759 0.12
760 0.12
761 0.13
762 0.14
763 0.15
764 0.15
765 0.16
766 0.15
767 0.13
768 0.15
769 0.16
770 0.13
771 0.13
772 0.12
773 0.11
774 0.12
775 0.13
776 0.13
777 0.12
778 0.12
779 0.15
780 0.15
781 0.15
782 0.15
783 0.16
784 0.15
785 0.19
786 0.27
787 0.3
788 0.37
789 0.41
790 0.48
791 0.53
792 0.55
793 0.53
794 0.47
795 0.46
796 0.4
797 0.36
798 0.3
799 0.22
800 0.19
801 0.16
802 0.13
803 0.09
804 0.07
805 0.08
806 0.08
807 0.09
808 0.12
809 0.16
810 0.16
811 0.2
812 0.24
813 0.25
814 0.32
815 0.32
816 0.33
817 0.32
818 0.34
819 0.33
820 0.32
821 0.32
822 0.26
823 0.24
824 0.21
825 0.19
826 0.16
827 0.15
828 0.14
829 0.13
830 0.1
831 0.13
832 0.14
833 0.17
834 0.18
835 0.18
836 0.21
837 0.25
838 0.3
839 0.31
840 0.33
841 0.34
842 0.36