Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q2HF38

Protein Details
Accession Q2HF38    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
106-131VAKSSGKATTKKRRRPSKKLVTTLESHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
104-124SRVAKSSGKATTKKRRRPSKK
159-181GKVRHKSLKSRPGALKRKERLVK
Subcellular Location(s) mito 22, cyto_mito 13, nucl 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR028160  Slx9-like  
Gene Ontology GO:0030686  C:90S preribosome  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0030688  C:preribosome, small subunit precursor  
GO:0000462  P:maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
Pfam View protein in Pfam  
PF15341  SLX9  
Amino Acid Sequences MKLWKRLLAEKNPIFRLCRCRAEMKCPSPTIIEILGRLGEQPSSHQAPTAPAPSKRLTARQKARARLADPLLPRKLHRENNVVSDQFIDSKRDKRLIKHSSFLSRVAKSSGKATTKKRRRPSKKLVTTLESLGDALEDIQADIEEEDAGAMDAEQARQGKVRHKSLKSRPGALKRKERLVKGEMERFGRSLAQLANISAAAAPVLGTAAGAGAAAAGSGSGSAGQEKMDMEGETQTAAPAQPAATSGRWAALRGFISATMEQNPAFLNKT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.62
2 0.6
3 0.6
4 0.57
5 0.57
6 0.54
7 0.58
8 0.6
9 0.66
10 0.7
11 0.68
12 0.68
13 0.62
14 0.59
15 0.52
16 0.48
17 0.42
18 0.35
19 0.29
20 0.21
21 0.2
22 0.19
23 0.16
24 0.16
25 0.13
26 0.1
27 0.09
28 0.12
29 0.17
30 0.2
31 0.2
32 0.21
33 0.21
34 0.23
35 0.27
36 0.31
37 0.3
38 0.28
39 0.33
40 0.34
41 0.38
42 0.38
43 0.44
44 0.46
45 0.51
46 0.59
47 0.65
48 0.71
49 0.73
50 0.77
51 0.74
52 0.67
53 0.63
54 0.57
55 0.52
56 0.49
57 0.49
58 0.46
59 0.41
60 0.4
61 0.41
62 0.46
63 0.47
64 0.49
65 0.49
66 0.47
67 0.52
68 0.56
69 0.49
70 0.4
71 0.35
72 0.29
73 0.25
74 0.23
75 0.21
76 0.19
77 0.24
78 0.28
79 0.33
80 0.35
81 0.37
82 0.47
83 0.52
84 0.53
85 0.53
86 0.53
87 0.53
88 0.52
89 0.51
90 0.46
91 0.37
92 0.34
93 0.32
94 0.3
95 0.24
96 0.25
97 0.27
98 0.27
99 0.32
100 0.41
101 0.48
102 0.57
103 0.66
104 0.72
105 0.77
106 0.82
107 0.86
108 0.88
109 0.88
110 0.88
111 0.86
112 0.81
113 0.73
114 0.65
115 0.55
116 0.45
117 0.33
118 0.24
119 0.15
120 0.11
121 0.07
122 0.05
123 0.04
124 0.03
125 0.03
126 0.03
127 0.03
128 0.03
129 0.03
130 0.03
131 0.03
132 0.03
133 0.02
134 0.03
135 0.03
136 0.02
137 0.02
138 0.03
139 0.03
140 0.03
141 0.05
142 0.06
143 0.06
144 0.1
145 0.12
146 0.19
147 0.26
148 0.35
149 0.42
150 0.47
151 0.57
152 0.64
153 0.72
154 0.68
155 0.69
156 0.68
157 0.7
158 0.74
159 0.72
160 0.73
161 0.67
162 0.73
163 0.71
164 0.66
165 0.61
166 0.55
167 0.56
168 0.51
169 0.54
170 0.48
171 0.46
172 0.44
173 0.38
174 0.35
175 0.27
176 0.21
177 0.17
178 0.14
179 0.14
180 0.13
181 0.13
182 0.13
183 0.12
184 0.12
185 0.09
186 0.08
187 0.05
188 0.04
189 0.04
190 0.03
191 0.03
192 0.03
193 0.03
194 0.02
195 0.03
196 0.02
197 0.02
198 0.02
199 0.02
200 0.02
201 0.02
202 0.02
203 0.02
204 0.02
205 0.02
206 0.02
207 0.03
208 0.03
209 0.04
210 0.05
211 0.05
212 0.06
213 0.07
214 0.08
215 0.1
216 0.1
217 0.1
218 0.11
219 0.11
220 0.11
221 0.11
222 0.09
223 0.08
224 0.08
225 0.08
226 0.07
227 0.07
228 0.07
229 0.08
230 0.12
231 0.12
232 0.14
233 0.14
234 0.17
235 0.17
236 0.18
237 0.18
238 0.2
239 0.2
240 0.2
241 0.21
242 0.17
243 0.21
244 0.21
245 0.22
246 0.2
247 0.21
248 0.19
249 0.19
250 0.19