Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A8Q5L5

Protein Details
Accession A8Q5L5    Localization Confidence Low Confidence Score 8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
288-312EWCIEKAQKRAQKLRKLIKDALQKRHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
300-303KLRK
Subcellular Location(s) cysk 15, cyto 12
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001247  ExoRNase_PH_dom1  
IPR036345  ExoRNase_PH_dom2_sf  
IPR027408  PNPase/RNase_PH_dom_sf  
IPR020568  Ribosomal_S5_D2-typ_fold  
IPR033196  Rrp43  
Gene Ontology GO:0000176  C:nuclear exosome (RNase complex)  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0006401  P:RNA catabolic process  
GO:0006364  P:rRNA processing  
KEGG mgl:MGL_2792  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01138  RNase_PH  
CDD cd11369  RNase_PH_RRP43  
Amino Acid Sequences MSVSAGTSSSDMEKIDVASAPVTIFKKLHPVEYLERHLKERIREDGRTLDQLRSVSVATGTLSQPFGSALVRLGEGTLVTASVTARIAHPTLERPNEGFLIPSVDLSSLCSPLYNAGPPEEEGQVLTHNLQMFLNNSGILPRSALCIEKGLAVWAIYVDVVCVSAEGSVLDAAALATVAALHDCQLPRIDRFVNSSQAIFDPDTKERLPLMNLPIFMTLGMYESTYVLADLTAFEESLCTGSIQVGLVDVNNEVNDPDIAKYDVFWLKVLGPCTTKHPQPLENEALIEWCIEKAQKRAQKLRKLIKDALQKRA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.14
3 0.13
4 0.12
5 0.11
6 0.11
7 0.11
8 0.15
9 0.16
10 0.17
11 0.17
12 0.17
13 0.27
14 0.27
15 0.31
16 0.29
17 0.33
18 0.39
19 0.46
20 0.53
21 0.51
22 0.52
23 0.5
24 0.54
25 0.52
26 0.51
27 0.49
28 0.51
29 0.5
30 0.49
31 0.5
32 0.53
33 0.52
34 0.53
35 0.49
36 0.41
37 0.37
38 0.36
39 0.33
40 0.26
41 0.22
42 0.15
43 0.13
44 0.12
45 0.09
46 0.12
47 0.11
48 0.12
49 0.12
50 0.11
51 0.11
52 0.11
53 0.11
54 0.08
55 0.08
56 0.08
57 0.08
58 0.08
59 0.08
60 0.08
61 0.07
62 0.07
63 0.07
64 0.05
65 0.04
66 0.04
67 0.05
68 0.05
69 0.06
70 0.06
71 0.06
72 0.07
73 0.09
74 0.1
75 0.11
76 0.12
77 0.16
78 0.22
79 0.25
80 0.25
81 0.24
82 0.26
83 0.26
84 0.24
85 0.19
86 0.13
87 0.14
88 0.13
89 0.12
90 0.1
91 0.09
92 0.09
93 0.12
94 0.13
95 0.09
96 0.09
97 0.09
98 0.09
99 0.1
100 0.12
101 0.11
102 0.1
103 0.1
104 0.11
105 0.12
106 0.14
107 0.13
108 0.11
109 0.1
110 0.1
111 0.09
112 0.09
113 0.09
114 0.08
115 0.08
116 0.09
117 0.08
118 0.09
119 0.09
120 0.1
121 0.1
122 0.08
123 0.08
124 0.08
125 0.09
126 0.08
127 0.07
128 0.06
129 0.07
130 0.08
131 0.08
132 0.08
133 0.09
134 0.09
135 0.09
136 0.09
137 0.08
138 0.07
139 0.07
140 0.06
141 0.05
142 0.05
143 0.04
144 0.03
145 0.03
146 0.02
147 0.03
148 0.03
149 0.03
150 0.03
151 0.03
152 0.03
153 0.03
154 0.03
155 0.03
156 0.03
157 0.03
158 0.03
159 0.03
160 0.02
161 0.02
162 0.02
163 0.02
164 0.02
165 0.02
166 0.02
167 0.02
168 0.03
169 0.06
170 0.06
171 0.07
172 0.1
173 0.12
174 0.12
175 0.16
176 0.17
177 0.15
178 0.21
179 0.23
180 0.25
181 0.24
182 0.24
183 0.21
184 0.21
185 0.22
186 0.17
187 0.16
188 0.15
189 0.16
190 0.19
191 0.18
192 0.19
193 0.18
194 0.19
195 0.18
196 0.19
197 0.23
198 0.22
199 0.22
200 0.22
201 0.21
202 0.2
203 0.17
204 0.13
205 0.08
206 0.07
207 0.06
208 0.06
209 0.06
210 0.06
211 0.06
212 0.06
213 0.06
214 0.05
215 0.04
216 0.04
217 0.04
218 0.05
219 0.05
220 0.05
221 0.05
222 0.05
223 0.05
224 0.06
225 0.06
226 0.05
227 0.05
228 0.06
229 0.07
230 0.07
231 0.06
232 0.06
233 0.06
234 0.06
235 0.06
236 0.06
237 0.06
238 0.06
239 0.06
240 0.06
241 0.07
242 0.07
243 0.07
244 0.08
245 0.09
246 0.1
247 0.1
248 0.1
249 0.15
250 0.18
251 0.18
252 0.18
253 0.17
254 0.19
255 0.23
256 0.24
257 0.22
258 0.21
259 0.21
260 0.28
261 0.33
262 0.33
263 0.38
264 0.42
265 0.44
266 0.48
267 0.55
268 0.53
269 0.48
270 0.45
271 0.38
272 0.33
273 0.28
274 0.23
275 0.15
276 0.09
277 0.1
278 0.12
279 0.16
280 0.21
281 0.31
282 0.37
283 0.46
284 0.57
285 0.65
286 0.72
287 0.79
288 0.83
289 0.83
290 0.85
291 0.83
292 0.81
293 0.82