Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A8PTE0

Protein Details
Accession A8PTE0    Localization Confidence High Confidence Score 22.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-23MARSGSKRSRKKHETPRDTDSAEHydrophilic
179-198HAYARAKKYRHELRRQEREHBasic
330-355APDLTIPPPPRRKRSRHSFSGRTSSLHydrophilic
396-422TDDTNSHMRRPKRQPSRPRGSRSSSTVHydrophilic
453-472DRVPHHRPGRPTFHPRYRGGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
8-11RSRK
183-209RAKKYRHELRRQEREHAREKKQQKPKP
340-343RRKR
404-417RRPKRQPSRPRGSR
431-463QHRRGSRGRGDHFGHRRGRGHVDRVPHHRPGRP
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto_nucl 12, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001878  Znf_CCHC  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
KEGG mgl:MGL_0409  -  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
Amino Acid Sequences MARSGSKRSRKKHETPRDTDSAEPSFVLDTNSENVRPEASITRNEAHEVPRNATDLDLPEHVAIVSDRSRPVDVYQAADTGSVESATGQDADGAYEQLDADGTRYYEAEANNERKRKGVCPVCGEAGHEKKRCPYQQDCPVPRIGGRSRTCERCGSSSHPETTCHTWWRLYAYNTPEKHAYARAKKYRHELRRQEREHAREKKQQKPKPGWAASLVMMPEDVDDDAGPSDDSSDSSSNSSGDADTNDAARKRMTSSRNTVPLPPSDWDPALKVCYNCASVGHHWGDDCFLRRTNPTRPTGDPSPFSEVIANAGPYSQAYAVRDGSVRSHAPDLTIPPPPRRKRSRHSFSGRTSSLLEDLQNSGSTNKDDDDDDDDDDDWFARHQKLREQESFLSDTDDTNSHMRRPKRQPSRPRGSRSSSTVPPTTPTAHQHRRGSRGRGDHFGHRRGRGHVDRVPHHRPGRPTFHPRYRGGYT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.9
2 0.88
3 0.87
4 0.84
5 0.76
6 0.69
7 0.64
8 0.56
9 0.46
10 0.38
11 0.31
12 0.24
13 0.22
14 0.2
15 0.14
16 0.13
17 0.15
18 0.18
19 0.18
20 0.19
21 0.19
22 0.19
23 0.18
24 0.19
25 0.22
26 0.23
27 0.27
28 0.31
29 0.33
30 0.33
31 0.36
32 0.35
33 0.34
34 0.39
35 0.38
36 0.36
37 0.36
38 0.36
39 0.34
40 0.31
41 0.29
42 0.22
43 0.22
44 0.2
45 0.18
46 0.16
47 0.16
48 0.16
49 0.14
50 0.11
51 0.12
52 0.14
53 0.16
54 0.17
55 0.2
56 0.21
57 0.21
58 0.22
59 0.27
60 0.25
61 0.26
62 0.25
63 0.24
64 0.23
65 0.22
66 0.21
67 0.13
68 0.12
69 0.08
70 0.07
71 0.06
72 0.06
73 0.07
74 0.07
75 0.06
76 0.06
77 0.06
78 0.08
79 0.08
80 0.08
81 0.07
82 0.07
83 0.07
84 0.06
85 0.07
86 0.05
87 0.06
88 0.07
89 0.07
90 0.07
91 0.08
92 0.09
93 0.12
94 0.12
95 0.17
96 0.24
97 0.31
98 0.38
99 0.43
100 0.42
101 0.43
102 0.46
103 0.43
104 0.46
105 0.47
106 0.46
107 0.48
108 0.51
109 0.5
110 0.47
111 0.46
112 0.44
113 0.45
114 0.47
115 0.43
116 0.41
117 0.43
118 0.52
119 0.54
120 0.53
121 0.51
122 0.53
123 0.6
124 0.7
125 0.68
126 0.62
127 0.59
128 0.53
129 0.47
130 0.44
131 0.38
132 0.36
133 0.36
134 0.4
135 0.44
136 0.49
137 0.5
138 0.48
139 0.47
140 0.4
141 0.42
142 0.41
143 0.43
144 0.42
145 0.44
146 0.4
147 0.39
148 0.4
149 0.42
150 0.39
151 0.34
152 0.31
153 0.27
154 0.27
155 0.3
156 0.31
157 0.28
158 0.3
159 0.32
160 0.39
161 0.39
162 0.4
163 0.37
164 0.33
165 0.32
166 0.33
167 0.35
168 0.36
169 0.45
170 0.51
171 0.54
172 0.56
173 0.64
174 0.68
175 0.69
176 0.71
177 0.72
178 0.74
179 0.81
180 0.8
181 0.79
182 0.77
183 0.74
184 0.73
185 0.72
186 0.68
187 0.67
188 0.72
189 0.72
190 0.75
191 0.74
192 0.73
193 0.73
194 0.75
195 0.76
196 0.71
197 0.63
198 0.55
199 0.52
200 0.42
201 0.35
202 0.26
203 0.15
204 0.12
205 0.1
206 0.07
207 0.06
208 0.05
209 0.03
210 0.03
211 0.04
212 0.04
213 0.04
214 0.04
215 0.03
216 0.04
217 0.04
218 0.05
219 0.07
220 0.07
221 0.08
222 0.09
223 0.09
224 0.08
225 0.09
226 0.09
227 0.07
228 0.07
229 0.06
230 0.07
231 0.07
232 0.08
233 0.1
234 0.1
235 0.1
236 0.1
237 0.1
238 0.12
239 0.19
240 0.22
241 0.26
242 0.32
243 0.38
244 0.43
245 0.44
246 0.43
247 0.39
248 0.36
249 0.33
250 0.27
251 0.24
252 0.2
253 0.2
254 0.17
255 0.16
256 0.16
257 0.16
258 0.17
259 0.15
260 0.14
261 0.16
262 0.16
263 0.15
264 0.15
265 0.16
266 0.14
267 0.2
268 0.2
269 0.18
270 0.17
271 0.17
272 0.17
273 0.15
274 0.17
275 0.14
276 0.14
277 0.15
278 0.19
279 0.24
280 0.31
281 0.37
282 0.39
283 0.41
284 0.43
285 0.48
286 0.51
287 0.5
288 0.44
289 0.39
290 0.42
291 0.37
292 0.35
293 0.29
294 0.23
295 0.21
296 0.19
297 0.16
298 0.09
299 0.08
300 0.08
301 0.07
302 0.08
303 0.07
304 0.08
305 0.09
306 0.11
307 0.12
308 0.13
309 0.14
310 0.13
311 0.14
312 0.16
313 0.16
314 0.15
315 0.17
316 0.16
317 0.16
318 0.18
319 0.2
320 0.19
321 0.25
322 0.26
323 0.32
324 0.42
325 0.49
326 0.57
327 0.63
328 0.69
329 0.72
330 0.81
331 0.82
332 0.83
333 0.85
334 0.84
335 0.82
336 0.82
337 0.72
338 0.63
339 0.55
340 0.45
341 0.38
342 0.3
343 0.23
344 0.15
345 0.16
346 0.15
347 0.14
348 0.13
349 0.12
350 0.13
351 0.13
352 0.13
353 0.12
354 0.12
355 0.12
356 0.14
357 0.19
358 0.19
359 0.19
360 0.19
361 0.18
362 0.17
363 0.17
364 0.15
365 0.1
366 0.09
367 0.11
368 0.15
369 0.2
370 0.22
371 0.29
372 0.38
373 0.46
374 0.5
375 0.53
376 0.51
377 0.51
378 0.51
379 0.44
380 0.39
381 0.31
382 0.27
383 0.23
384 0.21
385 0.18
386 0.21
387 0.22
388 0.25
389 0.32
390 0.37
391 0.45
392 0.54
393 0.63
394 0.69
395 0.77
396 0.83
397 0.87
398 0.92
399 0.92
400 0.91
401 0.88
402 0.85
403 0.81
404 0.78
405 0.74
406 0.69
407 0.66
408 0.6
409 0.52
410 0.47
411 0.45
412 0.4
413 0.38
414 0.39
415 0.43
416 0.49
417 0.57
418 0.63
419 0.67
420 0.73
421 0.77
422 0.77
423 0.75
424 0.75
425 0.72
426 0.71
427 0.68
428 0.69
429 0.69
430 0.7
431 0.69
432 0.65
433 0.65
434 0.61
435 0.67
436 0.64
437 0.64
438 0.59
439 0.61
440 0.63
441 0.67
442 0.69
443 0.68
444 0.67
445 0.65
446 0.69
447 0.69
448 0.7
449 0.71
450 0.75
451 0.76
452 0.8
453 0.81
454 0.77