FuNGI

A8Q4I8

Protein Details

Accession

A8Q4I8

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
135-154	TRNRMFKKRVREVHKSSSSA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 21, cyto 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
KEGG	mgl:MGL_2547 -

Amino Acid Sequences

MKQEHGIKSEPEDVKPSVQQRGFRDIPLFSMGSSNAVTHLMKFATHTRVDPNNESQFTPPVKLNRKLPLRVKMPPAKPGDQVIDKWGKPVMDKEGHALKWPSHDVDLETIRPYLDIDKPAAQENDASTGSGTSFTRNRMFKKRVREVHKSSSSARRTRNEEYYPWVLEDFETPQEWESSREPLPNSLKALEAWYFAEKERRESRRELPAPEIKQEANSSSSTMAPHAPWVGQLEGDSDETSTSHHVLFAFDDRNAGGFKVVPVRRQYKFMQLHKRVLTSEQVEEEFERHQRSSETERWFMRDRYNTGAGLGAPGGSSSGQARGRMPALALPGQPSLGWQSSSRLVAVSGEPQRRADDDDDLFGTVRKNETTYDELDFEDSFEDDDERADGQDDDDADAKELDERLKREMVADRLDDAHVKREPDELDDAVAVNRRSGADNLLGSSEYGRHDDAMLTGSGRQMRKIMKALSRREGLDTYDSDEEAKNPYASEESDESDEELTVLHPERALLAAREQKARLEKTKESSAASTPPTRSETPELESGVKRKNETARLDEAKKKARTESRSTSPVRSGSPSARSLSPLETEIVQLISSGRVASTSDLVQHFRARLKQDLSLKEQLSSAVKRIAYMDKKENKLKLKESVLADAGAISPRGSRP

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.39
2	0.44
3	0.44
4	0.44
5	0.45
6	0.5
7	0.5
8	0.57
9	0.54
10	0.51
11	0.49
12	0.4
13	0.39
14	0.36
15	0.31
16	0.22
17	0.23
18	0.2
19	0.19
20	0.18
21	0.16
22	0.12
23	0.15
24	0.15
25	0.13
26	0.16
27	0.14
28	0.14
29	0.17
30	0.22
31	0.25
32	0.27
33	0.28
34	0.32
35	0.39
36	0.46
37	0.48
38	0.5
39	0.52
40	0.52
41	0.52
42	0.47
43	0.47
44	0.43
45	0.4
46	0.37
47	0.39
48	0.45
49	0.51
50	0.55
51	0.58
52	0.64
53	0.69
54	0.73
55	0.73
56	0.71
57	0.71
58	0.74
59	0.74
60	0.7
61	0.69
62	0.68
63	0.62
64	0.58
65	0.56
66	0.53
67	0.47
68	0.44
69	0.44
70	0.45
71	0.41
72	0.4
73	0.37
74	0.31
75	0.29
76	0.32
77	0.32
78	0.3
79	0.31
80	0.35
81	0.4
82	0.39
83	0.43
84	0.41
85	0.34
86	0.34
87	0.37
88	0.33
89	0.27
90	0.28
91	0.24
92	0.28
93	0.29
94	0.25
95	0.23
96	0.21
97	0.2
98	0.19
99	0.18
100	0.16
101	0.17
102	0.18
103	0.2
104	0.24
105	0.25
106	0.3
107	0.29
108	0.26
109	0.24
110	0.22
111	0.23
112	0.19
113	0.18
114	0.14
115	0.13
116	0.13
117	0.14
118	0.13
119	0.13
120	0.15
121	0.19
122	0.26
123	0.31
124	0.38
125	0.45
126	0.53
127	0.55
128	0.64
129	0.7
130	0.72
131	0.75
132	0.79
133	0.77
134	0.8
135	0.81
136	0.73
137	0.69
138	0.69
139	0.69
140	0.66
141	0.66
142	0.62
143	0.62
144	0.64
145	0.67
146	0.62
147	0.56
148	0.55
149	0.52
150	0.46
151	0.4
152	0.34
153	0.26
154	0.21
155	0.2
156	0.16
157	0.13
158	0.13
159	0.12
160	0.13
161	0.14
162	0.14
163	0.16
164	0.15
165	0.18
166	0.19
167	0.22
168	0.23
169	0.29
170	0.33
171	0.32
172	0.33
173	0.29
174	0.28
175	0.25
176	0.27
177	0.2
178	0.17
179	0.15
180	0.15
181	0.15
182	0.15
183	0.22
184	0.2
185	0.26
186	0.34
187	0.37
188	0.4
189	0.44
190	0.5
191	0.54
192	0.57
193	0.53
194	0.52
195	0.55
196	0.53
197	0.5
198	0.47
199	0.36
200	0.33
201	0.31
202	0.26
203	0.2
204	0.18
205	0.16
206	0.14
207	0.15
208	0.14
209	0.14
210	0.13
211	0.11
212	0.11
213	0.11
214	0.1
215	0.1
216	0.12
217	0.11
218	0.09
219	0.09
220	0.09
221	0.1
222	0.1
223	0.1
224	0.08
225	0.08
226	0.07
227	0.08
228	0.08
229	0.08
230	0.07
231	0.08
232	0.08
233	0.09
234	0.1
235	0.13
236	0.13
237	0.12
238	0.12
239	0.11
240	0.12
241	0.12
242	0.1
243	0.07
244	0.06
245	0.07
246	0.16
247	0.17
248	0.2
249	0.25
250	0.32
251	0.33
252	0.37
253	0.38
254	0.39
255	0.47
256	0.52
257	0.57
258	0.57
259	0.63
260	0.6
261	0.6
262	0.5
263	0.43
264	0.39
265	0.3
266	0.26
267	0.2
268	0.18
269	0.17
270	0.17
271	0.16
272	0.13
273	0.13
274	0.14
275	0.12
276	0.13
277	0.13
278	0.17
279	0.23
280	0.28
281	0.31
282	0.34
283	0.34
284	0.38
285	0.41
286	0.39
287	0.38
288	0.35
289	0.33
290	0.33
291	0.35
292	0.3
293	0.27
294	0.26
295	0.19
296	0.15
297	0.12
298	0.07
299	0.04
300	0.04
301	0.04
302	0.03
303	0.04
304	0.04
305	0.09
306	0.1
307	0.11
308	0.12
309	0.13
310	0.14
311	0.13
312	0.13
313	0.1
314	0.11
315	0.12
316	0.11
317	0.11
318	0.11
319	0.11
320	0.11
321	0.09
322	0.1
323	0.09
324	0.1
325	0.08
326	0.1
327	0.12
328	0.13
329	0.12
330	0.1
331	0.09
332	0.09
333	0.1
334	0.13
335	0.17
336	0.19
337	0.2
338	0.21
339	0.21
340	0.21
341	0.24
342	0.19
343	0.18
344	0.16
345	0.17
346	0.16
347	0.16
348	0.15
349	0.13
350	0.12
351	0.09
352	0.09
353	0.08
354	0.09
355	0.09
356	0.13
357	0.15
358	0.16
359	0.17
360	0.17
361	0.17
362	0.17
363	0.16
364	0.13
365	0.1
366	0.08
367	0.06
368	0.06
369	0.06
370	0.05
371	0.05
372	0.06
373	0.06
374	0.06
375	0.06
376	0.06
377	0.06
378	0.07
379	0.07
380	0.07
381	0.09
382	0.09
383	0.09
384	0.09
385	0.08
386	0.08
387	0.09
388	0.11
389	0.13
390	0.14
391	0.17
392	0.18
393	0.18
394	0.2
395	0.23
396	0.24
397	0.24
398	0.23
399	0.21
400	0.21
401	0.21
402	0.21
403	0.17
404	0.19
405	0.18
406	0.18
407	0.18
408	0.2
409	0.21
410	0.21
411	0.23
412	0.18
413	0.16
414	0.15
415	0.15
416	0.12
417	0.15
418	0.12
419	0.09
420	0.1
421	0.1
422	0.12
423	0.12
424	0.13
425	0.13
426	0.13
427	0.14
428	0.13
429	0.13
430	0.11
431	0.11
432	0.11
433	0.09
434	0.1
435	0.1
436	0.1
437	0.1
438	0.11
439	0.11
440	0.1
441	0.09
442	0.08
443	0.08
444	0.1
445	0.15
446	0.15
447	0.15
448	0.18
449	0.21
450	0.25
451	0.3
452	0.34
453	0.36
454	0.45
455	0.5
456	0.52
457	0.52
458	0.49
459	0.47
460	0.42
461	0.37
462	0.32
463	0.27
464	0.24
465	0.22
466	0.21
467	0.19
468	0.18
469	0.16
470	0.16
471	0.17
472	0.13
473	0.12
474	0.13
475	0.13
476	0.14
477	0.17
478	0.15
479	0.15
480	0.16
481	0.17
482	0.16
483	0.15
484	0.15
485	0.11
486	0.09
487	0.07
488	0.08
489	0.09
490	0.08
491	0.08
492	0.08
493	0.09
494	0.1
495	0.11
496	0.1
497	0.15
498	0.22
499	0.24
500	0.28
501	0.28
502	0.32
503	0.38
504	0.43
505	0.45
506	0.45
507	0.47
508	0.5
509	0.57
510	0.55
511	0.5
512	0.47
513	0.42
514	0.4
515	0.38
516	0.37
517	0.31
518	0.32
519	0.35
520	0.33
521	0.35
522	0.36
523	0.35
524	0.33
525	0.36
526	0.34
527	0.34
528	0.36
529	0.36
530	0.38
531	0.37
532	0.35
533	0.38
534	0.43
535	0.47
536	0.5
537	0.51
538	0.53
539	0.57
540	0.62
541	0.63
542	0.63
543	0.64
544	0.64
545	0.6
546	0.6
547	0.62
548	0.63
549	0.65
550	0.66
551	0.65
552	0.68
553	0.69
554	0.65
555	0.61
556	0.57
557	0.51
558	0.47
559	0.44
560	0.41
561	0.43
562	0.42
563	0.4
564	0.37
565	0.37
566	0.35
567	0.33
568	0.29
569	0.25
570	0.22
571	0.19
572	0.19
573	0.17
574	0.15
575	0.12
576	0.1
577	0.09
578	0.09
579	0.08
580	0.08
581	0.07
582	0.07
583	0.08
584	0.09
585	0.11
586	0.11
587	0.16
588	0.19
589	0.21
590	0.23
591	0.26
592	0.28
593	0.31
594	0.37
595	0.36
596	0.41
597	0.42
598	0.48
599	0.52
600	0.55
601	0.57
602	0.59
603	0.55
604	0.49
605	0.46
606	0.42
607	0.4
608	0.35
609	0.32
610	0.29
611	0.29
612	0.28
613	0.31
614	0.38
615	0.39
616	0.44
617	0.51
618	0.54
619	0.62
620	0.69
621	0.73
622	0.73
623	0.74
624	0.73
625	0.71
626	0.68
627	0.68
628	0.63
629	0.6
630	0.53
631	0.44
632	0.38
633	0.3
634	0.25
635	0.19
636	0.16
637	0.11

A8Q4I8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer