Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q2HD56

Protein Details
Accession Q2HD56    Localization Confidence High Confidence Score 16.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
10-40EPSEPGPSQRRPQRGRRARKGQSSRPRGLASHydrophilic
934-962SSPPPAPPPSRPTRRRSRRPSPASSPPLHHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
18-36QRRPQRGRRARKGQSSRPR
75-117GRGRRAQGGSRGGNRRGGSRRGTGQRSVVVSHRGGRRPPSPHR
929-957GRKSSSSPPPAPPPSRPTRRRSRRPSPAS
Subcellular Location(s) mito 11, nucl 10, cyto_nucl 9, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR034078  NFX1_fam  
IPR001374  R3H_dom  
IPR036867  R3H_dom_sf  
IPR034077  R3H_FAP1  
IPR000967  Znf_NFX1  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003700  F:DNA-binding transcription factor activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF01424  R3H  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51061  R3H  
CDD cd06008  NF-X1-zinc-finger  
cd06006  R3H_unknown_2  
Amino Acid Sequences MTTRTFTVVEPSEPGPSQRRPQRGRRARKGQSSRPRGLASSGEGSEPGPAQPASVIVATPAVAVAPAPEASNQPGRGRRAQGGSRGGNRRGGSRRGTGQRSVVVSHRGGRRPPSPHRQGGNNTPRPSLRATAAEFVPGQPTQSLGAEPSESGPGTMPVILEFVAKSTAPDLMTRIHEDIDRCQYECIVCTGEVLRTTEMWSCSICWTSIHLFCAQQWYTSQLQLREDFPGGYRGADDDWRCPGCNSGLVGKPEVHHCWCRKETDPQPIPGLPPHTCGQTCSKPRATCPHPCSLMCHAGPCPPCTLMGPTQSCFCGKHTSTKKCRETDYGKGWSCQEICGDLFPCGEHSCPQICHPGLCGSCDIPTLSVCYCGREQREIPCSQRGDILESFNHGQAKLPSGIEQTPDQWFEGSFRCTNICGRPFDCGHHLCSKPCHSQDEAAAHCPLSPDVVTHCSCGKTPLASMSVEPRQSCQDPIPHCNKPCNKAQTCGHLCLSECHTGPCAPCTRIADIPCRCGRVTTKSLCHQGNISHPHCFRICKAHLNCGRHECGEHCCPGEKAAAERRKHKRTANENYEPEHICFQPPQPCGMPPPECRFACTRASPCGHPSGPHLCHTDETPCPKCPYLVSKPCVCGKKALRNQPCWFDEGRCGLPCGKKLKCGAHECRKPCHKPGECEDADISGSHCPQPCGKVRKSCEHTCVDQCHAPYACKEDKPCQSKTFVTCPCQHRKQEVRCQATKLTPSPAGKSTLTCDDECRRLQRNRKLAEALDIDPSTHADEHIPYSDTSLKLFRENVSWAQTQERQLRMFAAAPEEKRIRFKPMPPHQRAFLHALAEDFGLDSESQDPGPHRHVCVFKTPRFVSAPKKTLGQCLQVADKAAKLRTGVSAIAPKSSPRRQGSPFNALMLGGWATASRGGPGSGLHHPFPPLGRKSSSSPPPAPPPSRPTRRRSRRPSPASSPPLHASSRGRGSPPLSCCATSTPRRERLSAGRVLWLRMLVRGGVRWPAAGQRVGGTIGGLRLEMRKREAAGGAGQGVEEDWLAALEREEEEAEEKEEGVEEAEGEE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.32
2 0.32
3 0.36
4 0.44
5 0.49
6 0.59
7 0.62
8 0.72
9 0.8
10 0.83
11 0.88
12 0.89
13 0.91
14 0.9
15 0.93
16 0.93
17 0.92
18 0.93
19 0.91
20 0.87
21 0.82
22 0.76
23 0.66
24 0.59
25 0.52
26 0.46
27 0.42
28 0.36
29 0.29
30 0.27
31 0.25
32 0.24
33 0.21
34 0.16
35 0.13
36 0.12
37 0.12
38 0.12
39 0.12
40 0.12
41 0.12
42 0.12
43 0.09
44 0.09
45 0.09
46 0.09
47 0.08
48 0.05
49 0.05
50 0.05
51 0.05
52 0.06
53 0.07
54 0.07
55 0.09
56 0.11
57 0.16
58 0.22
59 0.25
60 0.3
61 0.36
62 0.41
63 0.48
64 0.51
65 0.53
66 0.55
67 0.57
68 0.58
69 0.6
70 0.62
71 0.64
72 0.66
73 0.63
74 0.62
75 0.57
76 0.57
77 0.55
78 0.55
79 0.52
80 0.5
81 0.57
82 0.59
83 0.64
84 0.59
85 0.57
86 0.55
87 0.52
88 0.48
89 0.43
90 0.39
91 0.36
92 0.39
93 0.42
94 0.43
95 0.45
96 0.49
97 0.52
98 0.56
99 0.63
100 0.67
101 0.68
102 0.71
103 0.72
104 0.74
105 0.73
106 0.76
107 0.77
108 0.75
109 0.69
110 0.65
111 0.6
112 0.55
113 0.52
114 0.44
115 0.37
116 0.33
117 0.34
118 0.35
119 0.34
120 0.33
121 0.29
122 0.26
123 0.26
124 0.2
125 0.18
126 0.13
127 0.14
128 0.13
129 0.14
130 0.14
131 0.11
132 0.13
133 0.12
134 0.12
135 0.13
136 0.13
137 0.12
138 0.12
139 0.12
140 0.11
141 0.11
142 0.11
143 0.1
144 0.08
145 0.09
146 0.09
147 0.09
148 0.08
149 0.08
150 0.09
151 0.08
152 0.09
153 0.09
154 0.11
155 0.11
156 0.12
157 0.13
158 0.15
159 0.18
160 0.21
161 0.22
162 0.2
163 0.22
164 0.23
165 0.27
166 0.33
167 0.32
168 0.29
169 0.28
170 0.29
171 0.27
172 0.26
173 0.23
174 0.16
175 0.14
176 0.15
177 0.15
178 0.16
179 0.17
180 0.18
181 0.17
182 0.15
183 0.17
184 0.19
185 0.19
186 0.18
187 0.16
188 0.16
189 0.17
190 0.18
191 0.17
192 0.13
193 0.16
194 0.2
195 0.22
196 0.23
197 0.23
198 0.22
199 0.23
200 0.3
201 0.26
202 0.22
203 0.2
204 0.23
205 0.23
206 0.26
207 0.29
208 0.24
209 0.28
210 0.29
211 0.29
212 0.28
213 0.27
214 0.23
215 0.21
216 0.21
217 0.18
218 0.16
219 0.15
220 0.12
221 0.13
222 0.18
223 0.18
224 0.17
225 0.22
226 0.24
227 0.25
228 0.24
229 0.25
230 0.21
231 0.23
232 0.23
233 0.22
234 0.26
235 0.27
236 0.28
237 0.27
238 0.27
239 0.28
240 0.31
241 0.3
242 0.32
243 0.34
244 0.41
245 0.43
246 0.46
247 0.46
248 0.51
249 0.54
250 0.58
251 0.59
252 0.54
253 0.55
254 0.51
255 0.49
256 0.42
257 0.4
258 0.29
259 0.28
260 0.26
261 0.26
262 0.25
263 0.26
264 0.3
265 0.34
266 0.38
267 0.42
268 0.48
269 0.46
270 0.51
271 0.58
272 0.56
273 0.57
274 0.58
275 0.58
276 0.55
277 0.54
278 0.55
279 0.51
280 0.52
281 0.42
282 0.39
283 0.31
284 0.33
285 0.35
286 0.31
287 0.27
288 0.2
289 0.2
290 0.19
291 0.23
292 0.21
293 0.26
294 0.28
295 0.26
296 0.28
297 0.28
298 0.28
299 0.25
300 0.23
301 0.24
302 0.23
303 0.32
304 0.4
305 0.5
306 0.58
307 0.68
308 0.73
309 0.68
310 0.71
311 0.7
312 0.66
313 0.65
314 0.63
315 0.62
316 0.55
317 0.53
318 0.5
319 0.46
320 0.4
321 0.32
322 0.24
323 0.17
324 0.16
325 0.17
326 0.16
327 0.13
328 0.12
329 0.11
330 0.12
331 0.11
332 0.11
333 0.1
334 0.13
335 0.15
336 0.16
337 0.18
338 0.23
339 0.23
340 0.23
341 0.23
342 0.26
343 0.23
344 0.24
345 0.23
346 0.16
347 0.16
348 0.17
349 0.15
350 0.1
351 0.09
352 0.1
353 0.09
354 0.14
355 0.13
356 0.15
357 0.17
358 0.21
359 0.23
360 0.26
361 0.28
362 0.3
363 0.36
364 0.38
365 0.39
366 0.41
367 0.4
368 0.36
369 0.37
370 0.31
371 0.3
372 0.27
373 0.26
374 0.19
375 0.21
376 0.21
377 0.2
378 0.2
379 0.15
380 0.15
381 0.14
382 0.17
383 0.16
384 0.15
385 0.14
386 0.16
387 0.16
388 0.16
389 0.16
390 0.15
391 0.15
392 0.16
393 0.15
394 0.12
395 0.12
396 0.12
397 0.14
398 0.16
399 0.14
400 0.14
401 0.15
402 0.16
403 0.19
404 0.23
405 0.24
406 0.24
407 0.24
408 0.27
409 0.27
410 0.29
411 0.32
412 0.27
413 0.27
414 0.31
415 0.32
416 0.3
417 0.34
418 0.37
419 0.38
420 0.38
421 0.38
422 0.32
423 0.33
424 0.35
425 0.36
426 0.32
427 0.27
428 0.25
429 0.22
430 0.21
431 0.19
432 0.15
433 0.1
434 0.08
435 0.06
436 0.08
437 0.12
438 0.12
439 0.13
440 0.15
441 0.15
442 0.15
443 0.16
444 0.15
445 0.12
446 0.12
447 0.13
448 0.14
449 0.13
450 0.14
451 0.16
452 0.19
453 0.2
454 0.2
455 0.18
456 0.2
457 0.21
458 0.22
459 0.19
460 0.22
461 0.24
462 0.3
463 0.36
464 0.38
465 0.38
466 0.45
467 0.47
468 0.45
469 0.5
470 0.53
471 0.48
472 0.49
473 0.5
474 0.52
475 0.51
476 0.5
477 0.43
478 0.34
479 0.33
480 0.28
481 0.29
482 0.22
483 0.19
484 0.16
485 0.17
486 0.17
487 0.17
488 0.18
489 0.17
490 0.15
491 0.17
492 0.19
493 0.2
494 0.22
495 0.24
496 0.29
497 0.27
498 0.33
499 0.31
500 0.32
501 0.29
502 0.27
503 0.28
504 0.27
505 0.31
506 0.31
507 0.34
508 0.36
509 0.42
510 0.41
511 0.38
512 0.33
513 0.29
514 0.31
515 0.34
516 0.31
517 0.3
518 0.3
519 0.32
520 0.32
521 0.31
522 0.25
523 0.26
524 0.27
525 0.31
526 0.32
527 0.39
528 0.44
529 0.45
530 0.47
531 0.43
532 0.42
533 0.33
534 0.32
535 0.24
536 0.24
537 0.24
538 0.22
539 0.18
540 0.18
541 0.17
542 0.18
543 0.18
544 0.13
545 0.14
546 0.22
547 0.29
548 0.3
549 0.4
550 0.48
551 0.52
552 0.57
553 0.59
554 0.6
555 0.63
556 0.71
557 0.71
558 0.7
559 0.66
560 0.63
561 0.62
562 0.53
563 0.44
564 0.36
565 0.26
566 0.19
567 0.17
568 0.19
569 0.22
570 0.21
571 0.23
572 0.22
573 0.22
574 0.24
575 0.28
576 0.3
577 0.27
578 0.33
579 0.37
580 0.36
581 0.38
582 0.38
583 0.36
584 0.35
585 0.35
586 0.32
587 0.3
588 0.33
589 0.32
590 0.31
591 0.33
592 0.29
593 0.25
594 0.27
595 0.3
596 0.29
597 0.31
598 0.31
599 0.26
600 0.26
601 0.27
602 0.26
603 0.21
604 0.26
605 0.26
606 0.27
607 0.29
608 0.28
609 0.28
610 0.26
611 0.31
612 0.34
613 0.39
614 0.4
615 0.42
616 0.45
617 0.5
618 0.51
619 0.43
620 0.41
621 0.39
622 0.46
623 0.51
624 0.57
625 0.59
626 0.64
627 0.67
628 0.66
629 0.6
630 0.53
631 0.47
632 0.38
633 0.34
634 0.3
635 0.29
636 0.23
637 0.23
638 0.24
639 0.25
640 0.28
641 0.32
642 0.29
643 0.31
644 0.36
645 0.41
646 0.45
647 0.52
648 0.57
649 0.6
650 0.67
651 0.65
652 0.69
653 0.72
654 0.69
655 0.66
656 0.67
657 0.62
658 0.61
659 0.63
660 0.65
661 0.55
662 0.53
663 0.47
664 0.37
665 0.31
666 0.25
667 0.19
668 0.11
669 0.11
670 0.12
671 0.13
672 0.13
673 0.14
674 0.19
675 0.27
676 0.33
677 0.38
678 0.45
679 0.49
680 0.58
681 0.64
682 0.64
683 0.62
684 0.58
685 0.57
686 0.54
687 0.53
688 0.46
689 0.42
690 0.36
691 0.35
692 0.32
693 0.28
694 0.23
695 0.26
696 0.27
697 0.27
698 0.3
699 0.33
700 0.41
701 0.45
702 0.48
703 0.45
704 0.45
705 0.46
706 0.48
707 0.5
708 0.47
709 0.46
710 0.5
711 0.54
712 0.59
713 0.63
714 0.61
715 0.62
716 0.66
717 0.7
718 0.73
719 0.76
720 0.74
721 0.69
722 0.69
723 0.64
724 0.59
725 0.54
726 0.46
727 0.4
728 0.38
729 0.37
730 0.36
731 0.35
732 0.34
733 0.3
734 0.28
735 0.27
736 0.28
737 0.29
738 0.27
739 0.29
740 0.29
741 0.34
742 0.36
743 0.38
744 0.39
745 0.44
746 0.54
747 0.59
748 0.64
749 0.62
750 0.64
751 0.62
752 0.55
753 0.53
754 0.47
755 0.38
756 0.34
757 0.3
758 0.25
759 0.22
760 0.22
761 0.17
762 0.13
763 0.12
764 0.09
765 0.1
766 0.12
767 0.14
768 0.14
769 0.12
770 0.15
771 0.19
772 0.18
773 0.19
774 0.2
775 0.19
776 0.2
777 0.22
778 0.21
779 0.2
780 0.23
781 0.25
782 0.26
783 0.27
784 0.25
785 0.28
786 0.31
787 0.35
788 0.38
789 0.39
790 0.35
791 0.34
792 0.35
793 0.31
794 0.29
795 0.23
796 0.23
797 0.23
798 0.23
799 0.29
800 0.31
801 0.31
802 0.35
803 0.36
804 0.39
805 0.4
806 0.46
807 0.51
808 0.58
809 0.68
810 0.69
811 0.71
812 0.68
813 0.65
814 0.62
815 0.57
816 0.49
817 0.39
818 0.32
819 0.28
820 0.23
821 0.2
822 0.16
823 0.1
824 0.07
825 0.07
826 0.06
827 0.06
828 0.07
829 0.08
830 0.08
831 0.1
832 0.12
833 0.14
834 0.21
835 0.23
836 0.23
837 0.29
838 0.33
839 0.33
840 0.42
841 0.47
842 0.45
843 0.52
844 0.51
845 0.5
846 0.5
847 0.53
848 0.52
849 0.54
850 0.55
851 0.47
852 0.52
853 0.49
854 0.53
855 0.53
856 0.48
857 0.41
858 0.39
859 0.4
860 0.36
861 0.36
862 0.29
863 0.27
864 0.25
865 0.23
866 0.22
867 0.19
868 0.19
869 0.19
870 0.21
871 0.19
872 0.18
873 0.24
874 0.22
875 0.24
876 0.23
877 0.25
878 0.31
879 0.37
880 0.43
881 0.42
882 0.48
883 0.51
884 0.61
885 0.65
886 0.65
887 0.61
888 0.53
889 0.48
890 0.41
891 0.35
892 0.26
893 0.19
894 0.1
895 0.08
896 0.06
897 0.06
898 0.08
899 0.08
900 0.08
901 0.08
902 0.08
903 0.09
904 0.1
905 0.14
906 0.19
907 0.23
908 0.23
909 0.24
910 0.25
911 0.27
912 0.3
913 0.34
914 0.32
915 0.33
916 0.35
917 0.37
918 0.41
919 0.49
920 0.53
921 0.53
922 0.54
923 0.55
924 0.61
925 0.66
926 0.66
927 0.63
928 0.63
929 0.66
930 0.71
931 0.73
932 0.73
933 0.76
934 0.82
935 0.86
936 0.88
937 0.89
938 0.89
939 0.9
940 0.91
941 0.88
942 0.88
943 0.85
944 0.78
945 0.73
946 0.65
947 0.61
948 0.52
949 0.49
950 0.43
951 0.42
952 0.46
953 0.43
954 0.41
955 0.41
956 0.43
957 0.46
958 0.44
959 0.42
960 0.38
961 0.35
962 0.35
963 0.37
964 0.42
965 0.43
966 0.49
967 0.53
968 0.6
969 0.63
970 0.63
971 0.63
972 0.64
973 0.64
974 0.61
975 0.53
976 0.52
977 0.5
978 0.49
979 0.44
980 0.38
981 0.31
982 0.25
983 0.25
984 0.19
985 0.19
986 0.19
987 0.2
988 0.22
989 0.22
990 0.2
991 0.2
992 0.24
993 0.27
994 0.27
995 0.25
996 0.22
997 0.23
998 0.23
999 0.22
1000 0.16
1001 0.13
1002 0.12
1003 0.12
1004 0.1
1005 0.1
1006 0.15
1007 0.21
1008 0.25
1009 0.28
1010 0.31
1011 0.32
1012 0.36
1013 0.37
1014 0.33
1015 0.31
1016 0.3
1017 0.26
1018 0.22
1019 0.2
1020 0.16
1021 0.14
1022 0.12
1023 0.08
1024 0.06
1025 0.04
1026 0.05
1027 0.06
1028 0.06
1029 0.06
1030 0.08
1031 0.09
1032 0.1
1033 0.11
1034 0.11
1035 0.14
1036 0.15
1037 0.17
1038 0.15
1039 0.15
1040 0.14
1041 0.14
1042 0.13
1043 0.11
1044 0.1