Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A8Q6I1

Protein Details
Accession A8Q6I1    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
304-381DDESTSKIKKKDRKKEKEKETISAKEMKGEKKKDKKAKKKDQSEHGAKDASSEPKKTKGSKEKSRKHKHHDAEKESESBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
310-389KIKKKDRKKEKEKETISAKEMKGEKKKDKKAKKKDQSEHGAKDASSEPKKTKGSKEKSRKHKHHDAEKESESASSKRSRR
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto_nucl 12.833, mito_nucl 11.333, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036898  RNA_pol_Rpb7-like_N_sf  
IPR041178  RPA43_OB  
IPR045113  Rpb7-like  
Gene Ontology GO:0000428  C:DNA-directed RNA polymerase complex  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
KEGG mgl:MGL_2973  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF17875  RPA43_OB  
Amino Acid Sequences MGSKRDADVHDRNPASSTGIVKVSAVMHFAIPPVWMRDPMASVLDQLDTLVMRFLPPLEGVLIAHSHARFLYPLGSIDGDSAFAEVPVRFTGIVWRPEIGMKLQGTITLCSPSHVSLLLYDTFNAAISAPHIPASMWEFVYYSDVGEVQRVDAKDRSVGFWRNKESGERLGGKNHMLQFSVISMTVANQMLSLHGSLLQDPFSVPPPRPGTLSFDQAMGTMEPMDEETNEEVPMPRRVRWEDSDEEDEQKDDQQQDNNLVEGVVENETDPEHGNNQMNGENNQRSMENEVSQEQGPLATGSLEDDESTSKIKKKDRKKEKEKETISAKEMKGEKKKDKKAKKKDQSEHGAKDASSEPKKTKGSKEKSRKHKHHDAEKESESASSKRSRRDA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.42
2 0.37
3 0.31
4 0.29
5 0.23
6 0.23
7 0.23
8 0.2
9 0.22
10 0.2
11 0.18
12 0.16
13 0.13
14 0.12
15 0.13
16 0.13
17 0.11
18 0.1
19 0.12
20 0.15
21 0.17
22 0.17
23 0.18
24 0.2
25 0.21
26 0.22
27 0.22
28 0.18
29 0.17
30 0.17
31 0.15
32 0.13
33 0.11
34 0.1
35 0.08
36 0.08
37 0.08
38 0.07
39 0.07
40 0.07
41 0.08
42 0.08
43 0.08
44 0.09
45 0.09
46 0.09
47 0.09
48 0.1
49 0.1
50 0.09
51 0.13
52 0.11
53 0.11
54 0.11
55 0.12
56 0.11
57 0.11
58 0.13
59 0.11
60 0.12
61 0.13
62 0.14
63 0.13
64 0.13
65 0.12
66 0.11
67 0.09
68 0.09
69 0.07
70 0.06
71 0.08
72 0.07
73 0.08
74 0.08
75 0.09
76 0.08
77 0.08
78 0.16
79 0.21
80 0.24
81 0.24
82 0.24
83 0.24
84 0.25
85 0.27
86 0.2
87 0.19
88 0.16
89 0.17
90 0.16
91 0.18
92 0.18
93 0.17
94 0.17
95 0.15
96 0.15
97 0.14
98 0.15
99 0.14
100 0.13
101 0.13
102 0.12
103 0.09
104 0.12
105 0.13
106 0.12
107 0.11
108 0.11
109 0.1
110 0.1
111 0.09
112 0.07
113 0.05
114 0.06
115 0.08
116 0.07
117 0.08
118 0.08
119 0.08
120 0.09
121 0.12
122 0.12
123 0.11
124 0.11
125 0.11
126 0.11
127 0.13
128 0.12
129 0.09
130 0.07
131 0.08
132 0.07
133 0.08
134 0.08
135 0.07
136 0.1
137 0.1
138 0.13
139 0.13
140 0.14
141 0.17
142 0.17
143 0.19
144 0.2
145 0.27
146 0.29
147 0.33
148 0.37
149 0.36
150 0.36
151 0.36
152 0.34
153 0.31
154 0.32
155 0.3
156 0.27
157 0.28
158 0.29
159 0.27
160 0.28
161 0.26
162 0.22
163 0.18
164 0.17
165 0.14
166 0.14
167 0.13
168 0.09
169 0.06
170 0.05
171 0.06
172 0.08
173 0.08
174 0.07
175 0.06
176 0.06
177 0.06
178 0.07
179 0.06
180 0.04
181 0.06
182 0.06
183 0.07
184 0.07
185 0.07
186 0.07
187 0.07
188 0.08
189 0.1
190 0.12
191 0.11
192 0.18
193 0.21
194 0.22
195 0.23
196 0.23
197 0.27
198 0.27
199 0.3
200 0.24
201 0.21
202 0.2
203 0.19
204 0.19
205 0.12
206 0.09
207 0.06
208 0.05
209 0.05
210 0.05
211 0.05
212 0.04
213 0.06
214 0.07
215 0.08
216 0.08
217 0.08
218 0.09
219 0.11
220 0.18
221 0.19
222 0.19
223 0.24
224 0.27
225 0.32
226 0.34
227 0.38
228 0.34
229 0.37
230 0.4
231 0.37
232 0.36
233 0.31
234 0.28
235 0.22
236 0.2
237 0.18
238 0.16
239 0.17
240 0.18
241 0.19
242 0.23
243 0.24
244 0.22
245 0.19
246 0.16
247 0.14
248 0.1
249 0.1
250 0.06
251 0.06
252 0.05
253 0.06
254 0.06
255 0.07
256 0.08
257 0.07
258 0.08
259 0.12
260 0.14
261 0.15
262 0.16
263 0.18
264 0.19
265 0.2
266 0.26
267 0.23
268 0.22
269 0.23
270 0.21
271 0.2
272 0.23
273 0.23
274 0.19
275 0.19
276 0.19
277 0.21
278 0.2
279 0.2
280 0.15
281 0.12
282 0.11
283 0.09
284 0.08
285 0.05
286 0.05
287 0.06
288 0.07
289 0.07
290 0.07
291 0.07
292 0.08
293 0.09
294 0.12
295 0.14
296 0.19
297 0.25
298 0.33
299 0.42
300 0.52
301 0.62
302 0.71
303 0.79
304 0.85
305 0.9
306 0.92
307 0.94
308 0.88
309 0.85
310 0.82
311 0.77
312 0.7
313 0.67
314 0.57
315 0.53
316 0.54
317 0.54
318 0.56
319 0.59
320 0.65
321 0.68
322 0.78
323 0.82
324 0.87
325 0.89
326 0.91
327 0.93
328 0.94
329 0.94
330 0.93
331 0.93
332 0.93
333 0.91
334 0.86
335 0.79
336 0.71
337 0.6
338 0.54
339 0.49
340 0.47
341 0.42
342 0.42
343 0.4
344 0.46
345 0.53
346 0.56
347 0.61
348 0.63
349 0.69
350 0.74
351 0.82
352 0.84
353 0.88
354 0.93
355 0.93
356 0.92
357 0.92
358 0.91
359 0.91
360 0.92
361 0.89
362 0.86
363 0.79
364 0.72
365 0.61
366 0.54
367 0.47
368 0.38
369 0.35
370 0.36
371 0.38