Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A8PZ78

Protein Details
Accession A8PZ78    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
174-195HIDPSVKRRRCERYERGFCELGHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 14, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045348  CPSF4/Yth1  
IPR000571  Znf_CCCH  
IPR036855  Znf_CCCH_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0098789  P:pre-mRNA cleavage required for polyadenylation  
KEGG mgl:MGL_1895  -  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50103  ZF_C3H1  
Amino Acid Sequences MSSSSADNVDGRTKSKELEHTDLVQPASHILALPVDYVPSHATTSLFSSLRQRRPPSDDDWPHNEFEFEPFVKRDLQIKLETNDQLCPRFKRGRCELGSQCTLRHCITPSPAIPTSQSRDVSRRTVCKHWLRGLCKKGDLCDYLHEYDLRRMPECRFYATFGFCNSSDECLYIHIDPSVKRRRCERYERGFCELGML
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.31
3 0.37
4 0.39
5 0.44
6 0.45
7 0.44
8 0.47
9 0.47
10 0.42
11 0.34
12 0.27
13 0.21
14 0.18
15 0.14
16 0.1
17 0.07
18 0.08
19 0.08
20 0.08
21 0.08
22 0.07
23 0.07
24 0.08
25 0.09
26 0.1
27 0.1
28 0.1
29 0.1
30 0.11
31 0.14
32 0.17
33 0.16
34 0.16
35 0.25
36 0.33
37 0.4
38 0.47
39 0.49
40 0.5
41 0.56
42 0.59
43 0.55
44 0.57
45 0.56
46 0.54
47 0.56
48 0.53
49 0.48
50 0.44
51 0.38
52 0.28
53 0.23
54 0.21
55 0.15
56 0.15
57 0.15
58 0.16
59 0.16
60 0.17
61 0.2
62 0.19
63 0.22
64 0.23
65 0.26
66 0.26
67 0.28
68 0.29
69 0.25
70 0.26
71 0.24
72 0.24
73 0.24
74 0.25
75 0.28
76 0.35
77 0.36
78 0.41
79 0.45
80 0.51
81 0.5
82 0.55
83 0.52
84 0.49
85 0.51
86 0.43
87 0.38
88 0.3
89 0.3
90 0.23
91 0.21
92 0.17
93 0.15
94 0.17
95 0.19
96 0.19
97 0.22
98 0.22
99 0.21
100 0.22
101 0.23
102 0.25
103 0.26
104 0.28
105 0.24
106 0.27
107 0.3
108 0.34
109 0.36
110 0.38
111 0.38
112 0.41
113 0.48
114 0.52
115 0.56
116 0.57
117 0.61
118 0.61
119 0.66
120 0.66
121 0.61
122 0.58
123 0.53
124 0.47
125 0.44
126 0.39
127 0.31
128 0.3
129 0.31
130 0.28
131 0.28
132 0.27
133 0.24
134 0.27
135 0.3
136 0.27
137 0.25
138 0.25
139 0.27
140 0.34
141 0.34
142 0.34
143 0.32
144 0.33
145 0.35
146 0.37
147 0.36
148 0.29
149 0.31
150 0.26
151 0.27
152 0.25
153 0.24
154 0.2
155 0.19
156 0.17
157 0.16
158 0.18
159 0.16
160 0.16
161 0.14
162 0.17
163 0.19
164 0.28
165 0.37
166 0.4
167 0.44
168 0.52
169 0.6
170 0.66
171 0.74
172 0.75
173 0.76
174 0.82
175 0.83
176 0.82
177 0.73