Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

G1XJA1

Protein Details
Accession G1XJA1    Localization Confidence Medium Confidence Score 14
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
146-165KDKEAKKKEEEEKKEKKRLEBasic
274-296ATYKTIYKTKCNKCNKLTQGPKAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
146-170KDKEAKKKEEEEKKEKKRLEAERSK
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 13.333, mito_nucl 11.166, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR021627  Mediator_Med27  
Gene Ontology GO:0016592  C:mediator complex  
Pfam View protein in Pfam  
PF11571  Med27  
Amino Acid Sequences MAPDPNPTIRPGPKAEPSNASSPSEDPSQTEETTLVSALSLLHQMHQKLALLRESIPHMVQPIMKASAYPTPETLFDEFSKRTLKASEDLVDFTKLVSDGRWVFDKASTSRRENGDESGEVKRWKSSAPLPHYLKDIAEGSEAVGKDKEAKKKEEEEKKEKKRLEAERSKERELEIAEVKEFESEDVRRGIIEEFKKEHGDLEITPEEDGKVLKVAIPKPVGLTFSIDILQPTAESNRYTVSLPTSSYLHILVLRSITTRPNAGSLKYLLDMIATYKTIYKTKCNKCNKLTQGPKADLPVIRRLKRIAKLVQKESKEDGGSSQDNDKMDTSGDNKVVKGAKDANPKIKKEPEEEEQPKEENDGTDDVAEVELVEEFWVTYHEGCAA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.55
2 0.56
3 0.55
4 0.54
5 0.55
6 0.52
7 0.48
8 0.42
9 0.37
10 0.36
11 0.33
12 0.3
13 0.25
14 0.27
15 0.29
16 0.27
17 0.27
18 0.23
19 0.2
20 0.2
21 0.19
22 0.13
23 0.08
24 0.08
25 0.07
26 0.08
27 0.1
28 0.1
29 0.13
30 0.17
31 0.18
32 0.19
33 0.21
34 0.23
35 0.23
36 0.26
37 0.27
38 0.25
39 0.25
40 0.26
41 0.28
42 0.27
43 0.24
44 0.21
45 0.19
46 0.2
47 0.2
48 0.19
49 0.18
50 0.18
51 0.18
52 0.17
53 0.18
54 0.21
55 0.23
56 0.22
57 0.2
58 0.19
59 0.21
60 0.24
61 0.23
62 0.21
63 0.2
64 0.23
65 0.22
66 0.24
67 0.27
68 0.24
69 0.24
70 0.23
71 0.25
72 0.23
73 0.26
74 0.28
75 0.25
76 0.27
77 0.27
78 0.26
79 0.22
80 0.19
81 0.16
82 0.12
83 0.11
84 0.09
85 0.12
86 0.12
87 0.15
88 0.17
89 0.17
90 0.18
91 0.2
92 0.24
93 0.23
94 0.29
95 0.32
96 0.34
97 0.39
98 0.4
99 0.42
100 0.39
101 0.39
102 0.35
103 0.31
104 0.3
105 0.28
106 0.28
107 0.25
108 0.24
109 0.22
110 0.19
111 0.19
112 0.2
113 0.24
114 0.3
115 0.35
116 0.44
117 0.46
118 0.47
119 0.49
120 0.45
121 0.38
122 0.31
123 0.26
124 0.17
125 0.14
126 0.12
127 0.1
128 0.13
129 0.13
130 0.11
131 0.1
132 0.09
133 0.16
134 0.22
135 0.29
136 0.3
137 0.34
138 0.38
139 0.47
140 0.56
141 0.59
142 0.63
143 0.66
144 0.72
145 0.78
146 0.81
147 0.75
148 0.7
149 0.69
150 0.69
151 0.69
152 0.68
153 0.66
154 0.68
155 0.71
156 0.68
157 0.59
158 0.51
159 0.42
160 0.34
161 0.31
162 0.23
163 0.18
164 0.17
165 0.16
166 0.15
167 0.13
168 0.12
169 0.08
170 0.08
171 0.08
172 0.1
173 0.1
174 0.1
175 0.09
176 0.1
177 0.11
178 0.14
179 0.15
180 0.17
181 0.18
182 0.2
183 0.21
184 0.2
185 0.2
186 0.15
187 0.14
188 0.11
189 0.15
190 0.14
191 0.14
192 0.14
193 0.13
194 0.12
195 0.11
196 0.11
197 0.05
198 0.05
199 0.05
200 0.07
201 0.11
202 0.12
203 0.17
204 0.18
205 0.18
206 0.19
207 0.2
208 0.19
209 0.15
210 0.16
211 0.12
212 0.11
213 0.12
214 0.1
215 0.1
216 0.09
217 0.08
218 0.06
219 0.06
220 0.07
221 0.08
222 0.08
223 0.09
224 0.09
225 0.11
226 0.11
227 0.11
228 0.13
229 0.13
230 0.13
231 0.14
232 0.14
233 0.13
234 0.13
235 0.13
236 0.11
237 0.11
238 0.11
239 0.1
240 0.09
241 0.09
242 0.1
243 0.1
244 0.12
245 0.12
246 0.13
247 0.13
248 0.18
249 0.19
250 0.19
251 0.2
252 0.19
253 0.2
254 0.19
255 0.18
256 0.13
257 0.11
258 0.1
259 0.09
260 0.09
261 0.08
262 0.08
263 0.11
264 0.13
265 0.18
266 0.2
267 0.28
268 0.37
269 0.47
270 0.57
271 0.65
272 0.71
273 0.73
274 0.81
275 0.8
276 0.81
277 0.8
278 0.79
279 0.77
280 0.71
281 0.67
282 0.59
283 0.54
284 0.46
285 0.4
286 0.42
287 0.42
288 0.42
289 0.43
290 0.45
291 0.49
292 0.53
293 0.57
294 0.56
295 0.57
296 0.63
297 0.7
298 0.73
299 0.68
300 0.66
301 0.62
302 0.58
303 0.49
304 0.4
305 0.33
306 0.31
307 0.31
308 0.28
309 0.28
310 0.26
311 0.25
312 0.27
313 0.25
314 0.19
315 0.18
316 0.19
317 0.18
318 0.2
319 0.25
320 0.24
321 0.24
322 0.28
323 0.31
324 0.29
325 0.32
326 0.34
327 0.37
328 0.46
329 0.53
330 0.58
331 0.63
332 0.66
333 0.68
334 0.69
335 0.67
336 0.63
337 0.63
338 0.59
339 0.62
340 0.64
341 0.62
342 0.58
343 0.55
344 0.49
345 0.45
346 0.4
347 0.3
348 0.27
349 0.23
350 0.2
351 0.18
352 0.18
353 0.15
354 0.13
355 0.12
356 0.08
357 0.07
358 0.06
359 0.06
360 0.05
361 0.05
362 0.05
363 0.05
364 0.07
365 0.08
366 0.08