Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

G1XC40

Protein Details
Accession G1XC40    Localization Confidence Low Confidence Score 8.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1115-1141TSLLRRDMSMKKRRARAQMERYRQHGVHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 13.5, cyto_nucl 10.5, cyto 6.5, mito 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR018834  DNA/RNA-bd_Est1-type  
IPR045153  Est1/Ebs1-like  
IPR029060  PIN-like_dom_sf  
IPR002716  PIN_dom  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
Gene Ontology GO:0004540  F:RNA nuclease activity  
GO:0000184  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay  
Pfam View protein in Pfam  
PF10373  EST1_DNA_bind  
PF13638  PIN_4  
CDD cd09880  PIN_Smg5-6-like  
Amino Acid Sequences MGPEQNDAPLSPTAGPDINSRFQAGMRDSRAKIACQHCRWTGSNLPRHMAEEHGNPVIRQEGTDDLKTFNIPAAAAAAAPASFGPAPQAQAEDSMQIDETSAVSSTTPATAPTARPPRRKPVASGGRRVDSVDPDFVRSPRRGGSQVAGGGRLYDPRSDSIKPSAQSSSRPTQAQRAQVASPSSPRTAPRPSNQTSRNPVPPTGPNALIIKKQPVDAPAPAITTTTTTRSPPPQGSTSLPSLPIVQNSSDADESEPQQPTELILQPETRPISQEQLVAEVKGIYAGLVMVEAKCIEVDSKQAAAATQGIKQVPPLNNDQWQALIALHRTLLHEHHDFFLASQHPSAAPSLRKLATKYAMPARMWRHGIHSFLELLRHRLPESFEHMLAFIYLAYSMMALLYETVPAFADTWVECLGDLGRYRMAIEEGDPRDREVWMHVSRFWYSKGTDRQPHVGRLYHHLAILARPNILQQLFFYCKALAVAQPFSAARESILTLFDPTALKEQDVEGNQSADAVFVLLHSICFTVVNQDAFAEKKDEYLELLDKKISLSKLKFKVPGVYIAICGIASLFQYNLKDGRMKLATTAKENQKATADAEAAYKNTIQNNPEKENLLPPGPVIDGYNPKDALLTQPPDLDPSVSFDISLTHAQELAFDILSLFFDRDNDAAVQPHIHVWLVFLDYLKHYPEGMALVVKTFPWEKLAEYGTALLKKNKNNESILEKIQASGTFPVAQKGIRPLPEEYMMRGLESARRYFPYGYFSKMVDDDERLIELPSMGAVREEKMLWLMVRFANYGPWIQFDPVRCSFSVSNGLKALLHNYTAQPTDTYEPSSIMEEDDSDVEMDMSSATMADDEEESFDEIENPELTQLLAQRRELRKQLNDPIPTVEQEKKAKKSDTFSSESFKPDVTTVVVDTNSLVKYLDIFKKMLEGNQWSIVLPYSVVTELQGLQRNEGKISETSQQALTLINQALVEKRKLRVVTAKQSAITNVSSQFKELIDDYSEEGRKNLDDIIIETAKAQGEISAKRFNPNDANNELRPVVLITDDAVMRVKAITRGVASVGTKQWVKYISPPDADTQRRIANTYLSLVMKHPRLDKDRVYKAAQEARGDESGATSLLRRDMSMKKRRARAQMERYRQHGVPC
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.19
3 0.22
4 0.27
5 0.29
6 0.29
7 0.3
8 0.28
9 0.28
10 0.33
11 0.32
12 0.34
13 0.37
14 0.44
15 0.43
16 0.51
17 0.52
18 0.48
19 0.51
20 0.53
21 0.57
22 0.55
23 0.61
24 0.58
25 0.62
26 0.62
27 0.6
28 0.6
29 0.59
30 0.62
31 0.59
32 0.58
33 0.53
34 0.53
35 0.47
36 0.42
37 0.37
38 0.33
39 0.33
40 0.35
41 0.34
42 0.31
43 0.31
44 0.31
45 0.26
46 0.21
47 0.2
48 0.22
49 0.26
50 0.3
51 0.29
52 0.27
53 0.28
54 0.28
55 0.26
56 0.21
57 0.17
58 0.13
59 0.12
60 0.12
61 0.11
62 0.1
63 0.09
64 0.08
65 0.07
66 0.07
67 0.06
68 0.07
69 0.07
70 0.07
71 0.11
72 0.12
73 0.14
74 0.15
75 0.16
76 0.14
77 0.17
78 0.18
79 0.16
80 0.15
81 0.14
82 0.14
83 0.12
84 0.12
85 0.1
86 0.09
87 0.08
88 0.08
89 0.07
90 0.07
91 0.08
92 0.09
93 0.1
94 0.09
95 0.09
96 0.12
97 0.16
98 0.18
99 0.27
100 0.37
101 0.44
102 0.54
103 0.6
104 0.67
105 0.74
106 0.75
107 0.71
108 0.71
109 0.74
110 0.72
111 0.75
112 0.72
113 0.65
114 0.62
115 0.58
116 0.5
117 0.44
118 0.4
119 0.37
120 0.31
121 0.32
122 0.35
123 0.34
124 0.37
125 0.33
126 0.33
127 0.31
128 0.35
129 0.33
130 0.34
131 0.35
132 0.35
133 0.38
134 0.36
135 0.33
136 0.27
137 0.26
138 0.23
139 0.24
140 0.19
141 0.17
142 0.17
143 0.2
144 0.25
145 0.25
146 0.28
147 0.32
148 0.37
149 0.35
150 0.37
151 0.39
152 0.37
153 0.41
154 0.44
155 0.44
156 0.43
157 0.46
158 0.45
159 0.48
160 0.52
161 0.54
162 0.52
163 0.48
164 0.44
165 0.44
166 0.45
167 0.37
168 0.37
169 0.33
170 0.3
171 0.29
172 0.3
173 0.32
174 0.38
175 0.43
176 0.46
177 0.52
178 0.55
179 0.62
180 0.66
181 0.69
182 0.69
183 0.69
184 0.69
185 0.63
186 0.6
187 0.55
188 0.53
189 0.51
190 0.47
191 0.4
192 0.34
193 0.35
194 0.35
195 0.34
196 0.32
197 0.32
198 0.29
199 0.3
200 0.29
201 0.28
202 0.3
203 0.28
204 0.29
205 0.24
206 0.24
207 0.22
208 0.21
209 0.18
210 0.16
211 0.17
212 0.16
213 0.17
214 0.17
215 0.22
216 0.27
217 0.32
218 0.34
219 0.38
220 0.37
221 0.39
222 0.41
223 0.41
224 0.4
225 0.36
226 0.32
227 0.27
228 0.27
229 0.25
230 0.23
231 0.21
232 0.17
233 0.18
234 0.18
235 0.2
236 0.17
237 0.17
238 0.16
239 0.16
240 0.18
241 0.21
242 0.22
243 0.19
244 0.19
245 0.19
246 0.18
247 0.2
248 0.22
249 0.18
250 0.18
251 0.21
252 0.2
253 0.26
254 0.27
255 0.22
256 0.21
257 0.21
258 0.24
259 0.23
260 0.25
261 0.2
262 0.23
263 0.24
264 0.21
265 0.2
266 0.15
267 0.13
268 0.11
269 0.1
270 0.05
271 0.04
272 0.04
273 0.03
274 0.03
275 0.04
276 0.04
277 0.05
278 0.05
279 0.05
280 0.05
281 0.05
282 0.06
283 0.05
284 0.08
285 0.1
286 0.11
287 0.11
288 0.11
289 0.11
290 0.11
291 0.14
292 0.13
293 0.13
294 0.16
295 0.16
296 0.16
297 0.18
298 0.24
299 0.24
300 0.26
301 0.29
302 0.3
303 0.34
304 0.35
305 0.34
306 0.27
307 0.24
308 0.21
309 0.16
310 0.14
311 0.1
312 0.1
313 0.1
314 0.1
315 0.11
316 0.12
317 0.13
318 0.16
319 0.18
320 0.18
321 0.19
322 0.19
323 0.18
324 0.17
325 0.2
326 0.17
327 0.16
328 0.15
329 0.14
330 0.13
331 0.14
332 0.15
333 0.14
334 0.14
335 0.15
336 0.2
337 0.22
338 0.24
339 0.25
340 0.29
341 0.28
342 0.28
343 0.31
344 0.33
345 0.36
346 0.34
347 0.39
348 0.38
349 0.41
350 0.42
351 0.38
352 0.37
353 0.34
354 0.36
355 0.31
356 0.28
357 0.23
358 0.21
359 0.25
360 0.2
361 0.22
362 0.23
363 0.22
364 0.21
365 0.22
366 0.24
367 0.21
368 0.28
369 0.26
370 0.23
371 0.22
372 0.22
373 0.2
374 0.18
375 0.14
376 0.07
377 0.04
378 0.04
379 0.04
380 0.03
381 0.03
382 0.03
383 0.03
384 0.03
385 0.03
386 0.03
387 0.03
388 0.04
389 0.04
390 0.04
391 0.05
392 0.05
393 0.06
394 0.05
395 0.07
396 0.06
397 0.08
398 0.08
399 0.08
400 0.07
401 0.07
402 0.07
403 0.08
404 0.09
405 0.08
406 0.08
407 0.09
408 0.09
409 0.09
410 0.1
411 0.07
412 0.09
413 0.15
414 0.17
415 0.2
416 0.2
417 0.21
418 0.21
419 0.21
420 0.19
421 0.15
422 0.2
423 0.19
424 0.21
425 0.21
426 0.23
427 0.24
428 0.25
429 0.24
430 0.19
431 0.18
432 0.24
433 0.3
434 0.35
435 0.4
436 0.42
437 0.49
438 0.49
439 0.53
440 0.48
441 0.43
442 0.38
443 0.38
444 0.39
445 0.32
446 0.29
447 0.25
448 0.22
449 0.2
450 0.24
451 0.18
452 0.14
453 0.13
454 0.13
455 0.15
456 0.14
457 0.13
458 0.08
459 0.13
460 0.16
461 0.16
462 0.17
463 0.14
464 0.14
465 0.15
466 0.15
467 0.11
468 0.1
469 0.11
470 0.1
471 0.11
472 0.11
473 0.11
474 0.11
475 0.09
476 0.07
477 0.07
478 0.08
479 0.07
480 0.08
481 0.07
482 0.08
483 0.08
484 0.09
485 0.08
486 0.08
487 0.11
488 0.11
489 0.1
490 0.1
491 0.11
492 0.13
493 0.14
494 0.16
495 0.13
496 0.13
497 0.13
498 0.12
499 0.11
500 0.08
501 0.07
502 0.04
503 0.03
504 0.03
505 0.04
506 0.03
507 0.03
508 0.04
509 0.04
510 0.04
511 0.04
512 0.04
513 0.06
514 0.08
515 0.08
516 0.08
517 0.08
518 0.09
519 0.09
520 0.1
521 0.09
522 0.08
523 0.09
524 0.09
525 0.09
526 0.09
527 0.1
528 0.13
529 0.13
530 0.13
531 0.12
532 0.12
533 0.12
534 0.15
535 0.14
536 0.16
537 0.18
538 0.26
539 0.3
540 0.34
541 0.37
542 0.35
543 0.39
544 0.34
545 0.35
546 0.29
547 0.25
548 0.22
549 0.18
550 0.18
551 0.12
552 0.11
553 0.06
554 0.04
555 0.04
556 0.04
557 0.03
558 0.05
559 0.05
560 0.06
561 0.07
562 0.08
563 0.1
564 0.1
565 0.15
566 0.15
567 0.14
568 0.17
569 0.22
570 0.22
571 0.24
572 0.3
573 0.31
574 0.36
575 0.36
576 0.34
577 0.3
578 0.29
579 0.26
580 0.22
581 0.17
582 0.11
583 0.13
584 0.12
585 0.11
586 0.1
587 0.1
588 0.1
589 0.12
590 0.13
591 0.14
592 0.19
593 0.24
594 0.26
595 0.27
596 0.27
597 0.25
598 0.25
599 0.25
600 0.2
601 0.15
602 0.12
603 0.12
604 0.11
605 0.11
606 0.08
607 0.09
608 0.14
609 0.16
610 0.19
611 0.18
612 0.18
613 0.18
614 0.17
615 0.18
616 0.17
617 0.17
618 0.15
619 0.16
620 0.16
621 0.18
622 0.18
623 0.15
624 0.1
625 0.12
626 0.14
627 0.12
628 0.12
629 0.11
630 0.11
631 0.13
632 0.14
633 0.1
634 0.08
635 0.09
636 0.09
637 0.09
638 0.1
639 0.08
640 0.07
641 0.06
642 0.06
643 0.05
644 0.06
645 0.06
646 0.05
647 0.04
648 0.05
649 0.06
650 0.06
651 0.07
652 0.08
653 0.08
654 0.08
655 0.09
656 0.09
657 0.08
658 0.09
659 0.08
660 0.07
661 0.06
662 0.06
663 0.07
664 0.07
665 0.07
666 0.07
667 0.07
668 0.08
669 0.1
670 0.1
671 0.1
672 0.09
673 0.08
674 0.09
675 0.09
676 0.08
677 0.08
678 0.07
679 0.07
680 0.07
681 0.07
682 0.08
683 0.08
684 0.07
685 0.09
686 0.1
687 0.1
688 0.13
689 0.14
690 0.13
691 0.13
692 0.15
693 0.14
694 0.18
695 0.18
696 0.21
697 0.25
698 0.28
699 0.36
700 0.39
701 0.41
702 0.39
703 0.41
704 0.41
705 0.4
706 0.39
707 0.34
708 0.29
709 0.25
710 0.24
711 0.21
712 0.17
713 0.14
714 0.13
715 0.13
716 0.13
717 0.14
718 0.14
719 0.14
720 0.14
721 0.18
722 0.21
723 0.2
724 0.22
725 0.22
726 0.24
727 0.29
728 0.28
729 0.24
730 0.24
731 0.22
732 0.19
733 0.18
734 0.16
735 0.16
736 0.18
737 0.19
738 0.16
739 0.18
740 0.2
741 0.21
742 0.22
743 0.24
744 0.23
745 0.25
746 0.24
747 0.23
748 0.23
749 0.22
750 0.23
751 0.18
752 0.18
753 0.16
754 0.14
755 0.15
756 0.13
757 0.13
758 0.11
759 0.09
760 0.07
761 0.06
762 0.06
763 0.05
764 0.06
765 0.06
766 0.07
767 0.08
768 0.08
769 0.08
770 0.09
771 0.1
772 0.09
773 0.09
774 0.11
775 0.1
776 0.11
777 0.12
778 0.11
779 0.12
780 0.13
781 0.14
782 0.12
783 0.13
784 0.13
785 0.13
786 0.16
787 0.17
788 0.23
789 0.24
790 0.26
791 0.24
792 0.28
793 0.27
794 0.27
795 0.34
796 0.28
797 0.28
798 0.27
799 0.27
800 0.23
801 0.23
802 0.23
803 0.14
804 0.14
805 0.13
806 0.13
807 0.15
808 0.16
809 0.16
810 0.14
811 0.15
812 0.17
813 0.16
814 0.18
815 0.16
816 0.16
817 0.16
818 0.17
819 0.15
820 0.12
821 0.12
822 0.1
823 0.1
824 0.1
825 0.09
826 0.07
827 0.07
828 0.07
829 0.06
830 0.06
831 0.05
832 0.04
833 0.04
834 0.03
835 0.03
836 0.03
837 0.03
838 0.04
839 0.05
840 0.05
841 0.06
842 0.07
843 0.08
844 0.08
845 0.08
846 0.08
847 0.08
848 0.09
849 0.09
850 0.08
851 0.08
852 0.08
853 0.07
854 0.08
855 0.12
856 0.16
857 0.19
858 0.21
859 0.3
860 0.35
861 0.41
862 0.46
863 0.49
864 0.51
865 0.56
866 0.63
867 0.63
868 0.61
869 0.56
870 0.54
871 0.49
872 0.42
873 0.39
874 0.34
875 0.32
876 0.39
877 0.45
878 0.47
879 0.51
880 0.55
881 0.55
882 0.56
883 0.58
884 0.57
885 0.55
886 0.5
887 0.49
888 0.46
889 0.45
890 0.4
891 0.32
892 0.26
893 0.21
894 0.21
895 0.16
896 0.15
897 0.13
898 0.14
899 0.14
900 0.13
901 0.13
902 0.14
903 0.13
904 0.12
905 0.11
906 0.08
907 0.11
908 0.18
909 0.22
910 0.22
911 0.22
912 0.22
913 0.27
914 0.28
915 0.28
916 0.27
917 0.26
918 0.27
919 0.3
920 0.3
921 0.25
922 0.25
923 0.23
924 0.17
925 0.13
926 0.1
927 0.08
928 0.08
929 0.08
930 0.08
931 0.09
932 0.1
933 0.15
934 0.22
935 0.2
936 0.23
937 0.28
938 0.28
939 0.28
940 0.27
941 0.25
942 0.2
943 0.23
944 0.25
945 0.22
946 0.23
947 0.22
948 0.22
949 0.19
950 0.19
951 0.16
952 0.16
953 0.15
954 0.14
955 0.13
956 0.14
957 0.18
958 0.21
959 0.25
960 0.24
961 0.26
962 0.31
963 0.32
964 0.36
965 0.41
966 0.46
967 0.52
968 0.55
969 0.56
970 0.52
971 0.52
972 0.49
973 0.42
974 0.34
975 0.27
976 0.23
977 0.25
978 0.24
979 0.24
980 0.24
981 0.21
982 0.22
983 0.2
984 0.19
985 0.16
986 0.17
987 0.19
988 0.24
989 0.26
990 0.24
991 0.24
992 0.22
993 0.21
994 0.2
995 0.19
996 0.14
997 0.13
998 0.14
999 0.2
1000 0.19
1001 0.19
1002 0.18
1003 0.18
1004 0.17
1005 0.16
1006 0.14
1007 0.11
1008 0.15
1009 0.2
1010 0.24
1011 0.3
1012 0.31
1013 0.37
1014 0.38
1015 0.4
1016 0.45
1017 0.46
1018 0.48
1019 0.46
1020 0.52
1021 0.46
1022 0.49
1023 0.43
1024 0.34
1025 0.29
1026 0.23
1027 0.18
1028 0.12
1029 0.11
1030 0.08
1031 0.11
1032 0.11
1033 0.11
1034 0.12
1035 0.11
1036 0.11
1037 0.11
1038 0.12
1039 0.13
1040 0.15
1041 0.16
1042 0.16
1043 0.18
1044 0.18
1045 0.21
1046 0.21
1047 0.22
1048 0.23
1049 0.25
1050 0.26
1051 0.25
1052 0.28
1053 0.27
1054 0.28
1055 0.32
1056 0.38
1057 0.4
1058 0.42
1059 0.43
1060 0.45
1061 0.51
1062 0.53
1063 0.49
1064 0.46
1065 0.44
1066 0.42
1067 0.43
1068 0.39
1069 0.35
1070 0.33
1071 0.32
1072 0.31
1073 0.26
1074 0.26
1075 0.26
1076 0.31
1077 0.31
1078 0.33
1079 0.37
1080 0.41
1081 0.46
1082 0.53
1083 0.59
1084 0.62
1085 0.67
1086 0.69
1087 0.66
1088 0.63
1089 0.65
1090 0.67
1091 0.62
1092 0.55
1093 0.48
1094 0.47
1095 0.44
1096 0.39
1097 0.31
1098 0.23
1099 0.2
1100 0.17
1101 0.15
1102 0.11
1103 0.12
1104 0.15
1105 0.16
1106 0.15
1107 0.2
1108 0.29
1109 0.4
1110 0.49
1111 0.56
1112 0.61
1113 0.71
1114 0.78
1115 0.83
1116 0.84
1117 0.84
1118 0.85
1119 0.87
1120 0.88
1121 0.86
1122 0.82
1123 0.78