Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

G1XLW3

Protein Details
Accession G1XLW3    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
149-168GVAPRAKMNQQRSRRFRSAQHydrophilic
1057-1079DYNSNNQHDRRPPQQDRRGGYRGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
451-467KRRQVEERREANAKRRK
Subcellular Location(s) cyto 9.5cyto_nucl 9.5, nucl 8.5, E.R. 3, mito 2, golg 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027073  5_3_exoribonuclease  
IPR041412  Xrn1_helical  
IPR004859  Xrn1_N  
IPR017151  Xrn2/3/4  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0004534  F:5'-3' RNA exonuclease activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0006353  P:DNA-templated transcription termination  
GO:0006397  P:mRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF17846  XRN_M  
PF03159  XRN_N  
CDD cd18673  PIN_XRN1-2-like  
Amino Acid Sequences MFNASELSDWFRRPISLRLVTNLSPTFFTTTIIIIIIIIIGIAPSLSVPAFFRWLSQKYPKIISPVLEALPQEIDGHEIPVDTTGPNPNGEELDNLYLDMNGIVHPCSHPEDRPPPETEQEMMLEVFRYTERVVAMVRPRKVLMMAVDGVAPRAKMNQQRSRRFRSAQEAKEKEEQVAEFVKLLASKGTDIDSNLQKKGWDSNAITPGTPFMDILSIALKYWVAHKLNTDPGWAKLKIIISDSSVPGEGEHKIMEFVRGQRSHPEHDPNTRHVIYGLDADLIMLGLATHEPHFRVLREDVFAQDSKPRVCKICNQKGHRAEECTGKAREKEGEFDEKSKANPRKPFIWLDVGILREYLAVELHVPGLSFQWDLERAIDDWVFLCFFVGNDFLPHFPSLEIRDAGIDTLTSIWRENLAAMKGFVTTDGNVNLERAQFILDGLAKQEDAIFRKRRQVEERREANAKRRKLQEEANNNSGNDKVSVHRGKSERIPTAHPANIPLFAPNDHSDKTKQLNHDVVVNRAEIRTANYANKSAAAALKAQLLQNTITTNPSTDEQPAETEAQPETEGASVLGKRKLDTMQADSGNQTPIEAAPGEGNADTVKLWEPGYRDRYYEQKFGRPPSDTNFRREVANAYVEGLCWVLLYYFQGCPSWTWYYPYHYAPFAQDFENIGELKINFTLGKPFKPFEQLMGVLPAASKHNIPKAFWPLMTEENSEIIDFYPEDFPIDLNGKKFAWQGVAILPFIDETRLLDAMNKIYPQIPAEEKERNEMGNELLLFSESHPLYDELACQFFSKRAVDGDHELDPRLSEGLSGGVRKDPNFIPRSTVSFPFTNVKSDIYGDIEDDQSMSVIYLLPEKKNLHKSMLLRGVVLKTPALTEGDKDVILNKQQGNGNRYGGGYLDRSNSGRGRGGRHHYNNPIAPPSGVRGPTLPAGYTLPDQQGRGGGQGWTPPGNQSFDFRYGQGYQQPQQGYGNGQYGGGSSGSSGYQSYGNNQGYSGSQSHNRQGGSGGGYQGGGGGGYERGYNDRNNYGGGGNSGYQDDRRGSYERGGGGERRDYNSNNQHDRRPPQQDRRGGYRGGGRGGHGQGGGGGYNRGNNSWMG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.34
2 0.37
3 0.42
4 0.43
5 0.46
6 0.5
7 0.48
8 0.51
9 0.46
10 0.38
11 0.31
12 0.31
13 0.3
14 0.25
15 0.25
16 0.19
17 0.18
18 0.17
19 0.16
20 0.14
21 0.09
22 0.09
23 0.07
24 0.05
25 0.04
26 0.03
27 0.03
28 0.03
29 0.02
30 0.02
31 0.02
32 0.04
33 0.04
34 0.05
35 0.07
36 0.09
37 0.14
38 0.14
39 0.17
40 0.24
41 0.27
42 0.34
43 0.42
44 0.47
45 0.49
46 0.55
47 0.54
48 0.54
49 0.54
50 0.48
51 0.44
52 0.42
53 0.37
54 0.34
55 0.31
56 0.26
57 0.24
58 0.22
59 0.16
60 0.12
61 0.14
62 0.12
63 0.13
64 0.12
65 0.11
66 0.11
67 0.11
68 0.12
69 0.09
70 0.11
71 0.16
72 0.17
73 0.18
74 0.19
75 0.19
76 0.2
77 0.2
78 0.2
79 0.17
80 0.19
81 0.17
82 0.17
83 0.16
84 0.14
85 0.13
86 0.11
87 0.08
88 0.07
89 0.07
90 0.07
91 0.08
92 0.09
93 0.12
94 0.17
95 0.2
96 0.22
97 0.3
98 0.39
99 0.45
100 0.49
101 0.51
102 0.5
103 0.5
104 0.51
105 0.43
106 0.35
107 0.3
108 0.27
109 0.23
110 0.18
111 0.15
112 0.12
113 0.12
114 0.1
115 0.11
116 0.1
117 0.12
118 0.11
119 0.12
120 0.13
121 0.18
122 0.28
123 0.34
124 0.36
125 0.36
126 0.37
127 0.36
128 0.36
129 0.33
130 0.26
131 0.23
132 0.22
133 0.2
134 0.2
135 0.19
136 0.19
137 0.17
138 0.14
139 0.1
140 0.12
141 0.18
142 0.25
143 0.35
144 0.44
145 0.54
146 0.65
147 0.73
148 0.79
149 0.81
150 0.78
151 0.75
152 0.76
153 0.76
154 0.74
155 0.76
156 0.71
157 0.68
158 0.71
159 0.65
160 0.55
161 0.48
162 0.39
163 0.32
164 0.31
165 0.26
166 0.18
167 0.17
168 0.17
169 0.14
170 0.14
171 0.12
172 0.1
173 0.1
174 0.1
175 0.12
176 0.12
177 0.13
178 0.19
179 0.25
180 0.28
181 0.28
182 0.28
183 0.28
184 0.28
185 0.33
186 0.31
187 0.3
188 0.3
189 0.36
190 0.42
191 0.42
192 0.41
193 0.34
194 0.32
195 0.26
196 0.23
197 0.15
198 0.09
199 0.09
200 0.09
201 0.09
202 0.09
203 0.08
204 0.08
205 0.08
206 0.08
207 0.07
208 0.1
209 0.18
210 0.18
211 0.19
212 0.22
213 0.26
214 0.33
215 0.34
216 0.35
217 0.29
218 0.32
219 0.37
220 0.34
221 0.3
222 0.26
223 0.28
224 0.25
225 0.26
226 0.23
227 0.2
228 0.24
229 0.24
230 0.21
231 0.19
232 0.17
233 0.15
234 0.16
235 0.13
236 0.11
237 0.1
238 0.09
239 0.1
240 0.1
241 0.12
242 0.14
243 0.17
244 0.25
245 0.26
246 0.28
247 0.35
248 0.39
249 0.42
250 0.45
251 0.5
252 0.46
253 0.54
254 0.57
255 0.53
256 0.56
257 0.51
258 0.45
259 0.37
260 0.33
261 0.25
262 0.22
263 0.18
264 0.11
265 0.1
266 0.1
267 0.09
268 0.07
269 0.06
270 0.03
271 0.03
272 0.03
273 0.03
274 0.04
275 0.05
276 0.06
277 0.07
278 0.11
279 0.13
280 0.13
281 0.17
282 0.19
283 0.2
284 0.22
285 0.22
286 0.21
287 0.23
288 0.22
289 0.19
290 0.21
291 0.22
292 0.22
293 0.25
294 0.26
295 0.26
296 0.28
297 0.36
298 0.43
299 0.5
300 0.57
301 0.6
302 0.67
303 0.72
304 0.76
305 0.71
306 0.65
307 0.57
308 0.56
309 0.53
310 0.49
311 0.44
312 0.4
313 0.37
314 0.34
315 0.37
316 0.31
317 0.31
318 0.29
319 0.35
320 0.34
321 0.35
322 0.35
323 0.31
324 0.32
325 0.37
326 0.4
327 0.39
328 0.45
329 0.47
330 0.49
331 0.52
332 0.54
333 0.49
334 0.48
335 0.41
336 0.37
337 0.35
338 0.31
339 0.26
340 0.22
341 0.18
342 0.11
343 0.11
344 0.08
345 0.05
346 0.04
347 0.05
348 0.05
349 0.06
350 0.06
351 0.06
352 0.06
353 0.06
354 0.07
355 0.06
356 0.06
357 0.07
358 0.08
359 0.09
360 0.1
361 0.1
362 0.1
363 0.12
364 0.12
365 0.1
366 0.09
367 0.09
368 0.08
369 0.07
370 0.06
371 0.05
372 0.05
373 0.06
374 0.06
375 0.06
376 0.07
377 0.08
378 0.08
379 0.09
380 0.1
381 0.09
382 0.08
383 0.1
384 0.12
385 0.15
386 0.14
387 0.13
388 0.13
389 0.13
390 0.13
391 0.11
392 0.08
393 0.05
394 0.06
395 0.06
396 0.06
397 0.06
398 0.06
399 0.07
400 0.07
401 0.08
402 0.1
403 0.1
404 0.1
405 0.1
406 0.1
407 0.1
408 0.1
409 0.09
410 0.08
411 0.07
412 0.08
413 0.09
414 0.09
415 0.09
416 0.1
417 0.1
418 0.09
419 0.09
420 0.07
421 0.08
422 0.07
423 0.06
424 0.08
425 0.07
426 0.07
427 0.08
428 0.08
429 0.07
430 0.07
431 0.08
432 0.09
433 0.11
434 0.19
435 0.24
436 0.26
437 0.35
438 0.39
439 0.43
440 0.5
441 0.58
442 0.61
443 0.65
444 0.69
445 0.65
446 0.68
447 0.64
448 0.64
449 0.62
450 0.57
451 0.53
452 0.55
453 0.54
454 0.51
455 0.57
456 0.56
457 0.58
458 0.59
459 0.58
460 0.52
461 0.49
462 0.45
463 0.38
464 0.29
465 0.2
466 0.15
467 0.1
468 0.17
469 0.21
470 0.21
471 0.26
472 0.27
473 0.29
474 0.34
475 0.39
476 0.35
477 0.34
478 0.37
479 0.35
480 0.38
481 0.38
482 0.31
483 0.28
484 0.24
485 0.23
486 0.2
487 0.16
488 0.12
489 0.11
490 0.13
491 0.13
492 0.15
493 0.15
494 0.16
495 0.17
496 0.2
497 0.25
498 0.25
499 0.26
500 0.28
501 0.3
502 0.28
503 0.33
504 0.3
505 0.28
506 0.25
507 0.23
508 0.19
509 0.16
510 0.16
511 0.1
512 0.11
513 0.12
514 0.13
515 0.15
516 0.16
517 0.17
518 0.17
519 0.17
520 0.15
521 0.12
522 0.11
523 0.09
524 0.09
525 0.08
526 0.1
527 0.1
528 0.11
529 0.1
530 0.1
531 0.1
532 0.1
533 0.1
534 0.09
535 0.09
536 0.09
537 0.08
538 0.08
539 0.09
540 0.09
541 0.09
542 0.1
543 0.09
544 0.1
545 0.11
546 0.12
547 0.11
548 0.11
549 0.11
550 0.1
551 0.1
552 0.09
553 0.08
554 0.06
555 0.06
556 0.05
557 0.06
558 0.07
559 0.09
560 0.12
561 0.11
562 0.12
563 0.14
564 0.14
565 0.17
566 0.18
567 0.2
568 0.22
569 0.23
570 0.23
571 0.22
572 0.22
573 0.19
574 0.16
575 0.12
576 0.08
577 0.07
578 0.07
579 0.06
580 0.05
581 0.05
582 0.05
583 0.06
584 0.05
585 0.06
586 0.04
587 0.05
588 0.04
589 0.05
590 0.06
591 0.06
592 0.07
593 0.08
594 0.11
595 0.17
596 0.23
597 0.23
598 0.23
599 0.24
600 0.32
601 0.35
602 0.4
603 0.36
604 0.38
605 0.41
606 0.43
607 0.45
608 0.39
609 0.37
610 0.35
611 0.44
612 0.39
613 0.4
614 0.4
615 0.37
616 0.35
617 0.34
618 0.31
619 0.23
620 0.22
621 0.17
622 0.15
623 0.14
624 0.13
625 0.13
626 0.1
627 0.07
628 0.05
629 0.05
630 0.03
631 0.03
632 0.05
633 0.06
634 0.06
635 0.07
636 0.08
637 0.08
638 0.09
639 0.13
640 0.16
641 0.15
642 0.19
643 0.2
644 0.25
645 0.28
646 0.3
647 0.27
648 0.24
649 0.24
650 0.22
651 0.23
652 0.2
653 0.17
654 0.15
655 0.15
656 0.15
657 0.16
658 0.14
659 0.11
660 0.11
661 0.11
662 0.1
663 0.09
664 0.09
665 0.07
666 0.08
667 0.16
668 0.16
669 0.19
670 0.21
671 0.22
672 0.22
673 0.27
674 0.27
675 0.22
676 0.24
677 0.22
678 0.2
679 0.21
680 0.19
681 0.14
682 0.14
683 0.12
684 0.1
685 0.09
686 0.1
687 0.1
688 0.17
689 0.18
690 0.19
691 0.24
692 0.3
693 0.31
694 0.3
695 0.29
696 0.26
697 0.28
698 0.29
699 0.25
700 0.19
701 0.18
702 0.18
703 0.16
704 0.13
705 0.1
706 0.08
707 0.07
708 0.08
709 0.08
710 0.08
711 0.09
712 0.08
713 0.08
714 0.1
715 0.13
716 0.13
717 0.13
718 0.15
719 0.15
720 0.16
721 0.17
722 0.16
723 0.15
724 0.13
725 0.14
726 0.15
727 0.16
728 0.14
729 0.13
730 0.12
731 0.11
732 0.1
733 0.09
734 0.06
735 0.05
736 0.07
737 0.08
738 0.08
739 0.09
740 0.11
741 0.13
742 0.14
743 0.13
744 0.12
745 0.13
746 0.14
747 0.13
748 0.15
749 0.15
750 0.17
751 0.21
752 0.26
753 0.25
754 0.29
755 0.29
756 0.26
757 0.24
758 0.22
759 0.19
760 0.16
761 0.15
762 0.11
763 0.1
764 0.1
765 0.1
766 0.09
767 0.15
768 0.12
769 0.12
770 0.13
771 0.14
772 0.15
773 0.15
774 0.16
775 0.12
776 0.13
777 0.13
778 0.13
779 0.13
780 0.12
781 0.15
782 0.14
783 0.14
784 0.15
785 0.17
786 0.19
787 0.22
788 0.24
789 0.25
790 0.25
791 0.25
792 0.23
793 0.21
794 0.18
795 0.15
796 0.11
797 0.07
798 0.06
799 0.09
800 0.1
801 0.1
802 0.11
803 0.14
804 0.16
805 0.16
806 0.2
807 0.2
808 0.27
809 0.3
810 0.3
811 0.31
812 0.32
813 0.37
814 0.37
815 0.37
816 0.32
817 0.3
818 0.32
819 0.33
820 0.32
821 0.29
822 0.27
823 0.24
824 0.22
825 0.22
826 0.21
827 0.17
828 0.17
829 0.14
830 0.15
831 0.14
832 0.12
833 0.11
834 0.1
835 0.07
836 0.07
837 0.06
838 0.05
839 0.05
840 0.05
841 0.11
842 0.14
843 0.15
844 0.2
845 0.23
846 0.3
847 0.39
848 0.41
849 0.39
850 0.43
851 0.45
852 0.49
853 0.55
854 0.47
855 0.4
856 0.4
857 0.37
858 0.33
859 0.31
860 0.22
861 0.14
862 0.14
863 0.14
864 0.14
865 0.12
866 0.12
867 0.14
868 0.15
869 0.15
870 0.14
871 0.15
872 0.16
873 0.19
874 0.23
875 0.21
876 0.25
877 0.29
878 0.35
879 0.38
880 0.39
881 0.37
882 0.33
883 0.32
884 0.27
885 0.24
886 0.2
887 0.18
888 0.16
889 0.17
890 0.18
891 0.19
892 0.23
893 0.24
894 0.25
895 0.28
896 0.29
897 0.33
898 0.39
899 0.46
900 0.52
901 0.57
902 0.62
903 0.63
904 0.68
905 0.65
906 0.6
907 0.56
908 0.46
909 0.4
910 0.33
911 0.3
912 0.29
913 0.26
914 0.23
915 0.2
916 0.22
917 0.25
918 0.25
919 0.21
920 0.17
921 0.17
922 0.18
923 0.19
924 0.19
925 0.2
926 0.21
927 0.21
928 0.21
929 0.23
930 0.21
931 0.21
932 0.2
933 0.16
934 0.15
935 0.18
936 0.2
937 0.18
938 0.18
939 0.2
940 0.21
941 0.24
942 0.23
943 0.24
944 0.27
945 0.29
946 0.31
947 0.28
948 0.29
949 0.28
950 0.31
951 0.34
952 0.35
953 0.34
954 0.39
955 0.39
956 0.36
957 0.36
958 0.34
959 0.31
960 0.29
961 0.28
962 0.22
963 0.21
964 0.19
965 0.18
966 0.17
967 0.14
968 0.1
969 0.07
970 0.08
971 0.08
972 0.08
973 0.08
974 0.08
975 0.11
976 0.12
977 0.15
978 0.23
979 0.25
980 0.25
981 0.25
982 0.25
983 0.23
984 0.26
985 0.25
986 0.2
987 0.25
988 0.29
989 0.36
990 0.39
991 0.38
992 0.34
993 0.33
994 0.33
995 0.3
996 0.28
997 0.22
998 0.18
999 0.18
1000 0.17
1001 0.16
1002 0.12
1003 0.08
1004 0.05
1005 0.05
1006 0.05
1007 0.06
1008 0.07
1009 0.08
1010 0.11
1011 0.14
1012 0.18
1013 0.22
1014 0.26
1015 0.26
1016 0.27
1017 0.27
1018 0.25
1019 0.23
1020 0.21
1021 0.19
1022 0.16
1023 0.16
1024 0.16
1025 0.16
1026 0.16
1027 0.19
1028 0.2
1029 0.2
1030 0.23
1031 0.26
1032 0.27
1033 0.31
1034 0.35
1035 0.33
1036 0.34
1037 0.36
1038 0.35
1039 0.36
1040 0.41
1041 0.4
1042 0.39
1043 0.42
1044 0.41
1045 0.47
1046 0.54
1047 0.59
1048 0.61
1049 0.62
1050 0.66
1051 0.71
1052 0.75
1053 0.75
1054 0.76
1055 0.77
1056 0.78
1057 0.82
1058 0.83
1059 0.81
1060 0.83
1061 0.78
1062 0.69
1063 0.63
1064 0.6
1065 0.55
1066 0.51
1067 0.45
1068 0.39
1069 0.4
1070 0.4
1071 0.38
1072 0.3
1073 0.25
1074 0.21
1075 0.21
1076 0.19
1077 0.13
1078 0.14
1079 0.12
1080 0.16
1081 0.17
1082 0.17