Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

G1XCZ5

Protein Details
Accession G1XCZ5    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
75-96IPQPPQHNSLKRKHPDNRHVDVHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto_nucl 15
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR034772  CPSF6/7  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006397  P:mRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12372  RRM_CFIm68_CFIm59  
Amino Acid Sequences MADDDNFDIDIYGEDLDDPSAPYKKVAAEDELFHDDDGKPDTGKSNGNAAAANGTTEDTNMEGANVTDNVKQEPIPQPPQHNSLKRKHPDNRHVDVNATTALYISELNWWTTDDDIRGWIRQADCEDELKDITFSEHKVNGKSKGVAFVEFTTTQASSATKAKIESFATQPGYQSKRHTVNFTQPHSNPFRTLPKDAPARNKDDNRSGPGNFNKDNRPHGPMSNNFPSPANFAPQSNMMGNNMGGGGGGGGGGGGGYRGGRGNMMGGGRGNMGGSGGGGYMNRNNAGNHMGGGGGSGSPPQSFGMMNQPGGFGNMGGGGGGGGGGMQFQGGGGGGGGGGFQGNRGGMNMGMRGGGPPNRGRGGFNNNMGMPMGGMGPNMGMNPPMGGMNMGGPMGNMGGGDMSGGNSNFNPMMGSGFNPMMGGGAPQFPNPNFTQQFFGQPQQGEQQWNPHGNKRPRQDG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.07
2 0.08
3 0.08
4 0.08
5 0.09
6 0.12
7 0.16
8 0.16
9 0.17
10 0.19
11 0.22
12 0.26
13 0.28
14 0.3
15 0.29
16 0.31
17 0.36
18 0.37
19 0.34
20 0.29
21 0.29
22 0.23
23 0.22
24 0.24
25 0.2
26 0.16
27 0.17
28 0.21
29 0.21
30 0.25
31 0.25
32 0.28
33 0.29
34 0.29
35 0.29
36 0.26
37 0.25
38 0.21
39 0.2
40 0.13
41 0.11
42 0.1
43 0.09
44 0.1
45 0.07
46 0.08
47 0.08
48 0.07
49 0.07
50 0.07
51 0.09
52 0.1
53 0.11
54 0.13
55 0.14
56 0.15
57 0.16
58 0.16
59 0.2
60 0.26
61 0.32
62 0.39
63 0.42
64 0.48
65 0.51
66 0.58
67 0.62
68 0.64
69 0.64
70 0.65
71 0.71
72 0.71
73 0.77
74 0.79
75 0.81
76 0.82
77 0.83
78 0.8
79 0.76
80 0.7
81 0.62
82 0.54
83 0.45
84 0.36
85 0.26
86 0.2
87 0.13
88 0.11
89 0.09
90 0.08
91 0.06
92 0.1
93 0.11
94 0.12
95 0.12
96 0.13
97 0.13
98 0.14
99 0.15
100 0.11
101 0.11
102 0.14
103 0.15
104 0.15
105 0.15
106 0.18
107 0.17
108 0.19
109 0.2
110 0.21
111 0.21
112 0.23
113 0.22
114 0.2
115 0.2
116 0.18
117 0.16
118 0.12
119 0.12
120 0.11
121 0.12
122 0.15
123 0.19
124 0.21
125 0.26
126 0.3
127 0.33
128 0.35
129 0.36
130 0.33
131 0.35
132 0.34
133 0.3
134 0.27
135 0.24
136 0.24
137 0.21
138 0.21
139 0.16
140 0.15
141 0.14
142 0.13
143 0.12
144 0.1
145 0.14
146 0.14
147 0.14
148 0.15
149 0.16
150 0.18
151 0.2
152 0.21
153 0.19
154 0.23
155 0.25
156 0.24
157 0.24
158 0.27
159 0.28
160 0.28
161 0.3
162 0.32
163 0.36
164 0.38
165 0.42
166 0.39
167 0.45
168 0.51
169 0.51
170 0.51
171 0.45
172 0.49
173 0.49
174 0.47
175 0.39
176 0.35
177 0.39
178 0.36
179 0.39
180 0.35
181 0.36
182 0.42
183 0.44
184 0.5
185 0.46
186 0.49
187 0.52
188 0.55
189 0.52
190 0.53
191 0.52
192 0.47
193 0.47
194 0.41
195 0.4
196 0.39
197 0.41
198 0.36
199 0.36
200 0.37
201 0.37
202 0.41
203 0.38
204 0.38
205 0.34
206 0.35
207 0.37
208 0.34
209 0.38
210 0.37
211 0.35
212 0.31
213 0.3
214 0.28
215 0.26
216 0.23
217 0.18
218 0.14
219 0.14
220 0.14
221 0.14
222 0.16
223 0.13
224 0.12
225 0.1
226 0.1
227 0.1
228 0.09
229 0.07
230 0.05
231 0.04
232 0.04
233 0.03
234 0.02
235 0.02
236 0.02
237 0.02
238 0.02
239 0.02
240 0.02
241 0.02
242 0.02
243 0.02
244 0.03
245 0.03
246 0.04
247 0.04
248 0.04
249 0.05
250 0.07
251 0.07
252 0.07
253 0.07
254 0.07
255 0.08
256 0.08
257 0.07
258 0.05
259 0.05
260 0.04
261 0.04
262 0.03
263 0.03
264 0.03
265 0.04
266 0.05
267 0.06
268 0.07
269 0.08
270 0.09
271 0.09
272 0.1
273 0.12
274 0.11
275 0.1
276 0.09
277 0.09
278 0.07
279 0.07
280 0.06
281 0.04
282 0.04
283 0.04
284 0.05
285 0.04
286 0.05
287 0.06
288 0.06
289 0.07
290 0.08
291 0.16
292 0.17
293 0.18
294 0.17
295 0.18
296 0.17
297 0.18
298 0.16
299 0.07
300 0.06
301 0.06
302 0.05
303 0.04
304 0.04
305 0.03
306 0.03
307 0.03
308 0.02
309 0.02
310 0.02
311 0.02
312 0.02
313 0.02
314 0.02
315 0.02
316 0.02
317 0.02
318 0.02
319 0.02
320 0.02
321 0.02
322 0.02
323 0.03
324 0.02
325 0.03
326 0.02
327 0.03
328 0.04
329 0.04
330 0.04
331 0.05
332 0.06
333 0.07
334 0.08
335 0.09
336 0.08
337 0.08
338 0.08
339 0.08
340 0.11
341 0.14
342 0.17
343 0.19
344 0.23
345 0.26
346 0.27
347 0.29
348 0.32
349 0.37
350 0.39
351 0.4
352 0.39
353 0.36
354 0.36
355 0.34
356 0.27
357 0.18
358 0.13
359 0.1
360 0.06
361 0.06
362 0.06
363 0.06
364 0.06
365 0.06
366 0.06
367 0.06
368 0.05
369 0.06
370 0.06
371 0.06
372 0.06
373 0.06
374 0.06
375 0.07
376 0.08
377 0.07
378 0.07
379 0.06
380 0.06
381 0.06
382 0.06
383 0.04
384 0.04
385 0.04
386 0.03
387 0.04
388 0.04
389 0.05
390 0.07
391 0.07
392 0.09
393 0.09
394 0.11
395 0.11
396 0.11
397 0.11
398 0.09
399 0.11
400 0.11
401 0.12
402 0.13
403 0.13
404 0.13
405 0.13
406 0.12
407 0.1
408 0.09
409 0.09
410 0.07
411 0.12
412 0.13
413 0.14
414 0.19
415 0.19
416 0.24
417 0.25
418 0.34
419 0.32
420 0.33
421 0.37
422 0.34
423 0.42
424 0.41
425 0.44
426 0.4
427 0.38
428 0.39
429 0.4
430 0.42
431 0.4
432 0.38
433 0.42
434 0.43
435 0.51
436 0.53
437 0.54
438 0.61
439 0.65
440 0.73