Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

G1XAV5

Protein Details
Accession G1XAV5    Localization Confidence High Confidence Score 25.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
113-138ESSNMAKDSKPKNPRKRQRSASVSSNHydrophilic
226-257DSDNNNKKKATKKPTKNTTPPRERKKLKLSTPHydrophilic
337-364LIVTRGKGFTKEKNKKKRGAYRGGAIDFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
122-129KPKNPRKR
232-268KKKATKKPTKNTTPPRERKKLKLSTPAKELPHKGESK
343-357KGFTKEKNKKKRGAY
Subcellular Location(s) nucl 24, mito 1, cyto 1, cysk 1, cyto_mito 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006594  LisH  
IPR007718  Srp40_C  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
Pfam View protein in Pfam  
PF05022  SRP40_C  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50896  LISH  
Amino Acid Sequences MADKAWIFKPSAAHAPTAAKSPGTDANTQDNQELLSLVSQYLQSNGFPQASRKLLRESEKRQIKIEPPKSHSLSLCDIYQRFRTAVAPASPSAQLAREAADDTSDTLSAKSAESSNMAKDSKPKNPRKRQRSASVSSNSSSTSTSSSGSSGSSSSSSSSSSSSSSSSSSPNSSSSSSSSSSSSSDSSSDSEDESDESDSSSDSSSDSSSSSDESSDDSSSDSSDSDSDNNNKKKATKKPTKNTTPPRERKKLKLSTPAKELPHKGESKKATETVESEEATPVLSTSTETKSESGTGEKVKNKPFSRINIEKITYEDEALKDNSFNGATYAQRAHEDLIVTRGKGFTKEKNKKKRGAYRGGAIDFAPKSYKFKD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.33
2 0.36
3 0.34
4 0.36
5 0.32
6 0.24
7 0.23
8 0.25
9 0.29
10 0.28
11 0.3
12 0.29
13 0.36
14 0.4
15 0.41
16 0.37
17 0.31
18 0.27
19 0.24
20 0.21
21 0.13
22 0.09
23 0.09
24 0.08
25 0.09
26 0.1
27 0.1
28 0.12
29 0.12
30 0.12
31 0.13
32 0.17
33 0.18
34 0.17
35 0.2
36 0.25
37 0.3
38 0.33
39 0.33
40 0.37
41 0.41
42 0.49
43 0.56
44 0.57
45 0.61
46 0.67
47 0.67
48 0.63
49 0.63
50 0.63
51 0.64
52 0.67
53 0.66
54 0.63
55 0.69
56 0.7
57 0.67
58 0.6
59 0.54
60 0.48
61 0.42
62 0.38
63 0.34
64 0.31
65 0.31
66 0.32
67 0.3
68 0.25
69 0.24
70 0.23
71 0.21
72 0.25
73 0.24
74 0.24
75 0.22
76 0.24
77 0.23
78 0.22
79 0.2
80 0.15
81 0.14
82 0.11
83 0.12
84 0.1
85 0.11
86 0.11
87 0.1
88 0.1
89 0.1
90 0.1
91 0.09
92 0.09
93 0.08
94 0.09
95 0.09
96 0.09
97 0.09
98 0.09
99 0.09
100 0.12
101 0.13
102 0.14
103 0.18
104 0.18
105 0.18
106 0.25
107 0.3
108 0.37
109 0.46
110 0.55
111 0.62
112 0.73
113 0.83
114 0.84
115 0.89
116 0.88
117 0.88
118 0.86
119 0.81
120 0.78
121 0.73
122 0.65
123 0.55
124 0.47
125 0.38
126 0.3
127 0.25
128 0.17
129 0.13
130 0.12
131 0.12
132 0.12
133 0.11
134 0.11
135 0.11
136 0.1
137 0.08
138 0.08
139 0.08
140 0.08
141 0.08
142 0.09
143 0.09
144 0.09
145 0.1
146 0.1
147 0.1
148 0.11
149 0.11
150 0.11
151 0.12
152 0.12
153 0.13
154 0.13
155 0.14
156 0.14
157 0.15
158 0.16
159 0.16
160 0.16
161 0.16
162 0.17
163 0.17
164 0.17
165 0.16
166 0.15
167 0.15
168 0.15
169 0.14
170 0.12
171 0.11
172 0.11
173 0.11
174 0.11
175 0.1
176 0.09
177 0.09
178 0.08
179 0.08
180 0.08
181 0.08
182 0.07
183 0.06
184 0.06
185 0.06
186 0.06
187 0.06
188 0.05
189 0.05
190 0.05
191 0.06
192 0.06
193 0.07
194 0.07
195 0.07
196 0.08
197 0.08
198 0.07
199 0.07
200 0.08
201 0.1
202 0.09
203 0.09
204 0.09
205 0.09
206 0.09
207 0.09
208 0.07
209 0.06
210 0.07
211 0.07
212 0.08
213 0.11
214 0.18
215 0.26
216 0.3
217 0.31
218 0.33
219 0.37
220 0.43
221 0.51
222 0.55
223 0.57
224 0.64
225 0.73
226 0.82
227 0.87
228 0.89
229 0.9
230 0.9
231 0.9
232 0.9
233 0.89
234 0.89
235 0.84
236 0.83
237 0.83
238 0.81
239 0.78
240 0.79
241 0.76
242 0.72
243 0.74
244 0.71
245 0.64
246 0.61
247 0.57
248 0.52
249 0.52
250 0.51
251 0.45
252 0.47
253 0.48
254 0.46
255 0.47
256 0.44
257 0.39
258 0.35
259 0.35
260 0.33
261 0.32
262 0.27
263 0.24
264 0.21
265 0.19
266 0.17
267 0.15
268 0.09
269 0.06
270 0.06
271 0.06
272 0.09
273 0.12
274 0.14
275 0.15
276 0.16
277 0.17
278 0.18
279 0.18
280 0.18
281 0.19
282 0.23
283 0.28
284 0.34
285 0.39
286 0.45
287 0.53
288 0.52
289 0.57
290 0.58
291 0.6
292 0.63
293 0.64
294 0.64
295 0.62
296 0.62
297 0.55
298 0.5
299 0.47
300 0.38
301 0.31
302 0.27
303 0.2
304 0.22
305 0.22
306 0.21
307 0.16
308 0.16
309 0.17
310 0.15
311 0.14
312 0.13
313 0.14
314 0.14
315 0.17
316 0.19
317 0.18
318 0.19
319 0.2
320 0.2
321 0.2
322 0.21
323 0.18
324 0.22
325 0.23
326 0.22
327 0.22
328 0.23
329 0.21
330 0.26
331 0.3
332 0.34
333 0.43
334 0.54
335 0.63
336 0.73
337 0.81
338 0.83
339 0.89
340 0.9
341 0.89
342 0.89
343 0.85
344 0.83
345 0.82
346 0.75
347 0.66
348 0.55
349 0.51
350 0.41
351 0.36
352 0.31
353 0.24