FuNGI

G1XHC8

Protein Details

Accession

G1XHC8

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
104-125	PGERPKPKLKFAPKNTIRKTKE	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
4-13	KPRRPPKPRG
107-122	RPKPKLKFAPKNTIRK
153-176	PSGRGARGRGRGRGGFGRGDGGPK
294-312	GGKEEKGKKDVKGKGKEVD
316-381	LEERKARSGRRDSGTGPRVKIEPSESPKATRRTTRSPEQIKKKQSSSPEDRRRKQVARSRSGNRKK

Subcellular Location(s)

mito 20, mito_nucl 14.333, nucl 6.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007811 RPC4
Gene Ontology	GO:0005666 C:RNA polymerase III complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0006383 P:transcription by RNA polymerase III
Pfam	View protein in Pfam PF05132 RNA_pol_Rpc4

Amino Acid Sequences

MPPKPRRPPKPRGGAAAASSSTAAEDSHKQEEFEPSLTAAESSASVPSEPIESTPLAIPPPSGRLEGLNNPAAPNLRSTRATTVSTVAEASGSTATVQPPVLAPGERPKPKLKFAPKNTIRKTKEEREQLNRQYDPPPQGDSLNAFGVTRGGPSGRGARGRGRGRGGFGRGDGGPKREEVAVASGPFSMGSVITMGGKQKVSIERLSRSFRTNRVSGLKTKREIGEDGEIKDEPYSSSDSEGGPKVDVEMIEMISSDEEEDGEGGEKKYSSVRGFAPVRIERREHVDKSAQQGGGKEEKGKKDVKGKGKEVDLEILEERKARSGRRDSGTGPRVKIEPSESPKATRRTTRSPEQIKKKQSSSPEDRRRKQVARSRSGNRKKDIIVPQSQEDFEEIDRYEVDRFSMLNELGPALPERGVDAEGDHDMDDAAMIPPEPRPDEKQNKLYLFQFPPVLPLMEPVEDVEDAEAQVKEEDSTAPAAASSSNQPAIKKEEKPKPKYTSLADVQKAQLPPGTAGKLNVHRSGRVTMVFGGIEFEVQRGVECDFLQDIVVLQKDSGALDERGKPKGRAWGMGQLKGKFVVTPDISKLV

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.75
2	0.68
3	0.63
4	0.52
5	0.42
6	0.35
7	0.27
8	0.2
9	0.15
10	0.13
11	0.11
12	0.16
13	0.2
14	0.25
15	0.26
16	0.27
17	0.29
18	0.36
19	0.35
20	0.32
21	0.28
22	0.23
23	0.23
24	0.22
25	0.2
26	0.13
27	0.1
28	0.1
29	0.09
30	0.1
31	0.1
32	0.09
33	0.09
34	0.1
35	0.11
36	0.11
37	0.11
38	0.13
39	0.12
40	0.14
41	0.15
42	0.16
43	0.15
44	0.15
45	0.15
46	0.14
47	0.18
48	0.19
49	0.19
50	0.18
51	0.2
52	0.25
53	0.3
54	0.33
55	0.34
56	0.32
57	0.31
58	0.32
59	0.32
60	0.27
61	0.26
62	0.24
63	0.24
64	0.26
65	0.29
66	0.33
67	0.35
68	0.37
69	0.33
70	0.32
71	0.29
72	0.27
73	0.24
74	0.18
75	0.14
76	0.11
77	0.11
78	0.08
79	0.07
80	0.07
81	0.09
82	0.09
83	0.1
84	0.11
85	0.1
86	0.1
87	0.12
88	0.13
89	0.12
90	0.13
91	0.21
92	0.3
93	0.35
94	0.38
95	0.45
96	0.48
97	0.55
98	0.63
99	0.66
100	0.67
101	0.71
102	0.78
103	0.78
104	0.84
105	0.86
106	0.86
107	0.79
108	0.78
109	0.78
110	0.76
111	0.76
112	0.75
113	0.75
114	0.73
115	0.79
116	0.78
117	0.78
118	0.7
119	0.63
120	0.58
121	0.55
122	0.52
123	0.44
124	0.4
125	0.32
126	0.31
127	0.3
128	0.28
129	0.25
130	0.2
131	0.18
132	0.14
133	0.13
134	0.13
135	0.12
136	0.1
137	0.08
138	0.07
139	0.08
140	0.1
141	0.15
142	0.18
143	0.21
144	0.23
145	0.29
146	0.37
147	0.41
148	0.44
149	0.44
150	0.42
151	0.43
152	0.46
153	0.43
154	0.36
155	0.31
156	0.29
157	0.24
158	0.28
159	0.25
160	0.23
161	0.21
162	0.19
163	0.2
164	0.18
165	0.17
166	0.13
167	0.15
168	0.15
169	0.14
170	0.14
171	0.13
172	0.12
173	0.12
174	0.11
175	0.07
176	0.04
177	0.04
178	0.04
179	0.04
180	0.05
181	0.06
182	0.07
183	0.09
184	0.09
185	0.09
186	0.13
187	0.17
188	0.19
189	0.23
190	0.27
191	0.29
192	0.34
193	0.4
194	0.38
195	0.39
196	0.4
197	0.41
198	0.42
199	0.39
200	0.39
201	0.4
202	0.41
203	0.44
204	0.49
205	0.5
206	0.47
207	0.49
208	0.46
209	0.42
210	0.4
211	0.35
212	0.33
213	0.29
214	0.28
215	0.26
216	0.24
217	0.22
218	0.21
219	0.18
220	0.1
221	0.09
222	0.11
223	0.09
224	0.1
225	0.11
226	0.12
227	0.14
228	0.15
229	0.13
230	0.11
231	0.11
232	0.1
233	0.1
234	0.09
235	0.08
236	0.07
237	0.07
238	0.06
239	0.07
240	0.06
241	0.05
242	0.05
243	0.04
244	0.03
245	0.03
246	0.03
247	0.03
248	0.03
249	0.04
250	0.06
251	0.06
252	0.06
253	0.06
254	0.07
255	0.09
256	0.12
257	0.12
258	0.13
259	0.14
260	0.21
261	0.23
262	0.24
263	0.28
264	0.29
265	0.32
266	0.32
267	0.32
268	0.26
269	0.32
270	0.37
271	0.31
272	0.31
273	0.33
274	0.32
275	0.36
276	0.4
277	0.33
278	0.28
279	0.28
280	0.27
281	0.26
282	0.24
283	0.25
284	0.24
285	0.25
286	0.29
287	0.3
288	0.3
289	0.35
290	0.42
291	0.47
292	0.5
293	0.52
294	0.52
295	0.51
296	0.49
297	0.41
298	0.36
299	0.27
300	0.21
301	0.18
302	0.14
303	0.13
304	0.12
305	0.11
306	0.13
307	0.15
308	0.15
309	0.22
310	0.28
311	0.35
312	0.37
313	0.4
314	0.38
315	0.46
316	0.51
317	0.48
318	0.41
319	0.36
320	0.33
321	0.31
322	0.3
323	0.24
324	0.24
325	0.26
326	0.32
327	0.31
328	0.35
329	0.4
330	0.45
331	0.44
332	0.44
333	0.45
334	0.48
335	0.53
336	0.58
337	0.62
338	0.66
339	0.72
340	0.75
341	0.77
342	0.76
343	0.75
344	0.7
345	0.65
346	0.63
347	0.63
348	0.63
349	0.65
350	0.68
351	0.73
352	0.74
353	0.77
354	0.78
355	0.73
356	0.73
357	0.7
358	0.69
359	0.68
360	0.71
361	0.72
362	0.74
363	0.8
364	0.78
365	0.72
366	0.67
367	0.6
368	0.61
369	0.61
370	0.57
371	0.54
372	0.49
373	0.49
374	0.46
375	0.44
376	0.35
377	0.27
378	0.22
379	0.15
380	0.14
381	0.12
382	0.1
383	0.1
384	0.11
385	0.11
386	0.1
387	0.1
388	0.09
389	0.08
390	0.09
391	0.12
392	0.11
393	0.1
394	0.1
395	0.11
396	0.1
397	0.11
398	0.1
399	0.08
400	0.08
401	0.07
402	0.08
403	0.08
404	0.08
405	0.08
406	0.07
407	0.08
408	0.08
409	0.09
410	0.08
411	0.07
412	0.07
413	0.06
414	0.06
415	0.05
416	0.05
417	0.04
418	0.05
419	0.05
420	0.07
421	0.09
422	0.12
423	0.15
424	0.21
425	0.31
426	0.41
427	0.48
428	0.55
429	0.6
430	0.6
431	0.6
432	0.56
433	0.54
434	0.47
435	0.42
436	0.37
437	0.29
438	0.29
439	0.27
440	0.25
441	0.17
442	0.17
443	0.16
444	0.14
445	0.14
446	0.12
447	0.13
448	0.11
449	0.12
450	0.1
451	0.08
452	0.08
453	0.1
454	0.09
455	0.08
456	0.08
457	0.09
458	0.08
459	0.09
460	0.09
461	0.08
462	0.1
463	0.09
464	0.09
465	0.08
466	0.08
467	0.08
468	0.09
469	0.11
470	0.13
471	0.17
472	0.19
473	0.2
474	0.23
475	0.31
476	0.36
477	0.41
478	0.48
479	0.54
480	0.63
481	0.7
482	0.77
483	0.77
484	0.76
485	0.75
486	0.7
487	0.69
488	0.67
489	0.68
490	0.6
491	0.56
492	0.52
493	0.51
494	0.46
495	0.38
496	0.32
497	0.24
498	0.24
499	0.25
500	0.26
501	0.21
502	0.24
503	0.3
504	0.35
505	0.39
506	0.44
507	0.41
508	0.4
509	0.42
510	0.43
511	0.39
512	0.33
513	0.3
514	0.23
515	0.23
516	0.21
517	0.17
518	0.16
519	0.13
520	0.12
521	0.11
522	0.1
523	0.08
524	0.08
525	0.09
526	0.08
527	0.09
528	0.1
529	0.1
530	0.12
531	0.12
532	0.13
533	0.12
534	0.11
535	0.11
536	0.13
537	0.14
538	0.12
539	0.11
540	0.12
541	0.12
542	0.12
543	0.13
544	0.14
545	0.15
546	0.19
547	0.27
548	0.3
549	0.37
550	0.41
551	0.41
552	0.41
553	0.49
554	0.49
555	0.47
556	0.48
557	0.51
558	0.53
559	0.58
560	0.61
561	0.52
562	0.5
563	0.46
564	0.42
565	0.32
566	0.28
567	0.29
568	0.27
569	0.29

G1XHC8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer