Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1D8PIP5

Protein Details
Accession A0A1D8PIP5    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
77-98STPFVDSRTKKKKRGLIFVLNAHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 11.5, pero 3, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006166  ERCC4_domain  
IPR011335  Restrct_endonuc-II-like  
IPR010994  RuvA_2-like  
IPR006167  XPF  
IPR047520  XPF_nuclease  
Gene Ontology GO:0000110  C:nucleotide-excision repair factor 1 complex  
GO:0003684  F:damaged DNA binding  
GO:0003697  F:single-stranded DNA binding  
GO:0000014  F:single-stranded DNA endodeoxyribonuclease activity  
GO:0000724  P:double-strand break repair via homologous recombination  
GO:0000736  P:double-strand break repair via single-strand annealing, removal of nonhomologous ends  
GO:1901255  P:nucleotide-excision repair involved in interstrand cross-link repair  
GO:0000712  P:resolution of meiotic recombination intermediates  
KEGG cal:CAALFM_C210440CA  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF02732  ERCC4  
CDD cd20078  XPF_nuclease_XPF_euk  
Amino Acid Sequences MSLFVHDDEENDKSTIPLNFSEPDIVPVYPEKAINCILPLKYQQEIVEDTLTKDGLLIMGCGLGWDIITANLLYALSTPFVDSRTKKKKRGLIFVLNAQDDELIRLQEEMNDLNWEDESQHERLVIINGDSQPLRRKKLYAEGGVIAISSRVLVVDLLSLIVSANDITGLFVFHAERIKETSNDAFIINLYRDNNNWGFIKAFSDDPESFSGFTPLATKLKLLRLSNVFLWPRFHVTISQSFNIKNKKDISRKSVTEISVKLTHNMNKIQSAILTCIQSCLGELKRHNPTLATEYWDIENVHDRDFVGRIRGSMNSSWHRVSVTSKNIVSDLSTLTNMLVGLINLDCIGFYQNVQRIVSESQKVQAGSKYRSQSPWLNLDEAVTVISCAKERAFGKRDGNYMFEELPKWNELGKLVHNILQEKRTSNLKNQGPILVVCSSKWVARDLTRLLETMQEEKIGDKRVFSCRRFMKDQLREYAHWRKEINPVVRRIWEEMEAEEQKEDESDIVITKTFTRNGQPVSKRRRTRGGSVAARVNQLRAPENFEAVDIDQEMLLELNEDEPIDQESDSLEFEKTQEENQEVLDLINETEQFQHDFDFVHIDKEEQIIVQAYNDKFNASILQELHPSHIIMYEQNLPFIRRVEVYQAINYENPAHAYFMYYGDSVEEQKYLLRVKREKEAFTKLIKEKATLGKHFETKDDNAKFQINRNNIVNTRIAGGSKFKTETDESNVIVDAREFGSSTPNLLYRIGINVIPCMLTIGDYILSPKMCVERKSISDLVQSFSSGRLFQQCKQMFRHYELPVLLIEFDGTQSFSLQPFSAVKYVRSTRDEPVESEIELNEQSNIQSKILSLLYAFPKLKIIWSSSPYETAQIFLELKANQEEPDVGTALDKGANRTIETGDGNPPMYNDDAIDFIQNIPGINAVNYHILIQQVKNIEELVSLSKDKFISILGDENGKKAYNFLNRKIK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.21
3 0.21
4 0.21
5 0.22
6 0.23
7 0.24
8 0.28
9 0.24
10 0.25
11 0.24
12 0.22
13 0.21
14 0.22
15 0.23
16 0.2
17 0.22
18 0.19
19 0.2
20 0.23
21 0.22
22 0.22
23 0.25
24 0.24
25 0.26
26 0.3
27 0.31
28 0.3
29 0.32
30 0.3
31 0.29
32 0.31
33 0.29
34 0.29
35 0.26
36 0.26
37 0.25
38 0.24
39 0.2
40 0.17
41 0.14
42 0.1
43 0.1
44 0.09
45 0.07
46 0.07
47 0.07
48 0.07
49 0.07
50 0.05
51 0.04
52 0.05
53 0.05
54 0.05
55 0.06
56 0.06
57 0.06
58 0.07
59 0.07
60 0.06
61 0.07
62 0.08
63 0.08
64 0.08
65 0.09
66 0.09
67 0.12
68 0.19
69 0.22
70 0.32
71 0.43
72 0.52
73 0.59
74 0.67
75 0.74
76 0.76
77 0.83
78 0.81
79 0.81
80 0.78
81 0.77
82 0.74
83 0.66
84 0.57
85 0.46
86 0.37
87 0.27
88 0.23
89 0.17
90 0.11
91 0.11
92 0.12
93 0.12
94 0.12
95 0.14
96 0.13
97 0.12
98 0.14
99 0.14
100 0.14
101 0.14
102 0.13
103 0.11
104 0.14
105 0.17
106 0.16
107 0.16
108 0.16
109 0.16
110 0.17
111 0.19
112 0.17
113 0.14
114 0.18
115 0.17
116 0.2
117 0.2
118 0.22
119 0.29
120 0.34
121 0.38
122 0.37
123 0.39
124 0.41
125 0.51
126 0.56
127 0.52
128 0.5
129 0.45
130 0.43
131 0.4
132 0.35
133 0.24
134 0.16
135 0.1
136 0.06
137 0.04
138 0.04
139 0.04
140 0.04
141 0.04
142 0.05
143 0.05
144 0.05
145 0.05
146 0.05
147 0.05
148 0.05
149 0.05
150 0.04
151 0.04
152 0.04
153 0.04
154 0.04
155 0.05
156 0.05
157 0.05
158 0.06
159 0.07
160 0.08
161 0.13
162 0.13
163 0.14
164 0.18
165 0.2
166 0.2
167 0.24
168 0.25
169 0.22
170 0.23
171 0.21
172 0.18
173 0.16
174 0.18
175 0.15
176 0.15
177 0.15
178 0.15
179 0.16
180 0.22
181 0.22
182 0.23
183 0.23
184 0.21
185 0.2
186 0.19
187 0.21
188 0.17
189 0.17
190 0.15
191 0.2
192 0.2
193 0.21
194 0.23
195 0.22
196 0.21
197 0.21
198 0.21
199 0.14
200 0.14
201 0.14
202 0.14
203 0.15
204 0.14
205 0.15
206 0.17
207 0.24
208 0.3
209 0.29
210 0.33
211 0.34
212 0.37
213 0.38
214 0.42
215 0.37
216 0.33
217 0.35
218 0.3
219 0.32
220 0.29
221 0.28
222 0.24
223 0.26
224 0.32
225 0.34
226 0.34
227 0.31
228 0.32
229 0.37
230 0.42
231 0.39
232 0.38
233 0.4
234 0.47
235 0.55
236 0.6
237 0.62
238 0.62
239 0.63
240 0.63
241 0.61
242 0.54
243 0.5
244 0.44
245 0.41
246 0.39
247 0.37
248 0.34
249 0.33
250 0.35
251 0.34
252 0.37
253 0.34
254 0.29
255 0.29
256 0.27
257 0.24
258 0.2
259 0.19
260 0.17
261 0.17
262 0.15
263 0.15
264 0.14
265 0.13
266 0.12
267 0.14
268 0.15
269 0.19
270 0.21
271 0.27
272 0.34
273 0.36
274 0.36
275 0.32
276 0.31
277 0.31
278 0.31
279 0.29
280 0.22
281 0.22
282 0.22
283 0.23
284 0.21
285 0.17
286 0.23
287 0.19
288 0.19
289 0.19
290 0.18
291 0.17
292 0.19
293 0.19
294 0.15
295 0.14
296 0.14
297 0.15
298 0.16
299 0.18
300 0.19
301 0.24
302 0.24
303 0.27
304 0.27
305 0.26
306 0.25
307 0.23
308 0.26
309 0.27
310 0.28
311 0.3
312 0.3
313 0.3
314 0.3
315 0.29
316 0.24
317 0.18
318 0.14
319 0.11
320 0.1
321 0.1
322 0.09
323 0.09
324 0.08
325 0.07
326 0.06
327 0.04
328 0.05
329 0.05
330 0.05
331 0.04
332 0.04
333 0.04
334 0.04
335 0.06
336 0.05
337 0.06
338 0.11
339 0.14
340 0.17
341 0.17
342 0.17
343 0.17
344 0.2
345 0.23
346 0.21
347 0.18
348 0.18
349 0.2
350 0.2
351 0.19
352 0.21
353 0.22
354 0.23
355 0.29
356 0.3
357 0.31
358 0.32
359 0.35
360 0.38
361 0.36
362 0.4
363 0.36
364 0.33
365 0.3
366 0.29
367 0.25
368 0.19
369 0.15
370 0.08
371 0.06
372 0.05
373 0.05
374 0.05
375 0.05
376 0.05
377 0.11
378 0.12
379 0.2
380 0.23
381 0.29
382 0.34
383 0.37
384 0.4
385 0.37
386 0.38
387 0.31
388 0.29
389 0.24
390 0.2
391 0.18
392 0.15
393 0.15
394 0.14
395 0.12
396 0.11
397 0.11
398 0.12
399 0.13
400 0.14
401 0.16
402 0.16
403 0.19
404 0.2
405 0.22
406 0.22
407 0.23
408 0.23
409 0.2
410 0.21
411 0.25
412 0.26
413 0.29
414 0.36
415 0.36
416 0.38
417 0.38
418 0.37
419 0.31
420 0.29
421 0.26
422 0.18
423 0.16
424 0.12
425 0.14
426 0.13
427 0.12
428 0.13
429 0.12
430 0.12
431 0.14
432 0.18
433 0.17
434 0.19
435 0.19
436 0.18
437 0.16
438 0.17
439 0.16
440 0.15
441 0.14
442 0.12
443 0.11
444 0.12
445 0.14
446 0.16
447 0.15
448 0.14
449 0.17
450 0.26
451 0.34
452 0.34
453 0.39
454 0.41
455 0.46
456 0.49
457 0.53
458 0.53
459 0.54
460 0.58
461 0.56
462 0.54
463 0.5
464 0.52
465 0.55
466 0.47
467 0.42
468 0.38
469 0.35
470 0.38
471 0.44
472 0.46
473 0.42
474 0.43
475 0.42
476 0.43
477 0.42
478 0.36
479 0.3
480 0.24
481 0.19
482 0.16
483 0.19
484 0.17
485 0.16
486 0.14
487 0.13
488 0.11
489 0.1
490 0.09
491 0.04
492 0.04
493 0.04
494 0.05
495 0.05
496 0.05
497 0.06
498 0.07
499 0.09
500 0.1
501 0.11
502 0.13
503 0.16
504 0.19
505 0.27
506 0.33
507 0.4
508 0.49
509 0.57
510 0.59
511 0.6
512 0.66
513 0.62
514 0.62
515 0.61
516 0.61
517 0.56
518 0.54
519 0.55
520 0.47
521 0.45
522 0.38
523 0.31
524 0.22
525 0.2
526 0.19
527 0.15
528 0.2
529 0.18
530 0.19
531 0.18
532 0.17
533 0.16
534 0.13
535 0.13
536 0.07
537 0.06
538 0.05
539 0.05
540 0.05
541 0.04
542 0.04
543 0.04
544 0.03
545 0.03
546 0.04
547 0.04
548 0.04
549 0.04
550 0.05
551 0.06
552 0.05
553 0.05
554 0.06
555 0.06
556 0.07
557 0.07
558 0.07
559 0.06
560 0.07
561 0.09
562 0.09
563 0.1
564 0.11
565 0.12
566 0.12
567 0.12
568 0.12
569 0.1
570 0.09
571 0.08
572 0.07
573 0.06
574 0.06
575 0.06
576 0.06
577 0.07
578 0.07
579 0.08
580 0.08
581 0.08
582 0.08
583 0.08
584 0.08
585 0.12
586 0.12
587 0.13
588 0.12
589 0.12
590 0.12
591 0.13
592 0.13
593 0.07
594 0.08
595 0.07
596 0.07
597 0.07
598 0.12
599 0.12
600 0.14
601 0.14
602 0.14
603 0.13
604 0.13
605 0.14
606 0.09
607 0.12
608 0.11
609 0.13
610 0.15
611 0.16
612 0.17
613 0.16
614 0.15
615 0.12
616 0.12
617 0.11
618 0.09
619 0.11
620 0.16
621 0.15
622 0.18
623 0.19
624 0.19
625 0.19
626 0.2
627 0.19
628 0.13
629 0.14
630 0.17
631 0.21
632 0.21
633 0.22
634 0.22
635 0.22
636 0.21
637 0.21
638 0.17
639 0.13
640 0.13
641 0.12
642 0.11
643 0.1
644 0.11
645 0.11
646 0.11
647 0.12
648 0.1
649 0.1
650 0.1
651 0.11
652 0.1
653 0.1
654 0.09
655 0.08
656 0.09
657 0.11
658 0.15
659 0.18
660 0.25
661 0.29
662 0.32
663 0.41
664 0.45
665 0.47
666 0.48
667 0.53
668 0.49
669 0.48
670 0.54
671 0.48
672 0.49
673 0.46
674 0.41
675 0.39
676 0.42
677 0.45
678 0.39
679 0.42
680 0.4
681 0.44
682 0.43
683 0.4
684 0.37
685 0.34
686 0.41
687 0.38
688 0.35
689 0.33
690 0.37
691 0.36
692 0.38
693 0.42
694 0.36
695 0.38
696 0.39
697 0.42
698 0.38
699 0.4
700 0.35
701 0.27
702 0.26
703 0.22
704 0.19
705 0.15
706 0.18
707 0.17
708 0.19
709 0.2
710 0.18
711 0.21
712 0.23
713 0.25
714 0.28
715 0.29
716 0.27
717 0.26
718 0.26
719 0.22
720 0.2
721 0.16
722 0.11
723 0.08
724 0.08
725 0.07
726 0.07
727 0.12
728 0.12
729 0.13
730 0.14
731 0.14
732 0.15
733 0.16
734 0.16
735 0.12
736 0.15
737 0.15
738 0.14
739 0.13
740 0.12
741 0.12
742 0.11
743 0.1
744 0.09
745 0.07
746 0.07
747 0.06
748 0.07
749 0.07
750 0.07
751 0.08
752 0.1
753 0.1
754 0.09
755 0.11
756 0.16
757 0.2
758 0.22
759 0.26
760 0.3
761 0.32
762 0.4
763 0.4
764 0.36
765 0.38
766 0.38
767 0.35
768 0.3
769 0.28
770 0.21
771 0.2
772 0.2
773 0.14
774 0.14
775 0.21
776 0.24
777 0.27
778 0.37
779 0.4
780 0.44
781 0.49
782 0.56
783 0.51
784 0.54
785 0.59
786 0.5
787 0.5
788 0.45
789 0.41
790 0.32
791 0.29
792 0.23
793 0.14
794 0.13
795 0.08
796 0.08
797 0.07
798 0.07
799 0.06
800 0.08
801 0.09
802 0.09
803 0.11
804 0.1
805 0.12
806 0.13
807 0.16
808 0.2
809 0.2
810 0.21
811 0.27
812 0.32
813 0.36
814 0.4
815 0.41
816 0.41
817 0.49
818 0.49
819 0.43
820 0.44
821 0.39
822 0.34
823 0.32
824 0.26
825 0.19
826 0.18
827 0.16
828 0.11
829 0.1
830 0.11
831 0.15
832 0.17
833 0.15
834 0.15
835 0.15
836 0.18
837 0.18
838 0.17
839 0.12
840 0.16
841 0.19
842 0.26
843 0.26
844 0.23
845 0.26
846 0.26
847 0.29
848 0.26
849 0.29
850 0.29
851 0.32
852 0.37
853 0.35
854 0.39
855 0.35
856 0.36
857 0.3
858 0.25
859 0.22
860 0.2
861 0.19
862 0.16
863 0.2
864 0.17
865 0.19
866 0.21
867 0.21
868 0.18
869 0.18
870 0.19
871 0.16
872 0.18
873 0.16
874 0.13
875 0.12
876 0.12
877 0.12
878 0.15
879 0.14
880 0.14
881 0.19
882 0.2
883 0.2
884 0.22
885 0.22
886 0.22
887 0.24
888 0.23
889 0.23
890 0.25
891 0.25
892 0.23
893 0.22
894 0.22
895 0.21
896 0.18
897 0.14
898 0.13
899 0.13
900 0.14
901 0.15
902 0.13
903 0.12
904 0.14
905 0.14
906 0.13
907 0.11
908 0.12
909 0.11
910 0.1
911 0.11
912 0.11
913 0.13
914 0.13
915 0.14
916 0.14
917 0.17
918 0.2
919 0.19
920 0.22
921 0.24
922 0.24
923 0.24
924 0.23
925 0.2
926 0.17
927 0.19
928 0.18
929 0.17
930 0.19
931 0.18
932 0.22
933 0.22
934 0.21
935 0.2
936 0.17
937 0.16
938 0.17
939 0.22
940 0.2
941 0.27
942 0.28
943 0.29
944 0.3
945 0.28
946 0.25
947 0.23
948 0.29
949 0.32
950 0.4