FuNGI

C4R8S9

Protein Details

Accession

C4R8S9

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

14.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1-21	MAKERGRRNLKKIKESSQSDS	Hydrophilic
622-645	KRPLEEPKKVEEKKDKSRGRRRYH	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
621-645	KKRPLEEPKKVEEKKDKSRGRRRYH

Subcellular Location(s)

nucl 18.5, cyto_nucl 10.833, mito 6.5, cyto_mito 4.833

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR011989 ARM-like IPR016024 ARM-type_fold IPR040000 NOP9 IPR033133 PUM-HD IPR001313 Pumilio_RNA-bd_rpt
Gene Ontology	GO:0030686 C:90S preribosome GO:0005730 C:nucleolus GO:0030688 C:preribosome, small subunit precursor GO:0032040 C:small-subunit processome GO:0003729 F:mRNA binding GO:0000480 P:endonucleolytic cleavage in 5'-ETS of tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) GO:0000447 P:endonucleolytic cleavage in ITS1 to separate SSU-rRNA from 5.8S rRNA and LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) GO:0000472 P:endonucleolytic cleavage to generate mature 5'-end of SSU-rRNA from (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) GO:0017148 P:negative regulation of translation GO:0065008 P:regulation of biological quality GO:0000056 P:ribosomal small subunit export from nucleus
KEGG	ppa:PAS_chr4_0742 -
Pfam	View protein in Pfam PF00806 PUF
PROSITE	View protein in PROSITE PS50302 PUM PS50303 PUM_HD

Amino Acid Sequences

MAKERGRRNLKKIKESSQSDSLKTLKADPSPSREAAQIDVNTFFGLVNSEELDYFKQAESTLNANAFENSEERQGFVSSVFEEAKGKELKLVTNQICSKLMERLILNGSDRQVKRLFKAFNGHFLSLAVHKYSSHVLETLFIRSASVIENELLNNYQEEEAEEEESDEVFATMENMFLFMLAELSSSIQKLIVHQYGSHVIRLLLLIVGARELPSSIMSNSILRSKKSKIARKMIEIKDNQDSNRAYQVPAGFKNELQELLGLIAKDKDSKQLRELAIDKIASPVIQLCIQLEGLVDKDRTIWTTIFPEVDDKDPKEEAFVEYLLSDPIGSHFFQAAIKYQKPKTVHRLYDLYIKDRLLKLAKRETTGAFVVKELLGKLKATDVTEMLDILIPHLSELIENNLEIGQAIVDASIARNNYGKEGIISQFLKVFNDANVLESVLKLSTSTLGNTKNDWPTAEERRCAIFLEKLVEYDDSFLDAVIAALLELPEDRFIQMCMHGVFSHVVESVLVIERVDIVKRRRLLNIFTEHVVTLSCNAYGSHIMDKLWQFSIKLNLFKDRIALALFENKDKIKDSIYGKLVWKNWSMELYCRRMYDWKNLIKQQELELFPDHRGAPTLLKKRPLEEPKKVEEKKDKSRGRRRYH

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.83
2	0.81
3	0.78
4	0.78
5	0.73
6	0.64
7	0.62
8	0.55
9	0.49
10	0.44
11	0.42
12	0.37
13	0.38
14	0.44
15	0.44
16	0.49
17	0.51
18	0.52
19	0.48
20	0.45
21	0.42
22	0.37
23	0.38
24	0.32
25	0.28
26	0.27
27	0.25
28	0.22
29	0.21
30	0.18
31	0.11
32	0.1
33	0.09
34	0.09
35	0.1
36	0.1
37	0.11
38	0.12
39	0.14
40	0.14
41	0.15
42	0.14
43	0.13
44	0.13
45	0.16
46	0.17
47	0.18
48	0.21
49	0.21
50	0.21
51	0.21
52	0.21
53	0.2
54	0.18
55	0.17
56	0.15
57	0.18
58	0.18
59	0.18
60	0.18
61	0.18
62	0.17
63	0.16
64	0.16
65	0.11
66	0.14
67	0.14
68	0.13
69	0.14
70	0.14
71	0.2
72	0.21
73	0.2
74	0.22
75	0.23
76	0.25
77	0.3
78	0.39
79	0.35
80	0.41
81	0.43
82	0.42
83	0.42
84	0.4
85	0.36
86	0.32
87	0.31
88	0.27
89	0.25
90	0.25
91	0.26
92	0.27
93	0.27
94	0.24
95	0.25
96	0.3
97	0.3
98	0.31
99	0.34
100	0.35
101	0.38
102	0.43
103	0.43
104	0.39
105	0.48
106	0.45
107	0.49
108	0.51
109	0.47
110	0.39
111	0.37
112	0.34
113	0.27
114	0.27
115	0.18
116	0.13
117	0.13
118	0.14
119	0.17
120	0.17
121	0.16
122	0.15
123	0.14
124	0.17
125	0.18
126	0.19
127	0.17
128	0.15
129	0.14
130	0.13
131	0.14
132	0.11
133	0.11
134	0.1
135	0.09
136	0.1
137	0.1
138	0.11
139	0.11
140	0.1
141	0.09
142	0.09
143	0.09
144	0.08
145	0.09
146	0.1
147	0.1
148	0.11
149	0.11
150	0.1
151	0.1
152	0.1
153	0.09
154	0.07
155	0.06
156	0.05
157	0.04
158	0.05
159	0.05
160	0.05
161	0.05
162	0.05
163	0.05
164	0.05
165	0.05
166	0.04
167	0.05
168	0.04
169	0.04
170	0.04
171	0.05
172	0.06
173	0.06
174	0.06
175	0.07
176	0.07
177	0.09
178	0.15
179	0.17
180	0.17
181	0.17
182	0.19
183	0.25
184	0.26
185	0.24
186	0.19
187	0.16
188	0.16
189	0.16
190	0.14
191	0.07
192	0.06
193	0.05
194	0.05
195	0.05
196	0.04
197	0.04
198	0.04
199	0.04
200	0.05
201	0.06
202	0.07
203	0.07
204	0.09
205	0.09
206	0.11
207	0.12
208	0.18
209	0.19
210	0.19
211	0.23
212	0.25
213	0.31
214	0.4
215	0.48
216	0.5
217	0.58
218	0.62
219	0.66
220	0.73
221	0.71
222	0.7
223	0.63
224	0.57
225	0.54
226	0.51
227	0.43
228	0.39
229	0.35
230	0.28
231	0.32
232	0.29
233	0.23
234	0.23
235	0.26
236	0.24
237	0.25
238	0.28
239	0.23
240	0.22
241	0.24
242	0.22
243	0.18
244	0.14
245	0.12
246	0.08
247	0.08
248	0.09
249	0.07
250	0.07
251	0.07
252	0.07
253	0.09
254	0.09
255	0.17
256	0.21
257	0.23
258	0.25
259	0.31
260	0.32
261	0.34
262	0.36
263	0.29
264	0.27
265	0.25
266	0.23
267	0.17
268	0.16
269	0.11
270	0.1
271	0.08
272	0.07
273	0.08
274	0.08
275	0.07
276	0.08
277	0.08
278	0.08
279	0.07
280	0.06
281	0.06
282	0.08
283	0.07
284	0.06
285	0.08
286	0.08
287	0.09
288	0.11
289	0.1
290	0.09
291	0.12
292	0.13
293	0.12
294	0.12
295	0.13
296	0.12
297	0.15
298	0.16
299	0.14
300	0.16
301	0.16
302	0.16
303	0.15
304	0.15
305	0.12
306	0.11
307	0.1
308	0.08
309	0.08
310	0.08
311	0.07
312	0.06
313	0.05
314	0.03
315	0.04
316	0.06
317	0.06
318	0.06
319	0.06
320	0.07
321	0.08
322	0.09
323	0.12
324	0.15
325	0.17
326	0.22
327	0.23
328	0.28
329	0.31
330	0.36
331	0.42
332	0.46
333	0.46
334	0.45
335	0.47
336	0.43
337	0.48
338	0.44
339	0.37
340	0.3
341	0.28
342	0.26
343	0.24
344	0.25
345	0.22
346	0.24
347	0.27
348	0.33
349	0.35
350	0.33
351	0.35
352	0.33
353	0.31
354	0.3
355	0.26
356	0.17
357	0.15
358	0.15
359	0.13
360	0.13
361	0.09
362	0.1
363	0.09
364	0.08
365	0.09
366	0.1
367	0.11
368	0.11
369	0.12
370	0.11
371	0.11
372	0.11
373	0.11
374	0.09
375	0.08
376	0.07
377	0.07
378	0.07
379	0.05
380	0.05
381	0.06
382	0.05
383	0.04
384	0.05
385	0.07
386	0.07
387	0.07
388	0.07
389	0.07
390	0.07
391	0.07
392	0.06
393	0.03
394	0.03
395	0.03
396	0.03
397	0.03
398	0.03
399	0.03
400	0.05
401	0.06
402	0.06
403	0.09
404	0.09
405	0.11
406	0.11
407	0.11
408	0.1
409	0.13
410	0.13
411	0.16
412	0.16
413	0.15
414	0.18
415	0.18
416	0.18
417	0.16
418	0.16
419	0.11
420	0.14
421	0.14
422	0.12
423	0.12
424	0.12
425	0.11
426	0.1
427	0.11
428	0.07
429	0.07
430	0.05
431	0.05
432	0.07
433	0.08
434	0.09
435	0.13
436	0.17
437	0.18
438	0.2
439	0.25
440	0.26
441	0.26
442	0.26
443	0.26
444	0.28
445	0.37
446	0.39
447	0.35
448	0.34
449	0.35
450	0.35
451	0.33
452	0.29
453	0.22
454	0.2
455	0.22
456	0.2
457	0.19
458	0.19
459	0.19
460	0.16
461	0.15
462	0.13
463	0.1
464	0.09
465	0.09
466	0.07
467	0.07
468	0.06
469	0.05
470	0.04
471	0.03
472	0.03
473	0.03
474	0.03
475	0.03
476	0.04
477	0.05
478	0.06
479	0.06
480	0.07
481	0.08
482	0.09
483	0.1
484	0.13
485	0.12
486	0.13
487	0.13
488	0.14
489	0.14
490	0.13
491	0.13
492	0.1
493	0.1
494	0.08
495	0.08
496	0.08
497	0.09
498	0.09
499	0.07
500	0.07
501	0.08
502	0.1
503	0.12
504	0.17
505	0.19
506	0.26
507	0.31
508	0.34
509	0.39
510	0.43
511	0.45
512	0.47
513	0.5
514	0.47
515	0.43
516	0.42
517	0.35
518	0.31
519	0.26
520	0.18
521	0.13
522	0.11
523	0.1
524	0.09
525	0.09
526	0.11
527	0.13
528	0.14
529	0.16
530	0.16
531	0.16
532	0.21
533	0.22
534	0.23
535	0.24
536	0.23
537	0.2
538	0.22
539	0.32
540	0.31
541	0.35
542	0.35
543	0.4
544	0.4
545	0.39
546	0.39
547	0.3
548	0.27
549	0.22
550	0.2
551	0.15
552	0.22
553	0.23
554	0.23
555	0.26
556	0.25
557	0.27
558	0.28
559	0.28
560	0.22
561	0.28
562	0.3
563	0.35
564	0.37
565	0.4
566	0.41
567	0.46
568	0.47
569	0.45
570	0.45
571	0.39
572	0.39
573	0.39
574	0.37
575	0.39
576	0.43
577	0.45
578	0.45
579	0.43
580	0.42
581	0.45
582	0.48
583	0.5
584	0.51
585	0.54
586	0.59
587	0.64
588	0.67
589	0.64
590	0.62
591	0.57
592	0.56
593	0.48
594	0.43
595	0.42
596	0.39
597	0.34
598	0.36
599	0.3
600	0.23
601	0.24
602	0.22
603	0.26
604	0.34
605	0.43
606	0.45
607	0.53
608	0.54
609	0.55
610	0.63
611	0.66
612	0.66
613	0.67
614	0.7
615	0.71
616	0.8
617	0.79
618	0.79
619	0.79
620	0.78
621	0.79
622	0.81
623	0.82
624	0.82
625	0.9

C4R8S9

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer