Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

G1XJJ6

Protein Details
Accession G1XJJ6    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
68-88SSNNVRTSERRRNAPNKFGSDHydrophilic
382-407LKHPLHSRPVPPKKTRKRTVKEMAVDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
390-399PVPPKKTRKR
464-487RIKKEQEKRQQQEEERRKAAKEPR
Subcellular Location(s) mito 19.5, cyto_mito 11, nucl 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR021950  Spt20  
IPR046468  Spt20-like_SEP  
Gene Ontology GO:0000124  C:SAGA complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF12090  Spt20  
Amino Acid Sequences MATAIYPKIKLSTPKAPLGGVLSTASAVNHAIPRPSPTPSKTLPSPTMSSTAITTSSSINGTGSASSSSNNVRTSERRRNAPNKFGSDLAAHGRIKKDRGADLDEDGDSLALNQPPRKKLKAMPRGIPTVITTQYILDKYKDKPPSLTLHMHPTHFRFDQQDGTFNYNSAMRSILEYIAQETIPADAVEVFRDARLLFYEGRLIVHIHDHRTAAKGVDGAPTKPKNDMLFSLNRWNEHLTPSPFAPYPAQKPGDAKEEPVVNGDIKPMDIDSSSKPGENKRVFKTVLHPTPSSLHAEICLLALTPLPPTARGRNASVVQTPATPASAHPLTVSTAPNTKLPTILNDKTSLTFEADYLLSTGPSLVLTPAESPEHAAAIIDALKHPLHSRPVPPKKTRKRTVKEMAVDEAKAAEEERLMLIMDERHQPSTVGAADDGPVGTGGFEPSFKRWKALESIKQKHEEDRIKKEQEKRQQQEEERRKAAKEPRPEPSIRTPVSATPVEQSPLDNKGSLRDMIARNGAIQQAQQQQREHLAQQAAAAQAQAAAQAQAQAAAQAQRQQHDAAAAASAAQAAQAQREAQAQAREQQHAAQVAAQAQAHAAAAQTPTSAPQQTSATQGSPIAAASSPFAHQGSPPMPTRTSTHSSQPGSRQQSPHMSTVQSIQHQHNQPMPGSPAMHASPMMRVTTSQPMHGSPAMAQGSPLARNVGMMQGGHVMNQAQAMAHQMMMAGARNPMVMNKAAHQMALGQNPEQQKIMMQRAFLMRQAQQQQHHQQQLLAAQHAAAQQHQQPQMMDGMGGVAGMHPGMAGRGFMGGMPGGGGMHMNGMMGGMQMGMNGYPQMMVANGMAGGGGMPIGMMNGAALQGYSPAQINMLMARGRGQPPQGQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.51
2 0.52
3 0.49
4 0.46
5 0.42
6 0.36
7 0.27
8 0.22
9 0.16
10 0.14
11 0.15
12 0.13
13 0.1
14 0.1
15 0.11
16 0.15
17 0.16
18 0.18
19 0.19
20 0.26
21 0.27
22 0.32
23 0.37
24 0.36
25 0.42
26 0.43
27 0.49
28 0.49
29 0.54
30 0.55
31 0.53
32 0.53
33 0.48
34 0.48
35 0.42
36 0.37
37 0.3
38 0.26
39 0.21
40 0.19
41 0.17
42 0.14
43 0.15
44 0.15
45 0.14
46 0.12
47 0.12
48 0.12
49 0.11
50 0.11
51 0.11
52 0.11
53 0.11
54 0.14
55 0.18
56 0.21
57 0.23
58 0.24
59 0.27
60 0.36
61 0.45
62 0.53
63 0.56
64 0.6
65 0.68
66 0.76
67 0.8
68 0.81
69 0.81
70 0.76
71 0.71
72 0.64
73 0.56
74 0.47
75 0.41
76 0.36
77 0.34
78 0.29
79 0.3
80 0.35
81 0.37
82 0.38
83 0.4
84 0.39
85 0.38
86 0.42
87 0.44
88 0.41
89 0.39
90 0.39
91 0.35
92 0.3
93 0.24
94 0.19
95 0.13
96 0.11
97 0.11
98 0.11
99 0.15
100 0.19
101 0.26
102 0.34
103 0.4
104 0.44
105 0.46
106 0.52
107 0.6
108 0.65
109 0.67
110 0.68
111 0.68
112 0.69
113 0.64
114 0.57
115 0.48
116 0.43
117 0.36
118 0.28
119 0.22
120 0.18
121 0.22
122 0.23
123 0.22
124 0.2
125 0.23
126 0.26
127 0.34
128 0.4
129 0.38
130 0.39
131 0.42
132 0.47
133 0.49
134 0.52
135 0.46
136 0.49
137 0.5
138 0.49
139 0.48
140 0.43
141 0.43
142 0.38
143 0.38
144 0.32
145 0.31
146 0.37
147 0.35
148 0.38
149 0.35
150 0.39
151 0.37
152 0.33
153 0.31
154 0.25
155 0.24
156 0.18
157 0.17
158 0.11
159 0.13
160 0.15
161 0.14
162 0.13
163 0.13
164 0.14
165 0.14
166 0.13
167 0.11
168 0.09
169 0.09
170 0.09
171 0.08
172 0.07
173 0.07
174 0.07
175 0.08
176 0.09
177 0.09
178 0.08
179 0.09
180 0.09
181 0.08
182 0.1
183 0.12
184 0.11
185 0.12
186 0.15
187 0.15
188 0.15
189 0.15
190 0.14
191 0.12
192 0.19
193 0.21
194 0.21
195 0.22
196 0.23
197 0.23
198 0.25
199 0.26
200 0.19
201 0.17
202 0.16
203 0.15
204 0.2
205 0.2
206 0.19
207 0.27
208 0.29
209 0.29
210 0.3
211 0.33
212 0.29
213 0.3
214 0.32
215 0.28
216 0.31
217 0.33
218 0.41
219 0.38
220 0.36
221 0.36
222 0.36
223 0.32
224 0.3
225 0.34
226 0.28
227 0.28
228 0.28
229 0.3
230 0.26
231 0.27
232 0.27
233 0.25
234 0.27
235 0.32
236 0.33
237 0.31
238 0.34
239 0.35
240 0.38
241 0.34
242 0.3
243 0.27
244 0.27
245 0.26
246 0.25
247 0.24
248 0.17
249 0.17
250 0.17
251 0.13
252 0.1
253 0.1
254 0.08
255 0.08
256 0.07
257 0.09
258 0.1
259 0.15
260 0.15
261 0.17
262 0.19
263 0.23
264 0.32
265 0.38
266 0.43
267 0.42
268 0.48
269 0.48
270 0.47
271 0.5
272 0.5
273 0.49
274 0.47
275 0.43
276 0.38
277 0.39
278 0.4
279 0.36
280 0.27
281 0.2
282 0.16
283 0.16
284 0.15
285 0.12
286 0.1
287 0.06
288 0.05
289 0.06
290 0.05
291 0.05
292 0.07
293 0.07
294 0.09
295 0.12
296 0.16
297 0.21
298 0.23
299 0.25
300 0.28
301 0.3
302 0.31
303 0.3
304 0.27
305 0.22
306 0.2
307 0.19
308 0.14
309 0.13
310 0.1
311 0.08
312 0.13
313 0.12
314 0.12
315 0.11
316 0.12
317 0.12
318 0.15
319 0.15
320 0.11
321 0.14
322 0.15
323 0.17
324 0.18
325 0.17
326 0.17
327 0.16
328 0.19
329 0.24
330 0.25
331 0.24
332 0.25
333 0.25
334 0.24
335 0.25
336 0.21
337 0.15
338 0.13
339 0.11
340 0.11
341 0.11
342 0.1
343 0.09
344 0.08
345 0.06
346 0.06
347 0.06
348 0.04
349 0.04
350 0.04
351 0.04
352 0.04
353 0.04
354 0.05
355 0.06
356 0.07
357 0.07
358 0.08
359 0.08
360 0.08
361 0.07
362 0.06
363 0.05
364 0.05
365 0.06
366 0.05
367 0.05
368 0.06
369 0.06
370 0.07
371 0.08
372 0.1
373 0.14
374 0.17
375 0.24
376 0.33
377 0.43
378 0.51
379 0.59
380 0.68
381 0.74
382 0.82
383 0.85
384 0.85
385 0.82
386 0.84
387 0.85
388 0.82
389 0.76
390 0.68
391 0.62
392 0.52
393 0.45
394 0.35
395 0.25
396 0.17
397 0.11
398 0.09
399 0.06
400 0.04
401 0.04
402 0.04
403 0.04
404 0.04
405 0.04
406 0.04
407 0.05
408 0.07
409 0.11
410 0.12
411 0.12
412 0.13
413 0.13
414 0.12
415 0.14
416 0.13
417 0.09
418 0.08
419 0.07
420 0.08
421 0.08
422 0.07
423 0.05
424 0.04
425 0.03
426 0.03
427 0.03
428 0.04
429 0.04
430 0.05
431 0.06
432 0.08
433 0.14
434 0.14
435 0.16
436 0.16
437 0.18
438 0.24
439 0.31
440 0.37
441 0.42
442 0.49
443 0.51
444 0.56
445 0.54
446 0.51
447 0.52
448 0.52
449 0.48
450 0.5
451 0.54
452 0.54
453 0.6
454 0.65
455 0.64
456 0.66
457 0.7
458 0.66
459 0.67
460 0.69
461 0.69
462 0.72
463 0.74
464 0.7
465 0.64
466 0.61
467 0.54
468 0.53
469 0.56
470 0.52
471 0.52
472 0.49
473 0.5
474 0.54
475 0.54
476 0.52
477 0.5
478 0.51
479 0.42
480 0.39
481 0.35
482 0.31
483 0.34
484 0.3
485 0.23
486 0.16
487 0.16
488 0.15
489 0.14
490 0.14
491 0.11
492 0.14
493 0.14
494 0.13
495 0.13
496 0.14
497 0.16
498 0.16
499 0.14
500 0.17
501 0.18
502 0.19
503 0.2
504 0.18
505 0.16
506 0.17
507 0.17
508 0.11
509 0.11
510 0.14
511 0.21
512 0.25
513 0.28
514 0.27
515 0.28
516 0.32
517 0.33
518 0.28
519 0.24
520 0.21
521 0.18
522 0.17
523 0.18
524 0.15
525 0.13
526 0.12
527 0.07
528 0.07
529 0.07
530 0.06
531 0.04
532 0.04
533 0.04
534 0.05
535 0.05
536 0.06
537 0.05
538 0.05
539 0.06
540 0.08
541 0.08
542 0.12
543 0.14
544 0.15
545 0.16
546 0.16
547 0.16
548 0.15
549 0.15
550 0.1
551 0.09
552 0.08
553 0.06
554 0.06
555 0.05
556 0.04
557 0.04
558 0.05
559 0.04
560 0.05
561 0.06
562 0.06
563 0.07
564 0.09
565 0.1
566 0.12
567 0.16
568 0.16
569 0.22
570 0.25
571 0.26
572 0.25
573 0.25
574 0.25
575 0.23
576 0.22
577 0.16
578 0.15
579 0.14
580 0.16
581 0.14
582 0.11
583 0.09
584 0.09
585 0.08
586 0.07
587 0.05
588 0.05
589 0.05
590 0.06
591 0.06
592 0.06
593 0.07
594 0.1
595 0.11
596 0.1
597 0.12
598 0.15
599 0.16
600 0.2
601 0.2
602 0.18
603 0.17
604 0.18
605 0.15
606 0.13
607 0.12
608 0.09
609 0.07
610 0.07
611 0.07
612 0.08
613 0.08
614 0.09
615 0.1
616 0.09
617 0.09
618 0.14
619 0.14
620 0.17
621 0.2
622 0.22
623 0.22
624 0.24
625 0.27
626 0.29
627 0.32
628 0.3
629 0.34
630 0.39
631 0.41
632 0.44
633 0.48
634 0.5
635 0.53
636 0.56
637 0.51
638 0.49
639 0.55
640 0.54
641 0.5
642 0.44
643 0.37
644 0.32
645 0.35
646 0.34
647 0.29
648 0.3
649 0.3
650 0.36
651 0.39
652 0.41
653 0.41
654 0.39
655 0.35
656 0.34
657 0.33
658 0.27
659 0.24
660 0.22
661 0.21
662 0.19
663 0.19
664 0.17
665 0.15
666 0.15
667 0.16
668 0.16
669 0.12
670 0.13
671 0.16
672 0.24
673 0.24
674 0.23
675 0.23
676 0.24
677 0.27
678 0.27
679 0.24
680 0.16
681 0.22
682 0.21
683 0.19
684 0.18
685 0.17
686 0.18
687 0.19
688 0.19
689 0.13
690 0.12
691 0.12
692 0.13
693 0.13
694 0.12
695 0.1
696 0.1
697 0.14
698 0.14
699 0.13
700 0.14
701 0.12
702 0.11
703 0.11
704 0.11
705 0.06
706 0.06
707 0.09
708 0.09
709 0.09
710 0.08
711 0.08
712 0.08
713 0.09
714 0.1
715 0.07
716 0.07
717 0.08
718 0.08
719 0.08
720 0.09
721 0.11
722 0.13
723 0.14
724 0.16
725 0.21
726 0.21
727 0.21
728 0.2
729 0.21
730 0.23
731 0.26
732 0.25
733 0.2
734 0.25
735 0.27
736 0.29
737 0.25
738 0.21
739 0.2
740 0.25
741 0.33
742 0.31
743 0.28
744 0.31
745 0.36
746 0.38
747 0.36
748 0.34
749 0.29
750 0.35
751 0.43
752 0.45
753 0.45
754 0.53
755 0.59
756 0.64
757 0.66
758 0.59
759 0.52
760 0.49
761 0.49
762 0.43
763 0.35
764 0.26
765 0.2
766 0.22
767 0.23
768 0.21
769 0.16
770 0.17
771 0.21
772 0.28
773 0.31
774 0.3
775 0.28
776 0.29
777 0.31
778 0.27
779 0.22
780 0.14
781 0.12
782 0.09
783 0.08
784 0.07
785 0.04
786 0.04
787 0.04
788 0.04
789 0.03
790 0.03
791 0.04
792 0.05
793 0.04
794 0.05
795 0.05
796 0.06
797 0.06
798 0.07
799 0.06
800 0.06
801 0.06
802 0.06
803 0.05
804 0.05
805 0.05
806 0.04
807 0.05
808 0.05
809 0.05
810 0.05
811 0.05
812 0.05
813 0.05
814 0.05
815 0.04
816 0.04
817 0.04
818 0.05
819 0.05
820 0.05
821 0.05
822 0.06
823 0.05
824 0.05
825 0.06
826 0.06
827 0.07
828 0.06
829 0.07
830 0.06
831 0.06
832 0.06
833 0.05
834 0.05
835 0.04
836 0.03
837 0.02
838 0.02
839 0.03
840 0.03
841 0.03
842 0.03
843 0.03
844 0.03
845 0.04
846 0.04
847 0.04
848 0.04
849 0.05
850 0.06
851 0.08
852 0.08
853 0.09
854 0.09
855 0.1
856 0.11
857 0.11
858 0.14
859 0.14
860 0.13
861 0.17
862 0.22
863 0.25
864 0.28