FuNGI

G1XUW6

Protein Details

Accession

G1XUW6

Localization Confidence

High

Confidence Score

18.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
262-293	TTSSGGGKKRERDRKRRREKEKEREKEREKEK	Basic
429-459	AATTKPEGSKRPRNRNRDRDRDRDRRKDEAT	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
239-248	PKIKEKGKGK
266-311	GGGKKRERDRKRRREKEKEREKEREKEKVSQQAAGSSGEKGKKVDK
434-455	PEGSKRPRNRNRDRDRDRDRRK
511-524	RGRGSRRGGRGGGP
588-615	PPRGRGGRGFGPFGPFGPRGGRGRGNAR

Subcellular Location(s)

mito 15, nucl 12

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR039722 Upf3 IPR005120 UPF3_dom
Gene Ontology	GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0000184 P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay
Pfam	View protein in Pfam PF03467 Smg4_UPF3
CDD	cd12455 RRM_like_Smg4_UPF3

Amino Acid Sequences

MATPGLIKIRTRGKGSAITVLQQTSTSASQPSVAPAAAPAPAPPPPAPKLKIVIRHLPASMTEQEYNVLTADVINKDTVEWSSFIPGKVPQDRNKPTTFSIAHARARSTETLIQIKAGLNGKPLTDSRGQEYAVQVEFAPFQKFPQQKGRLRHDARSGTIDNDPDFIFFLENLKHTGPNASSSAKTEGDGDKSKEKETKVYKDPLAAPVPSYEAPIMEPGSKVTTTPLVEFIKQQKLAPKIKEKGKGKAAVLAAEEDDAKSTTSSGGGKKRERDRKRRREKEKEREKEREKEKVSQQAAGSSGEKGKKVDKKSSNSTPASAAASAPATTSGKSSTEPPARPARRERGNAGLSAAAILQRDLGLTTSGRGRRNRGAESTSEKPATASSATTTVTSPSSNATASTNSQSTPSAPAPAPASSSEVKPTPEPAATTKPEGSKRPRNRNRDRDRDRDRRKDEATAASSTPTAPTSTPSQASRTEAVAGNTDQNTTSNPATVTPAPTQPVAQPQAHRGRGSRRGGRGGGPNRGPAQQATSTQATPPPPTAQASEPAASSTTPAPTPQSSTASIPTGPKSMQQAPANNNNHHHGPPRGRGGRGFGPFGPFGPRGGRGRGNARGGGNQGGGGGSNNGGGSNANSGTNNAA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.49
2	0.51
3	0.53
4	0.45
5	0.43
6	0.41
7	0.38
8	0.33
9	0.26
10	0.24
11	0.19
12	0.18
13	0.17
14	0.15
15	0.15
16	0.17
17	0.17
18	0.19
19	0.17
20	0.16
21	0.14
22	0.14
23	0.14
24	0.14
25	0.13
26	0.11
27	0.12
28	0.14
29	0.19
30	0.2
31	0.25
32	0.28
33	0.36
34	0.38
35	0.4
36	0.45
37	0.48
38	0.55
39	0.55
40	0.61
41	0.56
42	0.57
43	0.53
44	0.47
45	0.42
46	0.37
47	0.35
48	0.3
49	0.27
50	0.24
51	0.25
52	0.24
53	0.23
54	0.18
55	0.14
56	0.09
57	0.09
58	0.12
59	0.12
60	0.13
61	0.13
62	0.12
63	0.13
64	0.14
65	0.14
66	0.12
67	0.12
68	0.12
69	0.18
70	0.2
71	0.2
72	0.21
73	0.23
74	0.29
75	0.37
76	0.44
77	0.45
78	0.54
79	0.61
80	0.65
81	0.65
82	0.62
83	0.55
84	0.56
85	0.5
86	0.42
87	0.44
88	0.45
89	0.47
90	0.45
91	0.44
92	0.37
93	0.4
94	0.38
95	0.33
96	0.3
97	0.3
98	0.32
99	0.31
100	0.3
101	0.28
102	0.27
103	0.27
104	0.26
105	0.22
106	0.21
107	0.22
108	0.21
109	0.23
110	0.22
111	0.22
112	0.25
113	0.26
114	0.27
115	0.29
116	0.3
117	0.29
118	0.3
119	0.28
120	0.23
121	0.22
122	0.17
123	0.15
124	0.16
125	0.15
126	0.16
127	0.13
128	0.14
129	0.22
130	0.26
131	0.3
132	0.39
133	0.47
134	0.51
135	0.61
136	0.68
137	0.71
138	0.72
139	0.73
140	0.71
141	0.66
142	0.61
143	0.58
144	0.5
145	0.42
146	0.4
147	0.36
148	0.27
149	0.24
150	0.22
151	0.16
152	0.15
153	0.13
154	0.1
155	0.09
156	0.1
157	0.1
158	0.11
159	0.13
160	0.14
161	0.14
162	0.14
163	0.17
164	0.16
165	0.17
166	0.19
167	0.19
168	0.19
169	0.21
170	0.25
171	0.21
172	0.21
173	0.21
174	0.2
175	0.23
176	0.27
177	0.27
178	0.3
179	0.31
180	0.34
181	0.35
182	0.34
183	0.37
184	0.41
185	0.46
186	0.46
187	0.51
188	0.5
189	0.5
190	0.51
191	0.48
192	0.43
193	0.35
194	0.29
195	0.23
196	0.25
197	0.2
198	0.19
199	0.13
200	0.1
201	0.11
202	0.12
203	0.12
204	0.1
205	0.1
206	0.09
207	0.12
208	0.11
209	0.11
210	0.11
211	0.13
212	0.13
213	0.14
214	0.19
215	0.18
216	0.19
217	0.22
218	0.27
219	0.3
220	0.3
221	0.3
222	0.31
223	0.38
224	0.44
225	0.46
226	0.5
227	0.5
228	0.57
229	0.64
230	0.62
231	0.62
232	0.63
233	0.62
234	0.53
235	0.51
236	0.45
237	0.37
238	0.34
239	0.27
240	0.19
241	0.14
242	0.14
243	0.08
244	0.08
245	0.06
246	0.06
247	0.05
248	0.06
249	0.05
250	0.07
251	0.1
252	0.14
253	0.2
254	0.27
255	0.31
256	0.38
257	0.48
258	0.57
259	0.64
260	0.71
261	0.76
262	0.81
263	0.88
264	0.91
265	0.92
266	0.93
267	0.95
268	0.94
269	0.94
270	0.93
271	0.9
272	0.9
273	0.85
274	0.83
275	0.78
276	0.76
277	0.68
278	0.66
279	0.62
280	0.61
281	0.56
282	0.51
283	0.45
284	0.37
285	0.35
286	0.29
287	0.24
288	0.15
289	0.18
290	0.16
291	0.16
292	0.15
293	0.21
294	0.26
295	0.29
296	0.38
297	0.42
298	0.47
299	0.54
300	0.6
301	0.62
302	0.56
303	0.53
304	0.45
305	0.38
306	0.33
307	0.26
308	0.18
309	0.1
310	0.09
311	0.08
312	0.07
313	0.07
314	0.06
315	0.06
316	0.07
317	0.07
318	0.08
319	0.08
320	0.11
321	0.17
322	0.23
323	0.24
324	0.27
325	0.37
326	0.38
327	0.42
328	0.47
329	0.47
330	0.49
331	0.51
332	0.5
333	0.48
334	0.47
335	0.43
336	0.37
337	0.29
338	0.21
339	0.18
340	0.15
341	0.07
342	0.06
343	0.05
344	0.05
345	0.04
346	0.04
347	0.04
348	0.05
349	0.05
350	0.05
351	0.06
352	0.11
353	0.16
354	0.21
355	0.24
356	0.28
357	0.33
358	0.38
359	0.4
360	0.39
361	0.36
362	0.35
363	0.39
364	0.38
365	0.35
366	0.31
367	0.28
368	0.24
369	0.22
370	0.2
371	0.15
372	0.11
373	0.09
374	0.1
375	0.1
376	0.11
377	0.11
378	0.1
379	0.1
380	0.1
381	0.09
382	0.09
383	0.1
384	0.09
385	0.1
386	0.1
387	0.11
388	0.12
389	0.15
390	0.14
391	0.13
392	0.14
393	0.14
394	0.14
395	0.16
396	0.15
397	0.16
398	0.15
399	0.17
400	0.18
401	0.18
402	0.18
403	0.14
404	0.18
405	0.15
406	0.16
407	0.17
408	0.17
409	0.18
410	0.17
411	0.19
412	0.17
413	0.17
414	0.18
415	0.19
416	0.24
417	0.25
418	0.28
419	0.29
420	0.32
421	0.36
422	0.41
423	0.46
424	0.5
425	0.59
426	0.67
427	0.74
428	0.79
429	0.85
430	0.89
431	0.91
432	0.91
433	0.89
434	0.88
435	0.89
436	0.89
437	0.89
438	0.88
439	0.83
440	0.8
441	0.75
442	0.71
443	0.65
444	0.61
445	0.55
446	0.47
447	0.41
448	0.34
449	0.31
450	0.25
451	0.21
452	0.14
453	0.12
454	0.09
455	0.11
456	0.15
457	0.18
458	0.21
459	0.22
460	0.24
461	0.26
462	0.29
463	0.28
464	0.25
465	0.24
466	0.23
467	0.22
468	0.22
469	0.2
470	0.21
471	0.19
472	0.19
473	0.16
474	0.15
475	0.15
476	0.16
477	0.16
478	0.14
479	0.13
480	0.14
481	0.18
482	0.19
483	0.21
484	0.2
485	0.22
486	0.22
487	0.23
488	0.23
489	0.21
490	0.27
491	0.28
492	0.29
493	0.28
494	0.35
495	0.44
496	0.47
497	0.47
498	0.43
499	0.47
500	0.53
501	0.6
502	0.59
503	0.55
504	0.58
505	0.58
506	0.59
507	0.6
508	0.57
509	0.57
510	0.51
511	0.5
512	0.46
513	0.46
514	0.43
515	0.34
516	0.32
517	0.27
518	0.27
519	0.28
520	0.29
521	0.27
522	0.27
523	0.3
524	0.28
525	0.26
526	0.27
527	0.25
528	0.25
529	0.26
530	0.28
531	0.26
532	0.28
533	0.3
534	0.27
535	0.24
536	0.23
537	0.22
538	0.18
539	0.18
540	0.15
541	0.14
542	0.13
543	0.14
544	0.18
545	0.18
546	0.24
547	0.26
548	0.28
549	0.28
550	0.3
551	0.31
552	0.3
553	0.31
554	0.29
555	0.27
556	0.27
557	0.25
558	0.25
559	0.29
560	0.32
561	0.38
562	0.41
563	0.46
564	0.49
565	0.59
566	0.63
567	0.6
568	0.58
569	0.55
570	0.53
571	0.49
572	0.48
573	0.46
574	0.47
575	0.51
576	0.57
577	0.58
578	0.56
579	0.56
580	0.57
581	0.57
582	0.53
583	0.49
584	0.4
585	0.4
586	0.38
587	0.36
588	0.36
589	0.28
590	0.26
591	0.26
592	0.3
593	0.29
594	0.35
595	0.4
596	0.39
597	0.47
598	0.52
599	0.53
600	0.52
601	0.51
602	0.49
603	0.46
604	0.44
605	0.36
606	0.28
607	0.24
608	0.19
609	0.17
610	0.13
611	0.12
612	0.08
613	0.09
614	0.09
615	0.09
616	0.09
617	0.09
618	0.09
619	0.12
620	0.13
621	0.14
622	0.14

G1XUW6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer