Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

E3JXP1

Protein Details
Accession E3JXP1    Localization Confidence High Confidence Score 15.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-20MGKLKSDSKKNQRHDPLLVQHydrophilic
26-52LGSGKLSAPGRRQKRNKPEEERNLALDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
37-40RQKR
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 14, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007955  Bystin  
Gene Ontology GO:0030686  C:90S preribosome  
GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0030688  C:preribosome, small subunit precursor  
GO:0032040  C:small-subunit processome  
GO:0030515  F:snoRNA binding  
GO:0000447  P:endonucleolytic cleavage in ITS1 to separate SSU-rRNA from 5.8S rRNA and LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0016973  P:poly(A)+ mRNA export from nucleus  
GO:0006364  P:rRNA processing  
KEGG pgr:PGTG_02277  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF05291  Bystin  
Amino Acid Sequences MGKLKSDSKKNQRHDPLLVQLRDDQLGSGKLSAPGRRQKRNKPEEERNLALDDKTSKKILSIAKEQQQEMLSSEQHAEGFLSDDDDDDNDDSEKPAFRQREVDMGSDSDDQFEGFNEDQDGDESDGFDEEIEVDEGDQAILDSFRTTPSRNLADLILQKLEEQEDKQKLLDAKGKARQISPTADHPASLNPKITEVYTKVGQLLSRYKSGPLPKAFKILPSLRNWLQILEITSPHSWTPHATLAATRIFASNLEPRQCQKFYKYILYEKVREEIAEEKKLSVQMYMALKKSIYKPAAFFKGILFPLCESGTCTLKEAVIIGSILTKVSIPVLHSGAALLKLSGMEYTGPTSVFIRVLLDKKYALPYKVIDGLVFHFLSFKRESRQMPVLWHQSFLVFVQRYKSDLTREQKDALLDLLKIKNHPLITQEIRREIVNSVARGEEIPFEDVEMI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.81
2 0.77
3 0.77
4 0.76
5 0.69
6 0.6
7 0.54
8 0.49
9 0.43
10 0.36
11 0.27
12 0.2
13 0.22
14 0.2
15 0.18
16 0.17
17 0.21
18 0.26
19 0.3
20 0.35
21 0.43
22 0.51
23 0.6
24 0.69
25 0.75
26 0.81
27 0.87
28 0.89
29 0.9
30 0.91
31 0.91
32 0.9
33 0.83
34 0.74
35 0.67
36 0.57
37 0.47
38 0.4
39 0.35
40 0.31
41 0.31
42 0.3
43 0.26
44 0.26
45 0.32
46 0.35
47 0.36
48 0.4
49 0.45
50 0.51
51 0.56
52 0.55
53 0.53
54 0.48
55 0.42
56 0.35
57 0.3
58 0.23
59 0.19
60 0.2
61 0.17
62 0.16
63 0.15
64 0.12
65 0.09
66 0.11
67 0.09
68 0.1
69 0.09
70 0.09
71 0.09
72 0.09
73 0.11
74 0.09
75 0.1
76 0.09
77 0.1
78 0.1
79 0.12
80 0.13
81 0.13
82 0.2
83 0.22
84 0.23
85 0.28
86 0.28
87 0.35
88 0.36
89 0.36
90 0.3
91 0.28
92 0.29
93 0.27
94 0.25
95 0.18
96 0.15
97 0.13
98 0.12
99 0.12
100 0.13
101 0.1
102 0.11
103 0.1
104 0.11
105 0.11
106 0.11
107 0.12
108 0.1
109 0.1
110 0.09
111 0.09
112 0.09
113 0.08
114 0.07
115 0.06
116 0.05
117 0.06
118 0.06
119 0.05
120 0.05
121 0.05
122 0.05
123 0.05
124 0.05
125 0.04
126 0.04
127 0.04
128 0.04
129 0.04
130 0.05
131 0.07
132 0.1
133 0.11
134 0.14
135 0.2
136 0.23
137 0.22
138 0.23
139 0.22
140 0.24
141 0.26
142 0.25
143 0.2
144 0.17
145 0.16
146 0.16
147 0.17
148 0.13
149 0.12
150 0.18
151 0.2
152 0.21
153 0.21
154 0.24
155 0.24
156 0.27
157 0.31
158 0.27
159 0.31
160 0.36
161 0.4
162 0.38
163 0.37
164 0.36
165 0.33
166 0.34
167 0.3
168 0.29
169 0.31
170 0.29
171 0.28
172 0.25
173 0.27
174 0.27
175 0.26
176 0.23
177 0.18
178 0.19
179 0.19
180 0.19
181 0.17
182 0.14
183 0.16
184 0.15
185 0.15
186 0.15
187 0.15
188 0.15
189 0.15
190 0.19
191 0.18
192 0.2
193 0.2
194 0.2
195 0.24
196 0.28
197 0.32
198 0.32
199 0.34
200 0.33
201 0.37
202 0.36
203 0.33
204 0.35
205 0.33
206 0.32
207 0.3
208 0.35
209 0.32
210 0.35
211 0.34
212 0.28
213 0.23
214 0.19
215 0.18
216 0.13
217 0.13
218 0.12
219 0.12
220 0.12
221 0.12
222 0.11
223 0.1
224 0.09
225 0.12
226 0.12
227 0.12
228 0.12
229 0.12
230 0.14
231 0.15
232 0.14
233 0.12
234 0.1
235 0.09
236 0.09
237 0.12
238 0.14
239 0.17
240 0.19
241 0.2
242 0.22
243 0.27
244 0.29
245 0.29
246 0.27
247 0.3
248 0.31
249 0.37
250 0.39
251 0.39
252 0.45
253 0.48
254 0.48
255 0.43
256 0.41
257 0.33
258 0.29
259 0.26
260 0.25
261 0.25
262 0.26
263 0.25
264 0.24
265 0.25
266 0.27
267 0.25
268 0.18
269 0.13
270 0.14
271 0.19
272 0.21
273 0.21
274 0.2
275 0.2
276 0.22
277 0.25
278 0.28
279 0.25
280 0.24
281 0.26
282 0.32
283 0.37
284 0.35
285 0.32
286 0.26
287 0.29
288 0.28
289 0.26
290 0.21
291 0.16
292 0.17
293 0.17
294 0.15
295 0.11
296 0.13
297 0.15
298 0.14
299 0.16
300 0.14
301 0.14
302 0.14
303 0.13
304 0.11
305 0.09
306 0.08
307 0.06
308 0.07
309 0.07
310 0.06
311 0.06
312 0.05
313 0.05
314 0.06
315 0.07
316 0.07
317 0.1
318 0.11
319 0.12
320 0.11
321 0.12
322 0.12
323 0.12
324 0.11
325 0.08
326 0.07
327 0.06
328 0.07
329 0.06
330 0.06
331 0.05
332 0.06
333 0.08
334 0.09
335 0.09
336 0.09
337 0.11
338 0.11
339 0.11
340 0.11
341 0.11
342 0.15
343 0.18
344 0.19
345 0.2
346 0.2
347 0.22
348 0.3
349 0.31
350 0.29
351 0.28
352 0.28
353 0.3
354 0.34
355 0.32
356 0.24
357 0.21
358 0.22
359 0.24
360 0.22
361 0.18
362 0.16
363 0.16
364 0.2
365 0.22
366 0.23
367 0.24
368 0.31
369 0.34
370 0.38
371 0.45
372 0.44
373 0.46
374 0.52
375 0.56
376 0.5
377 0.48
378 0.41
379 0.35
380 0.33
381 0.27
382 0.27
383 0.19
384 0.2
385 0.24
386 0.25
387 0.26
388 0.29
389 0.32
390 0.3
391 0.38
392 0.45
393 0.47
394 0.5
395 0.51
396 0.5
397 0.47
398 0.41
399 0.35
400 0.29
401 0.23
402 0.25
403 0.27
404 0.26
405 0.26
406 0.28
407 0.3
408 0.29
409 0.3
410 0.27
411 0.31
412 0.37
413 0.45
414 0.48
415 0.47
416 0.47
417 0.46
418 0.45
419 0.37
420 0.38
421 0.36
422 0.31
423 0.28
424 0.27
425 0.27
426 0.26
427 0.26
428 0.21
429 0.18
430 0.18
431 0.16