Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

E3JTD4

Protein Details
Accession E3JTD4    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
33-56RLPIRPDERHHHHHHHNHHHPTGSBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
824-838LKKIARAKKAASLAK
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 14.5, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000467  G_patch_dom  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
KEGG pgr:PGTG_01801  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01585  G-patch  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50174  G_PATCH  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MIMYHRHSNENIRQSRPFDYDRSSTNSTTYQDRLPIRPDERHHHHHHHNHHHPTGSTAAAAPPPPSSTATAASHPHHNQAHPHPQFEQRRYPSSTYHHHHQTSSTRIHQNIPGTADHRFPSPSTDRLSRSQPNSAPRRIDYPERTIQARQMTTAQNNHSNGSFEDSRRTYEHNRSSTTTNNNNPSSNKAYDDHPSSNNHNNHTSTTTPINSSNTHHIHRRSDEFPASRSARYNPYPPSGPRADSHLPPSIGRISNGVTGHAAYHSSSSGPPAYDERMPASRSHEHIPQRTYDPNSQFNHGPPKDKSPPSQSVIFMGLPIHTDEANLRAFLEESGASVDSVTIIYDRITGQSKRYGFARFLSVEHARAFVEPAFPMVVWKEPSGSRFDRSGDGLKVKIDYSQKEKVPFEVRQRERELAPRSTPATPFISEIPNQSTYSYKSSSESSLTTVINDGARDIGGTPTSILLLRGLDPLSTEQEIAQHLQHIPDPSQTVLPESIRKVMLIKDRATRSSWGYAFVQFAEVQVAVKALSLLLNTSLFPRGFQIRSRTITVTFAHEHSFHPIYTPSDWSFRGASGQELAYWDDKAYAALYISPIAEPDRSPSTSSKTKAPTESKQAEEASNGRHEETDVDEVLTSIDPESERNSTKKEISIDQENSFKHQAKSDTLNNREANTGDRLTMESQTSEDPKNENLKAELKTQADLINPGEGGSQQIENMNSKPKGAEIKTEKKKNGVEPIATKKMVANIQKWQSKHQEIASAGTSEEEKSHLTIAPEHLVVDEDDFSDFNRLTCVLCQRQFKSPEDLQRHNNLSNLHKTNLQNEKLKKIARAKKAASLAKKLNNPGAAVPAPNAATTSATAEGSGAKYTDRAAARREAYGQPDAPNADKHEAKKARYEPAPAPAVPAAQPDKDGIQATNVGSKMLEKMGWQKGEGLGNGNGRVDPVQAAQYSKGVGLGASSSVPVGQYEDSKKGFLDQVKDKTVDRFNQDQS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.6
2 0.63
3 0.6
4 0.55
5 0.5
6 0.5
7 0.48
8 0.47
9 0.5
10 0.49
11 0.44
12 0.43
13 0.42
14 0.38
15 0.39
16 0.38
17 0.34
18 0.36
19 0.4
20 0.41
21 0.42
22 0.49
23 0.49
24 0.54
25 0.57
26 0.6
27 0.64
28 0.68
29 0.72
30 0.73
31 0.77
32 0.79
33 0.83
34 0.84
35 0.85
36 0.85
37 0.81
38 0.76
39 0.66
40 0.6
41 0.52
42 0.42
43 0.32
44 0.24
45 0.21
46 0.19
47 0.2
48 0.18
49 0.16
50 0.17
51 0.19
52 0.2
53 0.21
54 0.21
55 0.25
56 0.26
57 0.29
58 0.32
59 0.33
60 0.39
61 0.38
62 0.43
63 0.42
64 0.42
65 0.46
66 0.5
67 0.59
68 0.53
69 0.55
70 0.51
71 0.57
72 0.63
73 0.62
74 0.64
75 0.59
76 0.63
77 0.65
78 0.64
79 0.61
80 0.59
81 0.62
82 0.59
83 0.61
84 0.63
85 0.6
86 0.58
87 0.58
88 0.59
89 0.57
90 0.57
91 0.56
92 0.53
93 0.53
94 0.55
95 0.54
96 0.51
97 0.47
98 0.43
99 0.38
100 0.33
101 0.33
102 0.32
103 0.28
104 0.26
105 0.24
106 0.21
107 0.26
108 0.28
109 0.31
110 0.34
111 0.39
112 0.41
113 0.44
114 0.51
115 0.52
116 0.52
117 0.56
118 0.55
119 0.59
120 0.63
121 0.65
122 0.62
123 0.56
124 0.58
125 0.54
126 0.58
127 0.54
128 0.54
129 0.55
130 0.53
131 0.54
132 0.49
133 0.5
134 0.48
135 0.43
136 0.37
137 0.35
138 0.37
139 0.4
140 0.44
141 0.44
142 0.43
143 0.44
144 0.43
145 0.39
146 0.35
147 0.3
148 0.31
149 0.3
150 0.23
151 0.3
152 0.3
153 0.32
154 0.33
155 0.38
156 0.39
157 0.45
158 0.53
159 0.5
160 0.53
161 0.53
162 0.54
163 0.55
164 0.57
165 0.55
166 0.54
167 0.56
168 0.55
169 0.55
170 0.53
171 0.53
172 0.5
173 0.43
174 0.39
175 0.33
176 0.33
177 0.35
178 0.4
179 0.38
180 0.35
181 0.38
182 0.4
183 0.48
184 0.49
185 0.47
186 0.46
187 0.43
188 0.42
189 0.41
190 0.37
191 0.31
192 0.31
193 0.29
194 0.26
195 0.27
196 0.28
197 0.26
198 0.29
199 0.34
200 0.34
201 0.36
202 0.41
203 0.43
204 0.46
205 0.5
206 0.51
207 0.45
208 0.47
209 0.5
210 0.46
211 0.43
212 0.44
213 0.42
214 0.38
215 0.38
216 0.36
217 0.36
218 0.37
219 0.41
220 0.38
221 0.4
222 0.43
223 0.42
224 0.45
225 0.41
226 0.4
227 0.35
228 0.38
229 0.37
230 0.34
231 0.37
232 0.36
233 0.34
234 0.32
235 0.34
236 0.32
237 0.29
238 0.27
239 0.24
240 0.2
241 0.24
242 0.24
243 0.21
244 0.16
245 0.15
246 0.15
247 0.13
248 0.12
249 0.08
250 0.09
251 0.08
252 0.09
253 0.09
254 0.11
255 0.12
256 0.11
257 0.12
258 0.14
259 0.17
260 0.17
261 0.18
262 0.2
263 0.22
264 0.23
265 0.23
266 0.27
267 0.28
268 0.3
269 0.32
270 0.36
271 0.39
272 0.44
273 0.44
274 0.41
275 0.41
276 0.43
277 0.45
278 0.45
279 0.43
280 0.45
281 0.45
282 0.45
283 0.43
284 0.41
285 0.47
286 0.41
287 0.42
288 0.37
289 0.43
290 0.49
291 0.51
292 0.52
293 0.5
294 0.54
295 0.52
296 0.54
297 0.45
298 0.39
299 0.37
300 0.32
301 0.24
302 0.18
303 0.14
304 0.11
305 0.11
306 0.1
307 0.07
308 0.07
309 0.07
310 0.1
311 0.1
312 0.09
313 0.09
314 0.08
315 0.09
316 0.08
317 0.09
318 0.06
319 0.06
320 0.08
321 0.08
322 0.07
323 0.07
324 0.07
325 0.05
326 0.05
327 0.05
328 0.04
329 0.04
330 0.04
331 0.05
332 0.06
333 0.08
334 0.12
335 0.13
336 0.15
337 0.22
338 0.23
339 0.23
340 0.25
341 0.26
342 0.23
343 0.24
344 0.26
345 0.21
346 0.21
347 0.24
348 0.23
349 0.23
350 0.22
351 0.21
352 0.16
353 0.15
354 0.16
355 0.11
356 0.11
357 0.09
358 0.09
359 0.09
360 0.08
361 0.09
362 0.08
363 0.1
364 0.1
365 0.1
366 0.12
367 0.12
368 0.14
369 0.19
370 0.21
371 0.2
372 0.21
373 0.22
374 0.22
375 0.24
376 0.26
377 0.23
378 0.23
379 0.21
380 0.2
381 0.19
382 0.18
383 0.2
384 0.19
385 0.2
386 0.24
387 0.3
388 0.32
389 0.36
390 0.36
391 0.36
392 0.38
393 0.4
394 0.44
395 0.48
396 0.49
397 0.5
398 0.53
399 0.51
400 0.47
401 0.5
402 0.46
403 0.39
404 0.38
405 0.34
406 0.33
407 0.33
408 0.32
409 0.27
410 0.24
411 0.2
412 0.2
413 0.19
414 0.18
415 0.17
416 0.18
417 0.19
418 0.18
419 0.18
420 0.17
421 0.17
422 0.17
423 0.2
424 0.2
425 0.17
426 0.16
427 0.18
428 0.19
429 0.19
430 0.17
431 0.15
432 0.16
433 0.15
434 0.14
435 0.13
436 0.12
437 0.11
438 0.1
439 0.08
440 0.06
441 0.06
442 0.06
443 0.05
444 0.05
445 0.05
446 0.05
447 0.05
448 0.05
449 0.05
450 0.05
451 0.05
452 0.05
453 0.05
454 0.06
455 0.07
456 0.07
457 0.06
458 0.07
459 0.08
460 0.09
461 0.09
462 0.08
463 0.07
464 0.09
465 0.1
466 0.1
467 0.09
468 0.09
469 0.09
470 0.09
471 0.11
472 0.11
473 0.11
474 0.11
475 0.12
476 0.11
477 0.11
478 0.11
479 0.1
480 0.11
481 0.11
482 0.12
483 0.12
484 0.14
485 0.13
486 0.13
487 0.13
488 0.15
489 0.21
490 0.22
491 0.24
492 0.28
493 0.3
494 0.31
495 0.32
496 0.3
497 0.26
498 0.28
499 0.25
500 0.22
501 0.21
502 0.21
503 0.19
504 0.17
505 0.16
506 0.1
507 0.1
508 0.08
509 0.07
510 0.06
511 0.06
512 0.06
513 0.04
514 0.04
515 0.04
516 0.03
517 0.04
518 0.03
519 0.04
520 0.04
521 0.05
522 0.05
523 0.06
524 0.09
525 0.08
526 0.08
527 0.1
528 0.13
529 0.14
530 0.18
531 0.23
532 0.25
533 0.28
534 0.31
535 0.3
536 0.27
537 0.29
538 0.26
539 0.25
540 0.21
541 0.19
542 0.18
543 0.18
544 0.18
545 0.19
546 0.19
547 0.15
548 0.15
549 0.15
550 0.15
551 0.16
552 0.18
553 0.15
554 0.17
555 0.17
556 0.18
557 0.17
558 0.15
559 0.16
560 0.13
561 0.13
562 0.11
563 0.11
564 0.09
565 0.1
566 0.11
567 0.1
568 0.1
569 0.09
570 0.08
571 0.08
572 0.08
573 0.07
574 0.06
575 0.05
576 0.05
577 0.06
578 0.06
579 0.06
580 0.06
581 0.06
582 0.07
583 0.07
584 0.07
585 0.1
586 0.13
587 0.14
588 0.16
589 0.18
590 0.23
591 0.29
592 0.3
593 0.34
594 0.35
595 0.38
596 0.43
597 0.48
598 0.46
599 0.49
600 0.52
601 0.48
602 0.46
603 0.44
604 0.37
605 0.33
606 0.3
607 0.23
608 0.22
609 0.21
610 0.18
611 0.16
612 0.16
613 0.15
614 0.16
615 0.15
616 0.12
617 0.11
618 0.11
619 0.11
620 0.11
621 0.1
622 0.07
623 0.05
624 0.05
625 0.05
626 0.06
627 0.09
628 0.12
629 0.14
630 0.16
631 0.19
632 0.22
633 0.23
634 0.26
635 0.27
636 0.28
637 0.3
638 0.36
639 0.37
640 0.36
641 0.39
642 0.35
643 0.37
644 0.37
645 0.36
646 0.29
647 0.29
648 0.29
649 0.29
650 0.34
651 0.38
652 0.43
653 0.44
654 0.5
655 0.47
656 0.45
657 0.43
658 0.37
659 0.32
660 0.27
661 0.23
662 0.16
663 0.15
664 0.16
665 0.16
666 0.18
667 0.15
668 0.12
669 0.12
670 0.14
671 0.17
672 0.17
673 0.17
674 0.17
675 0.2
676 0.27
677 0.26
678 0.26
679 0.26
680 0.29
681 0.3
682 0.31
683 0.33
684 0.27
685 0.27
686 0.26
687 0.25
688 0.21
689 0.21
690 0.18
691 0.14
692 0.13
693 0.12
694 0.11
695 0.09
696 0.1
697 0.09
698 0.08
699 0.07
700 0.1
701 0.11
702 0.13
703 0.15
704 0.21
705 0.2
706 0.2
707 0.2
708 0.21
709 0.27
710 0.26
711 0.34
712 0.35
713 0.46
714 0.56
715 0.63
716 0.62
717 0.61
718 0.65
719 0.62
720 0.63
721 0.57
722 0.52
723 0.52
724 0.59
725 0.58
726 0.53
727 0.47
728 0.39
729 0.39
730 0.39
731 0.37
732 0.32
733 0.34
734 0.42
735 0.47
736 0.47
737 0.48
738 0.51
739 0.5
740 0.5
741 0.44
742 0.43
743 0.39
744 0.41
745 0.36
746 0.28
747 0.24
748 0.2
749 0.19
750 0.13
751 0.12
752 0.1
753 0.09
754 0.09
755 0.11
756 0.12
757 0.13
758 0.15
759 0.17
760 0.19
761 0.18
762 0.17
763 0.16
764 0.15
765 0.14
766 0.12
767 0.1
768 0.08
769 0.08
770 0.08
771 0.09
772 0.11
773 0.11
774 0.09
775 0.1
776 0.1
777 0.11
778 0.14
779 0.22
780 0.27
781 0.32
782 0.4
783 0.41
784 0.5
785 0.54
786 0.53
787 0.54
788 0.52
789 0.56
790 0.57
791 0.6
792 0.57
793 0.61
794 0.62
795 0.55
796 0.53
797 0.47
798 0.45
799 0.48
800 0.47
801 0.4
802 0.42
803 0.42
804 0.47
805 0.52
806 0.52
807 0.51
808 0.51
809 0.56
810 0.56
811 0.58
812 0.57
813 0.58
814 0.61
815 0.62
816 0.68
817 0.64
818 0.65
819 0.71
820 0.71
821 0.67
822 0.66
823 0.64
824 0.62
825 0.65
826 0.61
827 0.58
828 0.53
829 0.48
830 0.4
831 0.38
832 0.32
833 0.27
834 0.24
835 0.2
836 0.19
837 0.17
838 0.17
839 0.12
840 0.12
841 0.12
842 0.13
843 0.12
844 0.12
845 0.12
846 0.11
847 0.13
848 0.12
849 0.13
850 0.1
851 0.09
852 0.1
853 0.11
854 0.17
855 0.19
856 0.21
857 0.24
858 0.31
859 0.33
860 0.35
861 0.38
862 0.36
863 0.37
864 0.4
865 0.39
866 0.33
867 0.34
868 0.34
869 0.32
870 0.32
871 0.31
872 0.32
873 0.34
874 0.34
875 0.41
876 0.46
877 0.46
878 0.52
879 0.53
880 0.56
881 0.55
882 0.59
883 0.52
884 0.54
885 0.56
886 0.47
887 0.45
888 0.38
889 0.35
890 0.29
891 0.31
892 0.27
893 0.22
894 0.24
895 0.21
896 0.21
897 0.23
898 0.24
899 0.18
900 0.17
901 0.2
902 0.2
903 0.24
904 0.23
905 0.2
906 0.18
907 0.19
908 0.19
909 0.17
910 0.17
911 0.14
912 0.23
913 0.3
914 0.32
915 0.31
916 0.32
917 0.34
918 0.38
919 0.36
920 0.32
921 0.29
922 0.3
923 0.31
924 0.29
925 0.24
926 0.21
927 0.21
928 0.18
929 0.15
930 0.13
931 0.16
932 0.17
933 0.19
934 0.2
935 0.2
936 0.2
937 0.19
938 0.18
939 0.13
940 0.11
941 0.1
942 0.09
943 0.09
944 0.09
945 0.09
946 0.08
947 0.08
948 0.09
949 0.08
950 0.1
951 0.1
952 0.17
953 0.21
954 0.28
955 0.29
956 0.3
957 0.3
958 0.31
959 0.35
960 0.34
961 0.38
962 0.41
963 0.47
964 0.52
965 0.54
966 0.52
967 0.53
968 0.56
969 0.54
970 0.53