Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H6QVG6

Protein Details
Accession H6QVG6    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
23-47EISVPKSKAKPKAAAKPKPTSKTTKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
28-62KSKAKPKAAAKPKPTSKTTKAAPKPKATAAKSKSK
Subcellular Location(s) cyto_nucl 15.5, nucl 14, cyto 13
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003594  HATPase_C  
IPR036890  HATPase_C_sf  
IPR020568  Ribosomal_S5_D2-typ_fold  
IPR014721  Ribosomal_S5_D2-typ_fold_subgr  
IPR001241  Topo_IIA  
IPR013760  Topo_IIA-like_dom_sf  
IPR013759  Topo_IIA_B_C  
IPR013506  Topo_IIA_bsu_dom2  
IPR001154  TopoII_euk  
IPR018522  TopoIIA_CS  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0003918  F:DNA topoisomerase type II (double strand cut, ATP-hydrolyzing) activity  
GO:0006265  P:DNA topological change  
GO:0000712  P:resolution of meiotic recombination intermediates  
GO:0000819  P:sister chromatid segregation  
KEGG pgr:PGTG_22746  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00204  DNA_gyraseB  
PF02518  HATPase_c  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00177  TOPOISOMERASE_II  
CDD cd16930  HATPase_TopII-like  
cd03481  TopoIIA_Trans_ScTopoIIA  
Amino Acid Sequences MSSDESEDFNVANDDNSGSDFGEISVPKSKAKPKAAAKPKPTSKTTKAAPKPKATAAKSKSKPLTDRDENQADSDNNSEAGDVLTELPASKPPTTTNGPAGSKKKTASETYQKLSQLEHVLKRPDTYIGSVEAIRQFMWIFDKEKKTMVNKEISFVPGLYKIVDEILVNAADNKQRDDSMDTLKVTIDSEKNIISVMNNGKGIPIEIHETEQIYIPELIFGHLLAGSNFDDEEKKTTGGRNGYGAKLANIYSTEFIVEAADKQTAKKYKQIFKNNMSVKEKPKITENKKGEEYTKISFKPDLVKFNLPAENGLAGDMEALISKRVYDMAGTLRNVKVWLNDERIKLTGFKKYVEMYTSGVNEAIKGSAAKALEAPGSPGNGATKTPIIYEECGKRWEIAFAPSDGQFQQVSFCNSIATTKGGTHVEHIVKQLVEKIIESVNKKKAKLTLKPYQVRNHLWVFVNCLIENPTFDSQTKENMTLGMSKFGSKCVMTEEFMKKVMKSGVIDSVMDFAKFKEEAALKKTDGSKRSRITGIVKLEDANNAGTRKAADCTLILTEGDSAKSLAVAGLSVIGRDNYGVFPLRGKLLNVREASGAQLLNNAEIQHIKQIMGLQQGKKYASRDSLRYGSLMIMTDQASPPHHDHAPSLQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.1
2 0.1
3 0.11
4 0.11
5 0.1
6 0.1
7 0.1
8 0.1
9 0.14
10 0.14
11 0.16
12 0.23
13 0.24
14 0.27
15 0.34
16 0.41
17 0.46
18 0.54
19 0.6
20 0.62
21 0.72
22 0.79
23 0.82
24 0.83
25 0.84
26 0.86
27 0.84
28 0.81
29 0.79
30 0.75
31 0.74
32 0.74
33 0.74
34 0.74
35 0.76
36 0.79
37 0.78
38 0.77
39 0.77
40 0.78
41 0.72
42 0.73
43 0.69
44 0.71
45 0.67
46 0.71
47 0.7
48 0.68
49 0.69
50 0.65
51 0.69
52 0.67
53 0.68
54 0.67
55 0.66
56 0.59
57 0.55
58 0.53
59 0.44
60 0.37
61 0.33
62 0.26
63 0.2
64 0.18
65 0.17
66 0.11
67 0.11
68 0.09
69 0.07
70 0.07
71 0.07
72 0.07
73 0.07
74 0.08
75 0.12
76 0.16
77 0.16
78 0.17
79 0.18
80 0.25
81 0.3
82 0.33
83 0.34
84 0.38
85 0.41
86 0.48
87 0.51
88 0.5
89 0.49
90 0.47
91 0.47
92 0.45
93 0.46
94 0.48
95 0.53
96 0.55
97 0.55
98 0.59
99 0.55
100 0.51
101 0.46
102 0.41
103 0.39
104 0.38
105 0.39
106 0.39
107 0.43
108 0.43
109 0.43
110 0.39
111 0.35
112 0.3
113 0.27
114 0.23
115 0.2
116 0.21
117 0.2
118 0.21
119 0.2
120 0.18
121 0.16
122 0.15
123 0.12
124 0.12
125 0.15
126 0.15
127 0.17
128 0.24
129 0.29
130 0.3
131 0.33
132 0.37
133 0.39
134 0.45
135 0.47
136 0.49
137 0.44
138 0.46
139 0.45
140 0.41
141 0.35
142 0.27
143 0.23
144 0.16
145 0.16
146 0.14
147 0.12
148 0.1
149 0.1
150 0.1
151 0.08
152 0.07
153 0.08
154 0.08
155 0.08
156 0.09
157 0.1
158 0.13
159 0.14
160 0.15
161 0.14
162 0.15
163 0.17
164 0.2
165 0.21
166 0.24
167 0.27
168 0.25
169 0.25
170 0.24
171 0.23
172 0.2
173 0.21
174 0.16
175 0.13
176 0.14
177 0.14
178 0.14
179 0.14
180 0.13
181 0.09
182 0.14
183 0.16
184 0.17
185 0.17
186 0.17
187 0.17
188 0.17
189 0.17
190 0.12
191 0.1
192 0.11
193 0.11
194 0.13
195 0.13
196 0.14
197 0.14
198 0.15
199 0.13
200 0.12
201 0.11
202 0.1
203 0.1
204 0.09
205 0.09
206 0.08
207 0.07
208 0.06
209 0.06
210 0.06
211 0.05
212 0.07
213 0.07
214 0.07
215 0.07
216 0.07
217 0.08
218 0.09
219 0.12
220 0.12
221 0.13
222 0.14
223 0.17
224 0.21
225 0.23
226 0.23
227 0.24
228 0.25
229 0.25
230 0.26
231 0.23
232 0.19
233 0.17
234 0.16
235 0.12
236 0.1
237 0.11
238 0.09
239 0.09
240 0.08
241 0.07
242 0.07
243 0.06
244 0.06
245 0.06
246 0.06
247 0.08
248 0.08
249 0.09
250 0.15
251 0.2
252 0.22
253 0.27
254 0.35
255 0.41
256 0.51
257 0.61
258 0.63
259 0.62
260 0.7
261 0.69
262 0.69
263 0.66
264 0.61
265 0.56
266 0.54
267 0.51
268 0.42
269 0.45
270 0.47
271 0.49
272 0.54
273 0.53
274 0.52
275 0.54
276 0.54
277 0.48
278 0.43
279 0.4
280 0.33
281 0.35
282 0.29
283 0.27
284 0.26
285 0.26
286 0.29
287 0.28
288 0.3
289 0.29
290 0.31
291 0.3
292 0.33
293 0.34
294 0.26
295 0.23
296 0.18
297 0.14
298 0.12
299 0.11
300 0.07
301 0.05
302 0.05
303 0.04
304 0.03
305 0.03
306 0.03
307 0.03
308 0.03
309 0.03
310 0.04
311 0.04
312 0.04
313 0.04
314 0.05
315 0.09
316 0.12
317 0.13
318 0.15
319 0.15
320 0.15
321 0.16
322 0.15
323 0.13
324 0.13
325 0.16
326 0.2
327 0.24
328 0.25
329 0.26
330 0.26
331 0.25
332 0.25
333 0.23
334 0.24
335 0.2
336 0.2
337 0.21
338 0.22
339 0.22
340 0.2
341 0.2
342 0.14
343 0.16
344 0.15
345 0.14
346 0.13
347 0.11
348 0.1
349 0.09
350 0.08
351 0.06
352 0.05
353 0.05
354 0.07
355 0.07
356 0.07
357 0.07
358 0.08
359 0.09
360 0.08
361 0.1
362 0.08
363 0.09
364 0.09
365 0.09
366 0.09
367 0.08
368 0.09
369 0.08
370 0.09
371 0.09
372 0.09
373 0.1
374 0.11
375 0.12
376 0.16
377 0.19
378 0.2
379 0.21
380 0.21
381 0.2
382 0.19
383 0.2
384 0.17
385 0.16
386 0.15
387 0.15
388 0.16
389 0.16
390 0.17
391 0.15
392 0.15
393 0.12
394 0.1
395 0.12
396 0.12
397 0.15
398 0.14
399 0.14
400 0.13
401 0.13
402 0.13
403 0.12
404 0.11
405 0.09
406 0.09
407 0.12
408 0.13
409 0.13
410 0.15
411 0.2
412 0.2
413 0.21
414 0.22
415 0.21
416 0.19
417 0.19
418 0.21
419 0.16
420 0.15
421 0.13
422 0.14
423 0.15
424 0.19
425 0.22
426 0.25
427 0.33
428 0.37
429 0.37
430 0.39
431 0.43
432 0.48
433 0.54
434 0.55
435 0.56
436 0.62
437 0.68
438 0.72
439 0.72
440 0.7
441 0.65
442 0.61
443 0.55
444 0.49
445 0.45
446 0.39
447 0.37
448 0.34
449 0.32
450 0.26
451 0.24
452 0.23
453 0.2
454 0.2
455 0.19
456 0.17
457 0.17
458 0.17
459 0.2
460 0.18
461 0.24
462 0.26
463 0.23
464 0.21
465 0.2
466 0.21
467 0.22
468 0.22
469 0.21
470 0.19
471 0.2
472 0.2
473 0.21
474 0.23
475 0.17
476 0.17
477 0.18
478 0.2
479 0.18
480 0.26
481 0.28
482 0.28
483 0.31
484 0.32
485 0.27
486 0.28
487 0.29
488 0.25
489 0.22
490 0.23
491 0.25
492 0.25
493 0.25
494 0.21
495 0.22
496 0.19
497 0.18
498 0.15
499 0.1
500 0.12
501 0.12
502 0.12
503 0.15
504 0.19
505 0.23
506 0.27
507 0.31
508 0.27
509 0.33
510 0.4
511 0.4
512 0.43
513 0.46
514 0.51
515 0.5
516 0.55
517 0.53
518 0.5
519 0.49
520 0.5
521 0.5
522 0.43
523 0.4
524 0.36
525 0.35
526 0.32
527 0.27
528 0.22
529 0.19
530 0.17
531 0.16
532 0.16
533 0.17
534 0.16
535 0.17
536 0.16
537 0.13
538 0.13
539 0.15
540 0.16
541 0.15
542 0.14
543 0.12
544 0.13
545 0.13
546 0.13
547 0.11
548 0.1
549 0.09
550 0.09
551 0.09
552 0.07
553 0.06
554 0.05
555 0.05
556 0.07
557 0.07
558 0.08
559 0.08
560 0.08
561 0.08
562 0.09
563 0.1
564 0.07
565 0.1
566 0.13
567 0.12
568 0.15
569 0.17
570 0.2
571 0.2
572 0.22
573 0.27
574 0.3
575 0.38
576 0.37
577 0.36
578 0.34
579 0.33
580 0.33
581 0.29
582 0.23
583 0.16
584 0.19
585 0.17
586 0.17
587 0.18
588 0.16
589 0.14
590 0.15
591 0.16
592 0.18
593 0.19
594 0.18
595 0.18
596 0.21
597 0.24
598 0.31
599 0.37
600 0.34
601 0.37
602 0.42
603 0.42
604 0.43
605 0.42
606 0.39
607 0.42
608 0.45
609 0.46
610 0.49
611 0.51
612 0.48
613 0.46
614 0.41
615 0.33
616 0.29
617 0.25
618 0.18
619 0.16
620 0.16
621 0.18
622 0.18
623 0.19
624 0.19
625 0.23
626 0.26
627 0.28
628 0.3
629 0.29