Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

E3K003

Protein Details
Accession E3K003    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
426-450IVNPSQVKKKSAKPRSRVRFGDPSQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
434-440KKSAKPR
Subcellular Location(s) nucl 14, cyto_nucl 11, mito 6, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR008728  Elongator_complex_protein_4  
IPR027417  P-loop_NTPase  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0033588  C:elongator holoenzyme complex  
GO:0008023  C:transcription elongation factor complex  
GO:0002098  P:tRNA wobble uridine modification  
KEGG pgr:PGTG_03584  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF05625  PAXNEB  
CDD cd19494  Elp4  
Amino Acid Sequences MSSFKRNLKPNNPNQAPSSYPTGFHPSHYNGVPTASTGIASLDDLLGGGLPISSSFLIDEDEDGGYGKLILRYSIAQGIVSKQHLIVVGSSLDEGGDPEKIIDRLMSLDESDEPLEPPSSNQSQKSTARSSGLSAEKEKSTAPSDAADDDDEEEEDDDDEVNADKVKSQRMKIAWRYENLGHHHSEAESIYQQSRCHVFNLSKTMKLSADQRSRTDCIDVKNLEGLPTSLLAQIKQIIEERRKASSSLPSFRIVIQSIGSIGWPPMEDFMIFRFLKELEMLLRSTDCPKIAMISFPSAYRSPDLAKMLPWATSGSLSLQSFAGDEKSQAAFPNHQGAVHFIRLPSPSSLSPPATKLSVIRALGGGSEAGIGSNLGFKLGRRKGFRIEMMGLGLDIENENPPEEASTTHQPDKPSEVPVDGLDGLAIVNPSQVKKKSAKPRSRVRFGDPSQDSHDLLKNTDW
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.73
2 0.67
3 0.6
4 0.53
5 0.5
6 0.4
7 0.36
8 0.36
9 0.4
10 0.35
11 0.34
12 0.37
13 0.34
14 0.39
15 0.39
16 0.37
17 0.3
18 0.32
19 0.29
20 0.23
21 0.21
22 0.15
23 0.13
24 0.11
25 0.11
26 0.1
27 0.1
28 0.09
29 0.07
30 0.06
31 0.06
32 0.06
33 0.05
34 0.04
35 0.04
36 0.03
37 0.03
38 0.03
39 0.05
40 0.05
41 0.06
42 0.06
43 0.07
44 0.08
45 0.08
46 0.09
47 0.09
48 0.09
49 0.09
50 0.09
51 0.09
52 0.08
53 0.08
54 0.09
55 0.1
56 0.1
57 0.1
58 0.11
59 0.13
60 0.15
61 0.18
62 0.17
63 0.15
64 0.16
65 0.19
66 0.21
67 0.21
68 0.19
69 0.16
70 0.17
71 0.18
72 0.17
73 0.15
74 0.12
75 0.11
76 0.11
77 0.11
78 0.09
79 0.07
80 0.07
81 0.07
82 0.06
83 0.06
84 0.06
85 0.06
86 0.09
87 0.09
88 0.1
89 0.09
90 0.09
91 0.09
92 0.11
93 0.11
94 0.09
95 0.1
96 0.1
97 0.12
98 0.12
99 0.11
100 0.1
101 0.11
102 0.12
103 0.11
104 0.11
105 0.16
106 0.21
107 0.24
108 0.26
109 0.28
110 0.34
111 0.39
112 0.44
113 0.42
114 0.39
115 0.38
116 0.36
117 0.34
118 0.34
119 0.34
120 0.3
121 0.29
122 0.29
123 0.27
124 0.27
125 0.26
126 0.22
127 0.21
128 0.19
129 0.17
130 0.16
131 0.17
132 0.16
133 0.17
134 0.14
135 0.12
136 0.11
137 0.11
138 0.09
139 0.08
140 0.08
141 0.07
142 0.07
143 0.07
144 0.06
145 0.05
146 0.05
147 0.05
148 0.05
149 0.06
150 0.06
151 0.08
152 0.1
153 0.18
154 0.22
155 0.23
156 0.29
157 0.33
158 0.42
159 0.47
160 0.55
161 0.51
162 0.48
163 0.51
164 0.48
165 0.49
166 0.45
167 0.4
168 0.32
169 0.28
170 0.27
171 0.23
172 0.21
173 0.15
174 0.13
175 0.11
176 0.11
177 0.12
178 0.14
179 0.14
180 0.15
181 0.17
182 0.16
183 0.17
184 0.19
185 0.18
186 0.21
187 0.3
188 0.29
189 0.29
190 0.28
191 0.29
192 0.26
193 0.26
194 0.27
195 0.27
196 0.32
197 0.33
198 0.35
199 0.37
200 0.38
201 0.37
202 0.35
203 0.29
204 0.24
205 0.28
206 0.26
207 0.22
208 0.23
209 0.22
210 0.19
211 0.17
212 0.14
213 0.08
214 0.08
215 0.08
216 0.08
217 0.08
218 0.08
219 0.08
220 0.11
221 0.1
222 0.11
223 0.13
224 0.16
225 0.19
226 0.24
227 0.26
228 0.25
229 0.26
230 0.26
231 0.25
232 0.29
233 0.32
234 0.32
235 0.32
236 0.31
237 0.31
238 0.31
239 0.31
240 0.23
241 0.18
242 0.13
243 0.1
244 0.09
245 0.09
246 0.08
247 0.06
248 0.05
249 0.05
250 0.05
251 0.05
252 0.05
253 0.05
254 0.05
255 0.06
256 0.07
257 0.13
258 0.13
259 0.13
260 0.13
261 0.13
262 0.14
263 0.13
264 0.13
265 0.08
266 0.09
267 0.1
268 0.09
269 0.1
270 0.1
271 0.12
272 0.13
273 0.12
274 0.11
275 0.11
276 0.13
277 0.13
278 0.14
279 0.13
280 0.15
281 0.15
282 0.14
283 0.18
284 0.16
285 0.17
286 0.16
287 0.16
288 0.15
289 0.19
290 0.22
291 0.19
292 0.19
293 0.21
294 0.2
295 0.19
296 0.18
297 0.14
298 0.12
299 0.12
300 0.12
301 0.1
302 0.13
303 0.12
304 0.12
305 0.12
306 0.11
307 0.11
308 0.11
309 0.11
310 0.08
311 0.08
312 0.1
313 0.11
314 0.12
315 0.14
316 0.16
317 0.17
318 0.18
319 0.25
320 0.23
321 0.22
322 0.22
323 0.24
324 0.25
325 0.25
326 0.24
327 0.17
328 0.2
329 0.2
330 0.22
331 0.2
332 0.19
333 0.18
334 0.21
335 0.26
336 0.26
337 0.27
338 0.26
339 0.27
340 0.24
341 0.24
342 0.21
343 0.22
344 0.25
345 0.23
346 0.22
347 0.2
348 0.19
349 0.18
350 0.18
351 0.12
352 0.06
353 0.06
354 0.05
355 0.04
356 0.04
357 0.04
358 0.04
359 0.07
360 0.06
361 0.07
362 0.08
363 0.09
364 0.19
365 0.26
366 0.34
367 0.37
368 0.41
369 0.48
370 0.55
371 0.58
372 0.54
373 0.5
374 0.44
375 0.39
376 0.35
377 0.27
378 0.2
379 0.16
380 0.1
381 0.08
382 0.07
383 0.08
384 0.08
385 0.09
386 0.09
387 0.09
388 0.1
389 0.1
390 0.11
391 0.16
392 0.24
393 0.29
394 0.35
395 0.38
396 0.38
397 0.41
398 0.47
399 0.44
400 0.4
401 0.36
402 0.31
403 0.3
404 0.28
405 0.29
406 0.21
407 0.18
408 0.13
409 0.11
410 0.1
411 0.09
412 0.09
413 0.05
414 0.07
415 0.1
416 0.12
417 0.2
418 0.23
419 0.29
420 0.35
421 0.45
422 0.54
423 0.63
424 0.71
425 0.74
426 0.82
427 0.87
428 0.9
429 0.86
430 0.83
431 0.83
432 0.76
433 0.77
434 0.69
435 0.64
436 0.6
437 0.58
438 0.51
439 0.45
440 0.47
441 0.38