FuNGI

Q2H5D8

Protein Details

Accession

Q2H5D8

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
123-145	HPRPPGPEVARRQRKPPRQSAGS	Basic
186-207	FPVINPRKGKPRHQRHPLADLF	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
133-137	RRQRK

Subcellular Location(s)

nucl 8.5, cyto_nucl 8.5, cyto 7.5, pero 7, mito 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR013103 RVT_2
Gene Ontology	GO:0005739 C:mitochondrion
Pfam	View protein in Pfam PF07727 RVT_2
CDD	cd09272 RNase_HI_RT_Ty1

Amino Acid Sequences

MIKNDLAQVDLEQLKEWLNANTTEDKSIAEEEEEEDSEAQSTGATVVSTTAAFEDEGVTEVIDEEEEEILDSITVKGDHTSTFEDFYPTPPQTPPPGDLLAAAFHGMRNLQGTQSSPTSSGEHPRPPGPEVARRQRKPPRQSAGSATITIAEINVARAQPGSINNLHQSQLPAPPKRHHDLVEPHFPVINPRKGKPRHQRHPLADLFLQAERDHLQSHEKTGSWEEVSRHSDQIQGNQILDCMWVYTYKFNTRGFLAKCKARLVVRGDQQRVNHAEENYAATLAVRSFRAVLALAARFDLELKQFDAVNAFVNAKIDEDVYMEMPTGYRRPSRVLKLKKALYGLRKSPLLWQKELTATLTKLGFKALPHEPCMMIRKGCLIFFYVDDIVVAYRKNDSHIANAAISGLKAKYELTGGEDLRWFLGIEIHRDRARRYIWLSQTAYIDKIAELAQSDDLPRTPMGLRELQPYEGIATRQSTRLYQRKVGSILYTAVITRPDVAFAVARLARFNQNPGPEHHRAADQVLRYLHVTRSLALRLGGGDYLRVASDASFADNSIDRKSSQGYAITLFGGLIAWRASKQDTVTTSTTEAELLALAQAAKEGLFIQRLIAEMAIKLDDDVLVLECDNTNTISLVTKEIAVLQTKLRHVDIHNHWLRQEYQRGKIHVKYVPSKKMVADGLTKALNADNHQEFPSTPSTPFLLTQAFSDLLNALKYRWFQHLAALPVSPKHESASEEKDCIDIVSVDGYTFDQIVAYIVDARRSGTESIISLRYPADPAWDLGGESQHHVERKLLDYVELTRGKVQAAVALNGQYPSGRNAQVALRVVDGATTGTWVKYFDTVYDEDFVQQSDGQLELYISDFFGPAGLPASFCRPSAAELASGVSRDLQVILTYKRLRSIFLKGPEHSSRDIAW

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.18
2	0.2
3	0.21
4	0.17
5	0.18
6	0.19
7	0.23
8	0.29
9	0.29
10	0.29
11	0.28
12	0.26
13	0.25
14	0.26
15	0.22
16	0.16
17	0.16
18	0.16
19	0.19
20	0.19
21	0.18
22	0.16
23	0.15
24	0.15
25	0.14
26	0.11
27	0.08
28	0.07
29	0.07
30	0.07
31	0.06
32	0.05
33	0.06
34	0.07
35	0.07
36	0.07
37	0.07
38	0.08
39	0.08
40	0.08
41	0.08
42	0.07
43	0.09
44	0.09
45	0.08
46	0.07
47	0.08
48	0.08
49	0.07
50	0.06
51	0.06
52	0.06
53	0.06
54	0.07
55	0.07
56	0.06
57	0.07
58	0.07
59	0.06
60	0.08
61	0.08
62	0.08
63	0.09
64	0.11
65	0.11
66	0.14
67	0.18
68	0.18
69	0.2
70	0.21
71	0.23
72	0.22
73	0.25
74	0.29
75	0.26
76	0.27
77	0.27
78	0.3
79	0.33
80	0.37
81	0.35
82	0.33
83	0.33
84	0.31
85	0.3
86	0.27
87	0.21
88	0.17
89	0.15
90	0.1
91	0.09
92	0.1
93	0.09
94	0.09
95	0.11
96	0.11
97	0.12
98	0.13
99	0.15
100	0.18
101	0.2
102	0.21
103	0.2
104	0.21
105	0.23
106	0.24
107	0.31
108	0.33
109	0.37
110	0.39
111	0.42
112	0.43
113	0.41
114	0.47
115	0.44
116	0.47
117	0.51
118	0.59
119	0.65
120	0.65
121	0.73
122	0.76
123	0.8
124	0.81
125	0.82
126	0.8
127	0.76
128	0.78
129	0.75
130	0.72
131	0.65
132	0.55
133	0.45
134	0.36
135	0.3
136	0.25
137	0.17
138	0.1
139	0.07
140	0.08
141	0.1
142	0.09
143	0.09
144	0.09
145	0.1
146	0.12
147	0.14
148	0.18
149	0.18
150	0.21
151	0.24
152	0.26
153	0.26
154	0.25
155	0.25
156	0.22
157	0.29
158	0.34
159	0.38
160	0.4
161	0.46
162	0.52
163	0.54
164	0.56
165	0.5
166	0.5
167	0.54
168	0.56
169	0.6
170	0.54
171	0.5
172	0.46
173	0.44
174	0.44
175	0.43
176	0.45
177	0.39
178	0.41
179	0.5
180	0.55
181	0.66
182	0.69
183	0.71
184	0.73
185	0.79
186	0.86
187	0.81
188	0.85
189	0.77
190	0.71
191	0.61
192	0.52
193	0.44
194	0.34
195	0.3
196	0.2
197	0.19
198	0.15
199	0.15
200	0.14
201	0.13
202	0.19
203	0.18
204	0.23
205	0.24
206	0.22
207	0.23
208	0.25
209	0.27
210	0.22
211	0.25
212	0.23
213	0.26
214	0.3
215	0.3
216	0.29
217	0.26
218	0.31
219	0.28
220	0.33
221	0.33
222	0.31
223	0.29
224	0.28
225	0.27
226	0.21
227	0.2
228	0.14
229	0.07
230	0.06
231	0.07
232	0.08
233	0.12
234	0.16
235	0.21
236	0.25
237	0.26
238	0.27
239	0.28
240	0.35
241	0.34
242	0.38
243	0.39
244	0.39
245	0.4
246	0.41
247	0.43
248	0.37
249	0.4
250	0.38
251	0.4
252	0.44
253	0.5
254	0.52
255	0.51
256	0.5
257	0.5
258	0.47
259	0.44
260	0.4
261	0.32
262	0.29
263	0.27
264	0.29
265	0.22
266	0.19
267	0.14
268	0.09
269	0.1
270	0.09
271	0.1
272	0.07
273	0.07
274	0.08
275	0.08
276	0.09
277	0.08
278	0.08
279	0.1
280	0.11
281	0.11
282	0.1
283	0.1
284	0.09
285	0.1
286	0.1
287	0.08
288	0.09
289	0.09
290	0.1
291	0.11
292	0.11
293	0.12
294	0.1
295	0.1
296	0.1
297	0.1
298	0.09
299	0.1
300	0.1
301	0.09
302	0.09
303	0.08
304	0.07
305	0.07
306	0.08
307	0.08
308	0.08
309	0.07
310	0.07
311	0.07
312	0.08
313	0.09
314	0.11
315	0.12
316	0.14
317	0.19
318	0.26
319	0.35
320	0.43
321	0.51
322	0.57
323	0.63
324	0.66
325	0.63
326	0.62
327	0.58
328	0.56
329	0.54
330	0.49
331	0.44
332	0.41
333	0.39
334	0.42
335	0.44
336	0.4
337	0.35
338	0.32
339	0.31
340	0.32
341	0.32
342	0.26
343	0.21
344	0.17
345	0.18
346	0.18
347	0.16
348	0.14
349	0.14
350	0.13
351	0.11
352	0.16
353	0.19
354	0.2
355	0.22
356	0.24
357	0.23
358	0.24
359	0.29
360	0.26
361	0.2
362	0.18
363	0.2
364	0.2
365	0.19
366	0.17
367	0.15
368	0.13
369	0.13
370	0.16
371	0.11
372	0.1
373	0.09
374	0.09
375	0.08
376	0.07
377	0.07
378	0.05
379	0.06
380	0.07
381	0.09
382	0.13
383	0.13
384	0.15
385	0.18
386	0.19
387	0.17
388	0.17
389	0.15
390	0.11
391	0.1
392	0.09
393	0.06
394	0.05
395	0.05
396	0.05
397	0.05
398	0.06
399	0.06
400	0.08
401	0.12
402	0.12
403	0.13
404	0.13
405	0.13
406	0.12
407	0.12
408	0.09
409	0.06
410	0.09
411	0.09
412	0.13
413	0.16
414	0.19
415	0.2
416	0.21
417	0.22
418	0.23
419	0.24
420	0.23
421	0.25
422	0.29
423	0.3
424	0.37
425	0.37
426	0.34
427	0.35
428	0.31
429	0.28
430	0.21
431	0.18
432	0.1
433	0.1
434	0.08
435	0.06
436	0.06
437	0.06
438	0.06
439	0.06
440	0.07
441	0.06
442	0.06
443	0.07
444	0.07
445	0.08
446	0.08
447	0.09
448	0.12
449	0.15
450	0.16
451	0.2
452	0.21
453	0.2
454	0.19
455	0.18
456	0.16
457	0.13
458	0.12
459	0.08
460	0.09
461	0.1
462	0.12
463	0.12
464	0.14
465	0.21
466	0.28
467	0.31
468	0.35
469	0.36
470	0.37
471	0.38
472	0.36
473	0.3
474	0.23
475	0.2
476	0.15
477	0.13
478	0.1
479	0.09
480	0.08
481	0.07
482	0.07
483	0.06
484	0.06
485	0.06
486	0.07
487	0.06
488	0.06
489	0.1
490	0.09
491	0.1
492	0.1
493	0.11
494	0.15
495	0.15
496	0.18
497	0.18
498	0.21
499	0.22
500	0.26
501	0.32
502	0.31
503	0.32
504	0.3
505	0.27
506	0.24
507	0.25
508	0.24
509	0.17
510	0.18
511	0.17
512	0.16
513	0.16
514	0.17
515	0.15
516	0.15
517	0.15
518	0.13
519	0.15
520	0.15
521	0.15
522	0.13
523	0.13
524	0.09
525	0.09
526	0.09
527	0.07
528	0.06
529	0.05
530	0.05
531	0.05
532	0.05
533	0.04
534	0.04
535	0.06
536	0.06
537	0.07
538	0.07
539	0.07
540	0.08
541	0.1
542	0.11
543	0.11
544	0.12
545	0.11
546	0.12
547	0.14
548	0.14
549	0.14
550	0.15
551	0.14
552	0.15
553	0.15
554	0.14
555	0.12
556	0.1
557	0.08
558	0.06
559	0.05
560	0.04
561	0.04
562	0.04
563	0.05
564	0.06
565	0.07
566	0.09
567	0.1
568	0.13
569	0.15
570	0.2
571	0.21
572	0.21
573	0.21
574	0.2
575	0.19
576	0.15
577	0.13
578	0.08
579	0.07
580	0.05
581	0.04
582	0.04
583	0.04
584	0.03
585	0.03
586	0.03
587	0.03
588	0.04
589	0.04
590	0.05
591	0.06
592	0.07
593	0.07
594	0.08
595	0.08
596	0.08
597	0.08
598	0.07
599	0.06
600	0.07
601	0.07
602	0.06
603	0.05
604	0.05
605	0.05
606	0.04
607	0.05
608	0.05
609	0.05
610	0.05
611	0.05
612	0.05
613	0.06
614	0.06
615	0.06
616	0.06
617	0.06
618	0.06
619	0.07
620	0.08
621	0.1
622	0.09
623	0.09
624	0.09
625	0.1
626	0.12
627	0.12
628	0.12
629	0.14
630	0.18
631	0.19
632	0.21
633	0.21
634	0.22
635	0.21
636	0.3
637	0.33
638	0.39
639	0.42
640	0.41
641	0.41
642	0.41
643	0.43
644	0.39
645	0.43
646	0.37
647	0.42
648	0.46
649	0.51
650	0.52
651	0.53
652	0.53
653	0.47
654	0.48
655	0.49
656	0.51
657	0.55
658	0.53
659	0.51
660	0.45
661	0.47
662	0.42
663	0.36
664	0.32
665	0.25
666	0.26
667	0.24
668	0.23
669	0.19
670	0.19
671	0.17
672	0.15
673	0.19
674	0.18
675	0.2
676	0.21
677	0.21
678	0.19
679	0.22
680	0.25
681	0.2
682	0.18
683	0.18
684	0.19
685	0.19
686	0.2
687	0.18
688	0.16
689	0.14
690	0.14
691	0.15
692	0.15
693	0.13
694	0.13
695	0.11
696	0.1
697	0.12
698	0.11
699	0.09
700	0.12
701	0.14
702	0.16
703	0.21
704	0.24
705	0.23
706	0.29
707	0.34
708	0.34
709	0.33
710	0.32
711	0.27
712	0.25
713	0.28
714	0.22
715	0.18
716	0.16
717	0.17
718	0.19
719	0.24
720	0.3
721	0.3
722	0.3
723	0.3
724	0.28
725	0.26
726	0.23
727	0.19
728	0.1
729	0.08
730	0.09
731	0.08
732	0.08
733	0.08
734	0.09
735	0.08
736	0.08
737	0.07
738	0.05
739	0.05
740	0.06
741	0.06
742	0.06
743	0.1
744	0.1
745	0.12
746	0.12
747	0.13
748	0.14
749	0.16
750	0.17
751	0.14
752	0.15
753	0.15
754	0.18
755	0.19
756	0.18
757	0.16
758	0.16
759	0.16
760	0.16
761	0.15
762	0.16
763	0.15
764	0.16
765	0.18
766	0.17
767	0.16
768	0.16
769	0.19
770	0.15
771	0.16
772	0.18
773	0.19
774	0.2
775	0.21
776	0.23
777	0.23
778	0.25
779	0.28
780	0.25
781	0.23
782	0.24
783	0.26
784	0.32
785	0.31
786	0.28
787	0.26
788	0.27
789	0.26
790	0.25
791	0.22
792	0.19
793	0.2
794	0.2
795	0.19
796	0.19
797	0.2
798	0.18
799	0.18
800	0.14
801	0.12
802	0.14
803	0.18
804	0.17
805	0.17
806	0.19
807	0.22
808	0.27
809	0.29
810	0.26
811	0.22
812	0.21
813	0.21
814	0.18
815	0.16
816	0.11
817	0.08
818	0.08
819	0.08
820	0.08
821	0.09
822	0.1
823	0.11
824	0.13
825	0.13
826	0.13
827	0.17
828	0.18
829	0.2
830	0.21
831	0.2
832	0.19
833	0.19
834	0.18
835	0.15
836	0.14
837	0.13
838	0.12
839	0.11
840	0.1
841	0.1
842	0.09
843	0.08
844	0.09
845	0.09
846	0.08
847	0.08
848	0.08
849	0.07
850	0.07
851	0.07
852	0.06
853	0.08
854	0.08
855	0.09
856	0.1
857	0.17
858	0.18
859	0.19
860	0.21
861	0.19
862	0.22
863	0.25
864	0.25
865	0.2
866	0.19
867	0.22
868	0.2
869	0.19
870	0.17
871	0.13
872	0.12
873	0.12
874	0.12
875	0.1
876	0.11
877	0.15
878	0.17
879	0.25
880	0.29
881	0.29
882	0.36
883	0.36
884	0.38
885	0.38
886	0.44
887	0.45
888	0.5
889	0.56
890	0.51
891	0.59
892	0.61
893	0.61
894	0.55

Q2H5D8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer