Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

E3JX02

Protein Details
Accession E3JX02    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
404-430SEEQISRKTNSKPKKKLRSIPAQDELEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
415-419KPKKK
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto_nucl 12.833, mito_nucl 11.333, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016024  ARM-type_fold  
IPR009072  Histone-fold  
IPR037796  TAF6  
IPR011442  TAF6_C  
IPR046344  TAF6_C_sf  
IPR004823  TAF_TATA-bd_Histone-like_dom  
Gene Ontology GO:0000124  C:SAGA complex  
GO:0046695  C:SLIK (SAGA-like) complex  
GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0046982  F:protein heterodimerization activity  
GO:0016251  F:RNA polymerase II general transcription initiation factor activity  
GO:0003713  F:transcription coactivator activity  
GO:0051123  P:RNA polymerase II preinitiation complex assembly  
KEGG pgr:PGTG_02038  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF02969  TAF  
PF07571  TAF6_C  
CDD cd08050  TAF6C  
Amino Acid Sequences MPVIPIATGVWPKTSVKDVAESLGLGNLSDEAATALAADVEFRLTQLIEDSIKFMRHSKRTNLLVEDVDYALRAKNIEPLWGFASTDTLSFRRTTSAVGNLYFIDEEEIDLTKVLTAELPPIPQEASYTAHWLAVEGVQPAIPQNPTPAELKSHPAFSGLQSSAIPSSSKQAPETKNLTTKEHLSRELRLYFDRVTAAALSNDQSSRNAALASLSGDPGLHQLVPYLIQFAAEKITTTLSHTEPSLEHLRDVLQILESILSNPHSYLEPYLHQILPSILTCLLSSSFPSSPVTDELEREIRCTAGSLLKSQLNRYQHSYPTLRTRILKTLTKSLIDPQSTDRNQLGAIIGVKYLGLEPTKTVLSQNIKAFGESLDLALSEGKADQNRVDNLIRETLKIMSEAYSEEQISRKTNSKPKKKLRSIPAQDELEAEVGVQFAARLMSTSDEEETKLAYTFIKESTQTSDTEDSEEEEERSENAPEEDTNKMDIVEEKTEAQPVAETTEVTADSQVGQEKDVVTSDPVSTDQTANPEPKENEQATTENPPNEDSTIEDVKTNDDPTS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.27
3 0.26
4 0.3
5 0.29
6 0.29
7 0.28
8 0.26
9 0.21
10 0.2
11 0.17
12 0.12
13 0.11
14 0.09
15 0.08
16 0.07
17 0.07
18 0.05
19 0.05
20 0.05
21 0.05
22 0.04
23 0.05
24 0.05
25 0.05
26 0.05
27 0.06
28 0.07
29 0.07
30 0.08
31 0.07
32 0.08
33 0.09
34 0.12
35 0.12
36 0.13
37 0.16
38 0.17
39 0.19
40 0.2
41 0.25
42 0.32
43 0.39
44 0.45
45 0.51
46 0.58
47 0.62
48 0.67
49 0.64
50 0.58
51 0.51
52 0.46
53 0.4
54 0.32
55 0.25
56 0.2
57 0.16
58 0.13
59 0.12
60 0.11
61 0.09
62 0.16
63 0.16
64 0.22
65 0.21
66 0.23
67 0.25
68 0.25
69 0.24
70 0.18
71 0.2
72 0.15
73 0.15
74 0.16
75 0.14
76 0.15
77 0.16
78 0.16
79 0.16
80 0.17
81 0.18
82 0.19
83 0.25
84 0.26
85 0.26
86 0.27
87 0.24
88 0.24
89 0.21
90 0.17
91 0.12
92 0.09
93 0.09
94 0.09
95 0.09
96 0.08
97 0.08
98 0.08
99 0.07
100 0.07
101 0.07
102 0.07
103 0.06
104 0.1
105 0.11
106 0.12
107 0.12
108 0.13
109 0.13
110 0.12
111 0.13
112 0.11
113 0.14
114 0.14
115 0.17
116 0.16
117 0.17
118 0.17
119 0.16
120 0.15
121 0.13
122 0.13
123 0.1
124 0.1
125 0.09
126 0.09
127 0.09
128 0.11
129 0.1
130 0.09
131 0.11
132 0.12
133 0.14
134 0.16
135 0.16
136 0.19
137 0.2
138 0.26
139 0.25
140 0.25
141 0.23
142 0.24
143 0.23
144 0.2
145 0.25
146 0.19
147 0.18
148 0.17
149 0.18
150 0.16
151 0.16
152 0.15
153 0.09
154 0.13
155 0.16
156 0.18
157 0.19
158 0.27
159 0.29
160 0.35
161 0.39
162 0.39
163 0.42
164 0.43
165 0.44
166 0.39
167 0.43
168 0.43
169 0.42
170 0.43
171 0.39
172 0.41
173 0.42
174 0.42
175 0.38
176 0.32
177 0.31
178 0.26
179 0.25
180 0.21
181 0.16
182 0.14
183 0.13
184 0.12
185 0.1
186 0.09
187 0.09
188 0.1
189 0.1
190 0.1
191 0.1
192 0.11
193 0.11
194 0.11
195 0.1
196 0.08
197 0.08
198 0.08
199 0.09
200 0.08
201 0.07
202 0.07
203 0.07
204 0.07
205 0.07
206 0.08
207 0.06
208 0.05
209 0.05
210 0.06
211 0.07
212 0.07
213 0.07
214 0.06
215 0.07
216 0.07
217 0.07
218 0.08
219 0.07
220 0.08
221 0.07
222 0.08
223 0.08
224 0.09
225 0.12
226 0.11
227 0.12
228 0.12
229 0.12
230 0.11
231 0.16
232 0.19
233 0.17
234 0.16
235 0.16
236 0.16
237 0.16
238 0.17
239 0.12
240 0.07
241 0.07
242 0.07
243 0.07
244 0.06
245 0.05
246 0.06
247 0.06
248 0.06
249 0.06
250 0.07
251 0.07
252 0.07
253 0.08
254 0.09
255 0.09
256 0.11
257 0.14
258 0.13
259 0.13
260 0.13
261 0.12
262 0.11
263 0.1
264 0.09
265 0.07
266 0.07
267 0.07
268 0.07
269 0.08
270 0.06
271 0.07
272 0.09
273 0.09
274 0.09
275 0.11
276 0.11
277 0.11
278 0.13
279 0.15
280 0.13
281 0.13
282 0.14
283 0.19
284 0.18
285 0.18
286 0.17
287 0.14
288 0.13
289 0.13
290 0.12
291 0.11
292 0.12
293 0.12
294 0.15
295 0.18
296 0.18
297 0.2
298 0.23
299 0.24
300 0.25
301 0.29
302 0.3
303 0.29
304 0.34
305 0.35
306 0.33
307 0.37
308 0.38
309 0.36
310 0.35
311 0.36
312 0.37
313 0.39
314 0.41
315 0.35
316 0.4
317 0.39
318 0.37
319 0.35
320 0.34
321 0.35
322 0.3
323 0.29
324 0.25
325 0.32
326 0.32
327 0.34
328 0.28
329 0.23
330 0.22
331 0.22
332 0.18
333 0.1
334 0.1
335 0.08
336 0.08
337 0.07
338 0.07
339 0.06
340 0.06
341 0.06
342 0.06
343 0.06
344 0.06
345 0.09
346 0.09
347 0.09
348 0.1
349 0.14
350 0.18
351 0.23
352 0.25
353 0.28
354 0.27
355 0.27
356 0.27
357 0.22
358 0.19
359 0.14
360 0.12
361 0.07
362 0.07
363 0.07
364 0.07
365 0.07
366 0.05
367 0.05
368 0.07
369 0.08
370 0.09
371 0.11
372 0.15
373 0.16
374 0.2
375 0.21
376 0.21
377 0.22
378 0.27
379 0.26
380 0.22
381 0.22
382 0.2
383 0.19
384 0.17
385 0.16
386 0.1
387 0.1
388 0.11
389 0.11
390 0.12
391 0.12
392 0.12
393 0.14
394 0.16
395 0.18
396 0.19
397 0.24
398 0.3
399 0.39
400 0.48
401 0.57
402 0.66
403 0.74
404 0.82
405 0.86
406 0.88
407 0.89
408 0.9
409 0.88
410 0.86
411 0.83
412 0.73
413 0.64
414 0.55
415 0.46
416 0.35
417 0.26
418 0.17
419 0.09
420 0.07
421 0.06
422 0.05
423 0.04
424 0.03
425 0.04
426 0.04
427 0.04
428 0.05
429 0.07
430 0.09
431 0.11
432 0.12
433 0.12
434 0.13
435 0.13
436 0.13
437 0.12
438 0.11
439 0.1
440 0.09
441 0.1
442 0.12
443 0.13
444 0.15
445 0.16
446 0.17
447 0.22
448 0.23
449 0.22
450 0.25
451 0.26
452 0.24
453 0.25
454 0.24
455 0.2
456 0.21
457 0.22
458 0.17
459 0.15
460 0.15
461 0.14
462 0.15
463 0.14
464 0.13
465 0.13
466 0.14
467 0.14
468 0.16
469 0.17
470 0.17
471 0.18
472 0.17
473 0.16
474 0.16
475 0.19
476 0.2
477 0.2
478 0.2
479 0.21
480 0.22
481 0.24
482 0.23
483 0.19
484 0.16
485 0.14
486 0.16
487 0.14
488 0.13
489 0.11
490 0.14
491 0.14
492 0.13
493 0.13
494 0.1
495 0.1
496 0.12
497 0.16
498 0.14
499 0.14
500 0.15
501 0.16
502 0.16
503 0.17
504 0.16
505 0.13
506 0.15
507 0.15
508 0.14
509 0.15
510 0.16
511 0.18
512 0.18
513 0.18
514 0.22
515 0.27
516 0.3
517 0.31
518 0.36
519 0.36
520 0.39
521 0.46
522 0.42
523 0.4
524 0.39
525 0.4
526 0.36
527 0.42
528 0.42
529 0.36
530 0.36
531 0.35
532 0.34
533 0.32
534 0.29
535 0.24
536 0.25
537 0.26
538 0.26
539 0.26
540 0.24
541 0.27
542 0.3