FuNGI

E3JWS2

Protein Details

Accession

E3JWS2

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
426-451	FNPVGHFRTLRKRRPKPQEPVHEDGD	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
436-441	RKRRPK

Subcellular Location(s)

nucl 14.5, cyto_nucl 10.333, cyto_mito 5.833, mito 5.5, cyto 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007133 RNA_pol_II-assoc_Paf1
Gene Ontology	GO:0016593 C:Cdc73/Paf1 complex GO:0003682 F:chromatin binding GO:0000993 F:RNA polymerase II complex binding GO:0016570 P:histone modification GO:0006368 P:transcription elongation by RNA polymerase II
KEGG	pgr:PGTG_02938 -
Pfam	View protein in Pfam PF03985 Paf1

Amino Acid Sequences

MLKIPLGTLTPSAFSQWQHQLHHADPQNPITSPSSQRFGYPFSIQEFTGSSLMSKKTAASPLLIRHRYQNPFPPPPFPPKLLHISTDPARYAGYRFLRNLEKEREVPVISDADLGIPIELGIEADGTYGLGAYWEGDRECICPDPNATRLPLDPEDLALLAEPPPAPGSSISITNGNPQNHTLTVQGTSHHSASASGSPVPSSVHIPERRKTEVSWLRRTEYFNDVQHKSRDSINNQKGRAQVPALPKTKTERLAGIHSTFEVIANKPIQSLKHPTKPNLKAVEAFELLPNESTWANTYDFFRFQENPTDRTDQSSSKLNTLDERLEHAILRPVEIKAGGPRLAYFLPESSEGVANYKRIKEERKMIDEADQTEEEKMDDPEAGAEAVNELRFVRDYEISQERPINQYLLIFDDGKASGRRKAAYFNPVGHFRTLRKRRPKPQEPVHEDGDGKPLWDGISVTIQNDPEVIDSIKAVRKELLAPVLEPPSGP

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.2
2	0.25
3	0.32
4	0.36
5	0.38
6	0.43
7	0.45
8	0.44
9	0.52
10	0.51
11	0.46
12	0.44
13	0.46
14	0.44
15	0.4
16	0.41
17	0.35
18	0.35
19	0.37
20	0.38
21	0.38
22	0.34
23	0.37
24	0.36
25	0.37
26	0.37
27	0.33
28	0.31
29	0.31
30	0.33
31	0.3
32	0.29
33	0.26
34	0.24
35	0.22
36	0.18
37	0.15
38	0.18
39	0.19
40	0.19
41	0.18
42	0.16
43	0.2
44	0.25
45	0.25
46	0.24
47	0.28
48	0.35
49	0.45
50	0.47
51	0.43
52	0.46
53	0.53
54	0.56
55	0.57
56	0.58
57	0.57
58	0.64
59	0.65
60	0.63
61	0.59
62	0.63
63	0.62
64	0.56
65	0.51
66	0.46
67	0.52
68	0.48
69	0.46
70	0.39
71	0.4
72	0.4
73	0.4
74	0.35
75	0.28
76	0.26
77	0.24
78	0.24
79	0.26
80	0.27
81	0.28
82	0.29
83	0.33
84	0.4
85	0.44
86	0.49
87	0.48
88	0.47
89	0.44
90	0.46
91	0.45
92	0.38
93	0.34
94	0.29
95	0.24
96	0.19
97	0.17
98	0.14
99	0.1
100	0.1
101	0.09
102	0.07
103	0.05
104	0.04
105	0.04
106	0.04
107	0.03
108	0.03
109	0.03
110	0.03
111	0.04
112	0.04
113	0.03
114	0.03
115	0.03
116	0.03
117	0.03
118	0.03
119	0.04
120	0.04
121	0.06
122	0.06
123	0.07
124	0.08
125	0.09
126	0.11
127	0.12
128	0.13
129	0.13
130	0.15
131	0.18
132	0.21
133	0.22
134	0.22
135	0.21
136	0.21
137	0.25
138	0.23
139	0.22
140	0.18
141	0.17
142	0.16
143	0.15
144	0.14
145	0.08
146	0.08
147	0.06
148	0.07
149	0.06
150	0.06
151	0.07
152	0.07
153	0.08
154	0.07
155	0.1
156	0.1
157	0.11
158	0.12
159	0.14
160	0.14
161	0.19
162	0.25
163	0.23
164	0.23
165	0.23
166	0.24
167	0.22
168	0.23
169	0.18
170	0.13
171	0.14
172	0.14
173	0.13
174	0.14
175	0.16
176	0.15
177	0.14
178	0.13
179	0.12
180	0.13
181	0.14
182	0.12
183	0.11
184	0.1
185	0.1
186	0.1
187	0.1
188	0.1
189	0.1
190	0.1
191	0.18
192	0.24
193	0.28
194	0.32
195	0.37
196	0.39
197	0.39
198	0.37
199	0.4
200	0.42
201	0.46
202	0.51
203	0.48
204	0.47
205	0.49
206	0.51
207	0.43
208	0.4
209	0.37
210	0.32
211	0.36
212	0.35
213	0.35
214	0.35
215	0.34
216	0.3
217	0.31
218	0.32
219	0.31
220	0.4
221	0.45
222	0.49
223	0.48
224	0.5
225	0.48
226	0.43
227	0.39
228	0.3
229	0.27
230	0.28
231	0.35
232	0.34
233	0.32
234	0.32
235	0.35
236	0.38
237	0.36
238	0.3
239	0.25
240	0.25
241	0.28
242	0.29
243	0.26
244	0.21
245	0.18
246	0.17
247	0.14
248	0.13
249	0.1
250	0.08
251	0.1
252	0.11
253	0.11
254	0.11
255	0.13
256	0.13
257	0.15
258	0.23
259	0.27
260	0.34
261	0.38
262	0.42
263	0.51
264	0.55
265	0.59
266	0.55
267	0.49
268	0.44
269	0.43
270	0.41
271	0.32
272	0.28
273	0.21
274	0.17
275	0.16
276	0.13
277	0.12
278	0.09
279	0.08
280	0.07
281	0.08
282	0.09
283	0.1
284	0.11
285	0.13
286	0.14
287	0.16
288	0.17
289	0.18
290	0.18
291	0.19
292	0.28
293	0.29
294	0.29
295	0.32
296	0.35
297	0.32
298	0.35
299	0.36
300	0.28
301	0.27
302	0.33
303	0.3
304	0.28
305	0.3
306	0.26
307	0.25
308	0.26
309	0.26
310	0.18
311	0.21
312	0.2
313	0.19
314	0.19
315	0.17
316	0.2
317	0.18
318	0.19
319	0.17
320	0.15
321	0.15
322	0.15
323	0.15
324	0.13
325	0.16
326	0.16
327	0.14
328	0.15
329	0.17
330	0.17
331	0.17
332	0.14
333	0.12
334	0.12
335	0.13
336	0.13
337	0.12
338	0.13
339	0.12
340	0.14
341	0.15
342	0.16
343	0.19
344	0.2
345	0.23
346	0.26
347	0.32
348	0.36
349	0.45
350	0.5
351	0.53
352	0.54
353	0.51
354	0.52
355	0.49
356	0.45
357	0.39
358	0.32
359	0.26
360	0.24
361	0.23
362	0.17
363	0.16
364	0.14
365	0.1
366	0.09
367	0.09
368	0.09
369	0.09
370	0.08
371	0.07
372	0.06
373	0.06
374	0.08
375	0.07
376	0.07
377	0.07
378	0.08
379	0.09
380	0.1
381	0.12
382	0.13
383	0.14
384	0.2
385	0.27
386	0.28
387	0.31
388	0.33
389	0.32
390	0.33
391	0.34
392	0.28
393	0.22
394	0.22
395	0.19
396	0.19
397	0.2
398	0.17
399	0.15
400	0.17
401	0.17
402	0.19
403	0.22
404	0.21
405	0.24
406	0.27
407	0.3
408	0.29
409	0.35
410	0.39
411	0.44
412	0.46
413	0.47
414	0.48
415	0.51
416	0.52
417	0.49
418	0.45
419	0.42
420	0.49
421	0.53
422	0.58
423	0.63
424	0.72
425	0.79
426	0.87
427	0.91
428	0.91
429	0.92
430	0.93
431	0.9
432	0.85
433	0.79
434	0.71
435	0.62
436	0.53
437	0.48
438	0.36
439	0.28
440	0.22
441	0.19
442	0.15
443	0.15
444	0.14
445	0.1
446	0.18
447	0.18
448	0.19
449	0.22
450	0.22
451	0.21
452	0.2
453	0.19
454	0.12
455	0.14
456	0.14
457	0.11
458	0.12
459	0.17
460	0.22
461	0.22
462	0.22
463	0.22
464	0.23
465	0.26
466	0.3
467	0.31
468	0.28
469	0.28
470	0.31
471	0.32

E3JWS2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer