FuNGI

E3KLJ0

Protein Details

Accession

E3KLJ0

Localization Confidence

High

Confidence Score

20.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
49-68	KSYVPGKTRRNKTKVEIPSR	Hydrophilic
273-295	AGSNTKSRPNKPPKSKRAGRGAD	Hydrophilic
460-486	GITSKPDHPSTRKKQNSKTAPPSSSNP	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
279-292	SRPNKPPKSKRAGR
377-400	EGPGGSKKSGRGGGAAGRGGKGGK

Subcellular Location(s)

nucl 19.5, cyto_nucl 11, mito 6

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR039722 Upf3 IPR005120 UPF3_dom
Gene Ontology	GO:0005737 C:cytoplasm GO:0005730 C:nucleolus GO:0003729 F:mRNA binding GO:0000184 P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay GO:0045727 P:positive regulation of translation
KEGG	pgr:PGTG_11334 -
Pfam	View protein in Pfam PF03467 Smg4_UPF3
CDD	cd12455 RRM_like_Smg4_UPF3

Amino Acid Sequences

MSERTKLVVRHLPPSLPEEVFWKTLSRWLEPIPREDGTLDPPRCTATFKSYVPGKTRRNKTKVEIPSRAYIQFATPDQVVEFHQGYASQAFRDSHGNVTFPKVEFAPYQKVAGPPKKIDSRIGTIDTDHDYQAFLARLNAPVPEPNTNPDKPDEAPEKVERPEITPLIEHLRNARQAAQEAALTAKQQRQAATSAKSTSGRSFAGPPQIMKRVATNNESNQPTGVSSRKSGDPASHDPPPHKIDSAPSTSKGVKQTGKSSSTAAASTGQTTSAGSNTKSRPNKPPKSKRAGRGADDQSSHPPATDSQGKSSASTQQPKMILQPPKPSDSNSEKQTSTTPKNPTQSPAKSGKKQGSSLAEQGQGSQNGPTKPPNSTREGPGGSKKSGRGGGAAGRGGKGGKTTTGPGNPTSQATQPSSSSSSAPVATAATQKPKNHEPAKTEPNSSETAAARRRLGNALAGITSKPDHPSTRKKQNSKTAPPSSSNPPPAD

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.46
2	0.43
3	0.35
4	0.32
5	0.29
6	0.29
7	0.29
8	0.27
9	0.25
10	0.21
11	0.25
12	0.28
13	0.27
14	0.27
15	0.32
16	0.4
17	0.4
18	0.44
19	0.44
20	0.41
21	0.39
22	0.37
23	0.33
24	0.31
25	0.38
26	0.35
27	0.31
28	0.31
29	0.33
30	0.32
31	0.34
32	0.3
33	0.29
34	0.34
35	0.34
36	0.41
37	0.44
38	0.5
39	0.53
40	0.59
41	0.61
42	0.64
43	0.74
44	0.77
45	0.78
46	0.79
47	0.79
48	0.79
49	0.8
50	0.8
51	0.77
52	0.71
53	0.7
54	0.67
55	0.6
56	0.51
57	0.41
58	0.33
59	0.29
60	0.26
61	0.22
62	0.18
63	0.18
64	0.17
65	0.18
66	0.17
67	0.17
68	0.17
69	0.14
70	0.14
71	0.13
72	0.15
73	0.16
74	0.16
75	0.12
76	0.14
77	0.15
78	0.16
79	0.2
80	0.2
81	0.23
82	0.24
83	0.25
84	0.23
85	0.27
86	0.29
87	0.25
88	0.25
89	0.2
90	0.2
91	0.21
92	0.26
93	0.28
94	0.26
95	0.27
96	0.28
97	0.33
98	0.39
99	0.44
100	0.44
101	0.4
102	0.46
103	0.51
104	0.51
105	0.52
106	0.49
107	0.47
108	0.46
109	0.45
110	0.39
111	0.32
112	0.33
113	0.3
114	0.27
115	0.21
116	0.17
117	0.14
118	0.13
119	0.16
120	0.14
121	0.1
122	0.11
123	0.11
124	0.13
125	0.13
126	0.13
127	0.11
128	0.14
129	0.16
130	0.18
131	0.19
132	0.21
133	0.27
134	0.27
135	0.28
136	0.27
137	0.28
138	0.25
139	0.3
140	0.32
141	0.28
142	0.32
143	0.34
144	0.35
145	0.33
146	0.36
147	0.29
148	0.27
149	0.29
150	0.25
151	0.23
152	0.2
153	0.2
154	0.22
155	0.23
156	0.2
157	0.2
158	0.23
159	0.24
160	0.25
161	0.27
162	0.23
163	0.23
164	0.24
165	0.21
166	0.16
167	0.14
168	0.14
169	0.11
170	0.1
171	0.12
172	0.13
173	0.16
174	0.18
175	0.18
176	0.19
177	0.22
178	0.26
179	0.27
180	0.26
181	0.24
182	0.25
183	0.26
184	0.25
185	0.23
186	0.21
187	0.19
188	0.17
189	0.19
190	0.19
191	0.25
192	0.24
193	0.24
194	0.25
195	0.29
196	0.28
197	0.26
198	0.26
199	0.24
200	0.27
201	0.3
202	0.3
203	0.28
204	0.35
205	0.35
206	0.32
207	0.27
208	0.24
209	0.2
210	0.19
211	0.18
212	0.13
213	0.13
214	0.15
215	0.17
216	0.18
217	0.18
218	0.18
219	0.21
220	0.26
221	0.28
222	0.29
223	0.29
224	0.29
225	0.33
226	0.34
227	0.29
228	0.23
229	0.2
230	0.2
231	0.23
232	0.28
233	0.24
234	0.22
235	0.24
236	0.24
237	0.27
238	0.27
239	0.28
240	0.26
241	0.26
242	0.31
243	0.34
244	0.35
245	0.33
246	0.31
247	0.28
248	0.25
249	0.22
250	0.17
251	0.14
252	0.12
253	0.12
254	0.11
255	0.09
256	0.08
257	0.08
258	0.08
259	0.08
260	0.09
261	0.09
262	0.14
263	0.17
264	0.25
265	0.31
266	0.35
267	0.44
268	0.53
269	0.63
270	0.68
271	0.77
272	0.79
273	0.84
274	0.87
275	0.84
276	0.83
277	0.79
278	0.72
279	0.7
280	0.65
281	0.58
282	0.53
283	0.46
284	0.4
285	0.37
286	0.32
287	0.23
288	0.19
289	0.16
290	0.19
291	0.25
292	0.22
293	0.22
294	0.26
295	0.27
296	0.27
297	0.28
298	0.31
299	0.3
300	0.35
301	0.33
302	0.34
303	0.35
304	0.34
305	0.38
306	0.38
307	0.38
308	0.36
309	0.45
310	0.43
311	0.46
312	0.46
313	0.43
314	0.43
315	0.44
316	0.46
317	0.42
318	0.43
319	0.38
320	0.39
321	0.43
322	0.43
323	0.41
324	0.42
325	0.44
326	0.46
327	0.51
328	0.52
329	0.51
330	0.53
331	0.5
332	0.49
333	0.53
334	0.55
335	0.56
336	0.61
337	0.63
338	0.59
339	0.58
340	0.57
341	0.53
342	0.49
343	0.47
344	0.44
345	0.39
346	0.34
347	0.34
348	0.31
349	0.26
350	0.23
351	0.22
352	0.23
353	0.21
354	0.23
355	0.27
356	0.25
357	0.29
358	0.37
359	0.38
360	0.41
361	0.43
362	0.45
363	0.47
364	0.49
365	0.47
366	0.48
367	0.48
368	0.44
369	0.45
370	0.42
371	0.4
372	0.4
373	0.37
374	0.3
375	0.28
376	0.29
377	0.29
378	0.3
379	0.25
380	0.22
381	0.22
382	0.21
383	0.18
384	0.15
385	0.13
386	0.12
387	0.14
388	0.17
389	0.23
390	0.27
391	0.29
392	0.29
393	0.32
394	0.31
395	0.32
396	0.31
397	0.28
398	0.28
399	0.29
400	0.29
401	0.26
402	0.29
403	0.29
404	0.28
405	0.26
406	0.23
407	0.22
408	0.2
409	0.2
410	0.16
411	0.14
412	0.14
413	0.19
414	0.2
415	0.26
416	0.32
417	0.35
418	0.41
419	0.47
420	0.56
421	0.57
422	0.6
423	0.59
424	0.63
425	0.7
426	0.68
427	0.64
428	0.56
429	0.53
430	0.49
431	0.43
432	0.38
433	0.31
434	0.34
435	0.36
436	0.38
437	0.38
438	0.38
439	0.4
440	0.39
441	0.38
442	0.34
443	0.3
444	0.29
445	0.26
446	0.24
447	0.21
448	0.2
449	0.2
450	0.17
451	0.19
452	0.22
453	0.28
454	0.36
455	0.47
456	0.55
457	0.65
458	0.73
459	0.79
460	0.85
461	0.88
462	0.91
463	0.9
464	0.91
465	0.89
466	0.85
467	0.8
468	0.76
469	0.73
470	0.72

E3KLJ0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer