Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

E3L1K1

Protein Details
Accession E3L1K1    Localization Confidence Low Confidence Score 7.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
40-59DPYCKPLLCRIRKPEDNIKSHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 9.5, mito 8, cyto_nucl 8, cyto 5.5, extr 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007275  YTH_domain  
IPR045168  YTH_prot  
Gene Ontology GO:0005654  C:nucleoplasm  
GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:1990247  F:N6-methyladenosine-containing RNA binding  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
GO:0000381  P:regulation of alternative mRNA splicing, via spliceosome  
KEGG pgr:PGTG_16013  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04146  YTH  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50882  YTH  
CDD cd21134  YTH  
Amino Acid Sequences MLSGIHLIARSNCAFVNYLSHPHLNQAISLCNGKPLRPLDPYCKPLLCRIRKPEDNIKSGVGAQRIGGLHRSWVKRSADHPPSSHHNQFNKHRHTLPPSSTTTQNTKNLHNNNNNRENIHHQQQQHSNSLNEPSTTNLRTSSTLTAASNQSQSTTSSFLASHFPRRYFILKAYTDEDLRISVDRSIWVSQAHNEPILDQAYRTSGEGVFLIFSANQSGSFFGYARMAGPIAGVRGRRQSLPPASPPTEASIKAAAGRTRSASIGTPDRALEGLFVDLPPSASPRALSPVLPELPLRWPGSPVRRSLPILGPPRTPQSVLQPSSTISNTTTPTLTKDPHSTNTTLPFTSPLLSHDHHQLIPDAHPAQILVQDRNQQSTHDHHDNGDGEDDDEDDEDKLMSGKPFKVEWIRVQKLSFYRTKNLRNPFNGNREVKVSRDGTEVEPSIGAAIVAEIENEFNRHHHHHHHQIHQVQQDQQIHHQQDQHHHTQPSSSSSGLSALQDQHFQA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.19
3 0.24
4 0.22
5 0.27
6 0.29
7 0.32
8 0.3
9 0.32
10 0.37
11 0.3
12 0.29
13 0.26
14 0.25
15 0.25
16 0.28
17 0.24
18 0.27
19 0.28
20 0.27
21 0.32
22 0.32
23 0.36
24 0.4
25 0.46
26 0.47
27 0.54
28 0.58
29 0.57
30 0.57
31 0.53
32 0.55
33 0.6
34 0.61
35 0.61
36 0.67
37 0.71
38 0.73
39 0.8
40 0.81
41 0.79
42 0.74
43 0.67
44 0.59
45 0.5
46 0.47
47 0.43
48 0.34
49 0.26
50 0.21
51 0.23
52 0.22
53 0.22
54 0.22
55 0.17
56 0.22
57 0.29
58 0.33
59 0.31
60 0.38
61 0.4
62 0.42
63 0.46
64 0.5
65 0.52
66 0.53
67 0.52
68 0.5
69 0.55
70 0.59
71 0.63
72 0.6
73 0.58
74 0.61
75 0.7
76 0.75
77 0.75
78 0.72
79 0.69
80 0.67
81 0.69
82 0.68
83 0.63
84 0.59
85 0.57
86 0.55
87 0.55
88 0.52
89 0.51
90 0.5
91 0.52
92 0.48
93 0.49
94 0.54
95 0.58
96 0.63
97 0.67
98 0.69
99 0.7
100 0.76
101 0.71
102 0.64
103 0.59
104 0.58
105 0.55
106 0.53
107 0.5
108 0.44
109 0.5
110 0.56
111 0.57
112 0.54
113 0.5
114 0.43
115 0.39
116 0.41
117 0.34
118 0.27
119 0.23
120 0.21
121 0.23
122 0.23
123 0.22
124 0.19
125 0.2
126 0.2
127 0.23
128 0.22
129 0.18
130 0.19
131 0.19
132 0.21
133 0.21
134 0.22
135 0.21
136 0.18
137 0.18
138 0.16
139 0.17
140 0.16
141 0.16
142 0.14
143 0.14
144 0.14
145 0.14
146 0.19
147 0.2
148 0.27
149 0.28
150 0.29
151 0.29
152 0.32
153 0.34
154 0.31
155 0.33
156 0.32
157 0.3
158 0.31
159 0.32
160 0.31
161 0.28
162 0.26
163 0.22
164 0.15
165 0.14
166 0.12
167 0.1
168 0.09
169 0.09
170 0.1
171 0.12
172 0.12
173 0.12
174 0.13
175 0.13
176 0.15
177 0.18
178 0.18
179 0.17
180 0.16
181 0.15
182 0.16
183 0.16
184 0.13
185 0.09
186 0.09
187 0.09
188 0.1
189 0.1
190 0.09
191 0.08
192 0.08
193 0.08
194 0.08
195 0.07
196 0.06
197 0.06
198 0.05
199 0.05
200 0.05
201 0.05
202 0.05
203 0.05
204 0.06
205 0.06
206 0.07
207 0.07
208 0.07
209 0.07
210 0.07
211 0.07
212 0.07
213 0.07
214 0.06
215 0.06
216 0.05
217 0.06
218 0.08
219 0.08
220 0.09
221 0.13
222 0.14
223 0.15
224 0.16
225 0.23
226 0.26
227 0.29
228 0.32
229 0.34
230 0.35
231 0.34
232 0.34
233 0.3
234 0.27
235 0.23
236 0.2
237 0.15
238 0.13
239 0.14
240 0.15
241 0.14
242 0.13
243 0.13
244 0.13
245 0.13
246 0.13
247 0.12
248 0.11
249 0.13
250 0.16
251 0.16
252 0.16
253 0.14
254 0.15
255 0.14
256 0.13
257 0.1
258 0.06
259 0.06
260 0.05
261 0.05
262 0.05
263 0.05
264 0.05
265 0.05
266 0.06
267 0.06
268 0.06
269 0.07
270 0.07
271 0.12
272 0.12
273 0.12
274 0.12
275 0.16
276 0.17
277 0.17
278 0.16
279 0.13
280 0.15
281 0.19
282 0.19
283 0.15
284 0.17
285 0.21
286 0.3
287 0.31
288 0.32
289 0.31
290 0.33
291 0.34
292 0.36
293 0.35
294 0.34
295 0.38
296 0.38
297 0.37
298 0.35
299 0.37
300 0.35
301 0.32
302 0.25
303 0.28
304 0.34
305 0.34
306 0.33
307 0.3
308 0.29
309 0.3
310 0.29
311 0.21
312 0.14
313 0.15
314 0.15
315 0.16
316 0.16
317 0.14
318 0.18
319 0.2
320 0.2
321 0.2
322 0.25
323 0.27
324 0.31
325 0.35
326 0.33
327 0.32
328 0.37
329 0.36
330 0.3
331 0.27
332 0.24
333 0.21
334 0.2
335 0.18
336 0.13
337 0.16
338 0.17
339 0.18
340 0.22
341 0.24
342 0.23
343 0.23
344 0.24
345 0.21
346 0.21
347 0.24
348 0.19
349 0.17
350 0.16
351 0.15
352 0.13
353 0.16
354 0.18
355 0.15
356 0.17
357 0.24
358 0.25
359 0.29
360 0.29
361 0.25
362 0.26
363 0.3
364 0.35
365 0.34
366 0.34
367 0.31
368 0.36
369 0.36
370 0.33
371 0.29
372 0.21
373 0.16
374 0.15
375 0.15
376 0.1
377 0.09
378 0.09
379 0.07
380 0.07
381 0.06
382 0.06
383 0.07
384 0.09
385 0.11
386 0.14
387 0.16
388 0.18
389 0.19
390 0.24
391 0.3
392 0.33
393 0.4
394 0.46
395 0.49
396 0.5
397 0.5
398 0.51
399 0.49
400 0.5
401 0.48
402 0.43
403 0.46
404 0.52
405 0.61
406 0.64
407 0.69
408 0.71
409 0.71
410 0.75
411 0.75
412 0.75
413 0.75
414 0.69
415 0.62
416 0.59
417 0.54
418 0.47
419 0.46
420 0.39
421 0.31
422 0.31
423 0.32
424 0.28
425 0.32
426 0.31
427 0.24
428 0.22
429 0.2
430 0.17
431 0.15
432 0.12
433 0.06
434 0.05
435 0.05
436 0.05
437 0.05
438 0.05
439 0.06
440 0.07
441 0.09
442 0.09
443 0.1
444 0.16
445 0.21
446 0.26
447 0.35
448 0.43
449 0.53
450 0.61
451 0.68
452 0.71
453 0.72
454 0.74
455 0.72
456 0.67
457 0.61
458 0.6
459 0.58
460 0.52
461 0.53
462 0.55
463 0.52
464 0.51
465 0.51
466 0.48
467 0.52
468 0.57
469 0.58
470 0.56
471 0.55
472 0.51
473 0.51
474 0.49
475 0.46
476 0.41
477 0.33
478 0.26
479 0.25
480 0.27
481 0.23
482 0.22
483 0.2
484 0.22
485 0.23