Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

E3KAP9

Protein Details
Accession E3KAP9    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
84-107RTELTRTAKRTRKREKPLSEEEQEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
95-97RKR
Subcellular Location(s) mito 20, nucl 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR020103  PsdUridine_synth_cat_dom_sf  
IPR006145  PsdUridine_synth_RsuA/RluA  
Gene Ontology GO:0009982  F:pseudouridine synthase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000455  P:enzyme-directed rRNA pseudouridine synthesis  
KEGG pgr:PGTG_07077  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00849  PseudoU_synth_2  
CDD cd02869  PseudoU_synth_RluA_like  
Amino Acid Sequences MASKSLHSKLRSLLPRRCPHIRTATTAAATRGTTQANSHYPPSSTQIKRPSTSSYVPSTRSKMSFTRPTPSQIDPVLNTNETDRTELTRTAKRTRKREKPLSEEEQEKQRLEREEELTANLEKSFKPPKILFENEKVVVIDKPAGCALQAELGSEAYIRWKLIMDYLEKRRGKLFIVHRLDKSTTGPLILAKSSTASRTLSTQFKNSTVKKTYYAAIQFLGDRIGPIQDAKSSGQIECRMRDSKDRMVIAESNRTGTDCKQTKTNWELVTATSNHAIVRLTPQTGRKHQLRLHCSRFLAGPIVGDFKYDFRYLSYQSQKAIHNFLNREAPGRLLLHCSEIEFKLYKKEQPREYTVRVSSPLHDDFRIVCDQLDLSTNAIH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.66
2 0.72
3 0.76
4 0.79
5 0.72
6 0.71
7 0.73
8 0.67
9 0.64
10 0.62
11 0.6
12 0.54
13 0.54
14 0.46
15 0.38
16 0.35
17 0.29
18 0.26
19 0.22
20 0.2
21 0.2
22 0.25
23 0.28
24 0.3
25 0.31
26 0.3
27 0.3
28 0.31
29 0.35
30 0.38
31 0.36
32 0.41
33 0.48
34 0.52
35 0.53
36 0.53
37 0.55
38 0.51
39 0.52
40 0.49
41 0.48
42 0.46
43 0.48
44 0.51
45 0.48
46 0.47
47 0.44
48 0.44
49 0.41
50 0.45
51 0.5
52 0.48
53 0.52
54 0.49
55 0.52
56 0.53
57 0.5
58 0.46
59 0.39
60 0.39
61 0.33
62 0.35
63 0.33
64 0.29
65 0.27
66 0.24
67 0.24
68 0.21
69 0.22
70 0.18
71 0.19
72 0.21
73 0.25
74 0.28
75 0.32
76 0.36
77 0.43
78 0.5
79 0.55
80 0.63
81 0.7
82 0.75
83 0.79
84 0.85
85 0.85
86 0.86
87 0.86
88 0.83
89 0.78
90 0.72
91 0.65
92 0.63
93 0.57
94 0.49
95 0.41
96 0.39
97 0.37
98 0.36
99 0.38
100 0.32
101 0.32
102 0.32
103 0.32
104 0.29
105 0.25
106 0.22
107 0.17
108 0.15
109 0.12
110 0.16
111 0.22
112 0.21
113 0.27
114 0.27
115 0.33
116 0.4
117 0.45
118 0.45
119 0.44
120 0.48
121 0.42
122 0.42
123 0.35
124 0.29
125 0.23
126 0.19
127 0.18
128 0.12
129 0.13
130 0.12
131 0.12
132 0.11
133 0.11
134 0.1
135 0.09
136 0.09
137 0.08
138 0.08
139 0.08
140 0.08
141 0.08
142 0.07
143 0.06
144 0.07
145 0.06
146 0.06
147 0.07
148 0.07
149 0.1
150 0.12
151 0.14
152 0.2
153 0.26
154 0.35
155 0.35
156 0.36
157 0.35
158 0.34
159 0.31
160 0.32
161 0.34
162 0.35
163 0.42
164 0.45
165 0.44
166 0.45
167 0.45
168 0.38
169 0.33
170 0.25
171 0.17
172 0.14
173 0.13
174 0.12
175 0.12
176 0.11
177 0.09
178 0.06
179 0.08
180 0.08
181 0.08
182 0.09
183 0.09
184 0.09
185 0.12
186 0.15
187 0.2
188 0.21
189 0.24
190 0.24
191 0.27
192 0.34
193 0.33
194 0.37
195 0.36
196 0.36
197 0.35
198 0.35
199 0.33
200 0.3
201 0.29
202 0.23
203 0.2
204 0.18
205 0.16
206 0.14
207 0.14
208 0.09
209 0.07
210 0.06
211 0.06
212 0.05
213 0.06
214 0.06
215 0.06
216 0.09
217 0.09
218 0.13
219 0.14
220 0.14
221 0.17
222 0.23
223 0.24
224 0.24
225 0.28
226 0.27
227 0.28
228 0.35
229 0.37
230 0.38
231 0.41
232 0.4
233 0.36
234 0.37
235 0.39
236 0.34
237 0.36
238 0.3
239 0.25
240 0.24
241 0.24
242 0.22
243 0.2
244 0.28
245 0.25
246 0.26
247 0.3
248 0.31
249 0.38
250 0.42
251 0.47
252 0.38
253 0.35
254 0.35
255 0.3
256 0.34
257 0.27
258 0.24
259 0.18
260 0.18
261 0.15
262 0.15
263 0.14
264 0.1
265 0.14
266 0.15
267 0.16
268 0.19
269 0.26
270 0.33
271 0.39
272 0.46
273 0.45
274 0.51
275 0.53
276 0.6
277 0.62
278 0.65
279 0.65
280 0.63
281 0.59
282 0.52
283 0.49
284 0.41
285 0.35
286 0.26
287 0.2
288 0.16
289 0.18
290 0.17
291 0.16
292 0.15
293 0.13
294 0.16
295 0.16
296 0.15
297 0.14
298 0.19
299 0.22
300 0.31
301 0.37
302 0.36
303 0.39
304 0.43
305 0.45
306 0.45
307 0.47
308 0.43
309 0.42
310 0.42
311 0.43
312 0.46
313 0.41
314 0.41
315 0.36
316 0.33
317 0.29
318 0.28
319 0.25
320 0.22
321 0.22
322 0.22
323 0.22
324 0.22
325 0.22
326 0.21
327 0.24
328 0.22
329 0.22
330 0.28
331 0.32
332 0.37
333 0.43
334 0.52
335 0.57
336 0.62
337 0.71
338 0.69
339 0.72
340 0.73
341 0.67
342 0.62
343 0.57
344 0.51
345 0.45
346 0.44
347 0.44
348 0.39
349 0.35
350 0.33
351 0.3
352 0.33
353 0.33
354 0.27
355 0.21
356 0.19
357 0.19
358 0.19
359 0.21
360 0.17