FuNGI

E3JQ84

Protein Details

Accession

E3JQ84

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
404-434	PSPISIPSEKSKKTKKKKPLKRPADALEDKP	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
413-426	KSKKTKKKKPLKRP

Subcellular Location(s)

mito 15, mito_nucl 12.166, cyto_mito 10.166, nucl 8, cyto_nucl 6.666

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR041178 RPA43_OB IPR045113 Rpb7-like
Gene Ontology	GO:0005736 C:RNA polymerase I complex GO:0006352 P:DNA-templated transcription initiation GO:0006360 P:transcription by RNA polymerase I
KEGG	pgr:PGTG_00330 -
Pfam	View protein in Pfam PF17875 RPA43_OB

Amino Acid Sequences

MSHSKPSSSTRKPTDFHHLTARLKLPLAPVFLTKPMSKTTTIEMKAEEEESVKEEMDDLESDSDQSTKDLKKTLTEPDRIDEEYGNSGVLEAINQSLASLMMKYIPSLGSVLVSYLEPPMFILKDPSEGAAEEIRRPATKTSRLPVPTLPGNGWGVVDVEVKLLGWRPTIGQKLVGRPTLSSPSHLSLVIYRTFNASINENHLRAAGFHYDINFEVPAHWKSIVEPANPQDQSLSTNLPLEHHQDRGCWVDANGAVVGDDQGTVSFTVMGLTIANHMISVVGSLLDDPFSIESPARASQPSPRMTAMKQRLSGPGPVDSESSTDNSEDEGGRSKAASLRGRMKAPPAIQSGTALRPIAVHPHTVAIPTVTPTASSSLQPPPLTATNLKALDSAHLQPSFPVSHPSPISIPSEKSKKTKKKKPLKRPADALEDKPSLARNPSSPLPNQPTNPSAAIPPPLSSTNSSRKKKLKTN

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.71
2	0.66
3	0.61
4	0.61
5	0.59
6	0.55
7	0.6
8	0.59
9	0.5
10	0.46
11	0.44
12	0.4
13	0.36
14	0.36
15	0.3
16	0.29
17	0.29
18	0.31
19	0.33
20	0.29
21	0.27
22	0.28
23	0.3
24	0.3
25	0.29
26	0.32
27	0.38
28	0.39
29	0.38
30	0.35
31	0.34
32	0.34
33	0.33
34	0.27
35	0.18
36	0.17
37	0.18
38	0.17
39	0.15
40	0.13
41	0.12
42	0.12
43	0.13
44	0.12
45	0.11
46	0.12
47	0.12
48	0.13
49	0.13
50	0.13
51	0.11
52	0.12
53	0.16
54	0.18
55	0.21
56	0.26
57	0.27
58	0.32
59	0.35
60	0.44
61	0.46
62	0.49
63	0.48
64	0.47
65	0.49
66	0.45
67	0.43
68	0.34
69	0.28
70	0.24
71	0.22
72	0.18
73	0.14
74	0.12
75	0.11
76	0.1
77	0.08
78	0.05
79	0.05
80	0.06
81	0.05
82	0.05
83	0.05
84	0.05
85	0.06
86	0.05
87	0.05
88	0.07
89	0.08
90	0.08
91	0.09
92	0.09
93	0.09
94	0.1
95	0.1
96	0.08
97	0.08
98	0.08
99	0.07
100	0.07
101	0.07
102	0.08
103	0.08
104	0.07
105	0.07
106	0.09
107	0.09
108	0.09
109	0.12
110	0.11
111	0.14
112	0.15
113	0.15
114	0.14
115	0.13
116	0.15
117	0.15
118	0.16
119	0.15
120	0.17
121	0.18
122	0.17
123	0.19
124	0.23
125	0.26
126	0.33
127	0.37
128	0.39
129	0.46
130	0.47
131	0.48
132	0.45
133	0.43
134	0.38
135	0.35
136	0.3
137	0.25
138	0.23
139	0.21
140	0.19
141	0.14
142	0.11
143	0.1
144	0.1
145	0.08
146	0.07
147	0.07
148	0.07
149	0.07
150	0.08
151	0.08
152	0.08
153	0.08
154	0.1
155	0.15
156	0.18
157	0.18
158	0.22
159	0.24
160	0.29
161	0.33
162	0.34
163	0.29
164	0.27
165	0.29
166	0.31
167	0.29
168	0.25
169	0.24
170	0.23
171	0.24
172	0.23
173	0.2
174	0.15
175	0.17
176	0.18
177	0.16
178	0.14
179	0.15
180	0.15
181	0.16
182	0.15
183	0.15
184	0.13
185	0.19
186	0.21
187	0.2
188	0.19
189	0.18
190	0.17
191	0.15
192	0.17
193	0.12
194	0.1
195	0.1
196	0.11
197	0.11
198	0.11
199	0.12
200	0.1
201	0.08
202	0.08
203	0.11
204	0.11
205	0.11
206	0.11
207	0.1
208	0.11
209	0.18
210	0.21
211	0.18
212	0.2
213	0.2
214	0.27
215	0.27
216	0.26
217	0.19
218	0.16
219	0.18
220	0.17
221	0.16
222	0.09
223	0.11
224	0.11
225	0.12
226	0.13
227	0.16
228	0.16
229	0.17
230	0.17
231	0.15
232	0.17
233	0.19
234	0.18
235	0.14
236	0.13
237	0.13
238	0.13
239	0.14
240	0.12
241	0.09
242	0.08
243	0.07
244	0.07
245	0.05
246	0.04
247	0.03
248	0.03
249	0.04
250	0.04
251	0.04
252	0.04
253	0.04
254	0.04
255	0.04
256	0.04
257	0.04
258	0.04
259	0.05
260	0.05
261	0.05
262	0.04
263	0.04
264	0.04
265	0.04
266	0.04
267	0.03
268	0.03
269	0.03
270	0.03
271	0.03
272	0.04
273	0.04
274	0.04
275	0.04
276	0.05
277	0.06
278	0.06
279	0.06
280	0.09
281	0.1
282	0.11
283	0.11
284	0.12
285	0.18
286	0.25
287	0.28
288	0.27
289	0.28
290	0.3
291	0.31
292	0.4
293	0.41
294	0.4
295	0.39
296	0.39
297	0.42
298	0.41
299	0.42
300	0.34
301	0.3
302	0.26
303	0.24
304	0.23
305	0.19
306	0.18
307	0.16
308	0.16
309	0.12
310	0.11
311	0.1
312	0.1
313	0.11
314	0.1
315	0.1
316	0.13
317	0.13
318	0.13
319	0.13
320	0.13
321	0.15
322	0.22
323	0.25
324	0.26
325	0.35
326	0.39
327	0.42
328	0.42
329	0.43
330	0.42
331	0.39
332	0.4
333	0.35
334	0.32
335	0.3
336	0.31
337	0.3
338	0.25
339	0.26
340	0.2
341	0.16
342	0.15
343	0.15
344	0.2
345	0.18
346	0.18
347	0.16
348	0.18
349	0.18
350	0.18
351	0.18
352	0.12
353	0.11
354	0.12
355	0.12
356	0.1
357	0.11
358	0.11
359	0.14
360	0.14
361	0.14
362	0.16
363	0.2
364	0.25
365	0.25
366	0.24
367	0.26
368	0.27
369	0.3
370	0.28
371	0.26
372	0.29
373	0.29
374	0.29
375	0.26
376	0.23
377	0.22
378	0.24
379	0.24
380	0.22
381	0.22
382	0.21
383	0.21
384	0.24
385	0.24
386	0.21
387	0.24
388	0.2
389	0.26
390	0.27
391	0.29
392	0.27
393	0.27
394	0.32
395	0.3
396	0.31
397	0.33
398	0.41
399	0.44
400	0.52
401	0.6
402	0.66
403	0.73
404	0.8
405	0.83
406	0.86
407	0.91
408	0.94
409	0.94
410	0.94
411	0.93
412	0.92
413	0.88
414	0.87
415	0.82
416	0.75
417	0.72
418	0.62
419	0.53
420	0.45
421	0.41
422	0.33
423	0.32
424	0.3
425	0.25
426	0.3
427	0.35
428	0.39
429	0.4
430	0.46
431	0.5
432	0.53
433	0.54
434	0.54
435	0.51
436	0.49
437	0.47
438	0.39
439	0.34
440	0.31
441	0.33
442	0.28
443	0.27
444	0.26
445	0.27
446	0.29
447	0.3
448	0.34
449	0.4
450	0.49
451	0.54
452	0.6
453	0.67

E3JQ84

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer