Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

E3JXL4

Protein Details
Accession E3JXL4    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
200-221AATPSRSPKSRKKSNSASKSHSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
205-214RSPKSRKKSN
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR031398  She3  
Gene Ontology GO:0005789  C:endoplasmic reticulum membrane  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0048309  P:endoplasmic reticulum inheritance  
GO:0051028  P:mRNA transport  
KEGG pgr:PGTG_02250  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF17078  SHE3  
Amino Acid Sequences MDSKPASSSSSSRAHPSSRKTSISADSRRSLSISPTNSRTTHQKSQLPLPLRTQESNILSPSSTKFSQLKAFHRSVSSSSADQLAQRPPRTLSRKPSSTKTLPTKNSNCNFKSAQSTPPTPNGQPTHQNHQVTMLKEQLAKLQSELRIARGQVATLDNQLTRSKTPPSKTPPFGSSLSSSQRLQQQQQHPSSHSTQPSRAATPSRSPKSRKKSNSASKSHSLRKSSSSANSEQTDGLSIRFISGPGIHSSRSPQPSSIMDDSSLPISDSGYIKDPDGVWVPLNSPPAHSPSLNLSSSARYKSPSPSEAPRGISRIPISAVALGRVLAGDPLVPDHQSFQADIAEEQEPAEDHCDSVPRNSEYSSGASLSSPQIDDQNTTASTEPPGSHPPAVSRQPRGNPFFSSGGGRDRGAMIHQNSNADRTTNGGNTGKVITTLQSDLLYARTALDQSKSQLRLSQRAVESLNRQTEDLKESMSRLRLENEGLSKMLSRKERTVSELMDRLKRSEAELSTLKQEKKELDVNFKKISKETDEVVKDSVRRRDRAETQYEAVRSGVKSLSEGWKRDVTTLKQDICRLEEKHRKEMEDSRLKYNTLAKLHASRSGALSRIETDLNNLQSSKEGFIAKYTSELSGLRAHLEEEEKKSSEGLQLAKEVSDECARFKRILRNHSTGSSSSSSAAAPGPPHPKLKP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.46
2 0.5
3 0.56
4 0.59
5 0.59
6 0.61
7 0.58
8 0.6
9 0.6
10 0.63
11 0.62
12 0.6
13 0.58
14 0.56
15 0.54
16 0.51
17 0.43
18 0.4
19 0.4
20 0.4
21 0.41
22 0.44
23 0.48
24 0.47
25 0.49
26 0.52
27 0.52
28 0.55
29 0.57
30 0.58
31 0.58
32 0.66
33 0.71
34 0.67
35 0.62
36 0.59
37 0.58
38 0.58
39 0.55
40 0.48
41 0.47
42 0.46
43 0.45
44 0.4
45 0.34
46 0.29
47 0.3
48 0.3
49 0.28
50 0.23
51 0.26
52 0.27
53 0.29
54 0.38
55 0.43
56 0.47
57 0.5
58 0.52
59 0.5
60 0.5
61 0.48
62 0.42
63 0.4
64 0.36
65 0.29
66 0.28
67 0.27
68 0.25
69 0.25
70 0.27
71 0.3
72 0.34
73 0.35
74 0.36
75 0.37
76 0.46
77 0.51
78 0.55
79 0.57
80 0.6
81 0.67
82 0.69
83 0.73
84 0.73
85 0.72
86 0.73
87 0.73
88 0.73
89 0.71
90 0.76
91 0.76
92 0.77
93 0.79
94 0.79
95 0.7
96 0.66
97 0.61
98 0.54
99 0.54
100 0.47
101 0.47
102 0.44
103 0.48
104 0.46
105 0.5
106 0.52
107 0.45
108 0.51
109 0.47
110 0.45
111 0.5
112 0.51
113 0.53
114 0.56
115 0.56
116 0.48
117 0.52
118 0.51
119 0.44
120 0.41
121 0.36
122 0.31
123 0.31
124 0.32
125 0.29
126 0.27
127 0.25
128 0.23
129 0.25
130 0.24
131 0.28
132 0.29
133 0.26
134 0.27
135 0.27
136 0.3
137 0.25
138 0.24
139 0.21
140 0.22
141 0.19
142 0.18
143 0.2
144 0.15
145 0.17
146 0.2
147 0.19
148 0.19
149 0.21
150 0.27
151 0.32
152 0.35
153 0.42
154 0.49
155 0.56
156 0.59
157 0.61
158 0.55
159 0.53
160 0.51
161 0.45
162 0.4
163 0.36
164 0.35
165 0.34
166 0.31
167 0.31
168 0.36
169 0.38
170 0.4
171 0.43
172 0.47
173 0.54
174 0.6
175 0.6
176 0.54
177 0.55
178 0.54
179 0.51
180 0.49
181 0.44
182 0.4
183 0.44
184 0.44
185 0.41
186 0.4
187 0.38
188 0.34
189 0.4
190 0.47
191 0.47
192 0.52
193 0.56
194 0.63
195 0.7
196 0.76
197 0.76
198 0.75
199 0.78
200 0.82
201 0.85
202 0.83
203 0.79
204 0.77
205 0.76
206 0.76
207 0.71
208 0.64
209 0.57
210 0.54
211 0.51
212 0.47
213 0.46
214 0.42
215 0.39
216 0.4
217 0.39
218 0.35
219 0.32
220 0.27
221 0.22
222 0.18
223 0.14
224 0.1
225 0.09
226 0.09
227 0.09
228 0.09
229 0.07
230 0.08
231 0.1
232 0.12
233 0.13
234 0.13
235 0.13
236 0.17
237 0.23
238 0.26
239 0.26
240 0.23
241 0.25
242 0.27
243 0.32
244 0.3
245 0.24
246 0.2
247 0.2
248 0.2
249 0.17
250 0.15
251 0.09
252 0.07
253 0.07
254 0.09
255 0.08
256 0.09
257 0.11
258 0.12
259 0.12
260 0.13
261 0.13
262 0.12
263 0.14
264 0.14
265 0.11
266 0.11
267 0.12
268 0.13
269 0.16
270 0.14
271 0.14
272 0.14
273 0.18
274 0.19
275 0.18
276 0.16
277 0.18
278 0.23
279 0.22
280 0.21
281 0.18
282 0.19
283 0.22
284 0.23
285 0.19
286 0.16
287 0.17
288 0.22
289 0.25
290 0.26
291 0.27
292 0.3
293 0.35
294 0.37
295 0.38
296 0.34
297 0.33
298 0.3
299 0.29
300 0.24
301 0.2
302 0.17
303 0.14
304 0.13
305 0.12
306 0.12
307 0.1
308 0.09
309 0.08
310 0.07
311 0.06
312 0.06
313 0.03
314 0.03
315 0.03
316 0.03
317 0.04
318 0.05
319 0.05
320 0.05
321 0.07
322 0.08
323 0.09
324 0.09
325 0.08
326 0.09
327 0.09
328 0.09
329 0.1
330 0.09
331 0.08
332 0.08
333 0.07
334 0.07
335 0.06
336 0.08
337 0.06
338 0.05
339 0.06
340 0.08
341 0.08
342 0.1
343 0.14
344 0.13
345 0.14
346 0.14
347 0.16
348 0.15
349 0.17
350 0.16
351 0.12
352 0.11
353 0.1
354 0.11
355 0.1
356 0.09
357 0.08
358 0.07
359 0.09
360 0.09
361 0.1
362 0.1
363 0.11
364 0.11
365 0.12
366 0.12
367 0.1
368 0.1
369 0.11
370 0.11
371 0.11
372 0.14
373 0.15
374 0.16
375 0.15
376 0.17
377 0.22
378 0.29
379 0.3
380 0.31
381 0.35
382 0.4
383 0.46
384 0.48
385 0.45
386 0.39
387 0.39
388 0.36
389 0.32
390 0.28
391 0.22
392 0.21
393 0.2
394 0.18
395 0.15
396 0.14
397 0.13
398 0.13
399 0.17
400 0.16
401 0.18
402 0.19
403 0.22
404 0.22
405 0.24
406 0.22
407 0.17
408 0.15
409 0.13
410 0.15
411 0.12
412 0.16
413 0.15
414 0.15
415 0.16
416 0.17
417 0.14
418 0.12
419 0.12
420 0.09
421 0.1
422 0.1
423 0.1
424 0.09
425 0.09
426 0.09
427 0.09
428 0.09
429 0.07
430 0.07
431 0.07
432 0.08
433 0.08
434 0.1
435 0.11
436 0.13
437 0.2
438 0.21
439 0.21
440 0.25
441 0.27
442 0.32
443 0.34
444 0.39
445 0.33
446 0.34
447 0.35
448 0.34
449 0.35
450 0.34
451 0.36
452 0.29
453 0.29
454 0.27
455 0.27
456 0.27
457 0.23
458 0.19
459 0.15
460 0.16
461 0.2
462 0.22
463 0.22
464 0.19
465 0.21
466 0.21
467 0.22
468 0.23
469 0.22
470 0.2
471 0.18
472 0.17
473 0.17
474 0.18
475 0.22
476 0.25
477 0.26
478 0.29
479 0.34
480 0.36
481 0.39
482 0.41
483 0.38
484 0.37
485 0.4
486 0.39
487 0.4
488 0.38
489 0.35
490 0.33
491 0.31
492 0.28
493 0.29
494 0.26
495 0.25
496 0.27
497 0.27
498 0.31
499 0.37
500 0.36
501 0.31
502 0.34
503 0.3
504 0.32
505 0.38
506 0.34
507 0.39
508 0.45
509 0.49
510 0.52
511 0.54
512 0.5
513 0.45
514 0.46
515 0.41
516 0.36
517 0.33
518 0.36
519 0.35
520 0.35
521 0.35
522 0.33
523 0.32
524 0.35
525 0.42
526 0.4
527 0.4
528 0.43
529 0.5
530 0.56
531 0.6
532 0.61
533 0.56
534 0.53
535 0.55
536 0.51
537 0.43
538 0.35
539 0.3
540 0.23
541 0.21
542 0.19
543 0.14
544 0.15
545 0.18
546 0.27
547 0.3
548 0.32
549 0.33
550 0.37
551 0.37
552 0.4
553 0.44
554 0.39
555 0.42
556 0.48
557 0.49
558 0.48
559 0.51
560 0.49
561 0.46
562 0.48
563 0.42
564 0.45
565 0.49
566 0.51
567 0.58
568 0.59
569 0.58
570 0.57
571 0.62
572 0.62
573 0.63
574 0.61
575 0.58
576 0.57
577 0.55
578 0.53
579 0.51
580 0.48
581 0.41
582 0.4
583 0.36
584 0.41
585 0.42
586 0.44
587 0.39
588 0.33
589 0.33
590 0.34
591 0.32
592 0.27
593 0.26
594 0.22
595 0.23
596 0.23
597 0.19
598 0.21
599 0.24
600 0.26
601 0.26
602 0.24
603 0.22
604 0.24
605 0.26
606 0.22
607 0.2
608 0.2
609 0.18
610 0.21
611 0.23
612 0.2
613 0.21
614 0.21
615 0.18
616 0.18
617 0.18
618 0.18
619 0.21
620 0.21
621 0.2
622 0.19
623 0.19
624 0.2
625 0.25
626 0.28
627 0.28
628 0.33
629 0.32
630 0.32
631 0.32
632 0.31
633 0.3
634 0.3
635 0.28
636 0.25
637 0.27
638 0.27
639 0.26
640 0.25
641 0.21
642 0.2
643 0.23
644 0.21
645 0.23
646 0.29
647 0.32
648 0.34
649 0.4
650 0.46
651 0.48
652 0.58
653 0.62
654 0.62
655 0.65
656 0.66
657 0.64
658 0.55
659 0.52
660 0.45
661 0.38
662 0.31
663 0.28
664 0.23
665 0.2
666 0.2
667 0.17
668 0.16
669 0.22
670 0.28
671 0.31