Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

E3K9Z4

Protein Details
Accession E3K9Z4    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
55-80QNTTSTNSPPKKKTKLEPPEKPQDSQHydrophilic
657-680VYGKLKSIRLPKKLDRKSRGFGFVHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto_nucl 13.833, mito_nucl 11.333, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0016607  C:nuclear speck  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
KEGG pgr:PGTG_07425  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12320  RRM6_RBM19_RRM5_MRD1  
Amino Acid Sequences MAFVGYKSQEQAAWIKDVWEGVWVDGRSGRGTGSRISVEWAKGIEECGKTRGVPQNTTSTNSPPKKKTKLEPPEKPQDSQFAEFMSLSNPRKNKSLVHEIMELAVPTPQQPEPQSNKATVPHLQSEITTTEEPNLPPIESSSRSSSPPPVIGDDEDITDKEYLARRMKRKLTDTVELQPELEKTSPESKEWEQDVGENGDKNEPSVDQQANIPDDLSSKPPEPVVPSDEATILESGRLFLRNLAFSVTEEEIRAIFEPFGNVAQVHILLDNERKPKGLGYVSYSRSSDALEAYRKLDQSDFQGRLLHILPAVTRNPRGESSTSASKAHNTVKMEQDAKRKLESSKQFNWATLYMNSDAVASSVADRLKISKAELFNPDAQNPAVKLALAETHVINETKQFLEDNGIDVEAFEKLKSARSPTTILVKNIPYNTSTNVIKALFSEHGSVLKVLMPPSGTIAVVEMGDKQDTKSAFRSLSYKRIGNSVLYLEKAPLDLWKIDPAKPEVATPQEISQAKPSSKEEKESGEPGSTLFVKNLSFGTTSDALASRFSNLTGYLFSRIQTKPDPKNAEHRLSMGFGFVGFRTVDSAQQALQRMQGCYLDGHTLELKFAKRGREEEEKEEKALDGEKGKKTATNKLLIKNLPFEINKKELYELFGVYGKLKSIRLPKKLDRKSRGFGFVEYHTKKEAQEALKSLKFSHLLGRHLVIEYANDADSTLDLDHLRNSQSSFLKLPNPHQKKKFVGLNNLDDDDDDPVELDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.24
3 0.24
4 0.24
5 0.21
6 0.19
7 0.17
8 0.14
9 0.21
10 0.2
11 0.2
12 0.22
13 0.23
14 0.2
15 0.2
16 0.2
17 0.17
18 0.19
19 0.21
20 0.23
21 0.23
22 0.22
23 0.27
24 0.3
25 0.27
26 0.27
27 0.25
28 0.22
29 0.2
30 0.22
31 0.24
32 0.23
33 0.24
34 0.25
35 0.26
36 0.25
37 0.32
38 0.39
39 0.39
40 0.4
41 0.42
42 0.49
43 0.5
44 0.54
45 0.49
46 0.47
47 0.52
48 0.55
49 0.6
50 0.59
51 0.67
52 0.72
53 0.78
54 0.8
55 0.8
56 0.83
57 0.86
58 0.87
59 0.87
60 0.88
61 0.84
62 0.77
63 0.68
64 0.66
65 0.6
66 0.53
67 0.45
68 0.35
69 0.33
70 0.3
71 0.27
72 0.22
73 0.24
74 0.24
75 0.3
76 0.32
77 0.33
78 0.37
79 0.4
80 0.43
81 0.44
82 0.51
83 0.49
84 0.5
85 0.5
86 0.45
87 0.44
88 0.38
89 0.3
90 0.19
91 0.16
92 0.11
93 0.09
94 0.13
95 0.12
96 0.16
97 0.19
98 0.28
99 0.34
100 0.41
101 0.44
102 0.43
103 0.45
104 0.44
105 0.45
106 0.41
107 0.39
108 0.35
109 0.34
110 0.32
111 0.29
112 0.28
113 0.26
114 0.25
115 0.21
116 0.17
117 0.18
118 0.21
119 0.2
120 0.21
121 0.21
122 0.17
123 0.16
124 0.18
125 0.21
126 0.21
127 0.24
128 0.27
129 0.28
130 0.3
131 0.32
132 0.35
133 0.33
134 0.34
135 0.32
136 0.29
137 0.29
138 0.28
139 0.29
140 0.24
141 0.22
142 0.2
143 0.18
144 0.16
145 0.14
146 0.13
147 0.14
148 0.17
149 0.23
150 0.3
151 0.38
152 0.43
153 0.52
154 0.6
155 0.64
156 0.65
157 0.68
158 0.65
159 0.64
160 0.62
161 0.6
162 0.57
163 0.5
164 0.45
165 0.37
166 0.31
167 0.26
168 0.23
169 0.16
170 0.15
171 0.22
172 0.23
173 0.23
174 0.28
175 0.27
176 0.34
177 0.35
178 0.33
179 0.26
180 0.26
181 0.28
182 0.26
183 0.25
184 0.2
185 0.19
186 0.2
187 0.2
188 0.19
189 0.17
190 0.13
191 0.14
192 0.2
193 0.19
194 0.16
195 0.19
196 0.22
197 0.22
198 0.22
199 0.19
200 0.13
201 0.14
202 0.15
203 0.16
204 0.15
205 0.15
206 0.15
207 0.16
208 0.17
209 0.19
210 0.21
211 0.22
212 0.22
213 0.21
214 0.22
215 0.21
216 0.2
217 0.18
218 0.15
219 0.11
220 0.08
221 0.08
222 0.08
223 0.08
224 0.09
225 0.08
226 0.1
227 0.13
228 0.13
229 0.13
230 0.14
231 0.13
232 0.13
233 0.16
234 0.15
235 0.13
236 0.12
237 0.12
238 0.11
239 0.11
240 0.11
241 0.08
242 0.07
243 0.07
244 0.07
245 0.08
246 0.08
247 0.08
248 0.07
249 0.06
250 0.06
251 0.06
252 0.06
253 0.06
254 0.06
255 0.06
256 0.1
257 0.14
258 0.17
259 0.18
260 0.18
261 0.18
262 0.19
263 0.22
264 0.22
265 0.19
266 0.21
267 0.29
268 0.31
269 0.33
270 0.32
271 0.28
272 0.26
273 0.24
274 0.19
275 0.13
276 0.14
277 0.14
278 0.15
279 0.17
280 0.19
281 0.18
282 0.19
283 0.18
284 0.15
285 0.19
286 0.25
287 0.25
288 0.24
289 0.26
290 0.25
291 0.26
292 0.26
293 0.19
294 0.12
295 0.11
296 0.1
297 0.11
298 0.14
299 0.14
300 0.15
301 0.16
302 0.18
303 0.19
304 0.21
305 0.2
306 0.21
307 0.24
308 0.28
309 0.28
310 0.28
311 0.27
312 0.26
313 0.28
314 0.28
315 0.27
316 0.24
317 0.25
318 0.27
319 0.31
320 0.33
321 0.34
322 0.39
323 0.4
324 0.39
325 0.37
326 0.36
327 0.33
328 0.38
329 0.42
330 0.41
331 0.41
332 0.47
333 0.46
334 0.44
335 0.45
336 0.37
337 0.32
338 0.25
339 0.22
340 0.15
341 0.15
342 0.14
343 0.12
344 0.11
345 0.08
346 0.08
347 0.05
348 0.05
349 0.07
350 0.07
351 0.07
352 0.07
353 0.09
354 0.1
355 0.1
356 0.11
357 0.13
358 0.14
359 0.17
360 0.2
361 0.21
362 0.24
363 0.25
364 0.24
365 0.21
366 0.2
367 0.17
368 0.15
369 0.13
370 0.08
371 0.07
372 0.06
373 0.06
374 0.07
375 0.07
376 0.08
377 0.06
378 0.07
379 0.08
380 0.08
381 0.08
382 0.08
383 0.09
384 0.08
385 0.08
386 0.08
387 0.07
388 0.1
389 0.1
390 0.11
391 0.09
392 0.09
393 0.09
394 0.08
395 0.09
396 0.06
397 0.06
398 0.04
399 0.05
400 0.06
401 0.09
402 0.1
403 0.14
404 0.15
405 0.18
406 0.2
407 0.21
408 0.29
409 0.29
410 0.29
411 0.29
412 0.29
413 0.29
414 0.28
415 0.27
416 0.2
417 0.18
418 0.19
419 0.19
420 0.17
421 0.15
422 0.16
423 0.16
424 0.14
425 0.13
426 0.13
427 0.11
428 0.11
429 0.13
430 0.11
431 0.11
432 0.12
433 0.12
434 0.1
435 0.11
436 0.11
437 0.1
438 0.1
439 0.09
440 0.09
441 0.11
442 0.11
443 0.08
444 0.07
445 0.07
446 0.07
447 0.07
448 0.07
449 0.06
450 0.06
451 0.06
452 0.07
453 0.06
454 0.09
455 0.1
456 0.12
457 0.15
458 0.17
459 0.17
460 0.19
461 0.24
462 0.25
463 0.32
464 0.34
465 0.33
466 0.31
467 0.33
468 0.33
469 0.28
470 0.26
471 0.21
472 0.18
473 0.17
474 0.17
475 0.14
476 0.13
477 0.12
478 0.11
479 0.09
480 0.09
481 0.1
482 0.1
483 0.17
484 0.19
485 0.21
486 0.24
487 0.25
488 0.26
489 0.25
490 0.25
491 0.21
492 0.22
493 0.23
494 0.21
495 0.19
496 0.23
497 0.23
498 0.24
499 0.27
500 0.28
501 0.27
502 0.29
503 0.32
504 0.34
505 0.35
506 0.38
507 0.34
508 0.35
509 0.38
510 0.37
511 0.35
512 0.27
513 0.25
514 0.21
515 0.21
516 0.17
517 0.14
518 0.12
519 0.11
520 0.1
521 0.11
522 0.12
523 0.11
524 0.1
525 0.1
526 0.15
527 0.14
528 0.14
529 0.15
530 0.15
531 0.14
532 0.14
533 0.14
534 0.11
535 0.1
536 0.1
537 0.1
538 0.1
539 0.1
540 0.11
541 0.12
542 0.14
543 0.14
544 0.14
545 0.2
546 0.2
547 0.23
548 0.29
549 0.37
550 0.4
551 0.49
552 0.56
553 0.52
554 0.62
555 0.66
556 0.63
557 0.56
558 0.5
559 0.43
560 0.38
561 0.35
562 0.25
563 0.18
564 0.12
565 0.12
566 0.09
567 0.09
568 0.08
569 0.08
570 0.1
571 0.11
572 0.12
573 0.13
574 0.14
575 0.13
576 0.17
577 0.19
578 0.17
579 0.21
580 0.22
581 0.21
582 0.22
583 0.21
584 0.18
585 0.17
586 0.18
587 0.16
588 0.13
589 0.15
590 0.16
591 0.15
592 0.15
593 0.18
594 0.18
595 0.2
596 0.23
597 0.27
598 0.29
599 0.32
600 0.37
601 0.45
602 0.48
603 0.52
604 0.59
605 0.55
606 0.52
607 0.49
608 0.43
609 0.33
610 0.31
611 0.25
612 0.23
613 0.27
614 0.3
615 0.32
616 0.32
617 0.35
618 0.36
619 0.43
620 0.43
621 0.45
622 0.47
623 0.51
624 0.58
625 0.58
626 0.57
627 0.52
628 0.47
629 0.44
630 0.4
631 0.37
632 0.36
633 0.37
634 0.36
635 0.33
636 0.34
637 0.28
638 0.31
639 0.29
640 0.24
641 0.21
642 0.21
643 0.21
644 0.19
645 0.19
646 0.17
647 0.17
648 0.18
649 0.22
650 0.3
651 0.38
652 0.45
653 0.53
654 0.61
655 0.7
656 0.79
657 0.83
658 0.82
659 0.82
660 0.82
661 0.8
662 0.79
663 0.7
664 0.62
665 0.56
666 0.53
667 0.55
668 0.49
669 0.44
670 0.39
671 0.39
672 0.36
673 0.38
674 0.4
675 0.34
676 0.38
677 0.41
678 0.46
679 0.48
680 0.48
681 0.43
682 0.41
683 0.38
684 0.32
685 0.36
686 0.33
687 0.33
688 0.35
689 0.36
690 0.33
691 0.32
692 0.31
693 0.22
694 0.18
695 0.17
696 0.15
697 0.13
698 0.11
699 0.1
700 0.1
701 0.1
702 0.1
703 0.09
704 0.09
705 0.1
706 0.11
707 0.13
708 0.16
709 0.18
710 0.18
711 0.19
712 0.24
713 0.26
714 0.29
715 0.3
716 0.32
717 0.38
718 0.41
719 0.49
720 0.54
721 0.61
722 0.67
723 0.71
724 0.75
725 0.74
726 0.79
727 0.78
728 0.75
729 0.76
730 0.75
731 0.75
732 0.72
733 0.66
734 0.57
735 0.48
736 0.41
737 0.33
738 0.25
739 0.17